Cours de Biochimie Microbienne L3
Ceux-ci vont subir diverses réactions métaboliques par la bactérie pour assurer son fonctionnement. Métabolisme biochimique bactérien. Définition. Le
Fer et maladies infectieuses
Il joue un rôle significatif dans le métabolisme bactérien bactérie va aboutir à une baisse de la captation du fer et à une diminution de la virulence ...
Elucidation du métabolisme des microorganismes par la
20 oct. 2009 Application au métabolisme de la bactérie Acine- ... technologies permet de séquencer un génome bactérien en quelques jours.
COURS DE MICROBIOLOGIE GENERALE
Les travaux de Pasteur ainsi que le développement des connaissances du métabolisme bactérien permettent la naissance la microbiologie industrielle.
Exploration de la face cachée du métabolisme bactérien chez
11 déc. 2020 métabolisme bactérien chez. Acinetobacter baylyi ADP1. Thèse de doctorat de l'Université Paris-Saclay préparée à l'Université d'Evry Val d' ...
Ce document est le fruit dun long travail approuvé par le jury de
sur le métabolisme des bactéries concernant les deux phases antagonistes une bactérie homolactique
TD de Nutrition et Métabolisme Bactériens Introduction Générale sur
1) a) Le type trophique commun à ces 3 bactéries pour l'énergie Chimio- organotrophe et pour le carbone hétérotrophe. b) Les types métaboliques de chaque
OBSERVATIONS SUR LE METABOLISME DES BACTERIES
Le développement préalable de Botrytis cinerea sur le moût de raiSin favorise la croissance des bactéries lactiques et stimule la fermentation.
Etude du métabolisme bactérien de termites supérieurs à régimes
ETUDE DU METABOLISME BACTERIEN DE TERMITES. SUPERIEURS A REGIMES ALIMENTAIRES. DIFFERENCIES ROLE DES BACTERIES DANS LE METABOLISME DU TERMITE.
[PDF] METABOLISME ET NUTRITION BACTERIENS
Le métabolisme est l'ensemble des réactions biochimiques mises en jeu par un forme d'ATP est utilisée pour les biosynthèses bactériennes effectuées à
[PDF] Ecologie microbienne et métabolisme associé : étude de leau
Ainsi une étude plus précise sera focalisée sur deux produits majeurs du métabolisme bactérien : les acides gras volatils et le dioxyde de carbone Après la
(PDF) Le Métabolisme Bactérien Djazou Microbio - Academiaedu
En près de 1800 pages abondamment illustrées et en cou-leurs la 3 e édition française de cet ouvrage livre tous les secrets découverts à ce jour des
[PDF] Métabolisme des bactéries - Ency-Education
METABOLISME BACTERIEN 4 Transport par translocation de groupe III Source d'énergie 2 Les réactions d'oxydations 1 La photosynthèse
Bacterio19-Metabolisme Biochimique Bacterien PDF - Scribd
METABOLISME BIOCHIMIQUE BACTERIEN Dr Bendjama A 1- Définition : • Il est défini comme l'ensemble des transformations chimiques (réactions de biosynthèse
[PDF] Cours de Microbiologie Générale
%2520Nutrition%2520bact%25C3%25A9rienne.pdf
[PDF] Métabolisme Biochimique
Dans le cas des bactéries fermentaires le NADH2 est réoxydé directement par réduction du pyruvate Cette réoxydation ne donne pas lieu à une récupération d'
[PDF] Physiologie des microorganismes - MICROBIOLOGIE -
Ce sont des oligo-éléments (ou micro-éléments) nécessaires au métabolisme microbien car ils interviennent en tant que cofacteur ou activateur de réactions
[PDF] Etude de la diversité métabolique des micro-organismes - Archimer
Diversité métabolique : besoins énergétiques et métabolisme cellulaire d'ADNr16S archéens et bactériens en vue de l'étude de diversité (ADNr16S) de la
[PDF] Exploration de la face cachée du métabolisme bactérien chez
11 déc 2020 · Exploration de la face cachée du métabolisme bactérien chez Acinetobacter baylyi ADP1 Marion Thomas To cite this version: Marion Thomas
Quel est le Metabolisme des bactéries ?
1- Métabolisme énergétique : La bactérie produit de l'énergie au cours du catabolisme par le biais de réactions dites exergonique. Pour éviter toute perte sous forme de chaleur, ces réactions exergoniques (productrices d'énergie) sont couplées à des réactions dites endergonique (absorbent l'énergie).Quel est le mode de nutrition des bactéries ?
Toutes les bactéries ont besoin d'eau, d'une source d'énergie, d'une source de carbone, d'une source d'azote et d'éléments minéraux. Ces besoins élémentaires sont suffisants pour permettre la nutrition des bactéries qualifiées de prototrophes.Quelles sont les phases de la croissance bactérienne ?
7) comportant quatre phases : la phase de latence, la phase exponentielle, la phase stationnaire et enfin une phase de décroissance.- Tout au long de leur évolution, ces bactéries ont développé des mécanismes photosynthétiques qui leur permettent de générer de l'énergie à partir de la lumière solaire. En outre, elles peuvent générer également de l'énergie dans l'obscurité via des mécanismes respiratoires dépendant de la dégradation de sucres.
METABOLISME ET NUTRITION BACTERIENS
I. Introduction
Pour assurer sa croissance ou sa survie, une bactérie doit trouver dans son environnement de quoi satisfaire ses besoins nutritifs: sources d'énergie, de carbone, d'azote, etc...Ces éléments doivent être apportés dans un milieu où règnent des conditions physico-
chimiques favorables (température, pH, pression osmotique, etc...). Le métabolisme est l'ensemble des réactions biochimiques mises en jeu par un organisme pour permettre sa croissance (figure 1). Les réactions métaboliques peuvent être classées en deux catégories: - celles qui produisent de l'énergie: catabolisme. - celles qui consomment de l'énergie: anabolisme ou biosynthèse. Figure 1 : Représentation schématique simplifiée montrant la relation entre le catabolisme et l'anabolisme II. Métabolisme énergétique et types respiratoiresII.1. Métabolisme énergétique
Une bactérie, pour qu'elle puisse synthétiser ses constituants et se déplacer, doit dépenser de l'énergie. Cette énergie est procurée soit par photosynthèse (cas des bactéries photosynthétiques) soit par des réactions biochimiques d'oxydoréduction. On définit alors deux types trophiques: - énergie lumineuse ____ĺ phototrophie.
- énergie chimique ____ĺ chimiotrophie.
Cette énergie est stockée dans des liaisons chimiques comme l'ATP (Adénosine triphosphate; figure 2).Figure 2 : Structure de l'ATP
Energie
ATP ĸ ADP + Pi (PO
43-La bactérie, quand elle a besoin d'énergie, utilise l'ATP
ĺ ADP + Pi (PO
43-) + Energie
II.1.1. Phototrophie (tableau 1)
* Chez les plantes, la photosynthèse peut se résumer ainsi :Lumière
CO 2 + H 2O ĺ (CH
2O) + O
2 H 2O est le donneur d'électrons.
La photosynthèse a lieu au niveau des chloroplastes grâce aux pigments chlorophylliens. * Chez les bactéries photosynthétiques, il n'existe pas de chloroplastes; la bactériochlorophylle est dispersée dans le cytoplasme sous forme de chromatophores. On peut résumer leur photosynthèse comme suit:Lumière
CO 2 + 2RH 2ĺ (CH
2O) + 2R + H
2 O RH 2 est le donneur d'électrons. Chez les bactéries, le donneur d'électrons n'est jamais H 2O ; sa nature chimique permet
de distinguer deux types trophiques. Il peut être: - minéral ĺ photolithotrophie - organique ĺ photoorganotrophie Tableau 1 : Comparaison entre la photosynthèse chez les organismes eucaryotes et chez les bactériesEucaryotes Bactéries
Organismes plantes, algues bactéries vertes et pourpresType de chlorophylle chlorophylle a
absorbe à 650-750nm bactériochlorophylle
absorbe à 800-1000nmPhotosystème I
(photophosphorylation cyclique) présente présentePhotosystème II
(photophosphorylation non cyclique) présente absenteProduction de O
2 oui non donneur d'électrons H 2 O H 2S, autres composés
soufrés ou certains composés organiques les cyanobactéries possèdent la photosynthèse des plantes supérieures Pendant la photosynthèse, deux types de réactions ont lieu (figure 3): - l'énergie lumineuse est absorbée par les pigments chlorophylliens, puis transforméeen énergie de liaison (ATP) grâce à un système de transfert des électrons (light reaction).
- réactions de biosynthèse (dark reaction) pendant lesquelles l'énergie stockée sous forme d'ATP est utilisée pour les biosynthèses bactériennes effectuées à partir du CO 2 (ou de composés organiques). Figure 3 : Schéma montrant le couplage des réactions de photosynthèse pmf: proton motive force; H 2A: donneur externe d'électrons; X: ferredoxine
II.1.1.1. Photolithotrophes
Elles sont anaérobies strictes et utilisent les sulfures ou H 2 comme donneurs d'électrons. L'oxydation des sulfures produit des grains de soufre qu'on trouve dans le cytoplasme bactérien. On rencontre deux familles: - Chlorobacteriaceae (bactéries vertes sulfureuses) - Thiorodaceae (bactéries pourpres sulfureuses).II.1.1.2. Photoorganotrophes
- Athiorodaceae (bactéries pourpres non sulfureuses). Elles utilisent, comme leur nom l'indique, des substrats organiques comme donneurs d'électrons.Dans la plupart des cas, la photosynthèse n'est pas obligatoire; à l'obscurité, les bactéries
deviennent chimioorganotrophes.II.1.2. Chimiotrophie
La majorité des bactéries rencontrées dans la nature sont dépourvues de pigments chlorophylliens et sont par conséquent incapables de faire la photosynthèse. Elles doivent donc se procurer de l'énergie à partir de réactions chimiques d'oxydoréduction. L'ATP est produit lors de deux types de réactions de phosphorylation. II.1.2.1. Phosphorylation au niveau du substrat (figure 4) Figure 4 : Exemples de réactions de phosphorylation au niveau du substrat rencontrées chez les bactéries II.1.2.2. Phosphorylation oxydative (chaîne de transfert des électrons)La chaîne de transfert des électrons, encore appelée chaîne respiratoire, à laquelle sont
associées les phosphorylations oxydatives, a une structure très complexe comparable à celles des cellules eucaryotes mais il existe des différences notables d'une bactérie à l'autre (voir exemples ci-dessous). En admettant, pour simplifier, que le seul transporteur soluble d'électrons au cours du métabolisme respiratoire soit le NAD , l'oxydation complète du glucose par la voie aérobie du cycle tricarboxylique correspond à la réaction globale suivante: C 6 H 12 O 6 + 6H 2O + 12NAD
ĺ 6CO
2 + 12NADH + 12 H La chaîne respiratoire intervient pour réoxyder les coenzymes réduits:12NADH + 12H
+ 6O 2ĺ 12NAD
+ 12H 2 O Figure 5 : Représentation schématique de la chaîne respiratoire chez les bactéries AH 2 : Donneur d'électrons (substrat énergétique)A : Donneur oxydé
B : Accepteur final d'électrons
Les transporteurs intermédiaires (X, Y et Z) peuvent être des co-enzymes (tableau1) tels que NAD, FAD, FMN ou des cytochromes. En fonction de la nature du donneur, on définit deux types trophiques: - donneur minéral ĺ chimiolithotrophie - donneur organique ĺ chimioorganotrophieII.2. Types respiratoires des chimiotrophes
II.2.1. Respiration
La respiration est l'ensemble des réactions biochimiques d'oxydation procurant à l'organisme l'énergie nécessaire à ses biosynthèses essentiellement grâce à des phosphorylations oxydatives membranaires (chaîne de transfert des électrons). On distingue deux types de réactions en fonction de la nature chimique de l'accepteur final (figure 5, tableau 2): - accepteur = O 2ĺ respiration aérobie
- accepteur O 2 ĺ respiration anaérobie; l'accepteur peut être minéral (nitrates, sulfates, gaz carbonique) ou organique (ex: fumarate) Tableau 2 : Différents accepteurs d'électrons utilisés lors de la respiration chez les bactériesAccepteur
d'électrons Produit final réduit Nom du processus Exemples de microorganismes O 2 H 2O Respiration aérobie Escherichia coli,
Streptomyces
NO 3- NO 2- , NH 3 or N 2Respiration anaérobie
(dénitrification) Bacillus,Pseudomonas
SO 4--S or H
2S Respiration anaérobie (réduction
des sulfates) Desulfovibrio fumarate Succinate Respiration anaérobie utilisant un accepteur d'e organique Escherichia coli CO 2 CH 4Méthanogenèse Methanococcus
Exemples de chaînes respiratoires rencontrées chez les bactéries1 )Respiration aérobie chez les bactéries oxydase
2) Respiration aérobie chez les bactéries oxydase
3) Respiration anaérobie (nitrate comme accepteur final)
II.2.2. Fermentation
La fermentation est l'ensemble des réactions biochimiques d'oxydation qui fournissent à l'organisme de l'énergie grâce à des phosphorylations non couplées aux processus membranaires, mais ayant lieu uniquement dans le cytoplasme, au niveau du substrat. La production d'énergie, par fermentation, est impossible chez les bactéries aérobiesstrictes. En aérobiose, seules les bactéries anaérobies facultatives aérotolérantes peuvent
produire de l'énergie par fermentation; chez les bactéries anaérobies strictes et aéro- anaérobies facultatives les voies fermentatives sont réprimées en aérobiose (effet inhibiteur de l'oxygène). La fermentation du glucose, par exemple, se fait en deux étapes: - une première série de réactions aboutissant à l'oxydation du glucose en un composé intermédiaire (acide pyruvique); - une seconde série conduit à un ou plusieurs produits finals (acide lactique, acétate,éthanol, etc...).
L'énergie produite par fermentation est nettement inférieure à celle procurée par respiration. Exemple: l'oxydation complète du glucose en CO 2 et H 2O, par respiration
aérobie, produit 674 kcal; alors que sa fermentation en acide lactique ne produit que 22,5 kcal. Ceci explique le faible rendement de croissance obtenu en anaérobiose, comparé à celui obtenu au cours des processus respiratoires.III. Source de carbone
Certaines bactéries peuvent utiliser le gaz carbonique de l'air ou ses sels (carbonates) comme seule source de carbone; elles sont dites autotrophes. Elles sont donc capables de synthétiser la matière organique à partir de cette source minérale.Parmi ces bactéries, on distingue:
- les autotrophes strictes qui exigent le CO 2 comme source de carbone unique - les autotrophes facultatives qui peuvent utiliser le CO 2 et le carbone organique. Pour la majorité des bactéries, la source de carbone est organique; elles sont dites hétérotrophes.Parmi ces bactéries on distingue:
- celles qui sont capables de se développer en présence d'une seule source de carbonequotesdbs_dbs22.pdfusesText_28[PDF] microbiologie métabolisme
[PDF] respiration bacterienne microbiologie
[PDF] métabolisme glucidique bactérien
[PDF] phosphorylation oxydative ppt
[PDF] ascorbate chaine respiratoire
[PDF] phosphorylation oxydative animation
[PDF] phosphorylation oxydative schéma
[PDF] phosphorylation oxydative cours
[PDF] phosphorylation oxydative pdf
[PDF] boucle microbienne milieu aquatique
[PDF] boucle microbienne définition
[PDF] examen chaine de markov corrigé
[PDF] processus de markov pour les nuls
[PDF] temperature pdf