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II Nomenclature des molécules organiques ; 1) Les différentes familles d'hydrocarbures : Particularités de la chaîne Nom de la famille

  • Quelles sont les familles de molécules organiques ?

    Les glucides, les lipides, les protéines et les acides nucléiques constituent les quatre principales classes de composés organiques dans les cellules.
  • Quelles sont les familles de molécules ?

    Les familles possibles sont :

    Alcool.Aldéhyde.Cétone.Acide carboxylique.Alcène.Ester.Amine.Amide.
  • Quelle est la famille organique ?

    Ce sont les composés organiques qui poss?nt un groupe caractéristique renfermant un ou plusieurs atomes d'oxygène. Ce sont les composés organiques qui poss?nt comme groupe caractéristique le groupe hydroxyle –OH, porté par un atome de C lié par 4 liaisons simples.
  • Molécule organique : on appelle « molécule organique » toute molécule qui présente au moins un atome de carbone associé à l'hydrogène par liaison covalente. Les autres sont appelées minérales ou inorganiques. Les plus grosses molécules sont appelées des macromolécules.
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Chapitre 6

Structure des composés organiques6.1 Familles organiques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44

6.1.1 Représentations des molécules organiques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

44

6.1.2 Alcanes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

45

6.1.3 Alcools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

45

6.1.4 Cétones et aldéhydes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

46

6.1.5 Acides carboxyliques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

46

6.2 Spectroscopie infrarouge . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

47

6.2.1 Principe de fonctionnement . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

47

6.2.2 Exploitation d"un spectre infrarouge . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

47

6.3 Résumé . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

48

46Chapitre 6.Structure des composés organiquesD

ansla continuité des deux chapitres précédents, on s"intéresse ici à la structure de la matière,

et plus précisément celle des composés dits organiques. Il s"agit de toutes les molécules qui

sont constituées essentiellement de chaînes carbonées avec des hydrogène, mais aussi parfois d"autres

éléments et groupes chimiques. Ces molécules organiques sont par exemple celles qui constituent

l"immense majorité des structures biologiques, donc le monde du vivant. Les molécules organiques

peuvent être naturelles ou bien synthétisées en laboratoire. Ce chapitre introduit dans un premier temps les définitions des principales structures organiques

rencontrées, puis s"attache dans un deuxième temps au fonctionnement de la sprectroscopie infrarouge,

technique qui permet de caractériser en partie les molécules organiques.

6.1 Familles organiques

6.1.1 Représentations des molécules organiques

Formule brute

La formule brute d"une molécule organique s"écrit en indiquant simplement la nature et le nombre

d"éléments chimiques qui constituent la molécule.

Exemple:

C 3H6O2

Formule semi-développée

La formule semi-développée d"une molécule s"écrit en représentant toutes les liaisons inter-atomessauf

les liaisons des atomes d"hydrogène.

Exemple:

CH 3CH 2CO OH

Formule développée

La formule développée d"une molécule fait apparaître toutes les liaisons inter-atomes.

Exemple:

CH H HCH HCO OH

Formule de Lewis

La formule de Lewis fait apparaître toutes les liaisons, ainsi que les éventuels doublets non-liants.

Exemple:

CH H HCH HCO OH Poisson Florian Spécialité Physique-Chimie 1

ère

6.1.Familles organiques47Remarque:Dans la pratique, on fait souvent apparaître les doublets non liants également sur la

forme semi-développée.

6.1.2 Alcanes

Unalcaneest une molécule constituée uniquement d"atomes de carbone et d"hydrogène reliés par des

liaisons simples.

En tenant compte du fait qu"un atome de carbone doit être entouré de 4 liaisons (4 simples; ou 1

double et 2 simples; ou 2 doubles; ou 1 triple et 1 simple) et l"hydrogène 1 liaison simple, la formule

brute généralisée pour un alcane est la suivante : C nH2n+2

On appellealcane linéaireune molécule présentant une seule chaîne linéaire de carbones. C"est-à-dire

que tous les atomes de carbones d"une telle molécule sont liés à un ou deux autre carbones maximum.

A l"inverse, unalcane ramifiéprésente une chaîne carbonée principale, avec des chaînes secondaires

ramifiées. La nomenclature qui permet de nommer un alcane linéaire est la suivante : •Un préfixe qui désigne le nombrend"atomes de carbone

•Un suffixe-ane

Si l"alcane est ramifié, on procède comme suit : •On nomme la chaîne la plus longue selon la nomenclature d"un alcane, et on numérote les carbones de cette chaîne dans le sens qui minimise les numéros des carbones porteurs d"autres ramifications. •On nomme les ramifications par la notationalkyle

•On place les alkyles en préfixe en indiquant le numéro du carbone de la chaîne la plus longue

qui porte l"alkyle

Suivant le nombre de carbone qui compose une chaîne, les préfixes à employer sont les suivants :n12345678

Exemples:

CHH H HHCH HCH HCH HHH 3CCH 2CH CH 3CH 2CH 3CH

4C3H8C5H12

méthane propane 3-méthylpentane

6.1.3 Alcools

Unalcoolest une molécule organique présentant un groupementhydroxyleOH à la place d"un hydrogène.

La formule brute d"un alcool est la suivante :

C nH2n+2O La nomenclature qui permet de nommer un alcool est la suivante : alcan - numéro - olSpécialité Physique-Chimie 1

èrePoisson Florian

48Chapitre 6.Structure des composés organiquesExemple:

butan-2-olCH3CH2CHOH CH3C 4H10O

6.1.4 Cétones et aldéhydes

Lescétoneset lesaldéhydessont deux familles de molécules faisant intervenir un groupement carbonyle CO.

Lorsque cette double liaison carbone oxygène est située au milieu d"une chaîne carbonée, il s"agit d"une

cétone, et si elle est située en bout de chaîne, alors il s"agit d"unaldéhyde. La formule brute des cétones et des aldéhydes est la suivante : C nH2nO

La nomenclature est la suivante :

•alcan - numéro - onep ourles cétones

•alcan - alp ourles ald éhydes

Exemple:

CH3CHCH3

CO

CH3CH3CH2CH2CO

H C

4H8O C4H8O

3-méthylbutan-2-one butanal

6.1.5 Acides carboxyliques

Lesacides carboxyliquesforment une famille de molécules faisant intervenir un groupementCO

OHen bout de chaîne.

La formule brute des acides carboxyliques est la suivante : C nH2nO2 La nomenclature pour les acides carboxyliques est la suivante : acide alcan - oïque acide propanoïqueCH3CH2CO OHC

3H6O2Poisson Florian Spécialité Physique-Chimie 1

ère

6.2.Spectroscopie infrarouge496.2 Spectroscopie infrarouge

6.2.1 Principe de fonctionnement

Laspectroscopie infrarouge(IR) repose sur l"interaction entre une onde électromagnétique située

dans le domaine des infrarouges ([800-25000]nm), et la matière qu"elle rencontre. L"énergie portée

par la lumière infrarouge est caractéristique des énergies de vibration et de rotation des liaisons

chimiques. Ainsi, si une molécule reçoit un rayonnement IR dont l"énergie correspond exactement à

l"énergie de vibration d"une liaison chimique, ce rayonnement sera absorbé par la liaison.Chaque

type de liaison possède une valeur d"énergie qui lui est propre.

On peut alors caractériser les fonctions chimiques présentes dans une molécule grâce à l"étude de son

spectre infrarouge.Spectre infrarouge Par convention, les spectres IR représentent laTransmittanceen fonction dunombre d"onde:

σ=1λ

λest la longueur d"onde (en m)

σest le nombre d"onde (encm-1)

Le domaine spectral est

?200 cm-1;4000 cm-1?mais seul le domaine?1500 cm-1;4000 cm-1?

est susceptible d"être exploité dans ce chapitre. Le reste du domaine, non exploité, constitue ce

qu"on appelle " l"empreinte digitale » ou " carte d"identité » de la molécule.Remarque:Le choix d"utiliser la transmittance et le nombre d"onde comme variables d"origine

expérimentale; on aurait tout aussi bien pu choisir de représenter l"absorbance en fonction de la

longueur d"onde comme en spectroscopie UV-visible du chapitre 3

6.2.2 Exploitation d"un spectre infrarouge

Dans la pratique, chaque liaison chimique donne lieu à un signal bien précis sur le spectre. On peut

alors utiliser les spectres IR pouridentifierles groupes caractéristiques présents dans la molécule. En

revanche, cette technique ne nous permet pas de prévoir l"agencement relatif des différents groupes

caractéristiques au sein de la molécule. Si l"on veut des informations plus poussées pour déterminer la

formule semi-développée d"une molécule, il faut avoir recours à une autre technique de spectroscopie

appeléeRMNpourRésonance Magnétique Nucléaire(programme de Terminale).Type de liaisonσ(en cm-1)Largeur de la

bandeIntensité de la bandeCH2900 - 3100VariableMoyenne à forte OH (phase diluée)vers 3600FineMoyenne à forte OH (alcool, phase condensée)3000 - 3500LargeForte OH (groupe carboxyle)2500 - 3500LargeMoyenne à forte

CO (acide carboxylique)1700 - 1730FineForte

CO (aldéhyde)1720 - 1740FineForte

CO (cétone)1700 - 1720FineForte

Table 6.1- Bandes d"absorption caractéristiques des principaux groupementsSpécialité Physique-Chimie 1

èrePoisson Florian

50Chapitre 6.Structure des composés organiquesRemarque:Lorsqu"une molécule présente un groupement OH, on voit dans le tableau précédent

qu"on peut avoir un pic large ou fin, selon si l"on se trouve en phase diluée ou phase condensée.

Cela provient du fait qu"en phase condensée, ces molécules présentent des liaisons hydrogène entre

elles. Ces liaisons augurent un couplage, élargissant ainsi la gamme d"énergies de liaisons relative à ce

groupement, d"où le fait que le pic apparaisse large.

On retiendra donc qu"en phase condensée, il y a des liaisons hydrogène et donc le pic relatif au

groupement OH est large, alors qu"en phase diluée il n"y a plus de liaisons hydrogène et le pic

apparaît fin.

Exemple:On étudie le spectre de l"acide butanoïque donné sur la figure6.1 . On constate que dans

le domaine?1500 cm-1;4000 cm-1?, il y a deux bandes principales d"absorption : •pic large et fort à 2960cm-1caractéristique de la liaison OH d"un acide carboxylique. •pic fin et fort à 1712cm-1caractéristique de la liaison CO d"un acide carboxylique. Figure 6.1- Spectre infrarouge de l"acide butanoïque

6.3 RésuméFamilles organiques

FamilleGroupe

caractéristiqueReprésentationBandes IR (en cm -1) alcane alcaneCHVariable

3000 - 3500

alcool hydroxyleROHLarge ou fine

3000 - 3500

cétone carbonyleC RR ?OFine et forte ?1700 aldéhyde carbonyleC

RHOFine et forte

?1700 acide carboxyliquecarboxyleC ROHO carboxyle+hydroxylePoisson Florian Spécialité Physique-Chimie 1

ère

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