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:

TypologieB aseggpl ot2R eferences

Optimiser ses graphiques avecR

Jer^ome Sueur

MNHN { Systematique et Evolution

UMR CNRS 7205 { OSEB

sueur@mnhn.fr

28 Avril 2011

J SueurGraphiques

TypologieB aseggpl ot2R eferences

1Typologie

2Base

3ggplot2

4References

J SueurGraphiques

TypologieB aseggpl ot2R eferences

Outline

1Typologie

2Base

3ggplot2

4References

J SueurGraphiques

TypologieB aseggpl ot2R eferences

Typologie

{ Qu elsgr aphiques? simples et composes

2D ou 3D

statiques, interactifs, animes

J SueurGraphiques

TypologieB aseggpl ot2R eferences

Typologie

{ F amilles Quatre familles de graphiques issus de la base ou de packages speciques :base (Ross Ihaka)

packagegrids(Paul Murrel)packagelattice(Deepayan Sarkar)packageggplot2(Hadley Wickman)J SueurGraphiques

TypologieB aseggpl ot2R eferences

Outline

1Typologie

2Base

3ggplot2

4References

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Base { Pr incipes

Cinq grands types de fonctions graphiques

haut-niveau (high-level) bas-niveau (low-level) parametrage (parameters) division (treillis, faceting) impression (vectorielle, matricielle)

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TypologieB aseggpl ot2R eferences

Base { F onctionsde ha ut-niveau nuages de points prols graphiques en b^atons histogrammes bo^tes a moustaches graphiques en violons camemberts radars contours cartes de densite cartes geographiques images etc

J SueurGraphiques

TypologieB aseggpl ot2R eferences

Base { F onctionsde ba s-niveau points, traits, surfaces (rectangles, polygones, cercles) lignes, courbes, segments, eches titres, legendes, etiquettes

J SueurGraphiques

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Base { F onctionsde pa rametrage couleurs taille, police, orientation echelles marges superposition etc

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Base { No mbred epa ckages data vers count date

1 1.30 110 2001-06-21

2 1.40 129 2001-12-17

3 1.50 161 2002-06-12

4 1.70 219 2003-05-25

5 1.80 273 2003-11-16

6 1.90 357 2004-06-05

7 2.00 406 2004-10-12

8 2.10 548 2005-06-18

9 2.20 647 2005-12-16

10 2.30 739 2006-05-31

11 2.40 911 2006-12-12

12 2.50 1000 2007-04-12

13 2.60 1300 2007-11-16

14 2.70 1495 2008-03-18

15 2.80 1614 2008-10-20

16 2.90 1907 2009-04-17

17 2.10 2008 2009-10-26

18 2.12 2952 2011-04-06

J SueurGraphiques

TypologieB aseggpl ot2R eferences

Base { Ex emple plot(date, count)l l l l l l l l l l l l l l l l l l

20022004200620082010

0 500
1000
1500
2000
2500
3000
date countJ SueurGraphiques

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Base { Ex emple par(bg = "darkgrey", fg = "white", lwd = 2) plot(date, count, pch = 20, cex = 2, col = "white", xlab = "Annee", ylab = "Nombre", main = "Nombre de packages sur le CRAN") points(date[18], count[18], pch = 20, col = "yellow", cex = 2) text(date[18], count[18], pos = 2, label = "6 Avril 2011", col = "yellow") lines(lowess(date, count), col = 2, lwd = 2)

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TypologieB aseggpl ot2R eferences

Base { Ex emplel l l l l l l l l l l l l l l l l l

20022004200620082010

0 500
1000
1500
2000
2500
3000

Nombre de packages sur le CRAN

Année

Nombre

l6 Avril 2011J SueurGraphiques

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Base { Des ex emplesp arce ntaines http ://addictedtor.free.fr/graphiques/index.php

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Outline

1Typologie

2Base

3ggplot2

4References

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ggplot2 { H istorique developpe par Hadley Wickham (Rice University, Houston, USA)depend principalement des packagesreshapeet plyrpremiere version : Juin 2007

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