[PDF] analyse-R.pdf 26?/04?/2022 les possibilité





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Introduction aux graphiques avec R - CEL

30?/10?/2016 3 Additionner un graphique à un graphique existant ... Pour avoir un aperçu des possibilités graphiques du logiciel R on fait :.



Graphiques de base

Par une ironie de l'histoire le graphique statistique considéré par beaucoup comme étant le meilleur On peut (aussi) faire de mauvais graphiques sous R.



Séries chronologiques (avec R) (Cours et exercices)

06?/01?/2020 ci-dessous en incluant vos codes R



Traitement des résultats Isis-Fish sous R Sorties graphiques

Traitement des résultats Isis-Fish sous R. Sorties graphiques. Rapport à la date du 15 décembre 2006. Mathieu Merzéréaud. Ifremer. Université de Caen 



GERAD - Les graphiques dans R par Odile Wolber

Cette fonction a pour argument une matrice de valeurs entières qui indiquent le numéro des sous-fenêtres. Pour visualiser la partition crée on utilise la 



LART GRAPHIQUE SOUS R

Notons que tous les autres packages dédiés aux graphiques sous R (ggplot2 lattice



Gestion des couleurs sous R

Gestion des couleurs sous R. Michel BAYLAC. MNHN SEMIN-R du MNHN



R pour les débutants

sous forme de tableaux. R est un syst`eme d'analyse statistique et graphique créé par Ross Ihaka et Robert Gentleman1. R est `a la fois un logiciel et un 



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26?/04?/2022 les possibilités de manipulation de données sous R sont en ... il n'existe pas encore d'interface graphique pour R équivalente à celle ...



Chapitre 4 : Représentation graphique sous Matlab

*sin(x);. >> plot(xy). Page 4. La commande plot. Voici par exemple une autre façon de tracer le graphe de la fonction h(x) = x sin(x) entre -2? et 2?. Essayez 



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Lorsqu'une fonction graphique est exécutée R ouvre une fenêtre graphique et y affiche le graphe On peut spécifier le dispositif de gestion des fenêtres La 



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La philosophie des auteurs en termes de graphiques sous R est simple : ajouter les élé- ments un à un en commençant par ouvrir une fenêtre graphique avec des 



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Un rapide aperçu des très riches fonctions graphiques de R pour gérer fenêtres et fichiers tracer des camemberts diagrammes en colonnes mosaïc plot 



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Les fonctions graphiques de bas niveau pour retoucher un graphique existant Les fonctions graphiques de haut niveau http://pbil univ-lyon1 fr/R/Rfig pdf



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Dans R pour exporter un graphique il faut au minimum trois étapes: 1 Ouvrir le moteur graphique lié au format de fichier que l'on veut ( pdf png jpeg etc ) 



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Pour tracer un graphique de données : ? hist(x ) ? plot(x y ) ? contour 



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22 jan 2018 · dev print( pdf file="essai pdf ") • utilisation des menus (sous widows ou mac seulement) • La fenêtre graphique peut être fractionnée en 



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Exploration systématique des paramètres graphiques (c'est ce qui est le plus long à maîtriser): http://pbil univ-lyon1 fr/R/ pdf /tdr75 pdf Couleurs :

  • Comment faire un graphique sous r ?

    La fonction la plus couramment utilisée pour produire des graphiques dans R est la fonction plot() . plot() est une fonction générique dont le comportement s'adapte automatiquement à la nature de ses arguments. Il y a deux syntaxes possibles pour cette fonction : syntaxe classique: plot(x = varX, y = varY)
  • Comment superposer des graphes sur r ?

    4.

    1Tracer le premier graphique sans afficher aucun axe)2Indiquer son axe y (celui de gauche ou celui de droite)3Indiquer qu'on va tracer un deuxième graphique (commande par(new=T) )4Tracer le 2ème graphique.5Indiquer l'axe y de ce 2ème graphique (celui qui reste)
  • Comment faire un histogramme sur r ?

    Cliquez sur Rectangles et Barres (à gauche de l'histogramme), puis sur Intervalles et Etiquettes. En somme dans R++, modifier un histogramme se fait sans code, comme dans MS Excel. Mais en un clic, vous pouvez visualiser tous les histogrammes de toutes les variables numériques.
  • Principe de fonctionnement du package ggplot2. Le package ggplot2 fonctionne par couche successives. La première d'entre elles, est un peu le canevas du graph. Elle consiste à indiquer, dans quel jeu de données se trouve les données, et quelles sont les variables que l'on souhaite représenter.
analyse-R

Introduction

gKx @M@KXRDCxDMPTlSDR@

UDB2DS23STCHNDernière mise à jourEUQHDQDOIDOI10.5281/zenodo.639833310.5281/zenodo.6398333Contributeurs

P ar ordre alphabétique

JulienBarnier

XDTK+@TEEL@MM#GQHRSNOGD,@K@MMD*NRDOG,@QL@Q@MFD.HBNK@R2NADSSDCréation et Maintenance

Joseph Larmar

ange - GSSO

INRDOGK@QL@Q@MFDMDS

GUIDE -RP

5B5@MG9898CBBX9G8^9BEIYH95J97):GSSOR

K@QL@Q@MFDFHSGTAHNFTHCD

2analyse-Rb"DJH

Présentation

L 'objectif premierd' analyse-Rest deprésenter commentréaliser desanalyses statistiqueset div ersesNOkQ @SHNMR BNTQ@MSDR BNLLD K@L@MHOTK@SHNM CDCNMMkDR NTK@ OQNCTBSHNMCD FQ@OGHPTDR @UDBR. Il MD Rx @FHS O@RCxTM BNTQRCD RS@SHRSHPTDR KDRCHEEkQDMSR BG@OHSQDROQkRTOONRDMS CNMBPTD U NTR @UDY CkIgTMD BNMM@HRR@MBDCDR CHEEkQDMSDRSDBGMHPTDR OQkRDMSkDR3H U NTR RNTG@HSDYCDR OQkBHRHNMRSGkNQHPTDR LkSGNCNKNFHPTDR gOQNONR CxTMBDQS@HM SXODCx @M@KXRDR MNTRU NTR BNMRDHKKNMRCxTSHKHRDQ UNSQD LNSDTQCD QDBGDQBGD OQkEkQk%M DEEDSNM SQNTU D RTQHMSDQMDS CDSQjR MNLAQDTWRTOONQSR CDBNTQR R@MRBNLOSDQ KDRMNLAQDTWNTUQ -u T able des matièresSi v ous débutez avecRetRStudio, nous v ous conseillons de parcourir en premier lieu les chapitresRTHU@MSR -@MHOTKDQ0QHRDDML@HM !M@KXRDQ3S@SHRSHPTDRHMSQNCTBSHU

DR-@MHOTKDQ-@MHOTK@SHNMRCDCNMMkDR

!M@KXRDQ3S@SHRSHPTDRHMSDQLkCH@QDR

OTHRCDBNLOKkSDQU

Prise en main

Présentation et Philosophie

)MRS@KK@SHNMCDRetRStudio . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

0QDLHDQBNMS@BS

0QDLHDQSQ

@U@HK@UDBCDRCNMMkDR %WSDMRHNMRHMRS@KK@SHNMLHRDgINTQ )MSQNCTBSHNM@Ttidyv

erse . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

6

DBSDTQRHMCDW@SHNMDS@RRHFM@SHNM

,HRSDRDS4 @AKD@TWCDCNMMkDR &@BSDTQRDSU

DBSDTQRK@ADKKHRkR

/QF@MHRDQRDR~BGHDQR )LONQSCDCNMMkDR /qSQNTU

DQCDKx@HCD

Manipulation de données

Visualiser ses données

2DBNC@FDCDU@QH@AKDR

-@MHOTKDQKDRCNMMkDR@

UDBdplyr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

-@MHOTK@SHNMR@

U@MBkDR@UDBdata.table . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

4

QHRanalyse-R

-u

AnalyserSous-ensembles

TRHNMCDS@AKDR

'DRSHNMCDRC@SDR

NMBSHNMRgEDMlSQD

-@MHOTKDQCTSD

WSD@UDBstringr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

2kNQF@MHRDQRDRCNMMkDR@

UDBtidyr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Exporter

Export de données

%WONQSCDFQ @OGHPTDR

Statistiques introductiv

esStatistique univariée

3S@SHRSHPTDAHU@QHkD

)MSQNCTBSHNMgggplot2, la gr ammaire des graphiques 'Q

@OGHPTDRTMHU@QHkRDSAHU@QHkR@UDBggplot2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

$NMMkDRONMCkQkDR

Statistiques intermédiaires

Intervalles de conifiance

#NLO@Q @HRNMRLNXDMMDRDSOQNONQSHNMR $k~MHQTMOK@MCx kBG@MSHKKNMM@FDBNLOKDWD@UDBsurv ey . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

2kFQDRRHNMKHMk@HQD

!M@KXRDCDRBNQQDRONMC@MBDRLTKSHOKDR! #K@RRH~B@SHNM@RBDMC@MSDGHkQ @QBGHPTD#!(

Statistiques a

vancéesT

ableaux statistiques avancés avecgtsummary . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

%EEDSRCxHMSDQ @BSHNMC@MRTMLNCjKDanalyse-Rb"DJH ApprofondirMulticolinéarité dans la régression

1TDKSXODCDLNCjKDRBGNHRHQ

!M@KXRDCDRTQUHD !M@KXRDCDRkPTDMBDR 4

Q@IDBSNHQDRCDRNHMRTMD

WDLOKDCDCNMMkDRKNMFHSTCHM@KDR

!M@KXRDCDQkRD@TW !M@KXRDRO@SH@KD !M@KXRDSD

WSTDKKD

Gr aphiques;;D@CH et la gr ammaire des graphiques

eSDMCQDggplot2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

#NLAHMDQOKTRHDTQRFQ @OGHPTDR %W

DLOKDRCDFQ@OGHPTDR@U@MBkR

'Q @OGHPTDRHMSDQ@BSHER lattice: gr aphiques et formules #@QSDR !TSQDRD

WSDMRHNMRFQ@OGHPTDR

Progr ammationConditions et compar aisons

NQLTKDR

3SQTBSTQDRBNMCHSHNMMDKKDR

6

DBSNQHR@SHNMCNMSpurrr)

%WOQDRRHNMRQkFTKHjQDR

R Mark

down: les r apports automatisés Div ersMettre en forme des nombres a

vecscales . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

#NTKDTQRDS0 @KDSSDRanalyse-R -u Inde xLicence L e contenude cesite estdiffusé souslicence Cr eative CommonsA ttribution -P as d'utilisationcommer ciale -)

7HJ7=;:7DIB;IC]C;I9ED:?J?EDI(GSSOR

BQD@SHUDBNLLNMRNQFKHBDMRDRAX

MB R@EQ ##A X MB

R@#DK@ RHFMH~DCNMB PTDU

NTR lSDRKHAQD CDQDBNOHDQ LNCH~DQ QDCHRSQHATDQ KDRBNMSDMTR Cxanalyse-R, à

BNMCHSHNM PTDU

NTR BHSHDYK@ RNTQBDDS PTDU NR LNCH~B@SHNMRRNHDMS DKKD LlLDRCHRSQHATkDR RNTRK@ LlLDKHBDMBD@TSNQHR@MS@HMRHCx analyse-Rest dé veloppé avecRStudioet le code source est librement disponible surGitHub: GSSOR

FHSGTABNLK@QL@Q@MFD@M@KXRD

2 #D OQNIDSRD U

DTS BNKK@ANQ@SHE .xGkRHSDYCNMB O@Rg OQNONRDQCDR BNQQDBSHNMRNT @INTSRU NHQD LlLDg QkCHFDQCDRBG@OHSQDR@CCHSHNMMDKR!MMNS@SHNMRL@SGkL@SHPTDR

#@KBTKDQTMhFD $H@FQ @LLDCD,DWHR )MCD

WCDRBNMBDOSR

)MCD

WCDRENMBSHNMR

)MCD

WCDRDWSDMRHNMRanalyse-Rb"DJH

Présentation et Philosophie

Présentation de R

0GHKNRNOGHDCD2

0QkRDMS@SHNMCD23STCHN

WEBIN -RCe chapitre est é voqué dans le webin-R #01 (premier contact avec R & RStudio) sur9

NT4TAD

Présentation de R

Rest unlangage orientév

ers letr aitement dedonnées etl' analyse statistiquedériv é dulangage S. Ilest Ck

KHAQD1, publié sous licence GNU GPL

xTSHKHR@SHNMCDRprésente plusieurs a vantages {Bx DRS TMKNFHBHDK LTKSHOK@SDENQLDPTH ENMBSHNMMD@TRRH AHDMRTQ CDRRXSjLDR Linux,Mac OSX ou

Windows;

{Bx {Bx

DRSTMKNFHBHDKFQ@STHS

{Bx

DRS TMKNFHBHDK SQjROTHRR@MS CNMSKDR ENMBSHNMM@KHSkRCD A@RDODTU DMS lSQDkSDMCTDR gKx @HCD CDOKTRHDTQRLHKKHDQRCx

DWSDMRHNMR

{Bx DRS TMKNFHBHDK CNMSKD CkUDKNOODLDMS DRSSQjR @BSHEDS CNMSK@ BNLLTM@TSkCxTSHKHR@SDTQR MDBDRRDCDRx kK@QFHQ {KDR ONRRHAHKHSkRCD L@MHOTK@SHNMCD CNMMkDRRNTR Rsont engénér al largementsupérieures àBDKKDRCDR@TSQDRKNFHBHDKRTRTDKRCx @M@KXRDRS@SHRSHPTD {Bx

UDBRmark

down2, ilest de venu trèsaisé deproduire desr apports automatisésdans divers1.0

VVVFMTNQFOGHKNRNOGXEQDD

RVEQGSLK

uu format (W ord,PDF,HTML, ...) {Rest deplus utilisédans tousles secteursscientiifiques, ycompris dansle domainedes analyses Cx {KD KNFHBHDKK@ CNBTLDMS@SHNMCD QkEkQDMBDDS KDROQHMBHO@KDR QDRRNTQBDRRNMS DM@MFK@HR )KDRS SNTSDENHRO@QE@HSDLDMSONRRHAKDCxTSHKHRDQRsans spécialement maîtriser cette langue {HK M xDWHRSD O@RDMBNQD CxHMSDQE@BDFQ @OGHPTD ONTQRéquivalente àcelle d' autres logicielscomme SPSSouModalisa.Rfonctionne àl' aide deRBQHOSR CDR ODSHSROQNFQ @LLDR kCHSkRDS DWkBTSkR@T ETQDS gLDRTQD CDKx @M@KXRD DSRD Q@OOQNBGDQ@HS C@U@MS@FD CDSASdans sonutilisation (mais UDB TMDRXMS@W D DSTMD OGHKNRNOGHDSQjR CHEEkQDMSDR#D ONHMSPTH ODTS@OO@Q @nSQD BNLLDTM FQNR G@MCHB@ORx @UjQD @OQjRTM SDLORCx @OOQDMSHRR@FD lSQDTM LNCDCxTSHKHR@SHNM CxTMDFQ @MCDRNTOKDRRD {BNLLDRs' apparente davantage àun langagede programmation qu'à unlogiciel proprementCHS K@BNTQAD Cx @OOQDMSHRR@FD ODTSlSQD TMODT ^Q @HCDa MNS@LLDMSONTQ BDTWM x@X@MS I@L@HROQNFQ @LLk@TO@Q@U@MS)K DRSg MNSDQPTD KDCk UDKNOODLDMS @TSNTQCD Ra étéparticulièrement actifces dernièresannées. On SQNTU DQ@ CjRKNQR @TINTQCxGTHCD MNLAQDTRDRD WSDMRHNMR ODQLDSS@MSCD RD^ E@BHKHSDQ K@UHD a @TPTNSHCHDM

BDPTHM

xkS@HSO@RUQ@HLDMSDMBNQDKDB@RHKX@@MRPhilosophie de R Quelques pointsparticuliers dansle fonctionnementde Rpeuv ent parfoisdérouter lesutilisateurs G@AHSTkRgCx @TSQDRKNFHBHDKR {3NTRR, engénér al, onne voit pasdirectement lesdonnées surlesquelles ontr availle NMMD CHRONRD O@RDM ODQL@MDMBDCxTMD UTDCDR CNMMkDRRNTR ENQLDCD S@AKD@T3, commesous Modalisa ouSPSS . Cecipeut êtredéroutant audébut, maison serend vitecompte qu' on n'a pasADRNHMCDU

@UDBK@OKTO@QSCDRKNFHBHDKRNMQkkBGHQ@@UDBTM~BGHDQCDCNMMkDRNTUDQSgK@ENHRRNTRRchaque ifichierde donnéescorrespondr

a àun objetdifférent chargéen mémoire,permettant CD L@MHOTKDQSQjR E@BHKDLDMSOKTRHDTQR NAIDSRg K@ENHR O@QD

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