[PDF] Lhistogramme L'histogramme dans R. La





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26 avr. 2019 R topics documented: histogram . ... By default both a regular and an irregular histogram using a data-dependent.



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25 jui 2021 · I am trying to plot a theoretical function y = f(x) of my making over a background of a published PDF histogram to try to get them to match 



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How to Make a Histogram in Base R: 6 Steps With Examples

Learn how to create a histogram with basic R using the hist() function In 6 simple steps (with examples) you can make a basic R histogram for exploratory 



[PDF] Lhistogramme

Par défaut: 1) intervalles de même longueur; 2) règle de Sturges; 3) fréquences en ordonnée breaks: règle "Sturges" "Scott" ou "FD" Autres valeurs possibles: 

  • How to create histogram using R?

    A probability density function (PDF) is the continuous version of the histogram with densities (you can see this by imagining infinitesimal small bin widths); it specifies how the probability density is distributed over the range of values that a random variable can take.
  • What is PDF in histogram?

    R creates histogram using hist() function. This function takes a vector as an input and uses some more parameters to plot histograms.
  • What is the command for histogram in R studio?

    histogram and a PDF is that a histogram involves discrete data (individual bins or classes), whereas a PDF involves continuous data (a smooth curve). represents the probability that variable x lies in the given range, and f(x) is the probability density function (PDF).

L'histogramme

Outil important de statistique descriptive.

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

L'histogramme

Outil important de statistique descriptive.

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

L'histogramme

Outil important de statistique descriptive.

[b0,b1],(b1,b2],...,...,(bk-1,bk],b0: point d"ancrage

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

L'histogramme

Outil important de statistique descriptive.

[b0,b1],(b1,b2],...,...,(bk-1,bk],b0: point d"ancrage

Paramètre de lissage

:h=bj-bj-1

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

L'histogramme

Outil important de statistique descriptive.

[b0,b1],(b1,b2],...,...,(bk-1,bk],b0: point d"ancrage

Paramètre de lissage

:h=bj-bj-1 nj= #{xi?(bj-1,bj]} f(x) =?F(bj+1)-?F(bj) h h =nj nh, x?(bj,bj+1].

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

L'histogramme

Outil important de statistique descriptive.

[b0,b1],(b1,b2],...,...,(bk-1,bk],b0: point d"ancrage

Paramètre de lissage

:h=bj-bj-1 nj= #{xi?(bj-1,bj]} f(x) =?F(bj+1)-?F(bj) h h =nj nh, x?(bj,bj+1].

Aire sous l"histogramme=?

jn j nh×h= 1

J.-C. Mass

´eUniversit´e Laval

L'histogramme dans R

La fonctionhist

hist(x, breaks = "Sturges", freq = NULL, probability = !freq, include.lowest = TRUE, right = TRUE, density = NULL, angle = 45, col = NULL, border = NULL, main = paste("Histogram of" , xname), xlim = range(breaks), ylim = NULL, xlab = xname, ylab, axes = TRUE, plot =

TRUE, labels = FALSE, nclass = NULL, ...)

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

L'histogramme dans R

La fonctionhist

hist(x, breaks = "Sturges", freq = NULL, probability = !freq, include.lowest = TRUE, right = TRUE, density = NULL, angle = 45, col = NULL, border = NULL, main = paste("Histogram of" , xname), xlim = range(breaks), ylim = NULL, xlab = xname, ylab, axes = TRUE, plot =

TRUE, labels = FALSE, nclass = NULL, ...)

Par défaut: 1) intervalles de même longueur; 2) règle de Sturges; 3) fréquences en ordonnée.

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

L'histogramme dans R

La fonctionhist

hist(x, breaks = "Sturges", freq = NULL, probability = !freq, include.lowest = TRUE, right = TRUE, density = NULL, angle = 45, col = NULL, border = NULL, main = paste("Histogram of" , xname), xlim = range(breaks), ylim = NULL, xlab = xname, ylab, axes = TRUE, plot =

TRUE, labels = FALSE, nclass = NULL, ...)

Par défaut: 1) intervalles de même longueur; 2) règle de Sturges; 3) fréquences en ordonnée. breaks: règle "Sturges", "Scott" ou "FD". Autres valeurs possibles: n. d'intervalles voulu ( succès non garanti ), le vecteur des bornes des intervalles ( garanti

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

L'histogramme dans R

La fonctionhist

hist(x, breaks = "Sturges", freq = NULL, probability = !freq, include.lowest = TRUE, right = TRUE, density = NULL, angle = 45, col = NULL, border = NULL, main = paste("Histogram of" , xname), xlim = range(breaks), ylim = NULL, xlab = xname, ylab, axes = TRUE, plot =

TRUE, labels = FALSE, nclass = NULL, ...)

Par défaut: 1) intervalles de même longueur; 2) règle de Sturges; 3) fréquences en ordonnée. breaks: règle "Sturges", "Scott" ou "FD". Autres valeurs possibles: n. d'intervalles voulu ( succès non garanti ), le vecteur des bornes des intervalles ( garanti

Les argumentsfreq=FALSEouprobability=TRUE

produisent un véritable estimateur de densité.

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

L'histogramme dans R

Au lieu d'un graphique, la commande

> hist(x,plot = FALSE) produit une liste à 7 composantes

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

L'histogramme dans R

Au lieu d'un graphique, la commande

> hist(x,plot = FALSE) produit une liste à 7 composantes

Les composantes les plus importantes sont:

$breaks # les bornes des intervalles $counts # les fréquences de chacun des intervalles $density # les valeurs des?f(bj) $mids # les points milieux des intervalles

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

L'histogramme dans R

Au lieu d'un graphique, la commande

> hist(x,plot = FALSE) produit une liste à 7 composantes

Les composantes les plus importantes sont:

$breaks # les bornes des intervalles $counts # les fréquences de chacun des intervalles $density # les valeurs des?f(bj) $mids # les points milieux des intervalles On peut aussi construire un histogramme à partir de la fonctiontruehistdu packageMASS. Celle-ci produit par défaut un véritable estimateur de densité.

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

L'histogramme dans R

Au lieu d'un graphique, la commande

> hist(x,plot = FALSE) produit une liste à 7 composantes

Les composantes les plus importantes sont:

$breaks # les bornes des intervalles $counts # les fréquences de chacun des intervalles $density # les valeurs des?f(bj) $mids # les points milieux des intervalles On peut aussi construire un histogramme à partir de la fonctiontruehistdu packageMASS. Celle-ci produit par défaut un véritable estimateur de densité. truehistignore la règle de Sturges, mais propose celles de Scott et Freedman-Diaconis. Arguments: nbins(n. d'intervalles) eth(paramètre de lissage).

J.-C. Mass

´eUniversit´e Laval

Effet du paramètre de lissage

Jeuswissmon.dat#tableau à 4 var., 100 lignes

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Effet du paramètre de lissage

Jeuswissmon.dat#tableau à 4 var., 100 lignes

> x = read.table("swissmon.dat")[,1] #100observations de la variable V1#V1 largeur en mm de la marge d"un billet contrefait

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Effet du paramètre de lissage

Jeuswissmon.dat#tableau à 4 var., 100 lignes

> x = read.table("swissmon.dat")[,1] #100observations de la variable V1#V1 largeur en mm de la marge d"un billet contrefait

> par(mfrow=c(1,3)) #3 graphiques sur 1 ligne

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Effet du paramètre de lissage

Jeuswissmon.dat#tableau à 4 var., 100 lignes

> x = read.table("swissmon.dat")[,1] #100observations de la variable V1#V1 largeur en mm de la marge d"un billet contrefait

> par(mfrow=c(1,3)) #3 graphiques sur 1 ligne > hist(x,breaks=28,xlab="Largeur en > hist(x,breaks=12,xlab="Largeur en > hist(x,breaks=6,xlab="Largeur en

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Effet du paramètre de lissage

Jeuswissmon.dat#tableau à 4 var., 100 lignes

> x = read.table("swissmon.dat")[,1] #100observations de la variable V1#V1 largeur en mm de la marge d"un billet contrefait

> par(mfrow=c(1,3)) #3 graphiques sur 1 ligne > hist(x,breaks=28,xlab="Largeur en > hist(x,breaks=12,xlab="Largeur en > hist(x,breaks=6,xlab="Largeur en Différents lots de billets contrefaits=?multimodalité

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Effet du paramètre de lissage

Jeuswissmon.dat#tableau à 4 var., 100 lignes

> x = read.table("swissmon.dat")[,1] #100observations de la variable V1#V1 largeur en mm de la marge d"un billet contrefait

> par(mfrow=c(1,3)) #3 graphiques sur 1 ligne > hist(x,breaks=28,xlab="Largeur en > hist(x,breaks=12,xlab="Largeur en > hist(x,breaks=6,xlab="Largeur en Différents lots de billets contrefaits=?multimodalité

Premier histogramme: multimodal (sous-lissage);

deuxième: 2 modes; troisième: 1 mode (surlissage).

J.-C. Mass

´eUniversit´e Laval

swissmon.dat: 28, 12 et 6 classes

Largeur en mm

Densit'e

8 10 12

0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5

Largeur en mm

Densit'e

7 9 11 13

0.00 0.05 0.10 0.15 0.20 0.25 0.30 0.35

Largeur en mm

Densit'e

7 9 11 13

0.00 0.05 0.10 0.15 0.20 0.25 0.30 0.35

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Détermination du n. de classes

Seule façon garantie d'obtenir le n. d'intervalles désiré:breaks = vecteur des bornes des intervalles

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Détermination du n. de classes

Seule façon garantie d'obtenir le n. d'intervalles désiré:breaks = vecteur des bornes des intervalles

nombre de classes de la méthode de Sturges> nclass.Sturges(x) #x ci-dessus[1] 8

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Détermination du n. de classes

Seule façon garantie d'obtenir le n. d'intervalles désiré:breaks = vecteur des bornes des intervalles

nombre de classes de la méthode de Sturges> nclass.Sturges(x) #x ci-dessus[1] 8 nombre de classes de la méthode de Scott > nclass.scott(x) [1] 7

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Détermination du n. de classes

Seule façon garantie d'obtenir le n. d'intervalles désiré:breaks = vecteur des bornes des intervalles

nombre de classes de la méthode de Sturges> nclass.Sturges(x) #x ci-dessus[1] 8 nombre de classes de la méthode de Scott > nclass.scott(x) [1] 7 nombre de classes de la méthode de

Friedman-Diaconis

> nclass.FD(x) [1] 9

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Détermination du n. de classes

Seule façon garantie d'obtenir le n. d'intervalles désiré:breaks = vecteur des bornes des intervalles

nombre de classes de la méthode de Sturges> nclass.Sturges(x) #x ci-dessus[1] 8 nombre de classes de la méthode de Scott > nclass.scott(x) [1] 7 nombre de classes de la méthode de

Friedman-Diaconis

> nclass.FD(x) [1] 9 La règle de Sturges est déconseillée lorsquen >200.

J.-C. Mass

´eUniversit´e Laval

Défaillance de la règle de Sturges

> set.seed(129); x = rgamma(1000, 1.75)

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Défaillance de la règle de Sturges

> set.seed(129); x = rgamma(1000, 1.75) Les n. de classes des 3 règles sont:11 (Sturges), 25 (Scott), 36 (Freedman-Diaconis)

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Défaillance de la règle de Sturges

> set.seed(129); x = rgamma(1000, 1.75) Les n. de classes des 3 règles sont:11 (Sturges), 25 (Scott), 36 (Freedman-Diaconis) > par(mfrow=c(1,3) #3 histogrammes en parallèle

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Choix du point d'ancrage

Loi mélange:0.5?N(0,1) + 0.5?N(3,1)

X=?

N(0,1)avec proba.0.5

N(3,1)avec proba.0.5

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Choix du point d'ancrage

Loi mélange:0.5?N(0,1) + 0.5?N(3,1)

X=?

N(0,1)avec proba.0.5

N(3,1)avec proba.0.5

densité deX f(x) = 0.5×φ(x) + 0.5×φ(x-3),-∞< x <∞ oùφ(x) = exp(-x2/2)/⎷

2π.

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Choix du point d'ancrage

Loi mélange:0.5?N(0,1) + 0.5?N(3,1)

X=?

N(0,1)avec proba.0.5

N(3,1)avec proba.0.5

densité deX f(x) = 0.5×φ(x) + 0.5×φ(x-3),-∞< x <∞ oùφ(x) = exp(-x2/2)/⎷

2π.

Graphique

> a = seq(-4,6,.02) > plot(a,0.5*dnorm(a)+0.5*dnorm(a,3,1),ylab="densité", main = "0.5*N(0,1)+0.5*N(3,)",col="red",type="l")

J.-C. Mass

´eUniversit´e Laval

Graphe de la densité du mélange

-4 -2 0 2 4 6

00.050.001.0 51.0 02.0

0.5*N(0,1)+0.5*N(3,1)

x

étisned

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Choix du point d'ancrage (suite)

Simulation de 50 obs. de0.5?N(0,1) + 0.5?N(3,1)

> y = numeric(50); set.seed(399) > for (i in 1:50){if (runif(1)<=0.5) y[i] = rnorm(1) else y[i] = rnorm(1,mean=3,sd=1)}

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Choix du point d'ancrage (suite)

Simulation de 50 obs. de0.5?N(0,1) + 0.5?N(3,1)

> y = numeric(50); set.seed(399) > for (i in 1:50){if (runif(1)<=0.5) y[i] = rnorm(1) else y[i] = rnorm(1,mean=3,sd=1)} > range(y) # donne le min et le max [1] -2.082688 4.920506

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Choix du point d'ancrage (suite)

Simulation de 50 obs. de0.5?N(0,1) + 0.5?N(3,1)

> y = numeric(50); set.seed(399) > for (i in 1:50){if (runif(1)<=0.5) y[i] = rnorm(1) else y[i] = rnorm(1,mean=3,sd=1)} > range(y) # donne le min et le max [1] -2.082688 4.920506

Posons

> a = c(-2.1, -1.1, -0.1, 0.9, 1.9, 2.9, 3.9, 4.9,5.9) # point d'ancrage -2.1, 8 intervalles de longueur 1

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Choix du point d'ancrage (suite)

Simulation de 50 obs. de0.5?N(0,1) + 0.5?N(3,1)

> y = numeric(50); set.seed(399) > for (i in 1:50){if (runif(1)<=0.5) y[i] = rnorm(1) else y[i] = rnorm(1,mean=3,sd=1)} > range(y) # donne le min et le max [1] -2.082688 4.920506

Posons

> a = c(-2.1, -1.1, -0.1, 0.9, 1.9, 2.9, 3.9, 4.9,5.9) # point d'ancrage -2.1, 8 intervalles de longueur 1 par(mfrow=c(3,2)) #3 lignes de 2 graphiques chacune

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Choix du point d'ancrage (suite)

Simulation de 50 obs. de0.5?N(0,1) + 0.5?N(3,1)

> y = numeric(50); set.seed(399) > for (i in 1:50){if (runif(1)<=0.5) y[i] = rnorm(1) else y[i] = rnorm(1,mean=3,sd=1)} > range(y) # donne le min et le max [1] -2.082688 4.920506

Posons

> a = c(-2.1, -1.1, -0.1, 0.9, 1.9, 2.9, 3.9, 4.9,5.9) # point d'ancrage -2.1, 8 intervalles de longueur 1 par(mfrow=c(3,2)) #3 lignes de 2 graphiques chacune > for (i in seq(0,-0.9,by=.15) main="",col="blue") # 6 histogrammes

J.-C. Mass

´eUniversit´e Laval

Choix du point d'ancrage (suite)

y e'tisneD -2 0 2 4 6 00.0 y e'tisneD -2 0 2 4 6 00.0 y e'tisneD -2 0 2 4 00.0 y e'tisneD -2 0 2 4 00.0 y e'tisneD -2 0 2 4 00.0 y e'tisneD -2 0 2 4 00.0

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Polygone de fréquence

> taux = read.table("cdrate.dat")[,1]#69 taux d"intérêt > ht=hist(taux,xlim=c(7.3,8.9),ylim=c(0,1.4),xlab="taux", ylab="densité",probability=T,main="Polygone de fréquence",col="orange")

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Polygone de fréquence

> taux = read.table("cdrate.dat")[,1]#69 taux d"intérêt > ht=hist(taux,xlim=c(7.3,8.9),ylim=c(0,1.4),xlab="taux", ylab="densité",probability=T,main="Polygone de fréquence",col="orange") > ht$mids #7.5 7.7 7.9 8.1 8.3 8.5 8.7 (7 points milieux)

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Polygone de fréquence

> taux = read.table("cdrate.dat")[,1]#69 taux d"intérêt > ht=hist(taux,xlim=c(7.3,8.9),ylim=c(0,1.4),xlab="taux", ylab="densité",probability=T,main="Polygone de fréquence",col="orange") > ht$mids #7.5 7.7 7.9 8.1 8.3 8.5 8.7 (7 points milieux) Nous allons superposer le polygone à l'histogramme. > par(new=T) #commande la superposition

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Polygone de fréquence

> taux = read.table("cdrate.dat")[,1]#69 taux d"intérêt > ht=hist(taux,xlim=c(7.3,8.9),ylim=c(0,1.4),xlab="taux", ylab="densité",probability=T,main="Polygone de fréquence",col="orange") > ht$mids #7.5 7.7 7.9 8.1 8.3 8.5 8.7 (7 points milieux) Nous allons superposer le polygone à l'histogramme. > par(new=T) #commande la superposition > a = c(7.3,ht$mids,8.9) #9 points milieux > b = c(0,ht$density,0) #9 ordonnées > plot(a,b,type="l",xlim=c(7.3,8.9),ylim=c(0,1.4), col="blue"); abline(h=0)

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Polygone de fréquence

> taux = read.table("cdrate.dat")[,1]#69 taux d"intérêt > ht=hist(taux,xlim=c(7.3,8.9),ylim=c(0,1.4),xlab="taux", ylab="densité",probability=T,main="Polygone de fréquence",col="orange") > ht$mids #7.5 7.7 7.9 8.1 8.3 8.5 8.7 (7 points milieux) Nous allons superposer le polygone à l'histogramme. > par(new=T) #commande la superposition > a = c(7.3,ht$mids,8.9) #9 points milieux > b = c(0,ht$density,0) #9 ordonnées > plot(a,b,type="l",xlim=c(7.3,8.9),ylim=c(0,1.4), col="blue"); abline(h=0) Pour une superposition parfaite, il est essentiel d'inclure les mêmesxlim, ylim dans les 2 commandes.

J.-C. Mass

´eUniversit´e Laval

Polygone de fréquence (suite)

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

Polygone de fréquence (suite)

La fonctionfreq.polyfreq.poly function(x, br=NULL ) {if(missing(br)) br = hist(x, plot = F)$breaksfr = hist(x, , br, plot = F)$countsh=br[2]-br[1]; n = length(fr)centres =-seq(br[1]-h/2"h,n+2);freq = c(0, fr, 0)plot(centres, freq, ylab = "fréquence",axes=F, xlab =deparse(substitute(x)), xlim =range(centres),ylim=c(0,max(fr)+3))axis(1,at=centres, pos=0); axis(2,at=range(c(0,fr)))text(centres,freq+2,freq)title(main="Polygone de fréquence",cex=1.5)polygon(centres, freq, density=15,angle=45,col = 2) }

J.-C. Mass´eUniversit´e Laval

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