[PDF] Les Acides Aminés - Biochimie structurale





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Les Acides Aminés

Ils sont constitués de molécules élémentaires: les Acides Aminés (AA). 1 • Ionisation de groupement COOH et NH2 des AA. Les fonctions COOH et NH2 sont ...





Propriétés et méthodes détudes des acides aminés

Plan du cours. A. Propriétés physiques. 1. Solubilité. 2. Coloration et absorption. 3. Pouvoir rotatoire. 4. Ionisation des acides amines. B. Les propriétés 



Chapitre 5. Spectrométrie de masse pour lanalyse des protéines

L'hydrolyse totale des protéines conduit aux acides aminés qui les caractérisent. La source d'ionisation : elle consiste à vaporiser les molécules et à les ...



LES ACIDES AMINES

L'ionisation varie avec le pH : les acides aminés existent en solution Au cours de la réaction



Université Bordeaux – Victor Segalen U.F.R DES SCIENCES

http://www.cours-medecine.info/biochimie/acides-amines.html. [42] Rabier D. La chromatographie des acides aminés. Laboratoire de biochimie médicale. Hôpital 



Biochimie Les acides aminés en classe inversée

• Télécharger le sommaire du cours et les fiches de cours à compléter Problématique 4 : « Quelles conséquences liées à l'ionisation de la chaîne latérale des.



Historique Applications À lorigine la spectrométrie de masse servait

un caractère acide donc une source de proton pour l'ionisation des peptides peptides sur quelques dizaines d'acides aminés. Couplé avec des techniques ...



proprietes physicochimiques des aminoacides

proton la base du milieu bloque l'ionisation du groupement amine. L'acide aminé se trouve sous forme d'anion. Une base est un composé susceptible de capter un 



[PDF] Les Acides Aminés

Un « Acide Aminé » est par définition un acide avec une fonction amine: Il existe 20 AA courants faisant Ionisation de groupement COOH et NH2 des AA



[PDF] Les acides aminés : Propriétés Physico-chimiques - UNF3S

UE1 : Biomolécules (1) : Acides aminés et protéines Page 2 Propriétés Physico-chimiques des acides aminés: plan 1 Ionisation effet du pH



[PDF] LES ACIDES AMINES

L'ionisation varie avec le pH : les acides aminés existent en Au cours de la réaction une molécule d'eau est éliminée Il s'agit donc



[PDF] Chapitre 3: ACIDES AMINES

Les structures et les propriétés chimiques des acides aminés sont cruciales Comme nous l'avons vu dans le cours le pHi correspond au pH particulier où 



[PDF] Propriétés et méthodes détudes des acides aminés

Plan du cours A Propriétés physiques 1 Solubilité 2 Coloration et absorption 3 Pouvoir rotatoire 4 Ionisation des acides amines



[PDF] BTS Diététique - LES ACIDES AMINÉS - Fortrainjobs

Ionisation de groupement COOH et NH2 des AA Un AA s'ionise en solution en fonction du pH et peut exister sous l'une des trois formes suivantes : Le pKA 



[PDF] Cours des Protéines - Faculté des Sciences de Rabat

III- Propriétés physiques des acides aminés A- Ionisation des groupes acides et basiques des acides aminés 1- Notion d'acide- base



[PDF] Chapitre II : Protéines - Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie

tyroïde Chapitre II : Acides aminés peptides et protéines -Les AA comportent des fonctions amine et acide carboxylique susceptibles de s'ioniser en



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Parmi ces deux acides aminés lequel est en configuration L ? Ionisation des acides aminés COURS 5: L'AVENIR DE LA BIOLOGIE 17/08/2020



[PDF] Les Acides Aminés

constitués de molécules élémentaires: les Acides Aminés (AA) 1 Formule Générale Un « Acide Aminé » est Ionisation de groupement COOH et NH2 des AA



[PDF] 1 La chilarité 2 Ionisation des aa 3 Techniques détude des acides

1) Donner la définition d'une molécule chirale 2) Représenter en projection de Fisher la L et la D-Alanine 3) Définir le pouvoir rotatoire d'un acide aminé 



[PDF] Les Acides Aminés - Biochimie structurale - 2ATP

24 oct 2020 · Parmi ces deux acides aminés lequel est en configuration L ? Ionisation des acides aminés COURS 5: L'AVENIR DE LA BIOLOGIE



[PDF] LES ACIDES AMINES

*Ionisation: Les acides aminés contiennent un groupement carboxyle acide et un groupement aminé basique En solution ces deux groupements existent sous deux 



Acides aminés Ionisation ???? ??????? ???????? (exercices)

Les trois acides aminés sont déposés sur la colonne à pH = 20 puis au cours de la chromatographie le pH est amené progressivement à 70 Quels sont les 



[PDF] ACIDES AMINES

Les structures et les propriétés chimiques des acides aminés sont cruciales Comme nous l'avons vu dans le cours le pHi correspond au pH particulier où 



[PDF] Propriétés et méthodes détudes des acides aminés

Ionisation des acides amines 20 acides aminés possèdent un carbone asymétrique sauf la glycine Réaction utilisée au cours de la chromatographie



[PDF] Acides aminés et protéines - Cours UAC

A la fin du cours l'apprenant doit être capable de : ? Identifier un acide aminé standard; ? définir un peptide et une protéine ; ? Décrire les bases 



[PDF] chapitre 3 les acides aminèspdf

On peut répartir les acides aminés selon la nature de leur chaine latérale: Écrire les formes d'ionisation prédominantes de la Lysine aux pH suivants 



[PDF] Acides aminés - SOCLES 3

L'état d'ionisation d'un acide aminé dépend de son environnement particulièrement s'il se trouve incorporé dans une protéine (d'où l'existence d'une plage de 

  • Comment se fait l'ionisation des acides aminés ?

    Formes ioniques des acides aminés
    La charge positive de la fonction -NH3+ rend l'ionisation de la fonction -COOH plus probable, c'est à dire qu'elle abaisse le pKa de cette dernière (pKC). Le pKa normal pour un groupement carboxylique est d'environ 4,5 alors qu'il est de l'ordre de 2 pour celui d'un acide aminé.

  • Quels sont les acides aminés ionisables ?

    Acides aminés polaires ionisables : Acide Aspartique (Asp), Acide Glutamique (Glu), Histidine (His), Lysine (Lys), Arginine (Arg).

  • Qu'est-ce qu'un acide aminé PDF ?

    Un acide aminé est une molécule simple qui comprend une fonction acide (–COOH) et une fonction amine (–NH2). aminés. Connaitre les méthodes de séparation des acides aminés. - Les acides aminés sont des molécules solubles dans l'eau donc dans les liquides physiologiques par leurs diverses propriétés.
  • A pH=pKa on aura 50/50. Pour avoir le pHi d'un acide aminé, il faudra donc que les charges du a-NH2, a-COOH et de la chaine latérale s'annulent. Pour calculer ce pHi on fera la moyenne des deux pKa «<entourant » la forme ayant une charge globale nulle.

17/08/2020

Structure

17/08/20203

17/08/2020

Groupement Carboxyle : acide

Groupement Amine : basique

5

Notion de chiralité

Parmi ces deux acides aminés, lequel est en configuration L ? A 6

Acide Aminé L

TOUS LES ACIDES AMINÉS PROTÉINOGÈNES (sauf la glycine) SONT DANS LA

CONFIGURATION L

Notion de chiralité

7

Notion de chiralité

AAàchainelatérale

polaire: -Nonchargée:Ser,

Thr,Asn,Gln,Cys

-Chargée: His

Classification

Rappels sur la classification :

9

Classification

Méthionine

Tyrosine

Cystéine

A B C D F

Histidine

A B C D F

Glycine

Méthionine

Tyrosine

Glutamine

Cystéine

11

Propriétés

(2)

Précurseur de la sérotonine

(3) -Neurotransmetteur excitateur dans le SNC --Intermédiaire dans la synthèse et la dégradation de nombreux AA -Précurseur du GABA (neurotransmetteur inhibiteur) À quels acides aminés appartiennent ces propriétés ? AC 12 (2)

Précurseur de la sérotonine

(3) -Neurotransmetteur excitateur dans le SNC -Intermédiaire dans la synthèse et la dégradation de nombreux AA -Précurseur du GABA (neurotransmetteur inhibiteur)

Glutamate Proline

Propriétés

À quels acides aminés appartiennent ces propriétés ?

Rôles des AA

AA

Rôle

métabolique

Médiateurs

chimiques et neurotransmetteurs 14

Relations structure/fonction

Donneur de groupement -CH3méthylation

Groupement OH:

Phosphorylation/Déphosphorylation

activation/inactivation des enzymes

Concernant ce peptide :

NH2-Val-Arg-Leu-Asp-COOH

Données :

15 A) À pH=1, la charge nette de ce tétra peptide est de +2. B)À pH=1, la charge nette de ce tétra peptide est de +3. D)À pH=13, la charge nette de ce tétra peptide est de -2. QCM 1: CONCERNANT LE PEPTIDE CI-DESSUS, QUELLES SONT LA OU

LES PROPOSITIONS EXACTES?

17/08/2020

A) À pH=1, la charge nette de ce tétra peptide est de +2. B)À pH=1, la charge nette de ce tétra peptide est de +3. D)À pH=13, la charge nette de ce tétra peptide est de -2. QCM 1 : CONCERNANT LE PEPTIDE CI-DESSUS, QUELLES SONT LA OU

LES PROPOSITIONS EXACTES?

17/08/2020

Prérequis à connaitre :

oClassification des AA en fonction de leur chaine latérale (acide, basique, neutre) oPour les AA aux extrémités : oNH2ionisé positivement si pH < pKn oCOOHionisé négativement si pH > pKc oPour les AA polaire non-neutre du peptide : oNH2ionisé positivement si pH pKr Remarque : pour les AA au sein du peptide, on ne prend pas en compte leur fonction amine et carboxyle qui sont engagées dans les liaisons peptidiques. 18 oÉtape 1 : représenter le peptide pour reconnaitre les fonctions qui entrent en jeu.

NH2-Val-Arg-Leu-Asp-COOH

oConserver en fonction les données qui nous intéressent: 19

NH2COOH

Étape 2 : construire une échelle des pH pour chaque AA 20

Arginine

Leucine

Aspartate

pKn= 9,6

Charge = 0

pKr= 12,5

Charge = 0

Charge = 0

pKr= 3,9pKc= 2,2

Charge = -1Charge = -2

Étape 3 : Faire la sommede la charge de chaque AA du peptide au pH demandé pour avoir la charge nette du peptide. 21

Ionisation des acides aminés

Etape 3 : Faire la sommede la charge de chaque AA du peptide au pH demandé pour avoir la charge nette du peptide.

IONISATION DES PEPTIDES

Valine

Leucine

Aspartate

pKn= 9,6

Charge = +1

pKr= 12,5

Charge = +1

Charge = 0

pKr= 3,9pKc= 2,2

Charge = 0Charge = -2

Étape 3 : Faire la sommede la charge de chaque AA du peptide au pH demandé pour avoir la charge nette du peptide.

À pH=1

oSomme de la charge des AA = 1+1+0+0 oCharge nette du tétra peptide à (pH=1)= 2

À pH=13

oSomme de la charge des AA = 0+0+0-2 oCharge nette du tétra peptide à (pH=13)= -2

Ionisation des peptides

-Possèdent une fonction carbonyle -Soit une cétone = cétose-Soit un aldéhyde = aldose -+ au moins 2 groupements alcool

FORMULE = (CH2O)n

Les glucides

26

Fonctions

15/09/202027

Énergétique:oxydation glucose

Structurel:cellulose (plante) + GAG et protéoglycanes (articulation)

MONOSACCHARIDES:1 unité ayant une fonction

carbonyle et au moins 2 OH

OLIGOSACCHARIDES:entre 2 et 20 unités

POLYSACCHARIDES:> 20 unités

Classification des glucides

15/09/202028

15/09/2020

Série D ou L ?

La plupart des oses naturels appartiennent à la série D À ne pas confondre avec les acides aminés qui sont dans la configuration L (sauf la glycine)

À savoir !

15/09/2020

ALDOSES

Épimèresdu D-glucose

Les oses, en solution aqueuse, sont plus stables sous forme cyclique -ALDOSE ĺPYRANOSE -CÉTOSEĺFURANOSE carbone anomérique

Phénomène de cyclisation réversible

31

Cyclisation des oses

Si le groupement -OH esten basalpha.

Si le groupement -OH est en hautbêta.

Anomèresalpha ou béta

Forme béta

Ensolutionaqueuselesosesvontpasserdeleur

demutarotation.

1-Ouverturetransitoireducycle

2-Reformationfonctioncarbonyle

3-Recyclisation

Pourlesaldosesetlescétoses!

33

Mutarotation des oses

Lafonctioncarbonyledespeutfacilementpour

donnerunefonction.

Réaction de Benedict

donnerunefonctioncarboxyle. diabétiques.

Réaction de Benedict

36

Les différentes modifications

Les plus importantes à

connaître. 37

Les disaccharides

38
osidique,GlcȽ(1ĺ2)ȾFru.

PASunsucreréducteur

Les disaccharides

39

Les disaccharides

40
-principale forme de stockage de glucose chez les plantes -mélange de 2 homopolysaccharides : AMYLOSEet AMYLOPECTINE. -Amidon=amylose(20%)+amylopectine(80%) chaîne linéairede plusieurs milliers de résidus de D-glucose liés par des liaisons osidiques Ƚ(1ĺ4)

Ƚ(1ĺ6)

GLYCOGÈNE :

LES GLYCOSAMINOGLYCANES = GAG

disaccharidiques -manière covalente à des protéines pour former des protéoglycanes:

PROTÉOGLYCANES: GAGs+ protéine

Attention: hyaluronate

protéines de manière covalente. Il peut exister "pur» (humeur vitrée, liquide synovial) ou comme composant de la MEC. 41

Les hétéropolysaccharides

Professeur Larcher

17/08/202044

17/08/202045

17/08/202046

Appelé aussi astrobiologiepar les Anglo-saxons

Existe-t-il une vie différente?

Existe-t-

carbone)?

17/08/202047

formaldéhydes

Halley.

oxygènemoléculaire?

Murchison

primitive.

17/08/202048

17/08/202049

17/08/202050

Programme SETI

Searchfor ExtraTerrestialIntelligence

17/08/202051

17/08/202052

Dans le système solaire

Restons près de nous

17/08/202053

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Titan, satellite de Saturne

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Mars, le mythe des Martiens

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