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2014 - Domaine

Action 3 - Indice Composition

Premières propositions pour un

indice de composition du phytoplancton, basé sur les résultats de cytométrie en flux

Action 3 - Indice Composition - Livrable 2

Rapport final, mars 2016

Luis Felipe ARTIGAS (ULCO), Morgane DIDRY (CNRS), Emilie

PREVOST (CNRS), Simon BONATO (ULCO-CNRS), Alain

Lefebvre (IFREMER)

AUTEURS

Luis Felipe ARTIGAS,

Emilie PREVOST,

Morgane DIDRY,

Simon BONATO,

Alain LEFEBVRE,

CORRESPONDANTS

Onema : Marie Claude XIMENES

Ifremer : Catherine BELIN

AUTRES CONTRIBUTEURS

Vincent CORNILLE,

Eric LECUYER

Vincent DUQUESNE,

Camille BLONDEL,

Fernando GOMEZ,

Luis LAMPERT,

Fabrice LIZON,

Droits d'usage :

Niveau géographique :

Couverture géographique :

Niveau de lecture :

RESUME

MOTS CLES (THEMATIQUE ET GEOGRAPHIQUE)

TITLE

ABSTRACT

KEY WORDS (THEMATIC AND GEOGRAPHICAL AREA)

SYNTHESE POUR L'ACTION OPERATIONNELLE

Réseau Stations Points Période/fréquence Méthodes Rapport

RESOMAR

(DYPHYRAD) Radiale Wimereux- Slack

9 points (R0

à R4),

transect de la côte vers le large (5,25 milles nautiques) Février-juillet 2012 :

12 radiales

complètes + 2 radiales partielles (3

à 7 points)

Phytoplancton

-Abondance : comptages manuels -Abondance/classes de taille : cytométrie en flux -Pigments : HPLC et fluorescence spectrale Livrables

AII et 2

pour données

2011 et

2012 ;

Livrable

AIII pour

données 2013

Suivi saisonnier et

inter-annuel du point R1 Mai-novembre 2011

Février-juillet 2012

Mars-décembre 2013

Février-juin 2014

Campagne

DYPHYMA

(projet

INTERREG

DYMAPHY) Campagnes

océanographiques en Manche

Orientale, entre

France et

Angleterre, le long

des côtes entre

Antifer et Cap Gris-

Nez en France, et

entre Dover et

Eastbourne en

Angleterre 3 " legs » de

2 à 4 jours

d'enregistre- ments en continu 20-21 avril 2012

27-30 avril 2012

31 mai-4 juin 2012 Hydrologie

-Enregistrements du Pocket ferrybox : données en continu de T et S de l'AOA

Phytoplancton

situ prélèvements -Abondance : comptages par microscopie -Pigments : HPLC

Livrables

AII et 2

Nous avons choisi de nous focaliser sur trois niveaux d'analyses dans le but de déterminer les assemblages phytoplanctoniques mis en évidence par la cytométrie en flux automatisée : - Les données issues de la campagne DYPHYMA, au cours des trois legs - Le suivi saisonnier inter-annuel du point R1 entre 2011 et 2014 - Les données de suivi de la radiale Wimereux-Slack au cours de l'année 2012 seulement. Les données 2013 et 2014 issues des réseaux de surveillance SRN et SOMLIT seront

analysées dans le courant de l'année 2015, et serviront pour affiner les pistes qui permettront

de proposer un indice composition phytoplanctonique

Les différentes méthodes, traditionnelles et innovantes, utilisées dans ce suivi, leur apport

quant au suivi spatio-temporel du phytoplancton, ainsi que leur pouvoir de discrimination

taxonomique, ont déjà été décrits dans le tableau du livrable AII et sont brièvement repris

dans la partie Matériel et Méthodes.

En Manche Orientale, différents groupes ont été détectés par cytométrie en flux automatisée

de type CytoSense depuis 2011 lors des surveillances régulières, comme pendant les campagnes océanographiques DYPHYMA. Ces groupes ont été définis à partir des premiers travaux menés au moyen d'analyses cytométriques dans la zone (Guiselin 2010 ; Guiselin ii) nanoplancton (3 µm - 10 µm) : de un à trois groupes cellules assimilées en Manche

Orientale à l'espèce

1

Rapportfinal

Février2015

LuisFelipeARTIGAS

MorganeDIDRY

EmiliePREVOST

SimonBONATO

AlainLefebvre

Action3IndiceComposition.Livrable2

1

Tabledesmatières

4)La a)Paramètreshydrologiques

2)Dynamiquesaisonnière

e)Analysesfluorimétriques 2 pourlesNMDSréaliséessur

4.Représentationsde

3

Listedesfigures

unecaméracoupléeau communauté communauté communauté2, 4 groupes groupes groupes 5 6

I) Contextedel'action

représenterune des biologiques, composition.

Méditerranée,maispas

quitiennentcomptedu hauterésolution systèmesd'analysedesrésultats. 7 l'évaluationdeseauxmarinesdeLaManche etdelaMerduNordàtraverslecompartiment quiendécoulent (Artigasetal.,2014).

II) Descriptiondel'action

flux(traditionnelleou biodiversitégénétique. laconstructiond'unindicede

DCSMM.

butd'avancer compositioncompletdu laparticipation lespartenairesduprojetDYMAPHY. 8

III) Matérieletméthodes

1) Aired'échantillonnagerégulierenMancheOrientaleetMerduNord

troisprogrammesouréseaux(Figure1): Ͳ Leréseaudesurveillancedelaqualitédeseauxmarinescôtières(SuiviRégionalDes avectrois etcinqstationsenBaisdeSomme Ͳ LeServiced'ObservationLittoraleSOMLITduCNRSͲINSU,avecunestationcôtièreet unestationauSuddeBoulognesurMer

Ͳ LetransectcôteͲlargeprochedu

etduprojetDYMAPHY. prélèvements 9 radialesde3à7points.

Slacken2012,etlepointR1

2) CampagnesocéanographiquescôtièresDYPHYMAIetII

DYMAPHY

10 desprofilsdesonde

StationsDPM54àDPM80(Leg3):entrele31

maietle4juin2012 (27/04/12,28/04/12,29/04/12) 11

04/06/12)

3) Laméthodedefluorescencespectrale

LeFluoroprobe(bbeͲMoldaenke

phytoplanctonique.

LeFluoroprobe

Ͳ les"alguesvertes»(Chlorobiontes),

Ͳ les"alguesbleuͲvertes»(Cyanobactériesàphycocyaninemajoritaire), Ͳ les"alguesbrunes»(Straménopiles(dontlesBacillaryophyceaeouDiatomées), 12

Haptobiontes,Dinobiontes)

Ͳ legroupemixte"cryptophytes»(Cryptobiontes,RhodobiontesetCyanobactériesà phycoérythrinemajoritaire).

L'AOA(bbeͲMoldaenke

Afindefaciliter

).Une

4) Lacytométrieenfluxautomatiséedetype"PulseͲshapeͲrecording

FlowCytometry»

LecytomètreenfluxCytosense(CytobuoyBV

,PaysͲBas)estuncytomètreenflux

2010),permettantd'analyserunegamme

lalumière, pigmentphotosynthétique. delarencontreentre 13 unecaméra coupléeaucytomètreenflux i) picoplancton(0Ͳ3µm):cyanobactériesdutypeSynechococcus,picoͲeucaryotes, (hautniveauenfluorescence rouge), ii) nanoplancton(3µm-10µm):deunàtroisgroupesdePhaeocystisglobosa iii) microplancton(>20µm):unàdeuxgroupes,legroupecompositedes rougeassociée).

Pourunedescriptionplusprécisede

n°AII(Artigasetal.,2014).

5) L'approchechémotaxonomiqueparHPLC

phytoplanctoniquesetdelachlorophyllea. 14

été

àlabiomassetotale.Il

2014).

6) Extractiondelachlorophylleapourmesuresfluorimétriqueset

comptagephytoplanctonique

WimereuxͲSlack).

Une aété

HCL(Lorenzen(1966)).

15

IV) Résultats

1) DistributionduphytoplanctonͲCampagnesDYPHYMA

a) Paramètreshydrologiques (stationsDPM)pourlestroislegs,doncmoins dessaléesapparaissentaulargedes (1991)ontdéfinicommele"fleuve côtier».

Onobserveleplusfortgradientde

l'Angleterre.

2delacampagneDYPHYMA2012(ODV)

16 b) Chlorophylleatotale exprimés(i)enµg.l Ͳ1

équivalentsdechlorophylleaµg.l

Ͳ1 pourlessondesFluoroprobeetCTDet(iii)en10 8 .ml Ͳ1 (detouteslescellules). des 17

0510152025303540

DPM1 DPM2 DPM3 DPM4 DPM5 DPM6 DPM7 DPM8 DPM9 DPM10 DPM11 DPM12 DPM13 DPM14 DPM15 DPM34 DPM35 DPM36 DPM37 DPM38 DPM39 DPM40 DPM41 DPM42 DPM43 DPM44 DPM45 DPM46 DPM47 DPM48 DPM49 DPM50 DPM51 DPM52 DPM53 DPM54 DPM55 DPM56 DPM57 DPM58 DPM59 DPM60 DPM61 DPM62 DPM63 DPM64 DPM65 DPM66 DPM67 DPM68 DPM69 DPM70 DPM71 DPM72 DPM73 DPM74 DPM75 DPM76 DPM77 DPM78 DPM79 DPM80

20/4 21/4 27/4 28/4 29/4 31/5 1/6 2/6 4/6

Leg1 Leg2 Leg3

_Cytometer

Traversée

Traversée

Traversée

Traversée

Traversée

TraverséeCôtes

françaisesCôtes anglaisesCôtes anglaises Côtesanglaises 18 c) Analysescytométriquesencontinu (Hussonetal.,2010,Bonato etal.,2015). corrélation (19%)etde communauté

2,CM3=communauté3

19 dudétroit.Lacommunauté1 du aussiauniveaud'Eastbourne,où

Synechococcussp(35%).Enfin,laCM1est

20 communauté

CM3correspondd'unepartauxeauxdela

16%). 21
communauté1,CM2=communauté2,

CM3=communauté3

22
d) Analysestaxonomiques dénombré51 temps, l'analysemultidimensionnelle chaquestationDPMde répétitiveunefonctiondestress situerles distancesentreeux. plutôtqu'àleurétendue(dans dimensionréduit. grâce 23
aulogicielPAST.

Cettefigurenousfournitégalementune

les comptagesréalisésparleLOGͲULCO. del'IFREMERetduLOGͲULCO. estde

0,1332

Côtes

anglaises

Côtes

française

Traversée

Leg3 Leg2 Leg1 24
estde0,1779 moisdemaiͲ

Ͳdébutjuin,cequisemblelogiqueauvu

Enannexe3figurentlesdendrogrammes.

diagrammedesNMDS. e) AnalysesfluorimétriquessurlesDPMdelacampagneDYPHYMA

Côtes

anglaises

Côtes

française

Traversée

Leg3 Leg2 Leg1 25
quotesdbs_dbs15.pdfusesText_21

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