[PDF] Laurent ORUS 1- Quelle est la charge é





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De la mesure de la longueur dun fragment dADN …

génétique et de la biologie moléculaire. James D. Watson et Francis H. Crick y décrivent la structure de la molécule d'Acide. DésoxyriboNucléique (ADN).



GÉNÉTIQUE MOLÉCULAIRE

La biologie moléculaire n'est pas à proprement parler une discipline au sens où on Les ADN linéaires de faible taille (< 50 kb) peuvent être séparés par ...



Quelques ordres de grandeur autour de lADN Longueur moyenne d

la longueur de la totalité de l'ADN des cellules d'un être humain. - le taux de compaction lorsqu'une molécule d'ADN est condensée.



ELECTROPHORESE SUR GEL DAGAROSE 2. Le matériel d

La vitesse de migration d'une molécule d'ADN est fonction de deux paramètres: sa taille et la concentration en agarose du gel mais le voltage et la force 



Conductivité de lADN: études à léchelle de la molécule unique

Oct 27 2006 3.2 Mesures de forces sur molécule unique d'ADN et d'ARN . ... que la taille des pores se feront piéger et devront se libérer par reptation.



Exercice 1

3) indiquer les extrémités 5' et 3' de la molécule A Ce marqueur de taille est un mélange équimolaire de fragments d'ADN de tailles connues.



Principe de lamplification par PCR

séquence recherchée puis une élongation grâce à l'action d'une ADN ( entre 40 et 65°C



Etude à léchelle de la molécule unique des changements

Oct 20 2016 présents sur l'ADN et de paramètres physico-chimiques de la solution environnante. Thèse soutenue le 16/10/2015 devant le jury composé de : M.



Comparer des dimensions

= 8 Un cheveu est 8 fois plus grand qu'un globule rouge. c) La taille d'un cheveu et d'une molécule d'ADN. Données : Taille d' 



Laurent ORUS

1- Quelle est la charge électrique d'une molécule d'ADN ? Varie-t-elle avec sa taille ? 2-Quels sont les paramètres qui influencent la distance de migration 



Structure et organisation de l'ADN (Acide désoxyribonucléique)

La molécule d’ADN est composée d’un brin matriciel (ou brin anti-codant) dirige par définition de 3’ vers 5’ et servant comme son nom l’indique de matrice a l’ARN- polymérase ainsi que d’un brin codant dirige par définition de 5’ vers 3’ et ayant une



Structure et organisation de l'ADN (Acide désoxyribonucléique)

de ases d’ADN soit une longueur d’environ 18 à 2m ontenue dans un noyau de 6?m de diamètre alors que la taille du chromosome est de 02 à 2?m Les chromosomes résultent de e fait d’une ompa tion maximum des filaments inter phasiques L’ADN hromosomique étalé est environ 8000 fois plus long que le chromosome lui-même



TD1: Hybridation moléculaire - INRA

d’équilibre Calcul du Tm (formule empirique) Tm = 815 + 166 log [Na+] + 041 ( [G+C]) - 600/n - 061 ( formamide) pour n>100 30 < (G+C)



Introduction: Le code génétique - Université de Montréal

du transfert de l’information génétique d’une cellule mère vers les cellules filles Chaque cellule contient tout le code génétique Cependant les gènes sont exprimés différemment d’une cellule à l’autre L’ADN humain est de longueur d’environ 3 milliards de bases

Quelle est la structure de l'ADN?

L'ADN appartient à la famille chimique des acides nucléiques ; C'est un grand polymère défini par une séquence linéaire d'unités simples répétées. II/ Structure de l'ADN : II.A. Structure primaire : L’ADN soit l’acide désoxyribonucléique est un polymère contenant des chaines de monomère appelé Nucléotide formé de :

Qu'est-ce que la molécule d'ADN ?

La molécule d'ADN est une longue double hélice spiralée qui ressemble à un escalier en colimaçon. Dans ce document, deux brins, composés de molécules de sucre (désoxyribose) et de phosphate, sont reliés par des paires de quatre molécules appelées bases, qui forment les marches de l'escalier.

Comment sont formées les molécules d'ADN ?

Les molécules d'ADN des cellules vivantes sont formées de deux brins antiparallèles enroulés l'un autour de l'autre pour former une double hélice. On dit que l'ADN est bicaténaire, ou double brin. Chacun de ces brins est un polymère appelé polynucléotide.

Quelle est la taille d'un nucléotide ?

Bien que chaque nucléotide soit très petit, les molécules d'ADN peuvent en contenir des millions et atteindre des dimensions significatives. Par exemple, le chromosome 1 humain, qui est le plus grand des chromosomes humains, contient environ 220 millions de paires de bases 3 pour une longueur linéaire de plus de 7 cm .

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Donnez-nous votre avis sur ce scénario en remplissant le questionnaire suivant :

Enquête élèves Enquête professeur

Merci

EXPLOITATION D'UNE ELECTROPHORESE EN GEL

D'AGAROSE

Travaux des Actions Académiques Mutualisées

Niveau Première STL Biotechnologies

Thème du

programme Séparer des biomolécules par électrophorèse sur gel d'agarose

Situations

pédagogiques

Séance de TP-TD.

Liens internet

Compétences

B2i Domaine 1 : s'approprier un environnement informatique de travail Domaine 3 : créer, produire, traiter , exploiter des données

Domaine 4 : s'informer et se documenter

Matériels

TICE

Un poste PC par binôme

Une connexion internet

Logiciel de traitement d'images et tableur

Mots clés

Electrophorèse

ADN

Agarose

Approfondir

Page 2

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Activité n° 1 : Séparation de fragments d'ADN par électrophorèse en gel d'agarose ͻ Exploiter un document en ligne pour s'approprier le principe de la séparation de molécules d'ADN par électrophorèse.

Objectifs

ͻ 30 minutes

Durée

conseillée

Consignes

Questions

dans un gel d'agarose ?

3-En vous aidant de l'animation flash proposĠe, expliquer le principe de la séparation de

Utiliser les informations disponibles à l'adresse suivante : Vous y trouverez toutes les réponses aux questions ci-dessous

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Téléchargement de Mesurim

Télécharger la photo numérique du gel

Activité n° 2 : Mesure des distances de migration des différents fragments d'ADN à l'aide du logiciel Mesurim ͻ Utiliser le logiciel libre "Mesurim" pour mesurer les distances de migrations des différents fragments d'ADN qui ont migré dans le gel d'agarose

Objectifs

ͻ 30 minutes

Durée

conseillée

Consignes

Questions

1-Yuel est l'intĠrġt de faire migrer des fragments d'ADN de taille connue?

2-Comment ǀarie la distance de migration d'un fragment d'ADN en fonction de sa taille ?

3-Yuelle peut ġtre l'influence du pourcentage d'agarose sur la distance de migration d'un

fragment d'ADN ? Utiliser l'annexe 1 pour réaliser les mesures à partir de la photo numérique du gel.

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Activité n° 3 : Calcul de la taille des différents fragments d'ADN

à l'aide d'un tableur

ͻ Utiliser un tableur type"Excel" pour calculer la taille des différents fragments d'ADN qui ont migré dans le gel d'agarose

Objectifs

ͻ 30 minutes

Durée

conseillée

Consignes

Questions

de migration dans le gel d'agarose?

2-Quels sont les critères à prendre en compte pour choisir le type de marqueur ?

Utiliser l'annexe 2 pour construire un fichier permettant de calculer la taille des fragments d'ADN

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ANNEXE 1

UTILISATION DU LOGICIEL MESURIM POUR MESURER LA DISTANCE DE MIGRATION G(6 GH))(5(176 )5$*0(176 G·$G1 48H 217 0H*5( G$16 I( *(I

Le gel de départ

Marqueurs

Gel à 0,8% en agarose

Marqueurs de taille :

2000 pb

1500 pb

1000 pb

750 pb

500 pb

Il faut disposer de la version numérique du gel

Traitement du gel dans Mesurim

9 Lancer le logiciel

9 Ouvrir le fichier de la photo du gel : fichier_ouvrir

9 Sélectionner : Echelle à définir

9 Suivre les indications

9 (QUHJLVPUHU OH QRP GH O·pŃOHOOH GMQV OH ILŃOLHU

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9 Mesurer les distances de migration des différentes bandes :

6pOHŃPLRQQHU O·LŃ{QH © Mesure »

Régler la couleur

Choisir une mesure courante

Activer aussi les mesures multiples

Avec la souris, tracer un trait entre le puits de dépôt et la première bande

La valeur de la mesure apparaît

Cliquer alors sur " Envoyer »

Recommencer en prenant la mesure de la distance de migration des différentes bandes.

9 Récupération du tableau des valeurs de mesure :

sélectionner outil_tableau

Avec le menu édition, il est possible

de copier le contenu du tableau pour récupérer les valeurs dans un tableur

Retour à l'activité 2

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ANNEXE 2

FRQVPUXŃPLRQ G·XQ ILŃOLHU SRXU ŃMOŃXOHU OM PMLOOH GHV IUMJPHQPV G·$G1

9 Exploitation des marqueurs de taille

Dans la fenêtre tableau de " Mesurim »,

Il est possible de copier les valeurs du tableau.

Ouvrir un fichier Excel et coller

les valeurs du tableau Mesurim.

Saisir la valeur de taille de chaque

fragment entrant dans la composition du marqueur utilisé

Calculer dans une autre colonne le

LOG de la taille pour chaque bande

Dans notre exemple, on remarque

que le fragment le plus petit (50

SN Q·HVP SMV YLVLNOH VXU OH JHO

Création du graphique d=f(LOG(PM))

Calcul de la pente :

FMOŃXO GH O·RUGRQQpH j O·RULJLQH :

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9 Utilisation des marqueurs pour déterminer la taille des autres

fragments

Réaliser la mesure des distances de

migration des différentes bandes avec Mesurim. Reporter les valeurs.

Utiliser les valeurs calculées de la

SHQPH HP GH O·RUGRQQpH j O·RULJLQH GH

OM ŃRXUNH G·pPMORQQMJH SRXU ŃMOŃuler le LOG(PM) de la bande

Calculer alors la taille

Retour à l'activité 3

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