De la mesure de la longueur dun fragment dADN …
génétique et de la biologie moléculaire. James D. Watson et Francis H. Crick y décrivent la structure de la molécule d'Acide. DésoxyriboNucléique (ADN).
GÉNÉTIQUE MOLÉCULAIRE
La biologie moléculaire n'est pas à proprement parler une discipline au sens où on Les ADN linéaires de faible taille (< 50 kb) peuvent être séparés par ...
Quelques ordres de grandeur autour de lADN Longueur moyenne d
la longueur de la totalité de l'ADN des cellules d'un être humain. - le taux de compaction lorsqu'une molécule d'ADN est condensée.
ELECTROPHORESE SUR GEL DAGAROSE 2. Le matériel d
La vitesse de migration d'une molécule d'ADN est fonction de deux paramètres: sa taille et la concentration en agarose du gel mais le voltage et la force
Conductivité de lADN: études à léchelle de la molécule unique
Oct 27 2006 3.2 Mesures de forces sur molécule unique d'ADN et d'ARN . ... que la taille des pores se feront piéger et devront se libérer par reptation.
Exercice 1
3) indiquer les extrémités 5' et 3' de la molécule A Ce marqueur de taille est un mélange équimolaire de fragments d'ADN de tailles connues.
Principe de lamplification par PCR
séquence recherchée puis une élongation grâce à l'action d'une ADN ( entre 40 et 65°C
Etude à léchelle de la molécule unique des changements
Oct 20 2016 présents sur l'ADN et de paramètres physico-chimiques de la solution environnante. Thèse soutenue le 16/10/2015 devant le jury composé de : M.
Comparer des dimensions
= 8 Un cheveu est 8 fois plus grand qu'un globule rouge. c) La taille d'un cheveu et d'une molécule d'ADN. Données : Taille d'
Laurent ORUS
1- Quelle est la charge électrique d'une molécule d'ADN ? Varie-t-elle avec sa taille ? 2-Quels sont les paramètres qui influencent la distance de migration
Structure et organisation de l'ADN (Acide désoxyribonucléique)
La molécule d’ADN est composée d’un brin matriciel (ou brin anti-codant) dirige par définition de 3’ vers 5’ et servant comme son nom l’indique de matrice a l’ARN- polymérase ainsi que d’un brin codant dirige par définition de 5’ vers 3’ et ayant une
Structure et organisation de l'ADN (Acide désoxyribonucléique)
de ases d’ADN soit une longueur d’environ 18 à 2m ontenue dans un noyau de 6?m de diamètre alors que la taille du chromosome est de 02 à 2?m Les chromosomes résultent de e fait d’une ompa tion maximum des filaments inter phasiques L’ADN hromosomique étalé est environ 8000 fois plus long que le chromosome lui-même
TD1: Hybridation moléculaire - INRA
d’équilibre Calcul du Tm (formule empirique) Tm = 815 + 166 log [Na+] + 041 ( [G+C]) - 600/n - 061 ( formamide) pour n>100 30 < (G+C)
Introduction: Le code génétique - Université de Montréal
du transfert de l’information génétique d’une cellule mère vers les cellules filles Chaque cellule contient tout le code génétique Cependant les gènes sont exprimés différemment d’une cellule à l’autre L’ADN humain est de longueur d’environ 3 milliards de bases
Quelle est la structure de l'ADN?
L'ADN appartient à la famille chimique des acides nucléiques ; C'est un grand polymère défini par une séquence linéaire d'unités simples répétées. II/ Structure de l'ADN : II.A. Structure primaire : L’ADN soit l’acide désoxyribonucléique est un polymère contenant des chaines de monomère appelé Nucléotide formé de :
Qu'est-ce que la molécule d'ADN ?
La molécule d'ADN est une longue double hélice spiralée qui ressemble à un escalier en colimaçon. Dans ce document, deux brins, composés de molécules de sucre (désoxyribose) et de phosphate, sont reliés par des paires de quatre molécules appelées bases, qui forment les marches de l'escalier.
Comment sont formées les molécules d'ADN ?
Les molécules d'ADN des cellules vivantes sont formées de deux brins antiparallèles enroulés l'un autour de l'autre pour former une double hélice. On dit que l'ADN est bicaténaire, ou double brin. Chacun de ces brins est un polymère appelé polynucléotide.
Quelle est la taille d'un nucléotide ?
Bien que chaque nucléotide soit très petit, les molécules d'ADN peuvent en contenir des millions et atteindre des dimensions significatives. Par exemple, le chromosome 1 humain, qui est le plus grand des chromosomes humains, contient environ 220 millions de paires de bases 3 pour une longueur linéaire de plus de 7 cm .
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Donnez-nous votre avis sur ce scénario en remplissant le questionnaire suivant :Enquête élèves Enquête professeur
MerciEXPLOITATION D'UNE ELECTROPHORESE EN GEL
D'AGAROSE
Travaux des Actions Académiques Mutualisées
Niveau Première STL Biotechnologies
Thème du
programme Séparer des biomolécules par électrophorèse sur gel d'agaroseSituations
pédagogiquesSéance de TP-TD.
Liens internetCompétences
B2i Domaine 1 : s'approprier un environnement informatique de travail Domaine 3 : créer, produire, traiter , exploiter des donnéesDomaine 4 : s'informer et se documenter
Matériels
TICEUn poste PC par binôme
Une connexion internet
Logiciel de traitement d'images et tableur
Mots clés
Electrophorèse
ADNAgarose
Approfondir
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Laurent ORUS
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Activité n° 1 : Séparation de fragments d'ADN par électrophorèse en gel d'agarose ͻ Exploiter un document en ligne pour s'approprier le principe de la séparation de molécules d'ADN par électrophorèse.Objectifs
ͻ 30 minutes
Durée
conseilléeConsignes
Questions
dans un gel d'agarose ?3-En vous aidant de l'animation flash proposĠe, expliquer le principe de la séparation de
Utiliser les informations disponibles à l'adresse suivante : Vous y trouverez toutes les réponses aux questions ci-dessousPage 3
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Téléchargement de Mesurim
Télécharger la photo numérique du gel
Activité n° 2 : Mesure des distances de migration des différents fragments d'ADN à l'aide du logiciel Mesurim ͻ Utiliser le logiciel libre "Mesurim" pour mesurer les distances de migrations des différents fragments d'ADN qui ont migré dans le gel d'agaroseObjectifs
ͻ 30 minutes
Durée
conseilléeConsignes
Questions
1-Yuel est l'intĠrġt de faire migrer des fragments d'ADN de taille connue?
2-Comment ǀarie la distance de migration d'un fragment d'ADN en fonction de sa taille ?
3-Yuelle peut ġtre l'influence du pourcentage d'agarose sur la distance de migration d'un
fragment d'ADN ? Utiliser l'annexe 1 pour réaliser les mesures à partir de la photo numérique du gel.Page 4
Laurent ORUS
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Activité n° 3 : Calcul de la taille des différents fragments d'ADNà l'aide d'un tableur
ͻ Utiliser un tableur type"Excel" pour calculer la taille des différents fragments d'ADN qui ont migré dans le gel d'agaroseObjectifs
ͻ 30 minutes
Durée
conseilléeConsignes
Questions
de migration dans le gel d'agarose?2-Quels sont les critères à prendre en compte pour choisir le type de marqueur ?
Utiliser l'annexe 2 pour construire un fichier permettant de calculer la taille des fragments d'ADNPage 5
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ANNEXE 1
UTILISATION DU LOGICIEL MESURIM POUR MESURER LA DISTANCE DE MIGRATION G(6 GH))(5(176 )5$*0(176 G·$G1 48H 217 0H*5( G$16 I( *(ILe gel de départ
Marqueurs
Gel à 0,8% en agarose
Marqueurs de taille :
2000 pb
1500 pb
1000 pb
750 pb
500 pb
Il faut disposer de la version numérique du gelTraitement du gel dans Mesurim
9 Lancer le logiciel
9 Ouvrir le fichier de la photo du gel : fichier_ouvrir
9 Sélectionner : Echelle à définir
9 Suivre les indications
9 (QUHJLVPUHU OH QRP GH O·pŃOHOOH GMQV OH ILŃOLHU
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9 Mesurer les distances de migration des différentes bandes :
6pOHŃPLRQQHU O·LŃ{QH © Mesure »
Régler la couleur
Choisir une mesure courante
Activer aussi les mesures multiples
Avec la souris, tracer un trait entre le puits de dépôt et la première bandeLa valeur de la mesure apparaît
Cliquer alors sur " Envoyer »
Recommencer en prenant la mesure de la distance de migration des différentes bandes.9 Récupération du tableau des valeurs de mesure :
sélectionner outil_tableauAvec le menu édition, il est possible
de copier le contenu du tableau pour récupérer les valeurs dans un tableurRetour à l'activité 2
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ANNEXE 2
FRQVPUXŃPLRQ G·XQ ILŃOLHU SRXU ŃMOŃXOHU OM PMLOOH GHV IUMJPHQPV G·$G19 Exploitation des marqueurs de taille
Dans la fenêtre tableau de " Mesurim »,
Il est possible de copier les valeurs du tableau.
Ouvrir un fichier Excel et coller
les valeurs du tableau Mesurim.Saisir la valeur de taille de chaque
fragment entrant dans la composition du marqueur utiliséCalculer dans une autre colonne le
LOG de la taille pour chaque bande
Dans notre exemple, on remarque
que le fragment le plus petit (50SN Q·HVP SMV YLVLNOH VXU OH JHO
Création du graphique d=f(LOG(PM))
Calcul de la pente :
FMOŃXO GH O·RUGRQQpH j O·RULJLQH :
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9 Utilisation des marqueurs pour déterminer la taille des autres
fragmentsRéaliser la mesure des distances de
migration des différentes bandes avec Mesurim. Reporter les valeurs.Utiliser les valeurs calculées de la
SHQPH HP GH O·RUGRQQpH j O·RULJLQH GH
OM ŃRXUNH G·pPMORQQMJH SRXU ŃMOŃuler le LOG(PM) de la bandeCalculer alors la taille
Retour à l'activité 3
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