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BURKINA FASO

UNITE-PROGRES-JUSTICE

(MESRSI)

UNIVERSITE NAZI BONI (UNB)

ECOLE DOCTORALE

Sciences Naturelles et Agronomie

THESE

Présentée pour titre de

DOCTEUR Unique)

Doctorat en Gestion Intégrée des Ressources Naturelles

Option : Système de Production Animale

Spécialité : Génétique et Reproduction THEME

IMPACTS DE

GENETIQUE DANS LA REGION DES CASCADES AU BURKINA FASO. Présentée et soutenue publiquement le 06 Novembre 2018 à 10 heures

Par Seydou BLAGNA

Devant le jury composé de :

- Président : Adrien Marie Gaston BELEM, Professeur titulaire, Université Nazi Boni (Bobo-Dioulasso)

- Directeur de thèse : Hamidou BOLY, Professeur titulaire et Agrégé, Université Nazi Boni (Bobo-

Dioulasso)

- Rapporteur : Mamoudou H. DICKO, Professeur titulaire, Université Ouaga 1 Professeur Joseph Ki -Zerbo (Ouagadougou) - Rapporteur : Hassan Bismarck NACRO, Professeur titulaire, Université Nazi Boni (Bobo-Dioulasso) i

SOMMAIRE

SOMMAIRE ............................................................................................................................... i

DEDICACE ................................................................................................................................ ii

REMERCIEMENTS ................................................................................................................. iii

SIGLES ET ABREVIATIONS ................................................................................................. vi

LISTE DES TABLEAUX ....................................................................................................... viii

LISTE DES FIGURES .............................................................................................................. ix

LISTE DES PHOTOS ................................................................................................................ x

RESUME ................................................................................................................................... xi

ABSTRACT ............................................................................................................................ xiii

INTRODUCTION GENERALE ................................................................................................ 1

PREMIERE PARTIE : ETUDES BIBLIOGRAPHIQUES ......................................................... 4

CHAPITRE

.................... 5

CHAPITRE 2 : ANATOMIE ET PHYSIOLOGIE D

VACHE .................................................................................................................................... 25

CHAPITRE

.................................... 40

DEUXIEME PARTIE

: ETUDE EXPERIMENTALE .............................................................. 62

CHAPITRE 4

.................................................... 63

BOVINE PAR

SYNCHRONISATION DES CHALEURS AU CRESTAR

ND EN MILIEU ELEVEUR ....... 73

CHAPITRE 6

DEXAMETHASONE ET/OU A LA PROSTAGLANDINE F DEUX ALPHA CHEZ LES

VACHES INSEMINEES ......................................................................................................... 87

CHAPITRE 7 : IMPACT DES CROISEMENTS SUR LA SURVIE, PERFORMANCE PONDERALE, ADAPTATION ET MATURITE SEXUELLE DES VEAUX METIS F

1 .... 96

CONCLUSION GENERALE ................................................................................................ 111

PERSPECTIVES .................................................................................................................... 112

RECOMMANDATIONS ....................................................................................................... 112

REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES ............................................................................... 114

TABLES DES MATIERES ................................................................................................... 135

ANNEXES ............................................................................................................................. 142

ii

DEDICACE

Je voudrais dédier cette thèse, fruits des actions multiformes

A mes parents à Fobiri

et Zonsso Wani ZINA

éduqué et encouragé

A mes et frères

Pour leur amour fraternel et leur solidarité et une mention particulière à Sita

BLAGNA

et son mari Chonkatié Souleymane ZINA

Qui m toujours soutenu

A mes parents adoptifs à Bagassi

Feux Yirissan YE et Bakan TAMANI, pour leur amour et leurs bénédictions

Que leur Ame repose en paix

iii

REMERCIEMENTS

Au terme de ce travail, je voudrais remercier sincèrement les diverses contributions émanant ou re à bien les travaux, notamment : - Le Millenium Challenge Accout-Burkina Faso (MCA-BF) et plus particulièrement à son AD-10 s semences, du matériel roulant pour la conduite des travaux de recherche ; - Le Centre International de Recherche- Subhumide (CIRDES) qui a contribué matériellement et techniquement aux analyses hématologiques. Le Laboratoire Mixte International sur les Maladies à Vecteurs (LAMIVECT) de suivre les travaux de recherche. Le laboratoire des Systèmes l'Environnement (SyNAIE) pour le soutien logistique ayant facilitant la mobilité sur les sites s ; - es sincères remerciements à et l Développement Rural (IDR), à travers ses enseignants, donné les fondamentaux en zootechnie. Je remercie sincèrement les responsables administratifs et les enseignants de éployés dans la formation des ingénieurs et des docteurs en développement rural. Je traduis tout je continue de nouer une bonne collaboration ;

- Ce travail a été effectué sous la direction scientifique du Prof. Hamidou BOLY. Il a

toujours accepté sans malgré ses multiples occupations au Burkina Faso . Je lui exprime toute ma profonde reconnaissance ; - Mes particulières gratitudes vont au Prof. Adrien Marie Gaston BELEM et au Prof.

Bismarck Hassan NACRO

encouragements permanents. Ils ont forgé en moi une rigueur aussi bien au niveau scientifique que professionnel. Je les remercie également pour la placent en moi. En dehors de leurs apports scientifiques, je leur suis reconnaissant pour leurs qualités humaines. Mon profond respect et mes remerciements aux différents rapporteurs et à tous les membres du jury pour leur travail ention con ;

- Je voudrais également remercier très sincèrement le Prof. Youssouf Logténé MOPATE à

, ses conseils et iv ses encouragements. le Dr Fidèle Molélé MBAINDINGATOLOUM, le Dr Madjina TELLAH et le Dr Ardjoun Khalil DJALAL, tous enseignants à au

Tchad pour leurs temps et leur attention

appréciation des manuscrits de mes articles ; - Je réitère tous mes sincères remerciements au Dr POUSGA Salimata pour ses encouragements et ses conseils pratiques dans la rédaction du document final ; - Je saisis ici témoigner ma reconnaissance au Dr Jean OUEDRAOGO et à Monsieur Blami KOTE respectivement à INERA/Saria niversité de Ouahigouya pour leurs apports des données. Je vous dis merci ; - Je témoigne toute ma gratitude et mon respect à Monsieur Ousmane OUATTARA, binôme et collègu côtés et de partager avec lui ses nombreuses expérienc artificielle, de constat de gestation, de pathologie de la reproduction, de chirurgie, s et surtout dans le domaine de médecine de population ;

- Je reste sensible à la coopération de tous les collègues et agents du projet AD-10 (Dr

Hinkoti Stéphane TUINA, Clément YAMEOGO, Mme DRABO, Youssef OUEDRAOGO, Daouda OUEDRAOGO, Moussa DIALLO, Lucien BAYALA, Abdoul Kader MISSARE, Mme SANKARA, Mme IBRANGO) qui ont permis la réalisation de ce

travail pour leurs rôles dans la collecte des données. Je partage ces résultats avec eux et je leur

dis également grand merci ;

- Je garde un bon souvenir des éleveurs leaders et de leurs bergers et/ou bouviers de la région

des Cascades (Moussa DIALLO, Daouda OUEDRAOGO, Issa OUEDRAOGO, Mme OUATTARA/Monique KYELEM, El Adj Abdoulaye SANGARE, Ousmane SIDIBE, El Adj Salif KAFANDO, El Adj Oumar SOUNTOURA, Soïgou SIDIBE, Gnagalengan

TOU, Fatao OUEDRAOGO) pour

troupeaux, pour leurs importants rôles aussi bien dans la contention des animaux, mais aussi et surtout pour leur mémoire à retenir le évènements intervenus dans leurs troupeaux ; - A mes amis Dr Mamadou TRAORE, Dr Michel KERE, Dr Jérôme T. YAMEOGO, Dr Schemaiza BONZI, Dr Souleymane SANOGO, Dr Kalifa COULIBALY, Dr Albert KABORE, Dr Modou SERE, Dr Issaka SENOU, Dr P. Louis YAMEOGO, Dr Inoussa COMPAORE, Dr Boalidioa TANKOANO, Dr Boundia THIOMBIANO, Monsieur Dominique OUEDRAOGO, Monsieur Arnaud W. ZIDA, Monsieur Hilaire K. v KABORE, Monsieur Zézouma SANON, Monsieur Bassirou S. SANON, Monsieur Karim SAMA et Mademoiselle Ida O. BENAGABOU, je leur témoigne toute ma gratitude.

Je fais une mention très spéciale à :

Mes parents pour leur patience et leur compréhension de détermination et de dévouement ; Au Burkina Faso, pays des Hommes intègres pour les efforts nécessaires pour son développement.

A tous ceux, qui dans anonymat ont contribué discrètement de près ou de loin à

malheureusement être cités; loin vous rassure de ma profonde reconnaissance pour tous vos efforts déployés en vi

SIGLES ET ABREVIATIONS

ANOVA : Analysis Of Variance (Analyse de Variance) BNDT : Base Nationale de Données Topographiques

CG : Constat de Gestation

CIDR : Controlled Internal Drug Release

CIRDES : Centre International de Recherche-

Subhumide

CMAP : Centre national de Multiplication des Animaux Performants CRPA : Centre Régional de Promotion Agropastorale CRTA : Centre de Recherche sur les Trypanosomoses Animales

DGAT-DLR/MEF :

Développement Local et Régional

DGESS : Direction Générale des Etudes et Statistiques Sectorielles DRRA : Direction Régionale des Ressources Animales DRRAH : Direction Régionale des Ressources Animales et Halieutiques eCG : Equine Chorionic Gonadotropin ENA : EqL :

Equivalents lait

FAO : Food and Agriculture Organisation of the United Nations FSH : Follicule Stimulating Hormon GnRH : Gonadotrophin Releasing Hormon

IA : Insémination Artificielle

IM : Intra-musculaire

INSD : Institut National de la Statistique et de la Démographie

IFDC : Interational Fertilizer Development Center

INERA : Institut

INSTA :

IRED : Institut de Recherche en Elevage pour le Développement

LH : Luteinizing Hormon

MCA-BF : Millennium Challenge Accout-Burkina Faso

MRA : Ministère des Ressources Animales MRAH : Ministère des Ressources Animales et Halieutiques NEC vii

ONG : Organisation Non Gouvernementale

PAPSA :

PDEL/ZPO

: -urbaine de

Ouagadougou

PDRDP/BK

: Projet de Développement Rural Décentralisé et Participatif/Bazèga-Kadiogo PDRI : Projet de Développement Régionale Intégrée PGF

Į : Prostaglandine F deux alpha

PMSG : Pregnant Mare Serum Gonadotropin PNPDL : Programme National Pilote de Développement Laitier

PRID : Progesterone Intravaginal Device

PNPDL : Programme National Pilote de Développement Laitier PNUD : Programme des Nations Unies pour le Développement

PRID : Progesterone Intravaginal Device

PROCORDEL : Programme Concerté de Recherche-

RGPH :

SN. SOSUCO

: Nouvelle Société Sucrière de la Comoé

UF : Unité Fourragère

UI : Unité Internationale

UNCEIA : Union Nationale des Coopératives d'Elevage et d'Insémination Animale viii

LISTE DES TABLEAUX

Tableau I : Protocole d'insémination artificielle ...................................................................... 74

Tableau II : Taux de réussite suivant trois communes de la région des Cascades ................... 76

Cascades ................................................................................................................................... 80

............................................................... 89

paramètres retenus .................................................................................................................... 91

figure du veau et le taux de mortinatalité dystocique ............................................................... 91

Tableau VII : Gain moyen quotidien et variation entre sexe de la naissance à 24 mois ....... 101 Tableau VIII : Facteurs de variation du poids et de la taille des métis F

1 BA x ZP .............. 102

Tableau IX : Adaptation et comportement des métis F

1 BA x ZP ......................................... 103

Tableau X : Age, poids et taille des croisés F

1 BA x ZP à la puberté .................................... 103

Tableau XI : Caractéristiques des génisses au premier vêlage et des taurillons au stade

géniteur ................................................................................................................................... 104

ix

LISTE DES FIGURES

Figure 1

Constantinescu, 2007) .............................................................................................................. 25

Figure 2 : Ovaires à différents stades (Roche, 2003) ............................................................... 26

Figure 3

............... 27

Figure 4 : Ultra-structure de la corne utérine (Frandson et al., 2009) ...................................... 29

r de la vache (Barone, 2001) ............ 30

Figure 6 : Schéma des stades de développement folliculaire (Edson et al., 2009) .................. 32

Figure 7 : Dynamique folliculaire : groupes folliculaires et leur devenir (Hanzen et al.,

2003b) ....................................................................................................................................... 33

Figure 8 : Deux vagues folliculaire au cours du cycle chez la vache (Hanzen et al., 2003b) .. 35 Figure 9 : Mécanisme de régulation hormonale du cycle sexuel: dialogue cerveau-ovaire-

utérus (Mechekour, 2003) ........................................................................................................ 38

Figure 10 : Modifications de la concentration hormonale dans le plasma sanguin durant le ............................................................................................. 38 Figure 11 : Protocole de synchronisation des chaleurs à base de prostaglandine F

Į .............. 48

Figure 12 : Protocole de synchronisation associant GnRH et PGF

Į (Grimard et al., 2003) ... 49

Figure 13 : Protocole de synchronisation à base de CRESTAR

® (Grimard et al., 2003) ........ 50

Figure 14 : Protocole de synchronisation à base de la spirale vaginale (Maillard, 2002) ........ 51

Figure

................ 58 ......................................... 60

Figure 17

IGB-BNDT, 2002) .......... 63

-BNDT, 2002 ........... 64

Figure 19 : Pluviosité moyenne des dix (10) dernières années dans la région des Cascades .. 65

Figure 20 : Température moyenne en 2016 et 2017 dans la région des Cascades ................... 65

Figure 21 : Humidité moyenne relative de la région des Cascades de 2016 et 2017 ............... 66

Figure 22

.................................................................... 71

Figure 23 : Variation du taux de gestation suivant la NEC des vaches ................................... 76

Figure 24 : Taux de gestation suivant la race des vaches inséminées ...................................... 77

Figure 25 : Variation du taux de réussite selon les classes d'âge des vaches .......................... 78

Figure 26 : Effet du poids des vaches sur le taux de gestation ................................................. 78

Figure 27 : Taux de gestation suivant la parité des vaches ...................................................... 79

Figure 28 : Influence de la péripétie de la vache sur le taux de gestation ................................ 79

Figure 29 : Taux de progestérone en fonction du protocole pendant le vêlage après induction à

272 jours de gestation ............................................................................................................... 92

Figure 30 : Causes de mortalité des métis F

1 BA x ZP .......................................................... 100

Figure 31 : Fréquence des pathologies rencontrées chez les métis ........................................ 100

Figure 32

........................... 101 x

LISTE DES PHOTOS

Photo 1 : Vache zébu Peul soudanien en élevage traditionnel ................................................... 6

Photo 2 : Vache zébu Maure ...................................................................................................... 7

Photo 3 : Troupeau de vaches Azawak à la ferme expérimentale de Loumbila ........................ 8

Photo 4 : Vache Mbororo en élevage laitier à Bobo-Dioulasso ................................................. 9

Photo 5 : Vache de race Goudali .............................................................................................. 10

Photo 6 : Génisse Gir en élevage périurbain de Bobo-Dioulasso ............................................ 10

Photo 7 : Vache Girolando en élevage laitier à Ouagadougou ................................................ 11

Photo 8 : Troupeau Baoulé en système agro-pastoral à Gaoua ................................................ 12

Photo a en parc de nuit à Koflandé ...................................... 13

Photo 10 : Vache F

2 Brune des alpes x Azawak en production laitière ................................... 14

Photo 11 : Vache F

2 .......................................... 15

Photo 12 : Vache F

2 Montbéliarde x Goudali sur pâturage naturel .......................................... 16

Photo 13 : Vache F

1 Tarentaise x Montbéliarde en traite manuelle en élevage intensif .......... 16

Photo 14 : Vache F

1 Jersiaise x Borgou de race pure en élevage périurbain .......................... 17

xi

RESUME

impact insémination artificielle (IA) bovine, la technique évaluation des performances de croissance des métis ont été suivi dans la région des Cascades au Burkina Faso sur près de cinq (05) ans. accroître à long terme les faibles

performances de reproduction. Les données ont été analysées par le logiciel R version 3.2.0 et

le niveau de significativité de tous les tests a été fixé à 5%.

La synchronisation au moyen des

implants de progestagène combinés à la prostaglandine et à la PMSG indiquent des taux respectivement de 98,05 % et 48,88 %.

vêlages a diminué le poids des veaux à la naissance et le taux des vêlages assistés. Elle a aussi

permis un faible taux de morti-natalité pouvant être lié aux vêlages dystociques. Le protocole

associant la dexaméthasone et la prostaglandine FĮ par rapport aux autres protocoles utilisant séparément chaque produit avec un plus faible taux de progestérone plasmatique (0,56 ng/ml). Leffet significatif (P> 0,05) sur la vigueur du veau et sur la rétention placentaire. des veaux

métis issus du croisement de la Brune des alpes (BA) et le zébu Peul (ZP) révèle un taux de

survie de 88% (n=125) et un taux de mortalité global (avant et après le sevrage) de 12% (n=17). Les métis et métisses F

1 ont été plus sensibles à la fièvre aphteuse, à la

dermatophilose et aux trypanosomoses. Les courbes de croissance pondérale et de la taille des mâles ont été supérieures à .

Le GMQ moyen tout sexe confondu, a été de 433,67 ± 28,73 g/j entre 0-12 mois et 260,70 ±

41,64 g/j entre 12-24 mois. Toutefois, le mode et le type de vêlage, la saison de naissance et

surtout la traite de la mère ont eu une influence significative (P<0,05) sur la croissance

pondérale sur 6 mois. A partir de 12 mois, cest une influence significative (P< 0,05) sur la croissance des métis. Le poids à la puberté

ont été de 195,74 ± 17,38 kg et de 14,26 ± 2,87 mois (10-16 mois) et 230,39 ±19,61 kg et de

21,18 ± 3,76 mois (18-24 mois) pour les taurillons et les génisses.

Les femelles BA x ZP ont

vêlé pour la première fois à 30,26 ± 3,7 mois avec un poids moyen de 280,87 ± 34,23 kg.

Quant aux mâles, ils ont été des géniteurs à 30,00 ± 7,77 mois avec un poids moyen de 322,14

± 71,04 kg. Les métis ont présenté un tempérament plus docile. Ils ont eu moins de problème

de locomotion et le rythme cardiaque a été quasi normal pour la majorité, signes de leur

bonne adaptabilité dans les élevages au Burkina Faso. Les résultats démontrent le caractère

consentis xii dans infrastructures, la réduction de la distance parcourue par les agents , la formation des éleveurs pour le suivi (santé, alimentation et observation des retours de chaleurs) des vaches et la formation continue des inséminateurs des vêlages

échographique pourrait être une pratique de routine pour éviter les dystocies et limiter les

pertes en veaux mères Zébu Peul et le suivi sanitaire p veaux métis. La bonne adaptation et le tempérament docile des produits issus du croisement entre la Brunes des Alpes et le Zébu Peul ication des productions animales au Burkina Faso.

Mots clés : Insémination artificielle, induction de vêlage, veaux métis, performances

pondérales, adaptation, région des Cascades, Burkina Faso. xiii

ABSTRACT

The impact of bovine artificial insemination (AI), the technique of calving induction and the assessment of the growth performance of half-breeds were followed in the Cascades region of Burkina Faso for almost five (05) years. The objective of the study is to increase long-term low performance of cattle breeds through genetic improvement and reproductive performance. The data was analyzed by R version 3.2.0 software and the level of significance of all tests was set at 5%. The synchronization by the use of progestagen implants combined with prostaglandin and PMSG indicates a rate of 98.05% for induced estrus and a success of

48.88% for AI. Calving induction reduced calf birth weight and assisted calving rate. It has

also allowed a low still birth rate that can be related to dystocic calving. The induction

protocol combining dexamethasone and prostaglandin F2Į was found to be the most effective compared to other protocols separately using each product with a lower plasma progesterone level (0.56 ng / ml). The effect of calving induction was not significant (P> 0.05) on calf vigor and placental retention. The study of mixed-breed calves from the cross between the Alpine Brown and the Peul zebu revealed a survival rate of 88% (n = 125) and an overall mortality rate (before and after weaning) of 12% (n = 17). The F1 crossbreds were more susceptible to to foot -and-mouth disease, dermatophilosis and trypanosomosis. Male weight and height growth curves were higher than those of females from birth to adulthood (42 months). The average GMQ for all sexes combined was 433.67 ± 28.73 g / d between 0-12 months and

260.70 ± 41.64 g / d between 12-24 months. However, the mode and type of calving, the

season of birth, and especially the milking of the mother had a significant influence (P<0.05) on the 6-month weight gain. From 12 months, it is health and the breeding system that had a significant influence (P <0.05) on the growth of the half-breeds. The Weight and age at puberty were 195.74 ± 17.38 kg and 14.26 ± 2.87 months (10-16 months) and 230.39 ± 19.61 kg and 21.18 ± 3.76 months (18-24 months) for bull calves and heifers. The females BA x ZP calved for the first time at 30.26 ± 3.7 months with an average weight of 280.87± 34.23 kg. As for males, they were sires at 30.00 ± 7.77 months with an average weight of 322.14 ±71.04 kg. Half-breeds have a more docile temperament. They had less problem of locomotion and the rhythm of heartbeat was almost normal for the majority, these are signs of their good adaptability in the farms in Burkina Faso. The results demonstrate the multifactorial character

of the success of artificial insemination. Efforts should be made in the construction of

infrastructures, the reduction in the distance traveled by the agents for the act of insemination, the training of the breeders for the follow-up (health, food and observation of the heat returns) xiv of the cows and Continuing education of inseminators will improve the success rate. Induction of calving preceded by ultrasound follow-up could be a routine practice to avoid dystocia and limit calving losses by premature birth. However, abstinence from milking Zebu Peul mother cows and health monitoring can be a guarantee of good growth of mixed calves. The good adaptation and the docile temperament of the products resulting from the cross between the Broun Swiss and the Zebu Peul constitute an opportunity of genetic improvement for the intensification of animal productions in Burkina Faso. Key words: Artificial insemination, calving induction, mixed calves, weight gain, adaptation, cascades region, Burkina Faso.quotesdbs_dbs49.pdfusesText_49

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