[PDF] Institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie

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Janvier2017Fevier2017Mars2017LMMJVSDLMMJVSDLMMJVSD521512345912345123456786678910111210678910111229101112131415713141516171819111314151617181931617181920212282021222324252612202122232425264232425262728299272813272829303153031Avril2017Mai2017Juin2017LMMJVSDLMMJVSDLMMJVSD13121812345672212341434567891989101112131423567891011151011121314151620151617181920212412131415161718161718192021222321222324252627282519202122232425172425262728293022293031262627282930Juillet2017Août2017Septembre2017LMMJVSDLMMJVSDLMMJVSD2612311234563512327345678932789101112133645678910281011121314151633151617181920213711121314151617291718192021222334222324252627283818192021222324302425262728293035293031392526272829303131Octobre2017Novembre2017Décembre2017LMMJVSDLMMJVSDLMMJVSD391441234548123402345678456789101112494567891041910111213141546131415161718195011121314151617421617181920212247202122232425265118192021222324432324252627282948272829305225262728293031443031La science n'a pas de patrie, parce que le savoir est le patrimoine de l'humanité, le flambeau qui éclaire le monde. (Louis Pasteur)

Al' aubed'unnouveaujourpour larechercheàl'Inst itut PasteurdeNouvelle-Calédonie.

VincentRichard

L'année2017aurapermisàl'InstitutPasteurdeNouvelle-Calédonie(IPNC)d'ouvrirunenouvellepagedesonhistoiresanslesact ivitésde biologiemédicale,maistou joursaubénéficedespopulationsde Nouvelle-Calédonie.Cettetransitionn'auraitpasétép ossiblesanslesou tiendugouvernementdelaNouvelle-Calédoniequis'estmobilisépourappuyerlenouveaumodèleadosséauplanDoKamoetporterainsiencorepl usloinlarecher chedel'InstitutPasteur.Lesaccordssignésenmars2017entrel'InstitutPasteuretlegouvernementdelaNouvelle-Calédonieontconduitàrenforcerlerôledel' IPNCenm atièrederecherc he,d'expertiseensantépubliqueetdeformationauprofitdespopulationscalédoniennesavecunevisionrégionalequivafavoriserlerayonnementdel'ex pertiseprésenteenNouvelle-Calédonie.LeVanuatuetWallisetFutunaontaucoursdecettea nnéefai tappelàcetteexp ertisepourappuyerdesactionsde santépubliq uedanslecadredesmini-jeuxduPacif iqueoud elarecrudescencedecasdedengue.Lepremi ercomitédecoordin ationprévuparlesa ccordss'esttenuenjuillet2017aveclavenuedudirecteurgénéraldel'InstitutPasteur,ChristianBréchotquiapuapprécierlaqualitédestravauxmenésàl'IPNC,cequiaétéconfirméparlecomitéscientifiquequis'esttenuendécembre2017.Cetteannéeaura donctenusespr omessesavecun erecherchemenéepardeséq uipesquiontsus emobili serpourrépondre àl'engagementdugouv ernement delaNouvelle-Calédonieàleurcôté.VincentRichard

Lesfondementsdel'IPNC

DirectionVincentRichard

Conseilscientifique:6membres

Comitédecoordination:11membres

Directionadministrative&financière

Recherche

Organigrammedel'IPNC

Agendaetpointsdediscussion• Rappeldesmissionsdel'IPNC&présentationdesmissionsducomitédecoordination• Pointsurlaconventiondetransfertetdemutualisationdesmoyens• Synthèsesurletransfertdeslaboratoiresdediagnosticetsurlestravauxencours(dontlelaboratoireP3)avantinstallationdel'IPNCauMédipôle.(présentationparledirecteurduCHT)• Présentationdesactivitésderecherche,desantépubliqueetdeformationencours(localeetrégionaleaveclaCPS)Avec20projetsderecherchefinancésàladatedu20juillet2017,l'activitéderecherchedel'IPNCresteiden tiqueàcellede2016.Ilaé térap pelélesaxesd erecherch esfixésparlegouvernement;dans ledomainede lamédecine traditionnelledeuxp rojetsson tdéjàdéveloppésenlienavecl'universitédeNouvelle-Calédonie.• Pointsurlanominationdel'IPNCenqualitédelaboratoirederéférenceSurcesujet,lereprésentantdelaDASS,leDrGrangeon,aindiquéqu'untravailétaitencoursauniveaudesservicesdelaDASSpourfixerlesmissionsdeslaboratoiresderéférenceetqu'unedécisionseraitprisedanslemois.(NB:àladatedecerapportJuin2018,aucuneréponsen'aétéapportée)• Pointsurl'intégrationdel'IPNCaucomitédepilotageduROSSP(Missionrégionale)En2017,lacandidaturedel'IPNCcommemembreinvitéducomitédepilotageduROSSPaétévalidéeparlaCPSpourunpartenariatetunrôlerégionalplusfort.Ledirecteurgénéraldel'InstitutPasteur,lePrChristianBréchot,ainsistésurl'importancedecettemissionrégionalepourlerayonne mentdela Nouvelle-Calédonieetàassu rerl'IPNCdusoutiendu réseauinternationaldesInstitutsPasteursurlesdemandesrégionalespourlesquellesl'IPNCn'auraitpaslescompétences.• Bilanfinancierau30juin2017Lecompted' exploitation au30juinmontreundéficitde6millions,enl ienavec l'absenced'engagementsurlasubventiondesantépubliquequiavaitétébudgétiséeàhauteurde15millions.• DiversLapropositiondudirecteurdel'IPNCd'élargirlecomitédecoordinationàl'ASS-NCaétéactéparl'ensembledesmembresprésentsComitédecoordinationLesmembresduComitéCo-présidents• GouvernementdeNouvelle-Calédonie:MonsieurAlainMarc(coprésident)• InstitutPasteur:PrChristianBréchot(co-président)Membresdésignésparlesinstitutions• Haut-Commissariat:PrMoulayAbdelghani-Idrissi(DTRT)• ProvinceSud:MadameNinaJulié• ProvinceNord:MonsieurThierryMaillot• CHT:MonsieurDominiqueCheveau(ousonreprésentant:MadamePascaleKlotz)• DASS:DrJean-PaulGrangeon• CRESICA:MrYvonCavaloc(UNC)• IPNC:DrVincentRichardAbsent:• ProvincedesIlesLoyauté:MonsieurGeorgesKakuéNB:Observateur:DrMarcJouan,DirectionInternationale,InstitutPasteur.Datedupremiercomité:20Juillet2017

ConseilscientifiqueDatedudernierconseil:11et12décembre2017Membresprésents:• PrJohnAaskov(Brisbane)• PrBenAdler(Melbourne)• DrDidierFontenille(Cambodge)• DrYvonCavaloc(UNC,Nouméa)• DrEliseKlement(CHT,Nouméa)Membreabsentexcusé:• PrAndrewSteer(Melbourne)(présentparvisioconférence)

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RésumédurapportLeConseilatrouvéquelesactivitésdel'IPNCétaientbeaucouppluscibléesavecunpluspetitnombredeprogrammesd'importanceinternationa letraitantdesquestionsdesantéquiconsti tuentenmêm etempsuneprioritépourlaNou velle-Calédonie.Lesscientifiquesontégalementétablidesliensstratégiquesavecdesgroupesderecherchedepremierplanàl'extérieurdelaNouvelle-Calédonie.Cescollaborationspermettentdesouteniretvaloriserlarechercheentrepriseparl'IPNC.Leseffortsderecherchedel'IPNCportentsurlesprioritésduPlanDoKamoetleConseilfélicitel'IPNCpourseseffortsàrépondreàdesquestionscléspréoccupante spourlasantéde lapopulationdeNouvelle-Calédonie.L'IPNCparsaparticipationsoutientdesinitiativesdefédérationenNouvelle-CalédonietellesqueleCRESICA.LeCons eilestimequ'ilestre grettablequelaréd uctiondupersonne ldel'Inst itutaitconduitàl'arrêtdela recherches urlamaladiestrepto cocciquequi estuneca useimportantedemorbiditéetdemortalitéenNouvelle-Calédonie.Cependant,leConseilcomprendetsoutientcettedécision.LeConseilaétéimpressionnéparlaqualitédelarechercheeffectuéeaucoursdesdeuxdernièresannéesetleniveaudepublicationdansdesrev uesscient ifiquesinternationales.Cependant,ilfaudrasavoirmaintenirunniveaud'investi ssementimportantenpersonneletdanslesplates-formestechniquespour revenirauniveaud'activitéde2015,voireplus important encore,pourassure rl 'attractivitédescientifiquesdontl'expertiseseranécessairepourlesmenacessanitairesémergentesenNouvelle-Calédonieetdanslarégion. Lebesoin régionald'inst allation sderecherchecommeIPNCestencoreloind'êtrecouvert.

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Laleptospiroseestunezoonosecomplexequiconduitàdevoirs'intéresseràdifférentsfacteursl'influençant:envi ronnement,réservoirs(animaux),hôtessensiblesdontl'homme.Unemeilleureconnaissancedesfacteursderisquepermettrad'adapter lesstratégiesdeluttee tdeproposerdesmesurespréventivesspécifiquesàlapopulationdelaNouvelle-Calédonie.

CyrilleGoarant

ENVILEPTContexteCeprojet soulèvelaquestion delapersistancedeslep tospire sdansl'environnementmai saussiinterrogesurlesrelationshôtes/pathogènes/réservoir.Partantduconstatquecesbactériessontcapablesenlaboratoiredeformerunbiofilmquiauraitpourfonctiond'assurerleurprotection,lesscientifiquesdel'IPNContrecherchélaprésencedecesbiofilmsdansleshabitats naturels,étu diélescaractéri stiquesdecesbiofilms susceptiblesd'assur erlaprotectiondesbactéries etcherchéà déterminerlerôledubi ofilm desleptospireslorsde lacolonisationdestubulesrénauxproximaux.MéthodologieEnutilisantdesméthodesdebiologiemoléculaire,l'équipedel'URELadétectéavecsuccèslaprésenceetmisenévidencelaviabilitédeleptospirespathogènesdanslessolsprésumésêtrelelieud'infectionsrécentes.Leursrésultatssoulèventl'hypothèsequelesleptospirespersistentdanslessolsdessitesàrisqueplusieurssemainesaprèsl'événementinitialdecontamination.RésultatsLesscientifiquesonteneffetdétectélessouchespathogènesviablesdanslessolsjusqu'à9semainesaprèsl'événemen tdecontaminationh umaine.Lesanalysesphylogénétique sdugènelfb-1ontpermisderelieravecsuccèsl'identitédelasouchepathogèneprésentedansl'environnementàlasouchehumaineresponsable de l'infe ction.Lamiseencultu redeséchantillonsdesolsadepluspermisl'isolementde26souchesdeleptospiresetladécouvertede12nouvellesespèces(dont3pathogènes,5intermédiaireset4saprophytes).Lerôlepotentieldubiofilmdesleptospiresentantquestructureprotectriceaétéévalué.Apartirdeslamesdemicroscopie,placéesdansleszonesàrisques,l'équipedel'URELapudétecterlaprésen cede leptospirespathogènesausei ndebiof ilmsbactériensformésspontanémentsurunelamedeverre.Bienquecebiofilmnesoitpasexclusivementproduitparlesle ptospires,m aisrésulteplutôtd'unassemblagecomple xedecommu nautésmicrobiennes,cettedécouverteprouvenéanmoins,quelesleptospirespathogènespeuventêtrehébergésdansunbiofilmetprofiterdesafonctionprotectrice..

LEPT'EAUXContexteLatransmissiondelaleptospiroseàl'hommesefaitparl'expositionàdesleptospiresvirulentsparcontactavecl'urineoulestissusd'animauxinfectés,leplussouventindirectementviaunréservoirhydrotellurique.Pourtant,lesfacteursconditionnantl asurviedesleptospir espathogènes dansl'environnementdemeurenttrèsmalconnus.L'environnementaqueuxconstituantlaprincip alesourcedecontaminationhumaine,il estimportantd'identifierlesfacteursdecetenvironnementquisontassociésàlasurviedesleptospires.ObjectifL'objectifestdedécrirelasurviedeleptospiresdansdeseauxdedifférentescompositionsminéralesRésultatsAprèsdouzemoisd'expérimentation,lesrésultatsrévèlentdifférentstauxdesurvieselonl'eauutilisée,dès30joursd'incubation.Ilaétéobservéunedifférencedecom portemente ntrelessouchesdeleptospiresseulementpourl'eaula plusminéralisée.Deu xeauxsemblentpermettreunemeilleuresurviedetroisdesquatresouchesétudiées.Deplus,l'eaulaplusminéraliséesembledevenirfavorableàlasurvied'unedessouchesaudelàd'unandesurvie.Lestroissouchesrestentvivantesetvirulentes(pourlespathogènes)aprèsaumoins9moiseneauxalorsquelaquatrièmen'apassurvécuaprèsseulementdeuxjours.Lamic roscopienousp ermetégalementd'observerlafor mationd 'amascellulairesàpartirde 60joursd'incubationpourlespathogènesetd ès2jourspou rlasouchesaprophyte.PerspectivesCeprogram mederecherchevasepours uivreetp ermettrad'identifierlacompositionioniquedeseauxquifavoriselasurviedesleptospiresetainsiacquérirdesdonnéesimportantessurleursurvieetlem aintiende lavirulencedansdes conditionspauvresennutriments..

Lesarboviros essontdesmaladiesviralestransmise spardesarth ropodesvecteurs.Bienquel'onpuisseaujourd'huiconsidérerladenguecommeuneviroseendémiqueàlaNouvelle-Calédonie,laplusfortetransmissionduvirusensaisondespluiesluidonneunprofilendémo-épidémiquecaractéristique.Cependantlestableauxclin iquesresten tcl assiquesaveclesc omplicationsconnuesdeladenguepou vantcondu ireau décèsd'uncertainnombredemaladesinfectésparcevirus.

VIPRôledesparticulesinterférentesduvirusdeladengueContexteAucoursdelaréplicationvirale,deserreursdelapolymérasepeuventgénérerdesgénomesincomplets,quisontencapsidésdansdesParticulesViralesDéfectueuses(PVD).Répliquéesetpropagéeslorsdelaco-infectionavecdesvirionsfonctionnels,cesPVDpeuventaffecterlaphysiopathologiedel'infection:inhibitiondelaréplicationvirale,modulationdelaréponseimmunitairedel'hôteetcontributionàlapersistancedel'infection.Danslecasduvirusdeladengue(DENV),desPVDontétédétectéesàlafoischezleshumainsetlesmoustiquesAedesvecteursdel'infection.Ellespourraientconstituerunrégulateurnatureldelavirémiedespatients,etainsiinfluersurledeveniretlarésolutiondel'infection.ObjectifsCetteétudeviseàévaluerlerôledesPVDdanslarégulationdelavirémiechezlespatients.Ellesebasesur(1)lacaractérisationetlaquantificationdesPVDdansdesséradepatientsdeladengue,enlienavecleurvirémie,et(2)lamesureinvitrodel'impactdesPVDsurlaréplicationduDENV.PerspectivesParl'implémentationd'outilsdedétectionetdepurificationdesPVD,ceprojetouvrelavoieàuneétude pl uslargesur lerôledesPV Ddanslecycle naturelduDENV, quimesureraleurimpactsurlaphysiopathologieetlatransmissionduDENV.L'étudedel'impactdesPVDsurlavirémiepermettrad'envisagerleurquantificationdanslesérumdespatientscommeunoutilpronosticdelasévéritédel'infection.MéthodologieCaractérisationmoléculairedesPVDdansdesséradepatientsdeladengueenNouvelle-Calédonie:-EvaluationdelavirémiedespatientsparinfectionsinvitroetPCRentempsréel-Quantificationetanalysedu"profil»desARNsubgénomiquesdesPVDprésentsdanslesséradespatientsparPCRentempsréel-SéquençagedesARNsubgénomiquedesPVDprésentsdanslesséradespatientsMesureinvitrodelamodulationdelaréplicationduDENVparlesPVD:-ProductionetpurificationdePVDparinfectionsinvitroetultracentrifugation-QuantificationparPCRentempsréeldel'impactdesPVDsurlaréplicationinvitroduDENVencelluleshumaines

Arbo-VIRTUESSEvaluationdetestsnoninvasifsContexteLesmaladiesinfectieusestropicales,dontlesarboviroses,sontenaugmentationdanslemondeentieretleurémergencedansdesrégionsnon-endémiquesdevienthautementprobableenraisondel'expansiongéographiquedeleursréservoirsetvecteursnaturelsetdel'augme ntationdesdéplacements.Lediagnostic précoceet précisdel'agentpathogèneestdoncessentielàunepriseenchargeindividuelleadaptée,maisaussiàlasurveillancedelacirculationdecesp athogènesau nive audelapopulation.Or,cediagnostic,basésurdifférentesréactionspolyméraseenchaineentempsréel(qRT-PCR),chacunespécifiqued'unarbovirus,constitueuneapprochepeuefficaceentermesdetempsetdecoûts,enparticulierencasdedépistagesystématiquedeplusieursagentspathogènessurungrandnombr ed'échantillo ns.Parai lleurs,leséru mutilisédanslaplupartdesétudesimposeunprélèvementinvasifchezdespatientsfébriles.MéthodesObjectivesL'objectifprincipaldece projetpilote,Arbo-VIRTUESS,estd'améliorerledépistageprécoceetlasurveillancedesarbovirusgrâceàl'utilisationd'outilsmultiplexinnovantssurdesprélèvementsnon-invasifsd'urineetdesalive.MiseaupointdutestmultiplexxMAP(Luminex)pourledépistagedesarbovirusdansl'urineetlasalive.Validationcliniquedel'utilisationdesprélèvementsnon-invasifs:- InclusiondepatientsenNouvelle-CalédonieetenGuyanefrançaise- Détectiondesarbovirussurlesprélèvementsd'urine,saliveetsérumparRT-PCRentemps-réeletpartechnologiexMAP- ComparaisondesrésultatsobtenusRésultatsPerspectivesSurles115patientsinclusenNouvelle-Calédonie,vingtétaientpositifspourleZikaet54pourladengue.PourleZika,90%desurineset65%dessalivesétaientpositivescontre20%pourlessérums,pourledengue87%dessérumsétaientpositifscontreseulement7%desurineset13%dessalives.LescomparaisonsdesrésultatsdecesinclusionsaveclestechniquesdéveloppéesparnospartenairesenBelgiquesontencours.Aucuneinclusionn'apuêtreréaliséeenGuyanefrançaise.Ceprojet,encouplantprélèvementsnon-invasifsetdiagnosticmoléculairemultiplexé,devraitpermettred'améliorerlase nsibilitédudiagnosticdesinfectio nspar arboviroses.Dansuncontexted'introductione tderisqued'émergence,cenouvelouti lperm ettrad'adapter aumieuxlesméthodesdepréventiondelapopulationetdelutteanti-vectorielle.

DengueSévéritéContexteAvec4401casdedengue(2548confirmationsbiologiques),579cashospitaliséset11décèsentrele1erJanvieretle8Octobre2017,l'épidémiededengue2016-2017enNouvelle-Calédonie(NC)aétéconsidéréeparlesautoritéssanitairescommeunedesplusremarquables.Elleaétédeplusassociéeàdestableauxclin iqu essévères (atteinteshépatiques,c omplicationsophtalmiques...)ayantconduitàunpourcentageélevéd'admissionàl'hôpital.L'augmentationdunombrededécèsetafortiorilesformeshépatiquesobservéesaucoursdecetteépidémiepourraientêtreliéesàdescaractéristiquesparticulièresdesvirus,despatientsouencoredelaréponsehôte-pathogène.Figure1:ChronologiedesépidémiesdedengueenNouvelle-CalédonieObjectifsDéterminerdansquellemesurel esprésentation ssévèresd'infection parlevirusdelade ngueétaientassociéesàdescaractéristiquesparticulièrestellesquelegénotypeviraletsontropismehépatique,lescomorbiditésdespatientsouencoredesinfectionsantérieuresparlesvirusdeladengueetduZika.MéthodologieLapoursuitedeleurparticipationainsiqu'unéchantillonsanguinsupplémentaireserontdemandésauxpatientsdéjàinclusdansl'étudeArboVirtuess.-Sélectionde50sérade2017etdesannéesantérieures:1/3deformessévèresversus2/3deformesnon-sévères.-Etudesphylodynamiquesbaséessurunséquençageengénomecomplet.Recherchedevariationsdesquasi-espècesvirales.-Analysecomparativedutropismehépatiquesdessouchesviralesreprésentativesdel'épidémiede2016-2017versuscellesdesannéesantérieures.-Caractérisationdesséra:historiqued' infectionsan térieurespardes arbovirus,impactd'uneimmunitéhumoralepréexi stantesurlaréplicationduvirus deladengue dansd esmonocyteshumains(ADE).PerspectivesCetteétudepourramettreenévidenceuneévolutiondesvirusresponsablesdescassévèresparrapportauxcasnon-sévères,enlienavecunemodificationdeleurtropismehépatique.Deplus,ceprojetfourniraunecaractérisationinéditedel'impactdesanticorpsanti-Zikasurl'infectionparlevirusdeladengue.Dansl'ensemble,ceprojetpermettradecomprendrepourquoil'épidémiededenguede2017aétéinh abitu ellements évère.L'étudedel'influenced'uneimmun itéanti-Zikapréexistantesurlasévéritédeladenguepourraêtreutileauxterritoiresprésentantunesituationépidémiologiquesimilaire,suggérantunnouvelin dicateurpermettantd'estimerlerisqued eprogressionversunedenguesévère.HVecVEnviron

R-Zéro Facteursderisqued'émergenceduvirusZikaetdesurvenuedenouvellesépidémiesdanslePacifique.ArboPlex:Validationd'untestdiagnostiquemoléculairepourlesvirusdelaDengueetChikungunya.ContexteContexteEn2014,leZika(ZIKV)émergeaitdanslarégionPacifiqueetdiffusaitdanslemonde.Début2016,l'OMSadéclarél'épidémiedeZIKVuneurgencedesantépubliqueinternationaleenlienaveclesconséquencesneurologiquesgravesobser véessuiteàuneinfectionparleZIKV.Depui s,lenombredepaysayantdéclaréuneépidémiedeZikan'aeudecessed'augmenter,illustrantquel'expansiongéographiqueduZIKVestunprocessustoujoursencoursetcemêmedanslarégion.Deplus,laréapparitionduZIKVdanslesEtatsFédérésdeMicronésie,àKosrea,8ansaprèsl'épidémiedeYap,illustrelerisquederécurrenced'épidémiedansdeszonesprécédemmentexposées.Aujourd'huilesarbovirosess'insc riventcomme principalesmaladiesinfectieusesé mergentesetreprésententunproblèmedesantépu bliqueim portant.Lescomplicationsclin iquesgr aves,lasurveillanceépidémiologiqueetlesc asdetransmissiontransfusionnellesontautantd eraisonsnécessitantledéveloppementdenouvellestechniquesdiagnostiquesflexiblesetperformantes.ObjectifsObjectifsLeprésentprojetapourobjectifglobald'identifierlesfacteursderisqued'émergenceetderécurrenced'épidémiesdeZikadansle Pacifique ,ensefocal isantpluspar ticulièrem entsurl'immunitédecommunautéanti-Zika..LebutduprojetArboplexestdedévelopperetvalideruntestdediagnosticmoléculairesensibleappeléEnzyme-LinkedOligo-SorbentAssay(ELOSA)permettantnon seulementledépistage génomiquemultiplexedeladengue,duchikungunyaetduZikapendantlaphaseaigüedel'infection,maiségalementundiagnosticdifférentielprécoceàimplicationcliniquedanslecadredudondesang.MéthodesMéthodesCaractérisationdelaréponseimmunitai remémoir econtr eleZIKV-persistanceetpossibleinterférenceavecladengue.ImmunitédecommunautécontreleZIKV-statutetévolutiondans4sitesduPacifique.DynamiqueépidémiqueduZika-facteursderisqued'émergenceetderécurrenced'épidémie.CeprojetestbasésurlatechnologieELOSA(Enzyme-LinkedOligoSorbentAssay)etsurdessondespolythiolsoriginales.• DéveloppementdesondesgénériquesFlavivirusetAlphavirusetdetypage.• ValidationdelaspécificitédecapturedesgénomesamplifiésparPCRmultiplexe.• AnalysedesperformancesanalytiquesdutestELOSADENV/CHIKV/ZIKVmultiplexesurdespanelsd'échantillonsbiologiquesetcomparaisonauxméthodesdeRT-PCRentempsréel.PerspectivesRésultatsCeprojetdoitcontribueràapporterdesinformationscrucialessurlapersistancedel'immunitéprotectricecontrelevirusZikachezdespatientsinfectés.Ildoitégalementpermettred'évaluerleniveaud'expositionetd'immunitédespopulationsduPacifiqueauvirusZika.Lalimi tededétectiondute stELOSAe stde1TCID50/mLpourle DENV-1etle CHIKVe tde10TCID50/mLpourlesautressérotypesdeDENVetleZIKV.Laspécificitédiagnostiquedutestetlarobustessedelatechniquesontde100%.Aucuneréactioncroiséen'estobservéeentrecesarbovirus.Lavalidationclinique(RT-PCRentemps-réel)permetd'établirunecorrélationavecletestELOSAde100%pourleCHIKV,DENV-1et2etde93,75%pourleZIKV.PourleDENV-3et4,l'étudeamisenévidencel'hypothèsed'unemutationgénétiquedanslarégionNS5decessérotypescirculantenNouvelle-Calédonie.

ZikAlliance AlliancemondialepourlecontrôleduvirusZikaetsaprévention ContexteEn2014,leZika(ZIKV)émergeaitdanslarégionPacifiqueetdiffusaitdanslemonde.Début2016,l'OMSadéclarél'épidémiedeZIKVuneurgencedesantépubliqueinternationaleenlienaveclesconséquencesneurologiquesgravesobservéessuiteàuneinfectionparleZIKV.LeprojetZikAllianceestunvasteprojetquiapourobjectifsd'étudierlevirusZikaetsesconséquencesàdifférenteséchellesetàtraversdifférentsenvironnements.L'IPNCestpartenairedeceprojetetestimpliquédansleWP6:Vecte ursetplusparticulièrementlapartiecompétencevecto rielle .Lesobjectifs présentésicicorrespondentuniquementàlatâchedanslaquellel'IPNCestpartenaire.ObjectifsEvaluerlacompétencev ectorie llededifférentsmoustiques,d edifférentsenvironnements(Amérique,Asie,Europe,Pacifique)pourdifférenteslignéesdevirusZika.MéthodesHomogénéisationdesprotocoles.GénérationdespopulationsF1d'AedesaegyptietCulexquinquefasciatusdeNouvelle-Calédonie.ProductiondesstocksdevirusZika,différenteslignées.Réalisationdesexpériences d'infections expérimentales:mesu redesparamètresinfec tion,disséminationettransmission.Analysedesrésultatsàl'échelleglobale.RésultatsDeuxpopulationsd'Ae.aegypti(NouméaetKoné)ontétérécoltéesetgénérées.LesZIKVlignéeafricaineetlignéeasiatique /améri caineontétéréceptionné s.Lesinfectionsexpérimentalessontprogramméespourlepremiersemestre2018.PerspectivesMieuxconnaîtrelacapacitédetransmissiondesdifférentsvecteurspourlesdifférenteslignéesestnécessaireàl'évaluationdurisqueetàlamiseenplacedeméthodesdelutteetdepréventionpluscibléesetplusperformantes. DenGenEtudedel'évolutiondesgénotypesdesvirusdelaDengueContexteDesanalysesphylogénétiquesontrévéléqueladynamiqueévolutiveduvirusdeladengue(DENV)estsouventcaractériséeparleremplacementd'ungénotypeduDENVparunautregénotypedumêmesérotype.Detelsremplacementsgénotypiquessontépidémiologiquementsignificatifscarilspeuventê treassociésàdesmodi ficationsdel asévéritédelamaladieetd el 'immunitéhumaine.Cependant,lesmécanismessous-jacentsàcerenouvellementdugénotypedeDENVdanslanaturerestentmaldéfinis.ObjectifsLesobjectifsspécifiquesdecetteétude,menéedansdeuxcontextesépidémiologiquesdifférents:unezonehyper-endémique:Cambodge,etunezoneépidémique:Nouvelle-Calédonie(NC),sont:i)étudierinvivolerôlepotentieldelasélectiondirigéeparlevecteurdanslesremplacementsgénotypiquesduDENV;ii) étudierinvitrolacapaci térelativedesgéno typesduDENVàserépliqueretàproduiredesARNsubgénomiquesduflavivirus.MéthodesDynamiqueévolutiveduDENVenNCetauCambodge:environ20souchesparandepuis2009serontsélectionnées.LegèneEseraséquencéafindedéterminerl'appartenancedugénotype.Surlabase decesrésu ltats,cinq souchesrep résentativesparsérotype/ génotypeserontsélectionnéespourleséquençagedugénomeentier.FitnesscompétitiveduDENVinvivopardesanalysesdecompétencevectorielle:DeuxsouchesdeDENVpargénotypeserontsélectionnéespourl'expériencedecompétition.UnegénérationF1ouF2d'Ae.aegyptiseramiseencontactavecdifférentsratiosdesdeuxsouchesduDENV.Lestauxd'infection,dedisséminationetdetrans mission serontmesurésauxjours7et14après l'exposition.LaquantificationviraledesdeuxgénotypesseraeffectuéeparRT-qPCR.FitnessréplicatifduDENVinvitro:LacinétiquederéplicationdesouchesreprésentativesduDENVetlaproductiondesfRNAserontobservéespendant5jourssurdescellulesdemammifères.Laquantificationdel'ARNseraeffectuéecommeprécédemment.RésultatsTouteslessouchesduDENV(NCetCambodge)ontétéobtenuesaprèsmoinsdetroispassagessurdescellulesC6/36.Ellesonttoutesétéenvoyéesàl'IPpourleséquençageàhautdébitdugénomecomplet.Celui-ciestencoursderéalisation.PerspectivesCeprojetnouspermettrademieuxcomprendrelesmécanismesévolutifsquisous-tendentlesremplacementsdegénotypesduDENVtypiquementobservésaucoursdesépidémiesdedengue.

ZikAeDiagnosis,molecularevolutionandvectorcompetenceforAedesaegyptiofZikavirusfromAfrica,AsiaandPacificregion.ContexteEn2013,leZika(ZIKAV)émergeaitdanslarégionPacifiquepuisdiffusaitdanslemondeetcausaitpourlapr emièrefoisdes atteintes neurologiquesgraves.Iles tdoncimportantd edisposerdeméthodesdediagnosticmoléculairesrapidesetspécifiquespourunemeilleurepriseenchargedes patients. Deplus,peud'étud esavaientété réaliséessurlesvari ationsgénétiquesduvirus,quiperme ttraientdem ieuxcomprendrecette réemergence mondiale.Enfin,lesétudesde compétenceve ctorielleréalis éesjusqu'alorschezdesmou stiquesneconcernaientquelalignéeafricaine.ObjectifsLesobjectifs deceprojetétaientdemieux compren drelesm écanismesd'émerge nce,ladynamiquedecirculationetdemaintiendanslanatureduZIKAV:i)EvalueretstandardiserlesdifférentsoutilsdediagnosticduZIKAVnotammentmoléculaireii)analyserladiversitéduZIKVdanschacunedesdifférentesrégionsdumonde(Afrique,AsieduSud-EstetPacifique)iii)étudierlacompétencevectorielled'Aedesaegyptietd'AedesalbopictuspourleZIKAV.MéthodesEvaluationdestechniquesdediagnosticparRT-PCRentemps-réelSéquençage(génomecomplet)desvirusisolésdepatientsoudemoustiquesenAfrique,AsieetPacifiqueEtudedelacomp étencevec torielle(i)Produ ction desstocks deZIKAVlignéeAfricaineetAsiatique,ii)générationdespopulationsd'Aedesspp(Pacifique,Asie,Afrique)etiii)réalisationdesexpériencesdemesuredelacompétencevectorielleRésultatsLesanalysesdesgénomescompletsdeZIKAVdelarégionPacifiqueontmontréquel'épidémiedeZIKAVdanscetterégionétaitdueàuneseuleintroductionpuisàladiffusionduvirusàtraverslePacifique.LesrésultatssurlesZIKAVafricainssontencoursd'analyse.Lesétudesdecompétencevectorielleontmontréquelespopulationsd'Ae.aegypti,d'Ae.polynesiensisoud'Ae.albopictus d'Europeoud'Amériqueetd uPacifiqu esontpeucompétentespourtransmettreleZIKAVdelalignéeasiatique.Lesrésultatsencourssurlespopulationsasiatiquesetafric ainesmontrentdesrésultatssim ilaires.L'étudedela compétenceve ctorielled'Ae.aegyptideNouvelle-CalédoniepourdesZIKAVdelalignéeasiatiqueetafricaineadémontrédesrésultatssignificativementdifférentspourlatransmissionduvirus.Cesrésultatsindiquentunespécificitédesinteractionsgénotypeviralxgénotypevecteurdanscecontextecalédonien.PerspectivesL'analysedeladiversitégénétiqueetdelacompétencevectorielleduZIKAVnouspermettrademieuxcomprendrelesmécanismesd'émergence,ladynamiquedecirculationetdemaintiendanslanatureduZIKAV. DenVectCompétencevectorielled'AedesaegyptiporlesvirusdeladengueenNouvelle-Calédonie.ContexteLasurvenuedesépidémiesdedenguenécessitetroisacteursclés:l'agentpathogène(c'est-à-direlevirus),levecteur(Aedessp.)etl'hôtehumain.EnNouvelle-Calédonie,Ae.aegyptiestleprincipalvecteur(leseulavéréàcejour)desarbovirus.DepuislaSecondeGuerremondiale,laNCaétérégulièrementtouchéepardesépidémiesd edengueavecunecir culationcy cliquedes quatresérotypesdeDENV.Cependant,audébutdel'an2000,cemodèleachangéaveclapersistanceduDENV-1.Cesob servationssu ggèrentquenotrevecteurlocalestco mpétentpourleDENV.Cependant,sacapacitéàêtreinfectéparleDENV,luipermettantdereproduireetdetransmettrelevirusàl'hôtehumain,n'apasencoreétéétudiée.ObjectifsL'objectifdeceprojetestd'étudierlacapacitédesAe.aegyptinéo-calédoniensàtransmettrelesdifférentssérotypesDENV,enlienavecleprofilépidémiologiqueobservé.MéthodesSélectiondessouchesdeDENVàpartirdelabio-banqueetproductiondesstocksviraux:unesoucheduDENVdechaquesérotype/génotypeserasélectionnéedanslabio-banquedel'IPNCselonl'annéeépidémiquedecirculation.Celles-ciserontamplifiéessurcellulesC6/36(pasplusde3passages).LaquantificationviraleseferaparimmunofluorescencesurcellulesC6/36.CaractérisationphénotypiquedessouchesdeDENV représentativ eschezlevecteur:un epopulationdegénérationF1d'Ae.aegyptiserautiliséepourlesétudesdecompétencevectoriellemenéessurchaquesouc hedeDENV sélectionnées.Deu xexpériencesindépen dantesser ontréaliséesavectouteslessouchesvirales.Lestauxd'infection,dedisséminationetdetransmissionserontmesurésà7et14jourspost-gorgement.L'analysedeséchantillonsseraréaliséecommeprécédemment.RésultatsLesstocksvi rauxdeDENV1à4 ontétéréali sésetlesvirusontétéc aractéris ésphylogénétiquement.Lesdeuxexpériencesindépendantesd ecompétence vectorielleont étémenéessurl'ensembledessouchesdeDENV.Lesrésultatspréliminairesobtenussurlapremièreexpériencemontrentquelevecteurcalédonienest capabledetransmettreleDENV.Une transmissionduDENV-1/GIetduDENV-4estobservéedès7jourspost-infectionavecdestauxrespectifsde20%et33%.A14jourspost-infection,uneefficacitécompriseentre12,5et22%estobservéepourl'ensembledessouchesdeDENV.PerspectivesAinsi,ceprojetpermettrad'avoirunevisionglobaledelacapacitévectorielled'Ae.Aegypti,pointimportantpourmieuxcomprendrelatransmissionetladynamiquedesépidémiesdedengueenNouvelle-Calédonie.

Lesmaladiesà transmisionvectorielle im pactentdeplusenplusfortementlasantédespopulationsdeNouvelle-CalédonieetdelarégionPacifiqueetdefaitleurssystèmesdesanté.L'expertisedéveloppéeparl'institu tPasteurdeNouvelle-Calédoniedepuisdenombreusesannéesapermisderépondreauxdemandesdesautoritéssanitairesentermedesurveillanceetdeconseilspouradapterlaluttecontrelesvecteurs.L'IPNCdéveloppeégalementdesprogram mesderechercheàl'internationalequipermettentdefairerayonnerlaplateformecalédonienneetpermetd'envisagerl'im plantatio nd'unvectopole.

REAGIR Résistanced'Aedesaegyptiaupyréthroïdes:Evaluationdenouveauxinsecticidesetétudeduphénomènedereversion.Contexte Aedesaegyptiestun moustiqued'uneim portancemédicalemajeureenzoneintertropicale,oùiltransmetnotammentlesvirusdeladengueduchikungunyaetduZika.Enabsencedev accinsou detraitementefficacecontrecesarboviroses,lecontrôledespopulationsd'Ae.aegyptiresteindispensable.Laluttecontrecetteespèceestengrandepartiebaséesurl'utilisationd'insecticides,dontl'efficacitéestaujourd'huicompromisedufaitdudéveloppementderésistancesauxinsecticides.Endépitdel'impactdecesrésistancessurl'efficacitédestraitementsdelutteanti-vectorielle,iln'existequetrèspeudedonnéessurl'évolutiondecesrésistancesenl'absencedepressioninsecticide. ObjectifsDansuncontextedeforterésistanced'Ae.aegyptiauxinsecticidesdanslaplupartdesterritoiresfrançaisd'outre-mer,ceprojetviseà(i)identifierdenouvellessubstancesactivesutilisableset(ii)mieuxcomprendrel'évolutiondelarésistanceauxpyréthrinoïdesauseindespopulationsdecetteespècesoumisesàdifférentespressionsdesélection.MéthodesTâche1:Echantillonnagedespopulationsetévaluationd eleursniv eauxderésistanceàladeltaméthrine.Tâche2:Criblagedenouveauxadulticidesparbio-essaissurdessouchesd'Ae.aegyptidelaboratoires.Tâche3:Evaluationdespossibilitésderéversiondelarésistanceàladeltaméthrine.Quatrelignéessontélevéesenparallèlesurunedizainedegénérationsetsousdifférentesconditionsdepressioninsecticide.Tâche4:Evaluationdelacontre-sélectiondelarésistanceàladeltaméthrinesurdeslignéesrésistantessoumisesàdeuxnouvellesmoléculesinsecticides(identifiéesentâche2).Tâche5:Suividel'évoluti ondelar ésistanceàladeltaméthrineetdesmécan ismesim pliqué s(i.e.mutationdecible,expressiondesgènesdedétoxication)surleslignéesexpérimentalesdestâches3et4.RésultatsLespopulationsdeGuyanesesontavéréesbeaucoupplusrésistantesàladeltaméthrinequecellesdeNouvelle-Calédonie(NC).Enabsencedepressioninsecticide,leniveauderésistanceàladeltam éthrinen'aquefaiblementdiminuée nNC.En revanche,l' introductionrégulièred'individussensiblesaeuuneffetbénéfiquesurlaréductionduniveauderésistance.LesuividesmécanismesderésistanceamontréunefaibleimplicationdesmutationskdrenNC(1011Met1534 C),maisunenettecorrélati onentreles niveauxder ésistanceetd 'expressiondecertainesoxydases,notammen tCYP9J28.Malheureusement,la majoritédescandidatsinsecticidessesontavéréspeuefficacesenTâche2.PerspectivesLeprojetsouhaiteapporterdesréponsesauxproblématiquesauxquellessontconfrontéslesopérateursdelaLutteAnti-Vectorielledanslemonde,àsavoirlefaiblenombredemoléculesutilisablesetledéveloppementderésistancesauxpyréthrinoïdes.Aterme,ceprojetpourraitpermettredeproposerunestratégiedegestiondelarésistanceàcettefamilled'insecticidechezAe.aegypti.

INFRAVEC2InfrastructurederechercheProgrammesurlesvecteursdesmaladieshumainesetanimalesContexteLesinsectes vecteurstransmettentdesmalad iesparasitaires,tellesquelep aludismeetlaleishmaniose,etdesinfectionsvirales,tellesquelechikungunya,ladengue,lezika,l'encéphalitejaponaiseetlafièvrejaune.Les24partenai resduco nsortiumdétiennentlesprinc ipauxins ectariumseuropéensdebiosécuritépourl'infectionexpér imentaleetlecon finementdesinsectesvecteursdans desconditionsdeconfinementdeni veau2et3 (CL2/CL3),d'autresinstallationsc léspour lesinsectesvecteursetcomprennentdessitesenpremièreligneenAfrique,danslePacifiqueetauxAmériquesObjectifsLeprojetInfravec2fournitauxchercheursdesressourcesetunaccèsauxinfrastructurescléspourl'étudedelabiologiedesinsectesvecteurs,sansfraispourl'utilisateurfinal.L'objectifestd'accélérerlarechercheeuropéennesurlabiologiedesinsectesvecteursetdedévelopperdenouvellesmesuresdelutteanti-vectorielleciblantlesplusgrandes menacespourlasan téhumaineetlaproductionanimales.MéthodesDanslecadredeceprojet,l'IPNCproposeunaccèsàsonlaboratoiredeniveau2+pourlaréalisationd'infectionexpérimentalessurAedesaegypti,etdefournirdesmoustiquesmorts(Ae.aegyptiouCulexquinquefasciatus)oudespontesd'Ae.aegypti.L'IPNCestégalementenchargedelacréationd'unesouchederéférenced'Ae.aegyptidontlemicrobioteseracaractériséaudébutdelamiseenélevageetaucoursdesgénérations.PerspectivesInfravec2permettrad'optimiserl'exploitationdesinfrastructureseuropéennesderecherchesurlesvecteurs, pourlarechercheetlasanté publique,etfac ilitera ledéveloppementdeméthodologiesetdetechnologiesinnovantesdanscedomaine.

VECPAEVecteursdesarbovirosesduPacifique:diversité,distributionetoutilsd'identificationdesAedessp.pourlasantépublique.ContexteLesmaladiesàtransmissionvectorielleconstituentunproblèmemajeurdesantépubliquedanslePacifique.Enplusdeladengue,cescinqdernièresannéesontvul'émergencedesvirusduchikungunyaetdu Zikad anslePac ifiqueSud. Cesdiffére ntsvirus sonttransmispardesmoustiquesdugenreAedes(sou s-genreStegomyia)do ntungrandnombred'espèces sontprésentesdanslePacifique. Identifierces espèces danslesdifférentsEtatsetTerri toiresInsulairesOcéaniens(ETIOs)e stunpréalableindispensable àl'évaluationdurisque pourlapopulationetàl'élaborationd'unestratégiedelutteadaptée.Malheureusement,laplupartdecesespècesappartiennentaugroupescutellarisetsontmorphologiquementtrèssemblables.Leursidentificationsnécessitentdoncuneexpertiseimportantequin'estpastoujoursdisponiblesurplace.ObjectifsDévelopperuneexpertiseenentomologiemédicaledanslePacifiqueMéthodesLeprésentprojetproposederépondreàcebesoineni) renforçantlescapacitésd'iden tificationdes moustiquesAedesvecte ursdanslesterritoirespartenaires(VanuatuetFidji),ii) enmettantàjourlesconnaissancessurladistributiondesvecteursd'arbovirusauVanuatu,àFidji,enPolynésieFrançaiseetenNouvelle-Calédonie,etiii) endévelo ppantunoutild'identificationrapi dedece smoustiquesvec teursàdestinationdel'ensembledes ETIOs,bas ésurl'utilisationdesoutilsmode rnesd'identification(BiologieMoléculaireetSpectrométriedemasseMaldi-Tof).ActivitésTâche1:Transfertdecompétence.DeuxmissionsdeformationenentomologieserontréaliséesàFidjietauVanuatu.Tâche2:Distributiondesvecteurs.LorsdecesmissionsàFidjietauVanuatu,uninventairedesespècesd'Aedesdugroupescutellarisseraréalisé.Lemêmetyped'inventaireseraréaliséenNouvelle-CalédonieetenPolynésieFrançaiserespectivementparl'IPNCetl'ILM.Lesmoustiquescollectésserontidentifiésetconservéspourlasuiteduprojet.Tâche3:Développementd'unoutild'identification.Cettepartieduprojetviseàdévelopperunoutilrapideetfiabled'identificationdesespècesd'Aedesdugroupescutellaris.Pourcela,leséquençaged'ungènepermettantladifférentiationdesespècesentreellesseraréalisépourdesindividusdechaqueespèceetdechaquelocalité,capturéslorsdesmissionsdeterrain.Grâceauxséquencesobtenues,unePCRentemps-réelenpointfinalseradéveloppée,afindedisposerd'unoutild'identificationplusrapideetmoinscouteuxqueleséquençage.Enfin,unoutild'identificationrapideseradéveloppésgrâceàlaspectrométriedemasseMaldi-Tof.Cetoutilpermetd'obtenirunspectreprotéiquespécifiqued'uneespèce,etceenuntempstrèscourtetpouruncoûtrelativementfaibleRésultatsattendusAl'is sueduprojet,nousdisp oseronsd oncd'unebasededon néesassociant,p ourplusieursindividusdechaqueespèceretr ouvée,i) descriptionmorph ologique,ii)séquen cedugèned'intérêtetiii)profilprotéiquegénéréenspectrométriedemasse.PerspectivesCepartenariatFidji,Vanuatu,PolynésieFrançaiseetNouvelle-Calédoniedansunpremiertemps,quipourraparlasuiteêtreétenduauxautresETIOspermettrad'anticiperlerisquesanitairepourlarégion.Ae.aegypti Ae.polynesiensis Ae.albopictus Ae.hensilli

Lieu:NouméaDates:13décembre2017Personnel:MarikoMatsuiL'importancedesmaladiesinfectieus esdansl'his toirepasséeetrécentedespaysduPacifiqueconduitinéluctablementàs'interrogersurlesréponsesimmunitairesdespatientsexposésàcesdifférentsrisquessanitaires.L'évolutiondustatutimmunitairesecondaireàuneinfectionpeutmodifierlesréponsesàdefuturesexpositionsetinduiredesformescliniquessèvères.Comprendrelesmécanismesinduisantlaréponsedel'hôteestlaraisond'êtredecegroupederecherchequiseraamenéautr aversdudévelo ppementdesone xpertisesurl'immunitéinnéedelaleptospiroseàs'intéresserdanslefuturàd'autresthématiques.

MarikoMatsuiJulieCaglieroKarlHuet

LepTenActivationdesmacrophagesparexpositionauLeptospire:rôledescytokinesanti-inflammatoiresIL-10ContexteLaleptospiroseestunemaladienégligéeré-émergentedontonestimequ'elleinfecteplusd'unmilliondepersonneschaqueannée.Desétudessurlaréponseinflammatoiremiseenjeudanscettemaladiesontnécessaires,notammentpourmieuxcomprendrelerôledescytokinesagissantaucoursde laréponseimmunitair eàl' infectionbactérienne.Lespropriétésimmunosuppressives del'interleukine-10(IL-10)fontdec ettecytokine unmédiateurclédeladéfensedel'hôtelorsdel'infectionpuisqu'ellepeutaussibienatténuerl'inflammationetlimiterl'apparitiondelésionstissulaires,quepermettrelapersistancedesbactériesàl'originedel'infection.ObjectifsCetteétudeapourobjectif,vialaneutralisationdelavoiedesignalisationdel'IL-10,dedécrirelafonctiondecettecytokineimmunosuppressivedansdesmacrophages(MΦ)activéspardesleptospires,lorsd'uneinfectioninvitro,etceencomparantdesMΦmurinsetdesMΦhumai ns.Ceprojetpermettrad'ap profondi rlesconnaissances desmécanismesinflammatoiresentrantenjeulorsd'uneinfectionparlaleptospirose..MéthodesNousutiliseronsdesmacrophagesmurins(RAW264.7)ethumains(THP-1,préalablementdifférenciésauPMA)infectésinvitropardesleptospiresvirulents(L.interrogansserovarIcterohaemorrhagiaesoucheVerdun).Desleptospiressaprophytes(L.biflexastrainPatoc)etunesoucheVerdunnonvirulenteserontutiliséspourcomparaison.Lepotentielrôledel'IL-10lorsdel'inflammationseraétudiéaprèsneutralisationdelasignalisationIL-10grâceàdesanticorpsbloquantsoitdirectementl'IL-10,soitunesous-unitédesonrécepteurspécifique(IL-10R1).Lestempsd'incubationetquantitésd'anticorpsàutiliserseronttestés.IlaétémontréquelesleptospiresvirulentsactiventdifférentiellementlavoiedesignalisationdesToll-likeReceptors(TLR)selonlety pecellulairec onsidéré(humainou murin). Deslipopolysaccharides(LPS)d'E.colietdePam3CSK4serontdoncutiliséscommecontrôled'activationdesvoiesTLR4etT LR2respective ment.Eneffet,les celluleshu maines reconnaissentleLPSdesleptospiresvialeurTLR2alorsqu'encellulesdesourislesdeuxsignalisationTLR2etTL4sontactivésparlesleptospires.Photo:LibérationdecytokinespardesleucocytesPerspectivesUneffeti nhibiteurdel' IL-10lorsd elaréponseinflammatoir einduitedansdesMΦinfectéspardesleptospire sestattend u,ainsiqu'u nprofild'expressiondecytokin esdifférententrelesmodèleshumainsetsouris.Unevariabilitéauniveaudel'expressiondesmoléculesdeco-stimulationàlasurfacedescellulesestégalementattendue.Lesrésultatsobtenuspourrai entêtrelesbasespour larecherchedenouvelles thérapeutiquesetledéveloppementdevaccins.

LeptoPhagoRôledesrécepteursToll-LikeetNod-Likedansl'activationetlesfonctionsdesphagocytesinfectéspardesleptospirespathogènes.ContexteLeptospirainterrogansestunebactériezoonotiqueresponsabledelaleptospirose,unemaladienégligéeré -émergente,quiprovoquedessy mptômesléger sàgraveschezl'hommeetleh amster.Par contre,lesratsetles souri ssontdespo rteursrénauxchroniquesasymptomatiquesdecettebac térie.Lediagnosticestdifficileetl estraitementsantibiotiquesnes ontefficacesquelorsqueprescrits dèsl'app aritiondespremierssymptômes.Laleptospiro seou lesvaccinscontenantlabactérieentièreprovoquentuneréponsehumoraledecourtedurée,cequisuggèreunefaibleréponseimmunitaireinnée.ObjectifsLeprojet"LeptoPhago»étudieralafaçondontlesleptospirespathogènessontreconnusetdigérésparlesphagocytes,macrophages(MΦ),neutrophilesetcellulesdendritiques(CDs),ensefocalisantsurleurreconnaissanceparlesrécepteursdesfamillesToll-like(TLR)etNod-like(NOD).En effet,deprécédentsr ésultatsont montréquelelipopolysaccharide(LPS)particulierdesleptospiresn'estpasreconnuparleTLR4desMΦhumains,alorsqu'ilestreconnuparleTLR4murin,cequiconfèreuneprotectioncontrelamaladieetrendl'inf ection asymptomatiqueche zlasouris.Desdonn éespréliminairessuggèrentégalementqueL.interroganséchappeàlareconnaissanceparlesrécepteursNOD1etNOD2.Demanièreintéressante,lerécepteurNOD1aunrôlecrucialdanslerecrutementetl'activationdesfonctionsphagocytairesdesMΦetdesneutrophiles.Deplus,l'autophagie, quiarécemmentémergécommeunmé canismeimpor tant d'éliminationdesbactéries,estcontrôléeparlastimulationdesrécepteursTLRetNOD.Nousavonsfaitl'hypothèsequelanon-reconnaissanceparlesrécepteursTLRetNODpourraitêtreunmécanismeparlequellesleptospireséchappentausystèmeimmunitaireinnéchezleshô tessensible s.Graceàdes approchesbasée ssur"l'entraînementimmunitaire",noussouhaitonsaméliorerlaréponseimmunitaireenaugmentantl'activitéphagocytairecontrelesleptospiresvirulents.Photo:ActivationdemacrophagespardesleptospirespathogènesMéthodesPourrépondreauxproblématiquesdecePTR,nousutiliseronsdifférentsoutilsetmodèlesanimauxdisponibles ,avecenparticul ierunelignéedeleptospires pathologiques transgéniquesdontlabioluminescencepermetdesuivreenimagerielivelesphasesaiguesetchroniquesdelaleptospirose.Cetteapprocheparbioluminescencepermettraderéduireleseffectifsdesourisàinfecter,maisaussidesuivreendirectl'éliminationdesbactériesinvivo.Des sourisexpr imantlerécepteurNOD1 humain(HuNOD1)etun esouc hedeleptospiresmutantspourLipL21permettrontdetesterinvivolesconséquencesdelanon-reconnaissancedesbactér iesparNOD1 .Danscesconditions,le mutantLipL21devraitrecruterplusdeneutrophilesquelesleptospiressauvagesetnouspourronscomparercesrésultatsauxfluxdeneutrophilesrecrutésdansdessourisHuNOD1.Nousutiliseronsaussidessour isexprimantleTLR4hu main(HuTLR4/MD2),quide vraientêtrese nsiblesauxleptospiresetpourraientconstituerunmodèlehumaindesubstitutionpourlaleptospirose.Sicelas'avèreêtrelecas,cessourisseraientunmodèleplusfaciled'utilisationetplusfidèlequeleshamsterspourtesterdenouvellesstratégiesthérapeutiques,notammententermederestaurationd'activitéphagocytiqueetd'entraînementimmunitaire.PerspectivesCeprojetderecherchefondamentaledevraitaideràidentifierlesvoiesdesignalisationsainsiqueleursdérégulationsconduisantàl'échappementdesbactériesprovoquantlaleptospiroseàlaphagocytoseparlescellulesdusystèmeimmunitaireinné.Danslefutur,cesconnaissancesdevraientpermettredemettreaupointdenouveauxvaccinsetthérapeutiquesutilisantdesagonistesdesrécepteursTLRetNODpourrestaurerlaréponseimmunitaireàl'infectionparLeptospirachezl'homme.

MédiPlantesEtudedupotenti elanti-inflammatoiredesplantesutiliséesenmédicinetraditionnelleenNouvelle-Calédonie.ContexteLamédecinetraditionnelle(MTR)demeureunmoyendetraitementrépandudeparlemondeetnotammentenNouvelle-Calédonieoùellecohabiteaveclamédecinemoderne.Parmilesdiffér entesMTR,lap hytomédecine,baséesurl'utilisationdesp lantesmédicinales,estdeplusenplusemployéepourtraiterlessymptômesdepathologieschroniques,tellesquelesmaladiesinflammatoires.Lorsquel'onconnaitlarichessefloraleexceptionnelledelaNouvelleCalédonie(3270plantesdont74,4%endémiques),onréalisecombienlespossibilitésdemiseaupointdephytomédicamentssonténormes.ObjectifsL'étudeproposéeicia pourobjectifl'évaluationdes potentielsan ti-inflammatoiresdeplantesissuesdel aphytomédecinedeNouvelle-Calédonie.Lesmécanismesd'actio nprécisdesextraitsdecesplantesserontétudiésdanslebutdevaliderleurutilisationetpermettreàtermelamiseàdispositiondelapopulationdepréparationsvégétalesàvertusmédicinales.MéthodesSurlabased'étudesethnopharmacologiques,desplantesconnuespourêtreutiliséespourleurspropriétésanti -inflammatoireset/ouanti-pyrétiquesdanslaMTRCalédonienne serontsélectionnée s.20plantesserontrécoltéesetextraitesselon lesméthodes traditionnelles(décoction,macération,infus ion)pourfairelacomparaisonavecl esméthodesd'extractionchimiquesclassiquesetvoirsionobserveunevariationauniveaudeleuractivitédétectée.LesprofilschromatographiquesdecesextraitsvégétauxserontanalysésparHPLC/MS(chr omatographie enphaseliquide àhauteperformance/Spectrométriedemasse).Lestestsd'activitébiologiqueseronteffectuéssurdesmacrophage sdérivésdemonocyteshumains (MDMs)desangdedonneurs sains,activespardulipo polysacch aride(LPS )bactérien.Lespotentielsanti-inflammatoiresserontévaluésenme surantlesmédiateursde l'inflamm ationgrâceautestdeGri ess(OxydeNitrique)etàdesELISA/multiplex(cytokines).Notrebutestégalementd'éluciderlemécanismeparlequellesextraitsayantunefonctionanti-inflammatoireexercentleureffet.NousutiliseronslaGC/MS(Chromatographieenphasegazeuse/Spectrométriedemasse)etlaRTqPCRafin d'év aluerl 'étatd'activationde lavoiedes kynurenines(marqueurtrèssensibledel'inflammation).L'activitédedeuxfacteursdetranscriptionclésdel'inflammation,NFkBetAP1,seraégalementétudiéeparwesternblotetRTqPCR.PerspectivesPlusieursvoiesdevalorisationpeuventêtreenvisagées,depuisl'améliorationdesconnaissancesphytochimiquesdesplantesmédicinalesdelaNouvelle-Calédonieenvuedeleurpréservation,jusqu'audéveloppementdenouveauxphytomédicamentsenpartenariatlocaletrégionalavecdesindustriespharmaceutiques.Collaborations

UnecollaborationCHT/IPNCpourl'appuiau développementd'unerecherchetr anslationnelleauMédipôle:l'e xpertisedel'InstitutPasteurassocié àlaqualitédelaplatef ormetechnologiqueduMédipôleetdescompétencescliniquesdesprofessionnelsduCHTvapermettredepositionnerlaplateformederecher checalédoniennecommeuneexemple auseinduréseauinternationaldesInstitutsPasteur..

JulienColotEmilieBarsac

Evaluationdel'efficacitéduvaccinBexserosurlessouchesdeméningoccoqueBdeNouvelle-CalédonieContexteLaNouvelle-Calédonieconnaituneincidencedesinfectionsinvasivesàméningocoques3foissupérieure àcelledelaFrancemétropolitaine, ave cuneforteprédomi nancedu sérogroupeB.LenouveauvaccinBe xsero®c iblantlem éningocoquedusérog roupeBprésenteunintérêtmajeurpourlesnombreuxindividusdéficitairesdanslesystèmeducomplémentdecetarchipel.Cependant,l'hypervariablitéantigéniqueduméningocoqueimposededémontrerl'efficacitéduvaccinsurlessouchescirculantlocalementObjectifsRéaliseruneétudephylo génétiquede ssouchesdemé ningocoquedesérogroupeBenNouvelle-Calédonieetdéterminerl'efficacitéduvaccinBexserosurlessouchescirculantesenNouvelle-CalédonieMéthodesUnpanelde48méningocoquesinvasifsdusérogroupeBisolésentre2000et2015aététypéparMultiLocusSequenceTyping(MLST).Secondairement,lesgènesfhbp,nadA,nhbaetporA,codantpourles4antigènesméningococciquesinclusdanslevaccinBexsero®,ontétéséquencés.Lesvariantsalléliquesontétéidentifiésetreliésauxvariantsantigéniquescorrespondant,afindedéterminerleprofilantigéniquedechaqueisolat.RésultatsLes48isol atssontrép artisen21séquenc e-types(ST),reg roupésdans10comp lexesclonaux(cc).Lecc32estmajoritaireavec37,5%desisolats.Auseindececc,leST-267,endémiqueàlaNouvelle-Calédonie,estleplusreprés enté(20,8 %).Sur labasedugénotypagedesantigènesvaccinauxuniquement,lacouverturepotentielleglobaleestiméeestcompriseentre33,3et89,6%,avecuneforteefficacitéattenduesurlesisolatsducc32.L'estimationseraaffinéesecondairementparuntestdetypeELISAprenantencompteletauxd'expressionmembranairedesantigènes(MeningococcalAntigensTypingSystem).PerspectivesLesrésultatsd ecetteétudepréliminai reconcor dentaveclad istributionmondi aledeslignéeshyperinvasivese tpermettentd'envisageruneefficacitésatisfaisan teduv accinBexsero®.Lessouchesducc32,etnotammentleST-267,sontidentifiéescommeciblesessentiellesduvaccin.LetestMATS,do ntcetteétud eestunpréalableindi spensable,détermineral'efficacitéréelleduvaccinsurlessouchesdeNouvelle-CalédonieetfixeralaplaceduvaccinBexsero®parmilesrecommandationsvaccinaleslocalesPortageintestinaldeKlebsiellapneumoniae(étudemulticentriqueenpopulation)ContexteL'émergenceetladiffusiondesouch eshyp er-virulentesdeKlebsiellapneumoniae(Kp)àtraverslemondeinterrogentsurl'écologiedecettebactérie,sesréservoirsetlesmécanismesconduisantàlacolonisationetauxinfections.Lerôled'unportagesainauniveauintestinaldanscecontexteestsuspectéetestl'objetdecetteétude.ObjectifsIdentifierlerôleduportageintestinaldansl'infectionpardesKpàhautrisque(MDRethyper-virulentes).SuivreladiffusionglobaledesdifférentslignagesdeKphyper-virulentesetMDRpardesap prochesàtrès hauterésolutionreposantsur des comparaisons degénomes complets.MéthodesDescohortes devolontairessainsontso umisdes sellesàintervallerégulieren Nouvelle-Calédonie,àMadagascar,àDakaretauCambodge.LesKpserontisoléesparculturesurmilieusélectifetcaractérisées.Lapersistanceduportagepourraêtreévaluéeparlesprélèvementssuivisdesmembresde scohortes. Lessouchesàhautrisque (MDRethyper-virulentes)collectéesdanslesdifférentssitespermettrontdedocumenterlacirculationglobale.RésultatsL'inclusiondespatientsdansl'étuden'apasétéconformeauxprévisionsde300patientsprélevés.Nousn'avonspuobtenirqu'unecentainedepatientsavecenvironlamoitiéporteurdeKp.L'ensembledesantibiogrammesdesKpontétéréalisésàl'IPNCetlessouchesontétéenvoyéesàl'IPpourl'analysemoléculaire.PerspectivesL'analysemoléculaireactuellementencoursnouspermettrademieuxconnaîtreladiffusionglobaledecessouchesdeKphypervirulentesafindemenerd'autresétudesplusciblées.

Recherchederésistanceàlacolistinedanslessouchescliniquesd'EscherichiacolienNouvelle-Calédonie.ContexteSuiteàladécouvertefin2015d'unerésistanceàlacolistinetransférableparplasmidechezdesEscherichiacolienChine,plusieursinstitutsderechercheontrévélélaprésencedecetterésistanceencodéeparlegèneMCR-1dansdenombreuxpayschezdesanimauxd'élevageetchezl'homme.PourlapremièrefoisenFrance,deuxisolatscliniqueshumainsde2014porteursdecetterésistanceontétéobservéschezdesE.coliBLSEdelacollectiondel'InstitutPasteurdeNouvelle-Calédonielaissantcraindreunepossiblediffusionaucoursdesdeuxdernièresannéessurleterritoire.ObjectifsL'objectifprincipalestdedéterminerlaprévalencedugèneplasmidiquederésistanceàlacolistineMCR-1chezlessouchesE.coliBLSEissuesdepatientscalédonienssurl'année2015/2016puischezdessouchescliniquesd'E.colisurunepériodede3mois(OctobreàDécembre2017).Secondairement,ils'agitdedéterminerladynamiquededispersiondelarésistanceetlavariabilitégénotypiquedugèneMCR-1.MéthodesL'ensembledelacollectionE.coliBLSE2015/2016 soit275souchesesttestérétrospectivementàlacolistinevialekitUMICafind'identifierlessouchespotentiellementporteusesdecettenouvellerésistance.LessouchescliniquesE.coliisoléesdurant3moissontétudiéesàpartirdukitCMISensititre(mêmetypedetechniquequelekitUMIC).LaprésencedugèneplasmidiqueMCR-1danscessouchessélectionnéesestdéterminéeparPCRetlesampliconsainsiobtenussontséquencésauCentreNationaldeRéférence.RésultatsSurles275souchestestéesprovenantdelacollection,unepossèdeunerésistancepositiveàlacolistineavecdesCMI>2mg/L,etuneautresembleêtrerésistante.Celareprésenteenviron1%del'ensembledelacollectiondesannées2015/2016.LeséquençagedesdeuxsouchesestencoursderéalisationparleCNR.PerspectivesCetteétudeconfirmelaprésencedelarésistanceàlacolistinechezEscherichiacolisurleterritoiremaisnesemblepasindiqueruneaugmentationdel'incidenceparrapportà2014.Ceprocessusderésistanceaétédémontréchezd'autresentérobactériestelsqueKlebsiellasp;ilseraitintéressantderéaliserunsuividecesbactéries.Klebsiellapneumoniaedetypemucoide ContexteL'émergencedesouchesdeKlebsiellapneumoniaeporteusesdeplasmidesprovoqueunehypervirulencedueàl'hyperviscosité.Cephénotypemucoïdeaccruestcaractériséparun"stringtest»positifetestassociéàuneaugmentationdesinfectionsgravesouprofondesetàuneréductiondel'efficacitédutraitement,enparticulierdanslesservicesdesoinsintensifs. ObjectifL'objectifétaitd'évaluerl'effetducaractèremucoîdesdessouchesdeK.pneumoniasurl'évolutioncliniquedespatientshospitalisésMéthodesL'ensemblededonnéesissuesdesf ormulairescliniques despatientsi nfectésparK.pneumoniaadmisauCHTGastonBourretde2013à2014afaitl'objetd'unpremièrephased'analysedescriptive.Dansunsecon dtemps,c haquevariableaétéincl uedansuneanalyse bivariéepuismultivariée,pourétudierl'associationentrelephénotypemucoïdeetl'occurrencedelamort,desinfectionsgravesouuntraitementprolongé.RésultatspréliminairesAutotal,55patientsbactériémiquesontétéincluset27%dessouchesisoléesétaienthypermucoïdes.Lessoucheshypermucoïdesontétéresponsablesde2/3desinfectionscommunautairestandisquelesinfections nosocomialesétaientprincipalementnonhypermucoïdes(72,5%vs33,4%,p=0,01).Iln'yavaitpasdedifférencesignificativedelétalitéentrelesdeuxgroupesmaislespatientsinfectésparunesouchehypermucoïdeetaienthospitaliséspluslongtemps(73,5joursvs50,7jours,p=0,04),unplusgrandnombredesitesanatomiquesétaienttouchés(OR7;IC95%1,2-39,6;p=0,03)etleshémoculturesrestaientpositivespluslo ngtempsmalgréuneantib iothérapieadéquate(OR1,4,IC95%1,0-1,9,p=0,04).Iln'apasétéretrouvédedifférencesignificativeenfonctiondel'USIouduscoredesévéritéIGS2.

Etudedel'activitéantibactérienned'extraitsdeplantesutiliséesenmédecinetraditionnelleenNouvelle-Calédonieetévaluationsurdessouchesbactériennesrésistantesauxantibiotiques.ContexteLesantibiotiquesontlargementparticipéàlarévolutionmédicaledu20èmesiècleenfaisantconsidérablementreculerlamortalitéassociéeaux maladiesinfectieuses.Hélas ,leur utilisationmassiveetrépétéea conduitàl'apparitionde bactéri esrésistantesauxantibiotiques.Ponctuellesaudépart,cesrésistancessontdevenuestrèspréoccupantesetconduisentendépitdemisesurlemarchédenouvellesmoléculesàdessituationsd'impassesthérapeutiques.ObjectifsLesbactéries multi-résistantesn'épargnantpaslaNou velle-Calédonie,larecherchedenouvellesmoléculesquiseraientdenouveauxchefsdefilepourdenouveauxantibiotiques,trouveparticulièrementenNouvelle-Calédonie,unterraind'investigationpropice.Eneffet,laNouvelle-Calédoniepossèdeuneflore diversifiéeencoretrès peuinexplo réeetunepharmacopéetraditionnelleq uin'apasencorelivrésespotentialités enmatièrethérapeutique.MéthodesCeprojetpréliminaireconsisteàrécolterdesplantesmédicinalesréputéesantipyrétiquesdelapharmacopéetraditionnellepuisdelesextrairepardessolvantsàpolaritécroissanteetenfind'évaluerleu rpotentielleactivitéantibiotiqu esurdessouc hesmultirésistantesprovenantdelacollectiondel'IPNC.RésultatsLescreen ingd'extraitsdeplantessurles Staphylococcusaureusrésistantàlaméticilline(SARM)arévéléde sac tivitésintéressantes.La CI50(concen trationinhibant50%dela croissancebactérienne)apuêtredéterminéesurdeuxextraitsdeplantes.Aucuneactivitésignificativen'aétédétectéesurlesPseudomonasaeruginosarésistantàlaceftazidime.PerspectivesCetteétudeestunpremiertravailayantmisenévidencel'activitéantibactériennedecertainsextraitsdeplantescalé donienne ssurdessouches deSARM.Ilfautmaintenantisolerleprincipeactifafindeconfirmercesrésultatsetpoursuivrel'évaluation.Collaborations

Lafeuillederoutedel'unité d'épidémiologiedoitconduireàrenforcerlesliensaveclescl iniciensho spitalierspourledéveloppementd'unerecherchetranslationnelleauMédipôleetàdévelopperdesoutilsdetypeobservatoiredelasantésurlesquelspourronts'adosserlesquestionsderecherchedesautresunitésdel'IPNC.L'unitéd'épidémiologieestlachevilleouvrièreparlaquellesebâtissentlesprojetsd' avenirpourl aNouvelle-Calédonieetson rayonnementrégional.

ArnaudTarantola

MycoplasmagenitaliumContexteLerôlep athogènedeMycoplasmagenitalium(MG)dansl'ur étritenon-gonococciquearécemmentétéreconnu.L'azithromycine(1gr.p.o.)estconsidéréecommeleseultraitementefficacecontreMG,pathogèneidentifiéseulementaudébutdesannées1980etresponsablede15à20%desurétritesnon-gonococciquesetde30%desurétritesrécidivantesoupersistantes.Unerésistancecroissanteàl'azithromycineaétédocumentée.Lespatients ré féréspou runeIST,nesontcependantpastestéspourMG.Saprévalenceentantqu'agentpathogènecausantl'urétriteetleniveauderésistanceàl'azithromycinesontinconnusenNouvelle-Calédonie.ObjectifsLebutdecetteétudeestd'estimerlaprévalencedeMycoplasmagenitaliumchezleshommesadresséspoururétriteaucentredesoind'accèslibredelaProvinceduSud(ESPAS),lesfacteursderisqueassociés,leséventuelsprofilsderésistanceetl'efficacitédelapriseenchargesyndromique.MéthodesL'équipemédicaledel'ESPASquiprendenchargeleshommesseprésentantavecuneurétriteremplitunquestionnaireanonymiséetstandardisé.Lesdonnéessontsaisiesdansuneficheinformatisée(EpiData),encoursdevalidationparl'entréedes60premiersquestionnaires.Les donnéesserontanalyséesparl'unitéd'épidémiologiedel'IPNC.RésultatspréliminairesValidationdelabasededonnéesinformatiqueréaliséesurEpiDataPerspectivesIdentifierlesfacteursderisqueassociésavecuneuréthritedueàMGpourétablirunprofilderisquepermettantdeguiderladémarchediagnostique.ISTchezleshommesetlesfemmesasymptomatiquesContexteUneétuderéaliséeen2012parl'AgencesanitaireetsocialedeNouvelle-CalédonieaconcluàlaforteprévalencedesIST(NeisseriagonorrhoeaeetChlamydiatrachomatis)chezles18-49ansenNouvelle-Calédonie:laprévalenceobservéeétaitde3,5%(95CI%:1,9-5,1)po urNeisseriagonorrhoeae,9%[6,6 -11,4]po urChlamydiatrachomatis(atteignantunportagedeChlamydiatrachomatisde18.7%chezles18-25ans),et2.1%[0.8-3.3]co-infectionspourcesdeuxITS.ObjectifsEstimerlafréquenceduportageasymptomatiquedeNeisseriagonorrhoeae(NG)etdeChlamydiatrachomatis(CT)chezlesfemmesadultesetdeCTchezleshommesparmilespersonnesfréquentantuncentresesantéenNouvell e-Calédonie.Documenterlesfacteursderisqueassociésauportageasymptomatiquechezcespersonnes.MéthodesUneétudemonocentrique,descriptive,observationnelleetnon-interventionnelleestencourssurlespatientsrecrutésconsécutivementseréférantàlaconsultationvolontaireettestsconfidentielsEspas-CMPVIH(cliniqueVCCT)entreAvriletOctobre2017.PortageasymptomatiqueCTetNGsontdocumentésenutilisantunePCRmultiplexsurlesauto-testsvaginauxchezlesfemmesetleséchantillonsurinaireschezleshommes.PerspectivesSidesprévalencesélevéesétaientconfirmées,celapourraitjustifierlamiseenoeuvred'undépistagesystématiquepourletraitementdesISTentantqueprévention,guidésipossibleparunscorederisquesurleportagedesIST.

AlgorithmedetripourlaDengueContexteAvec4401casdedengue(2548biologiquementconfirmés),579cashospitaliséset11décèsentrele1erjanvieretle8octobre2017,l'épidémiededengue2016-2017aétéimportante.Plusimportantencore,elleaétéassociéeàunpourcentageplusélevéd'hospitalisationsetdeprésentationscliniquessév ères (lésions hépatiques,complicationsophtalmiques...).L'unitéspécialedédiéeàladengueinstalléeàl'hôpitalaétédébordée.ObjectifsDéterminersil'algorithmedetriagedéveloppéparl'hôpitaletdistribuéparlesautoritésdesantépu blique(DAS S)1/aeuunimpactsurle profildespatientsréf érése thospitalisés;2/aététrouvéutileparlesmédecinsgénéralistesetlepersonneldessallesd'urgence.MéthodesUneétudebio statistiquecomparan tlesprofilscliniquesetbiologi quesdespatientsadmisàl'hôpitalderéférenceen2016(avantdistributiondel'algorithmeenjanvier2017)etaprès,enutilisantpour2017desdonnéesdepatientssélectionnédefaçonaléatoire.Uneétudesem i-qualitativeanonymiséeutilis antdesoutilsd'enquêteenligne documentélaperceptionetl'u tilisatio ndel'algorithmeparlesmédeci nsde lacommunauté.RésultatspréliminairesLesdonnéespatientsde2016et2017n'ontétéquerécemmentmisàjouretn'ontpasencoreétéanalysées.Environ50%desmédecinsgénéralistesenNouvelle-Calédonieapaticipéàl'étude,donnantunaperçudunombredepatientssuspectésdedenguedanslacommunauté,desdifficultésrencontréespourorienterlespatientsversl'hôpitaletleurperceptiondel'algorithmedetriage.PerspectivesCetteétudeinformerasurl'impact-lecaséchéant-del'algorithmedetriagesurlesprofilscliniquesetbiologiquesdespatientsréférésCHT.Celaaideraàdéterminersil'outilexistantestsatisfai santets'ilyanécessi téded év elopperunalgorithmespécifiquepourlesmédecinsdeville.ONENA ContextePlusieursmaladiesetvulnérabilitésconnuespourêtreassociées àdesfacteursderisquegénétiquesou microbiotiquessontplusfréque ntesparmi lespopulationsd'ascendanceocéanienne,non-européennesetnon asiatiques(ONEN A).Cespopulationssontpeuoupasreprésentéesdanslesétudessurlesfacteursgénétiquesoumicrobiotiquesassociésaurisqueouàlagravitédesmaladiestransmissiblesounontransmissibles.Laquestiondelarecherchesurlesmaladiesetl'ethnicitéestcependantextrêmementsensibleenNouvelle-CalédonieetenFrance.ObjectifsÉtabliruncadrederecherchequiabriteradesétudesmultidisciplinaires-hospitalièreset/oucommunautaires-surdiversaspectsdelagénétiquedelapopulationetdel'individu,lesvulnérabilités,parexempletransmissibles(dengue,leptospirose,grippe)etles maladiesnon transmissibles(obésité ,maladiesmétab oliquesetleursconséquences)etlesfacteursassociés.MéthodesUnepremièreétapeaconssitéàrecenserlespopulationsONENAdanslePacifiqueetàeffectuerunerecherchedesconnaissan ceslesplusrécentessurlagénétique ,lemicrobiomeetlesmaladiestransmissiblesetnon-transmissiblesdanslePacifique.CeciaproduitundocumentquiaétésoumisàIPParispourunevalidationéthique.RésultatspréliminairesUnrecensementexhaustifdesdonnéesdémographiquesetdesantépubliqueapermisdedocumenterlenombreetladiversitédespopulationsdel'ONENAdanslePacifiqueSud.Unerevuedelalittératurerécenteadocumentédesconnaissancesdepointesurlesfacteursgénétiquesoumicrobiotiquesassociésàlamaladie,etseslimites.Cecadreaété validé.C ecadrederecherche aétéappro uvéparIPParis. Despers onnesressourcesclésenNContétéiden tifiées.Lespo intsfocaux pourlag énétiquedes populationsetlesétudessurlemicrobiomeontétéidentifiésetcontactésàIPParisetidentifiésàIPLille.PerspectivesLescaractéristiquesspécifiquesgénétiquesetcellesdumicrobiotedesONENAsontuniquesetdemandentàêtreétudiéesplusprécisemmentpourajusterlesestimationsdesrisques,lapréventiondesrisques,lesstratégiesdiagnostiquesetthérapeutiques,aubénéficedespopulationsduPacifiqueetau-delà.Ceprogramme,cependant,serascientifiquementetdiplomatiquementexigeantetnécessiteradutempspourêtremisenoeuvreavantquedesétudesspécifiquespuissentêtresoumisespourfinancement.

SujetdustageEtudedelasurviedesleptospirespathogènesenco-cultureaveclesamibeslibresenvironnementalesNiveauL3/CUIRDates01/03/2017-30/06/2017BénéficiaireA. Rey(UNC)EncadrantR;ThibeauxSujetdustageDéveloppementqRT-PCRarbovirusNiveauL2Dates23/10/17au15/12/2017BénéficiaireA.Devaux(UNC)EncadrantC.Inizan,M.MinierSujetdustageCinétiquesderéplicationvira ledesarb ovirusàl'origined'épidémieenNCNiveauPACES2èmeannée,UnivParisDescartesDates26/06/2017au11/08/2017BénéficiaireA.Simon-Dupré(UniversitéParisDquotesdbs_dbs17.pdfusesText_23

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