COURS DE CHIMIE ORGANIQUE
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Quel est l'importance de la chimie organique dans la médecine ?
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La chimie organique est la chimie du carbone, tout composé possédant au moins un atome de carbone est dit composé, soit naturel ou synthétique.Comment s'appelle la chimie qui s'applique dans la médecine ?
La chimie pharmaceutique et la chimie thérapeutique (chimie médicinale ou chimie médicale) sont des disciplines scientifiques placées à l'intersection de la chimie, de la pharmacologie et de la médecine.- Les éléments constitutifs des composés organiques
l'hydrogène (H), l'oxygène (O), l'azote (N) ou plus rarement le soufre (S) ou le phosphore (P), dans le cas des composés organiques naturels ; les composés synthétiques peuvent contenir d'autres éléments, comme les halogènes.
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1ère Année Médecine Dentaire
- 1 -Département de Médecine Dentaire
COURS DE
CHIMIE ORGANIQUE
1ERE ANNEE DE MEDECINE DENTAIRE
ANNEE 2021 2022
DR G. MERABET
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- 2 -CHAPITRE I
DEFINITIONS ET CONCEPTS GENERAUX
Introduction
La chimie organique est le domaine de la chimie qui étudie les composés du carbone. Ces composés
sont appelés : les hétéroatomes. - La synthèse de macromolécules qui sont utilisées dans la fabrication des plastiques, des- Certaines familles organiques possèdent des propriétés qui permettent de fabriquer les
- La chimie organique est la base de la fabrication des médicaments, elle est omni présente Un composé organique est caractérisé par une formule qui peut être :A- La formule brute
Tout composé organique possède une formule brute : CxHyOzB- La formule développée
Cette formule permet de donner les positions relatives des atomes dans la molécule, on
détaillera toutes les liaisons.Exemple : C5H12
H H H H H H
H - C ʹ C ʹ C ʹ C ʹ C ʹ C - H
H H H H H H
C- La formule semi-développée
On ů'utilise quand la formule développée devient très grande.Exemple: C5H12
CH3 ʹ CH2 ʹ CH2 ʹ CH2 ʹ CH3
D- la formule compacte
Elle simplifie les formules développées, les liaisons ne sont représentées, et les groupes
identiques sont mis entre parenthèses avec un indice qui indique leur multiplicité.Exemple : Le pentane : C5H12
CH3 (CH2) 3CH3
E- La formule géométrique : (ou la représentation de Kekulé, formule en zigzague) pas représentés. Elle est surtout utilisée pour les molécules cycliques.Exemple : C5H12
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- 3 -II- Classification des atomes de carbones
Un atome de carbone sera :
CH4.Exemple :
CH3CH2CCH
CH3 CH3 CH3 CH3III- Les fonctions organiques
La fonction organique caractérise des composés chimiques qui ont des propriétés chimiques
groupements fonctionnels ou les groupes fonctionnels. Exemple : les acides carboxyliques : CH3 COOHLes alcools : C2H5OH
On peut donc classer les composés organiques en famille de fonction on aura les familles des alcools,
sont pris comme référence pour définir les fonctions principales. Ces fonctions sont formées en
remplaçant un ou plusieurs hydrogènes par des groupes fonctionnels. Exemple : CH4 CH3 COOHCH3 H CH3 NH2
CH3 OH
CH3 CHO
1-Les hydrocarbures aliphatiques
Ce sont des hydrocarbures à c haine ouverte et il existe trois groupes : les alcanes, les alcènes et les
alcynes. a- les alcanes : formule générale CnH2n+2Ce sont des hydrocarbures saturés (ils ne possèdent ni double ni triple liaisons), ils sont constitués de
carbones tous hybridés sp3, et ils peuvent être linéaire ou ramifiés.Exemples :
CH3CH3 ʹ CH2 ʹ CH2 ʹ CH2 ʹ CH2 ʹ CH2 ʹ CH3 CH3 ʹ CH2 ʹ CH2 ʹ CH ʹ CH2 ʹ CH3
Alcane linéaire Alcane ramifié
b- Les alcènes : formule générale CnH2n Ce sont des hydrocarbures insaturés ils possèdent au moins une double liaison.Exemple : CH3
CH2 CH2 ʹ CH2 ʹ CH2 ʹ CH3 CH2 CH2 ʹ CH ʹ CH3Alcène linéaire Alcène ramifié
IIII II IV
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- 4 - c- Les alcynes : formule générale CnH2n-2 Ce sont des hydrocarbures insaturées ils possèdent au moins une triple liaison.Exemple : CH3
HC CH2 ʹ CH2 ʹ CH2 ʹ CH3 HC CH2 ʹ CH ʹ CH3 Alcyne linéaire Alcyne ramifié2- Les hydrocarbures cycliques
Ce sont des hydrocarbures à chaine fermée.
Exemple :
3- Les hydrocarbures aromatiques
Ces composée comportent un ou plusieurs cycles benzénique. Le benzène a pour formule brute :
C6H6, il a trois doubles liaisons non localisées.Cours Chimie Organique Dr Atmani-Merabet. G
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- 5 -CHAPITRE II
LA NOMENCLATURE DES COMPOSES CHIMIQUES
Introduction
Jadis, les composés organiques portaient des noms qui ne suivaient aucune règle précise (des noms
pure et appliquée). Ces règles permettent de nommer les composés organiques en prenant les
alcanes comme référenceI - La nomenclature des alcanes : CnH2n+2
1- Les alcanes linéaires (voir tableau -1-)
préfixe qui indique le nombre de carbone de leur chaine suivi de la terminaison " ANE ».En enlevant
correspondant remplaçant la terminaison " ane » par " yle ». Exemple : CH4 le méthane CH3- le méthyle Tableau-1- Nom des alcanes à chaine linéaires CnH2n+2Nom Formule Radical
alkyleFormule
CnH2n+1
Méthane CH4 Méthyle CH3
Ethane C2H6 Ethyle C2H5
Propane C3H8 Propyle C3H7
Butane C4H10 Butyle C4H9
Pentane C5H12 Pentyle C5H11
Hexane C6H14
Heptane C7H16
Octane C8H18
Nonane C9H20
Décane C10H22
Undécane C11H24
Dodécane C12H26
Tridécane C13H28
Eicosane C20H42
Tricontane C30H62
Tetracontane C40H82
2- Les alcanes ramifiés
2- On identifie les radicaux alkyles, on les appellera les substituants et on les classe par ordre
alphabétique.3- On numérote la chaine principale, et on détermine la position des substituants par des
indices (des chiffres).4- 'ŝůLJĂun substituant, on numérote la chaine principale de sorte que le substituant possède
'ŝůLJĂplusieurs substituants, on numérote la chaine principale dans les deux sens. Le sens
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- 6 - a) Celle qui porte le plus grand nombre de substituants. plus petits.c) Si la condition (b) est vérifiée par les deux chaines, on prendra la chaine pour laquelle les
indices les plus petits sont donnés aux substituants classés 1er par ordre alphabétique. ces règles dans les exemples.Exemples :
1- les alcanes ramifiés : (les exemples sont traités sur feuilles en cour)
2-Les alcanes avec des radicaux usuels (voir le tableau-2)
Tableau 2 : Noms de quelques radicaux usuels
Structure Nom courant Abréviation
CH3 CH CH3Isopropyle
Ipr CH3CH2 - CH
CH3Isobutyle
IbuCH CH2
Vinyle ou ethényle
Cyclopropyle
Phényle
PhBenzyle
Exemples alcanes avec des radicaux usuels : (les exemples sont traités sur feuilles en cour)3-Les alcanes cycliques
Exemples : (les exemples sont traités sur feuilles en cour) II - La nomenclature des alcènes CnH2n (composés insaturés)Ce sont des hydrocarbures qui comportent au moins une double liaison (=) (une insaturation).
Principe :
1- On choisit la chaine la plus longue et qui contient la double liaison ou les doubles liaisons.
2- Le plus petit indice est donné à la double liaison ce qui indique le sens de la numérotation de
la chaine principale (CP). CH2Cours Chimie Organique Dr Atmani-Merabet. G
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- 7 -1er carbone non saturé. (Application avec les exemples)
III- La nomenclature des alcynes : CnH2n -2
même squelette en remplaçant la terminaison (ANE) par (YNE). Les règles de nomenclature sont
A- Exemples des alcènes : (les exemples sont traités sur feuilles en cour) B- Exemples des alcynes : (les exemples sont traités sur feuilles en cour) IV- Composés contenant des doubles et des triples liaisonsPrincipe :
1- On trouve la chaine la plus longue qui contient le maximum de doubles et de triples liaisons.
qui a le maximum de doubles liaisons (=).3- La numérotation se fait de façon à donner les indices les plus petits aux insaturations. 'ŝůLJĂ
Exemples des composés à (=) et triples liaison : (les exemples sont traités sur feuilles en cour)
1 2 3 4 5
Absences de substituants CH2 CH - CH2 ʹ C CH pent-1-èn-4-yne6 5 4 3 2 1
CH3 - CH CH - CH2 ʹ C CH Hex-4-èn-1-yneV- Les hydrocarbures aromatiques
Ils comportent au moins un cycle benzénique. On utilise pour la nomenclature de ces composés les
termes : ortho, méta et para. Ortho (1,2) Méta (1,3) Para (1,4) (les exemples sont traités sur feuilles en cour)La molécule
est appelée phénol. OHCours Chimie Organique Dr Atmani-Merabet. G
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- 8 - VI- Nomenclature des fonctions organiques : (Tableau 3 ) Si la molécule contient un seul groupe fonctionnel on aura : une fonction simple. Si la molécule contient deux ou plusieurs groupes fonctionnels identiques, on aura : une fonction multiple. Si la molécule contient des groupes fonctionnels différents, on aura : une fonction mixte. Exemples: CH3COOH fonction simpleCH3-CH-COOH fonction mixte
OHCH3-CH-CH2OH function multiple
OH tableau 3. Tableau-3- Classement des fonctions par ordre croissant de prioritéFonction
Groupement
fonctionnelTerminaison
Suffixe
Préfixe
Alcanes
-C-C- Ane AlkyleAlcynes
-C=C- Yne AlcynesAlcènes
-C=C- Ene AlcènesEthers
-O- Oxyde de AlkoxyAlcools
-OH OlHydroxy
Cétones
-CO- One OxoAcides carboxyliques
-COOH Oique1-Les dérivés halogénés : R-X (X : F, Cl, Br, I)
Les halogènes ne sont jamais prioritaires, ils sont toujours désignés par des préfixes. On fait
Exemples :
CH3-CH2F
fluoro éthane 15 2-bromo-3-chloro pentane
(les exemples sont traités sur feuilles en cour)2- Les éthers oxydes : R-O-'
Ils sont considérés comme des dérivés des alcools dans lesquels le proton hydroxylique du - OH est
remplacé par un groupe alkyle -'͘ Br Cl 2 3 4Cours Chimie Organique Dr Atmani-Merabet. G
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- 9 -Les éthers ne sont pas un groupe prioritaire et ils sont toujours désignés par le préfixe : oxy-
- La chaîne la plus longue est le groupe principal R. (les exemples sont traités sur feuilles en cour3- Les alcools : R-OH (OH : groupe hydroxyle)
(les exemples sont traités sur feuilles en cour4- Les cétones : R-CO-R ou R-CO-'
On les nomme en utilisant la terminaison " one ». (les exemples sont traités sur feuilles en cour5- Les acides carboxyliques : RCOOH
On les nomme en utilisant le suffixe " oique » et en faisant précéder le nom du mot " acide ».
Pour les acides cycliques on utilisera le suffixe " carboxylique ».La molécule est appelée acide benzoïque.
COOH (les exemples sont traités sur feuilles en cour.CHAPITRE III
LA STEREOCHIMIE
molécules peuvent avoir la même formule brute, la même formule développée plane mais une
trois dimensions). Les représentations suivantes nous aident à écrire des molécules spatiales dans le
plan. I- Les moyens de représentation des molécules spatiales :1- La représentation perspective cavalière
Le 1,2 ʹ dibromo éthane Br-CH2 ʹ CH2 ʹ Br sera représenté en perspective cavalière comme suit :
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- 10 - HH HH Br Br 1 2 rotation de C1de 180°HH Br 2HH Br 1 rotation de C1de 60° HH Br 1 2Br H H2H H Br 1 rotation de C2 de 180° Br HH (a) (a') (b) (b') Remarque : la forme décalée est plus stable que la forme éclipsée.2- La représentation de Cram
Les liaisons sont soit dans le plan, soit en avant du plan ou bien en arrière du plan. : La liaison est dans le plan : La liaison est en avant du plan -----: liaison est en arrière du plan.Exemple :
CH4 H H H HH H H H1,2- dibromo éthane (BrCH2 ʹ CH2Br)
H HH Br Br 1 2 rotation de C1de 60°HH Br 2BrH H 1 (a) (b)H(a) Cram éclipsée (b) Cram décalée.
60°
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- 11 -3- La projection de Newman
rencontré est représenté par un point sur le plan, le 2ème carbone rencontré est représenté par un
cercle. Les liaisons du 1er carbone partent du centre du cercle et celles du 2ème carbone partent de la
circonférence du cercle. 1 2 3 Exemple : propane-1,3-diol HOCH2 - CH2 - CH2OH. H OHH2 3 H H CH2OH CH2OH HH H OH H 23perspective éclipsée Newman éclipsée
H 2 3 H CH2OH CH2OH HH HH 2 3H H H OHCram décalée Newman Décalée
4- La projection de Fisher
On place la chaîne hydrocarbonée la plus longue à la verticale avec ses substituants dirigés vers
horizontaux sont projetés en avant du plan. Pour faire une projection de Fisher la molécule doit être
éclipsée. 4 3 2 1
Exemple (1): Acide- 2,3-dihydroxy butanoique : CH3 ʹ CH(OH) ʹ CH(OH) - COOH 1COOH HHO HOH 4CH3 2 3 1COOH HHO HOH 4CH3 2 3Cours Chimie Organique Dr Atmani-Merabet. G
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- 12 - H OHH2 3quotesdbs_dbs33.pdfusesText_39[PDF] cours pharmacie 1ere année pdf
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