[PDF] Virus de limmunodéficience humaine (VIH)

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Rédacteurs Dr Véronique Avettand-Fenoel

Dr Charlotte Charpentier

Dr Benoit Visseaux

Date de mise à jour Janvier 2017

1. CLASSIFICATION

Le virus de limmunodéficience humaine est un virus à

ARN monocaténaire de polarité

positive , à capside polyédrique et enveloppé, appartenant à la famille des Rétroviridae, du genre lentivirus. Les rétrovirus ont en commun que leur génome doit être transcrit en ADN par une ADN polymérase ARN-dépendante (synthétisant lADN à partir dune matrice qui est lARN génomique), autrement dit une transcriptase inverse (TI ou RT pour reverse transcriptase).

LADN viral ainsi synthétisé s

insère dans lADN cellulaire par ses deux extrémités appelées LTR (pour long terminal repeat, séquences terminales redondantes). Linformation génétique virale se trouve ainsi intégrée sous forme dun ADN dit " proviral » définitivement dans le

génome cellulaire grâce à lintégrase virale, doù elle sera exprimée par laction de la

machinerie transcriptionnelle cellulaire, aboutissant à la synthèse de nouveaux génomes

viraux et dARN messagers viraux qui seront traduits en protéines. Le génome de tous les rétrovirus suit la même organisation générale :

Gène

gag (group antigen) codant les protéines de structure (capside, matrice,

Gène

pol (polymérase) codant les enzymes nécessaires au cycle viral : TI, protéase et intégrase ;

Gène

env (enveloppe) codant les glycoprotéines denveloppe (gp120 : surface ; gp41 : transmembranaire ou fusion). Le génome viral comporte, en plus des gènes classiques (gag, pol et env), des gènes de

régulation ayant un rôle essentiel dans le pouvoir pathogène du virus (tat, rev, vif, vpr, vpu

ou vpx et nef). Figure 1. Représentation de lorganisation génomique commune aux rétrovirus

Source : Dr Benoit Visseaux

Figure 2. Structure de la particule virale VIH. Le nom des protéines virales de structure et denveloppe (donné en fonction du poids moléculaire de la protéine) est indiqué en bleu pour le VIH-1 et en rouge pour le VIH-2.

Source : CDC/Dr. Edwin P. Ewing, Jr. - Centers for Disease Control and Prevention's Public Health Image

Library (PHIL) (Image de microscopie électronique) ; Dr Benoit Visseaux (Schéma de la particule virale)

La rétro-transcription est une opération complexe assurée par la

TI. Cette enzyme clé dans le

cycle viral assure une étape complexe, au niveau cytoplasmique. Elle est une cible thérapeutique majeure et est responsable de la grande variabilité du VIH au sein de chaque individu. En forme de main droite, elle reçoit la matrice dARN entre le pouce et la base des autres

doigts. Cest là quest synthétisé, en début de cycle, un brin dADN complémentaire (ADNc)

à partir de la matrice ARN. En outre, lenzyme à fonctions multiples quest la TI assure

ensuite lhydrolyse de la matrice dARN (par une activité RNaseH) et la synthèse du

deuxième brin de cet ADN. La TI doit donc, de façon répétée, sattacher et se détacher de

lADN et de lARN viral, avec un risque derreur par dérapage (frameshift) à chaque ré- attachement.

De plus, la TI na

pas de mécanisme de correction, une incorporation erronée survient tous les 10000 nucléotides. Sachant que le génome viral est de 10000 nucléotides environ, une mutation est incorporée à chaque cycle viral. Il en résulte que la population virale est un mélange de virus génétiquement différents mais voisins, appelé quasi-espèce.

Dautre part,

un à 10 milliards de virus composant la population virale sont renouvelés tous les 2 jours par lorganisme infecté . La pression que subit cette population très diverse

de virus conduit à la sélection des souches permettant un échappement aux anticorps

neutralisants, aux lymphocytes CD8+ anti-VIH, et la résistance aux antirétroviraux. La

variabilité du VIH chez chaque individu infecté est importante. Certaines régions du

génome VIH sont plus instables que dautres, comme par exemple la très variable boucle V3 (V pour variable) au niveau de la gp120 de lenveloppe virale où se fixent les anticorps neutralisants.

2. MODES DE TRANSMISSION ET ÉPIDÉMIOLOGIE

2.1. Modes de transmission

Le virus est transmis par les

rapports sexuels, par transfusion avec du sang de sujet infecté ou par échange de seringue chez les toxicomanes. Le taux de transmission materno- (TMF), en absence de traitement, est de 20 à 40% pour le VIH-1 et de 1 à 4% pour le VIH-2.

La contamination survient

au cours du 3ème trimestre de grossesse et à laccouchement. Le virus peut aussi être transmis lors de l allaitement. La transmission sexuelle se trouve facilitée par la multiplicité des partenaires. Le risque de transmission sexuelle du VIH varie selon les pratiques. Une charge virale élevée, en particulier lors de la primo-infection, augmente le risque de transmission, de même que la présence de sang du sujet source lors du rapport sexuel et la présence de lésions génitales ulcérées telles quen donnent certaines IST. Il sagit donc dune transmission par " les 3S » (sang, sexe et seringue) et dune transmission mère-enfant.

La contamination professionnelle des

soignants, par piqûre accidentelle, est rare mais existe (risque de 0,3% [0,18-0,45] en labsence de traitement ARV efficace chez la personne source). Les facteurs qui augmentent ce risque sont la profondeur de la blessure, le calibre de laiguille, la présence de sang frais dans laiguille. À linverse, le port de gants, une charge virale indétectable chez le patient source et la prise rapide dun traitement préventif chez la personne exposée diminuent le risque de transmission. Le risque est bien moindre que pour la transmission professionnelle du VHB sans vaccination (pour mémoire la règle des 3 : le risque moyen dinfection est environ de 30%, 3%, 0,3% et

0,03% pour, respectivement, un accident dexposition au sang VHB+, VHC+, VIH+ et pour une

exposition sexuelle au VIH). * probabilité de transmission par acte Table 1. Table récapitulative des différents taux de transmission du VIH.

2.2. Découverte et épidémiologie

La découverte du VIH-1 en

1983 revient à la française Françoise BARRÉ-SINOUSSI dans

léquipe de Luc MONTAGNIER de lInstitut Pasteur. En 1986, un 2ème type de VIH, VIH-2, a été

découvert par léquipe de Virologie de lHôpital Claude Bernard sous la direction de

Françoise BRUN-VÉZINET, et caractérisé par François CLAVEL de lInstitut Pasteur. Figure 2. Classification des virus VIH et prévalence respective.

Source : Dr Benoit Visseaux

Il existe une grande diversité au sein des virus VIH (cf. figure 2). La plupart des VIH-1

appartiennent au groupe M (Majoritaire), composé de 9 sous-types (A, B, C, D, F, G, H, J, et K). Le sous-type B est le plus répandu dans les pays occidentaux (cf. figure 3). LAfrique, continent dorigine de ces virus, est le continent le plus riche en sous-types différents, avecquotesdbs_dbs2.pdfusesText_2

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