[PDF] INTERPRÉTATION DUN RÉSULTAT PCR DE COVID-19





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INTERPRÉTATION DUN RÉSULTAT PCR DE COVID-19

21 août 2020 faiblement positif peut parfois être difficile à interpréter. L'interprétation erronée d'un résultat PCR faiblement positif comme équivalent ...



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PCR a typiquement une phase exponentielle suivie d’une phase plateau La mesure de Ct est un cycle PCR donné et représente toute l’expérience Elle est prise dans la phase exponentielle là où la pente est linéaire On place le seuil (ligne rouge) dans cette phase et le Ct se mesure là où la courbe PCR croise le seuil Le seuil est



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Comprendre les tests RT-PCR et leurs résultats Les tests de diagnostic de la COVID-19 par RT-PCR en temps réel permettent de déterminer si un patient a été infecté ou non par le SARS-CoV-2 en détectant la présence de matériel génétique du virus et en en mesurant la quantité



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Understanding RT-PCR tests and results COVID-19 Real-Time RT-PCR diagnostic tests can provide information on whether or not a patient has been infected with SARS-CoV-2 by detecting and measuring the virus’ genetic material This document provides a brief description of the Real Time Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) test



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Comment mesure-t-on le CT d’une courbe PCR?

Une courbe PCR a typiquement une phase exponentielle suivie d’une phase plateau. La mesure de Ct doit être prise dans la phase exponentielle, là où la pente est linéaire. On place le seuil (ligne rouge) dans cette phase, et le Ct se mesure là où la courbe PCR croise le seuil.

Quelle est la lecture de la RT-PCR en temps réel ?

Ainsi, plus le volume d’ADN cible augmente, plus l’intensité de la fluorescence augmente elle aussi. Quelle est la lecture de la RT-PCR en temps réel ? La fluorescence émise est ensuite captée sous forme de signal pour générer une valeur de « cycle seuil » (Ct).

Comment appliquer la PCR en temps réel ?

Pour appliquer la PCR en temps réel à des échantillons d’ARN (du matériel génétique du SARS-CoV-2, par exemple), les chercheurs ont donc recours à une enzyme spéciale – la transcriptase inverse – de façon à convertir l’ARN en matrices d’ADN, également appelées ADN complémentaire (ADNc).

Quelle est la valeur à laquelle la courbe PCR croise le seuil ?

Valeur à laquelle la courbe PCR croise le seuil. Un qPCR comporte environ 40 cycles. Plus le Ct est élevé (30-35), moins l’ARNm détecté est présent, car il faut plus de cycles PCR pour pouvoir détecter l’amplification fluorescente. Si le Ct a une petite valeur (10-15), le gène est fortement exprimé.

-19

FAIBLEMENT POSITIF

21 Août 2020

des clarifications ont été apportées par rapport à la version du 30 juillet

AVIS RAG

Compte tenu et du nombre croissant de personnes

asymptomatiques testées, par exemple en préopératoire ou avant un voyage, un résultat PCR

faiblement positif peut parfois être difficile à interpréter. L'interprétation erronée d'un résultat PCR

faiblinfectiosité peut avoir des conséquences importantes sur les

différents aspects de la vie des patients et de leur foyer, notamment de l'accès à l'éducation pour les

enfants, au report d'une opération chirurgicale, à l'utilisation des ressources de santé ou aux

conséquences économiques.

Le RAG a élaboré un avis sur l'interprétation de ces résultats. Cet avis a déjà été validé par le RMG et

est disponible sur le site web de Sciensano : https://covid-

EN PRATIQUE

Après vis ci-

RAG initial, ont travaillé sur une directive plus concrète pour son application clinique. Quatre

critères ont été établis, qui doivent être pris en compte pour évaluer si un résultat peut être interprété

comme une infection ancienne.

Comme directive générale, un patient qui remplit les 4 critères suivants (et ce au moment du

prélèvement qui donne un résultat PCR faiblement positif) peut, en pratique, être considéré comme non

infectieux:

1. la personne une

semaine. Si elle a présenté des symptômes graves, 4 semaines devront être respectées apparition des symptômes ;

2. la personne n'a eu aucun contact avec un cas positif confirmé au cours des 3 dernières

semaines (2 semaines d'incubation + 1 semaine de période infectieuse) ; 3. 1

4. il existe un précédent résultat PCR positif pour ce patient, au minimum une semaine avant

ce prélèvement, ou une sérologie positive connue.

objectif de ces critères est d'aider les microbiologistes et les cliniciens à interpréter un résultat PCR

faiblement positif. Elles ne remplacent en aucun cas les indications de testing et les procédures en

vigueur : les personnes qui ont déjà été diagnostiquées par PCR ne devraient généralement pas être

retestées endéans les 8 semaines suivantes.

1 Dans la littérature (voir l'avis RAG initial), aucun virus infectieux n'a été retrouvé dans les cultures virales en dessous

du seuil décrit ici. Pareil pour les résultats du CNR : sous ce même cutoff, aucun virus infectieux n'a été retrouvé dans les

cultures virales (et ce même avec une certaine marge). Le cutoff d'une charge virale de 100.000 copies d'ARN/ml

correspond, dans le CNR, à une valeur Ct de 32 (ligne de calibration IDT, lors de l'amplification du gène E, qPCR sarbeco).

Cependant, la valeur du Ct correspondant au cutoff quantitatif diffère selon les laboratoires, en fonction de la méthodologie

utilisée et du flux de travail (extraction, amplification, calibration). Néanmoins, pour tous les laboratoires, on peut dire qu'un

résultat négatif pour le gène E peut toujours être considéré comme une faible charge virale, quel que soit le résultat

pour le gène N dans ce cas.quotesdbs_dbs6.pdfusesText_12
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