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IntroductionaMPI
1 PlanMPI : Message Passing Interface
Premiers programmes/premieres fonctions
Les communications point a point2
MPI = Message Passing Interface;
Denition
I bibliotheque, plus exactement API de haut niveau, pour la programmation parallele obeissant au paradigme de l'echange de message;IInterfaces C/C++ et Fortran disponiblesContexte
I MPI est adaptea la programmation parallele distribuee; IMPI est nee de la collaboration d'universitaires et d'entreprises.ITres repandu dans le monde du calcul intensif.
3Fonctionnalites MPI
La bibliotheque MPI permet de gerer :
1. l 'environnementd 'execution; 2. l escom municationsp oint ap oint; 3. l escom municationscol lectives; 4. l esgr oupesd ep rocessus; 5. l estop ologiesd ep rocessus;MPI permet en outre de gerer : 1. l escom municationsun idirectionnelles; 2. l acr eationdy namiqued ep rocessus; 3. l emu ltithreading; 4. l esen trees/sortiespa ralleles( MPI/IO). beaucoup de fonctionnalites (environ 120 fonctions pour MPI 1, plus de 200 pour MPI 2). Neanmoins, la ma^trise des communications point a point et collectives est susante pour paralleliser un code de facon ecace; 4Pourquoi utiliser MPI
MPI est avant tout une interface;
MPI est present sur tout type d'architecture parallele; MPI supporte les parallelismes moderes et massifs; Les constructeurs de machines et/ou de reseaux rapides fournissent des bibliotheques MPI optimisees pour leurs plate-formes;MPI est egalement disponible pour la plupart des machines du marche en open source : ILAM-MPI : http ://www.lam-mpi.org;
IMPICH : http ://www-unix.mcs.anl.gov/mpi/mpich;
IOPEN-MPI
5Plus precisement
MPI : Message Passing Interface
Premiers programmes/premieres fonctions6
Premier programme MPI
#includeMPIInit (&argc, &argv); /* starts MPI */
printf( "Hello worldnn");MPIFinalize();
return 0; Tous les appels de la bibliotheque MPI commencent par le prexeMPI_; Aucun appel a MPI ne peut avoir lieu avant l'appel aMPI_Init();
Aucun appel a MPI ne peut avoir lieu apres l'appel aMPI_Finalize();
7Compilation et execution
% mpicc essai-1.c -o essai % mpirun -np 4 essaiHello world
Hello world
Hello world
Hello world[h]la procedurempiruncree 4 processus, chaque processus executant le programmeessai;les facns d'executer MPI ne sont pas portables! Elles dependent des machines, mais elles secient au moins le nombre de processus et l'ensemble des processeurs sur lesquelsMPI va s'executer. Par Exemple :
MPICH : mpirun -np 4 -machinele hosts essailes facons de compiler dependent elles aussi des implementations allant jusqu'a utiliser un script de compilation :MPICH :mpicc essai.c
8 Ensemble des processus :MPI_COMM_WORLDLors de l'initiatialisation de l'environnement, MPI regroupe tous les processus crees sous le communicateur predeni MPI_COMM_WORLDcommunicateur = ensemble de processus + contexte de communicationsun communicateur est de typeMPI_Comm; (ici : il est conseille d'utiliserMPI_COMM_WORLD 9Nombre total de processus :MPI_Comm_size
intMPI_Comm_size( MPI_Comm comm, int *size);MPI_Comm_sizeretourne danssizela taille du communicateurcomm;#includeMPIInit (&argc, &argv);
MPICommsize (MPICOMMWORLD,
&size); printf( "Hello world :s = %dnn", size );MPIFinalize();
return 0;g% mpirun -np 4 essaiHello world :s = 4
Hello world :s = 4
Hello world :s = 4
Hello world :s = 410
Rang d'un processus :MPI_Comm_rank
int MPI_Comm_rank(MPI_Comm comm, int *rank);Pour un communicateur donne, MPI associe a chaque processus un numero compris entre 0 et N-1 (N etant la taille du communicateur);Le numero unique associe au processus s'appelle le rang du processus;La fonctionMPI_Comm_rankretourne le rang du processus rankdans le communicateurcomm 11Exemple
Programme : #include
#includeMPIInit (&argc, &argv);
MPICommrank (MPICOMMWORLD, &rank);
MPICommsize (MPICOMMWORLD, &size);
printf( "Hello world from process %dof %dnn", rank, size );MPIFinalize();
return 0;gExecution :% m pirun-n p4 e ssaiHello world from process 1 of 4
Hello world from process 0 of 4
Hello world from process 2 of 4
Hello world from process 3 of 4
12En Resume
MPI_Init()etMPI_Finalize()doivent ^etre
respectivement la premiere et la derniere fonction MPI;MPI_COMM_WORLDdesigne l'ensemble des processus pouvant
communiquer;La taille d'un communicateur est retournee par MPI_Comm_size();Le rang d'un processus est retourne parMPI_Comm_rank(); 13 PlanMPI : Message Passing Interface
Premiers programmes/premieres fonctions
Les communications point a point14
Echange de message : envoi (send)/reception (receive)Un message est caracterise par :
I une t^ache expeditrice;Iune t^ache destinataire
Iles donnees a echanger;Pour echanger un message entre t^aches I l'expediteur doit envoyer le message (send); Ile destinataire doit recevoir le message (receive); 15Echange de message :principe
Soit 2 t^achesT0 etT1
IElles ont chacune leur propre espace d'adressage;IElle s'executent des instructions independantes en parallele;Pour mener a bien le calcul parallele,T1 a besoin
d'informations deT0 (point de synchronisation) : IT0 doit envoyer des donnees aT1 : les donnees sont pointees paradr_sendet de taillenb_elt;IT1 doit recevoir des donnees aT0 :
la taille du message + le destinataire doit ^etre connue par le destinataire (preallocation de la zone memoire)16Echange de message :principe
L'echange d'information a lieu (par le reseau le plus souvent, onparle alors de communication)sendbloqueT0 tant que les donnees ne sont pas envoyees;reveivebloqueT1 tant qu'il n'a pas recu toutes les
donnees;17Envoi : instructionMPI_SEND
int MPI_Send (void *buf,(adresse des donnees a envoyer)int count,(taille du message)MPI_Datatype datatype ,(type des donnees a envoyer)int dest,(la destination)int tag,(drapeau du message)MPI_Comm comm,(dans quelle communicateur));
18Envoi : instructionMPI_SEND
int MPI_Send (void *buf,(adresse des donnees a envoyer)int count,(taille du message)MPI_Datatype datatype ,(type des donnees a envoyer)int dest,(la destination)int tag,(drapeau du message)MPI_Comm comm,(dans quelle communicateur));
18Envoi : instructionMPI_SEND
int MPI_Send (void *buf,(adresse des donnees a envoyer)int count,(taille du message)MPI_Datatype datatype ,(type des donnees a envoyer)int dest,(la destination)int tag,(drapeau du message)MPI_Comm comm,(dans quelle communicateur));
18Envoi : instructionMPI_SEND
int MPI_Send (void *buf,(adresse des donnees a envoyer)int count,(taille du message)MPI_Datatype datatype ,(type des donnees a envoyer)int dest,(la destination)int tag,(drapeau du message)MPI_Comm comm,(dans quelle communicateur));
18Envoi : instructionMPI_SEND
int MPI_Send (void *buf,(adresse des donnees a envoyer)int count,(taille du message)MPI_Datatype datatype ,(type des donnees a envoyer)int dest,(la destination)int tag,(drapeau du message)MPI_Comm comm,(dans quelle communicateur));
18Envoi : instructionMPI_SEND
int MPI_Send (void *buf,(adresse des donnees a envoyer)int count,(taille du message)MPI_Datatype datatype ,(type des donnees a envoyer)int dest,(la destination)int tag,(drapeau du message)MPI_Comm comm,(dans quelle communicateur));
18Envoi : instructionMPI_SEND19
Reception : instructionMPI_recv
int MPI_Rev (void *buf,(adresse des donnees a recevoir)int count,(la taille du message doit ^etre inferieur ou egale a
cette valeur)MPI_Datatype datatype ,(type des donnees a recevoir)int source,(la source)int tag,(drapeau du message)MPI_Comm comm,(dans quelle communicateur)MPI_Status *status(le statut du message recu));
20Reception : instructionMPI_recv
int MPI_Rev (void *buf,(adresse des donnees a recevoir)int count,(la taille du message doit ^etre inferieur ou egale a
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20Reception : instructionMPI_recv
int MPI_Rev (void *buf,(adresse des donnees a recevoir)int count,(la taille du message doit ^etre inferieur ou egale a
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20Reception : instructionMPI_recv
int MPI_Rev (void *buf,(adresse des donnees a recevoir)int count,(la taille du message doit ^etre inferieur ou egale a
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20Reception : instructionMPI_recv
int MPI_Rev (void *buf,(adresse des donnees a recevoir)int count,(la taille du message doit ^etre inferieur ou egale a
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20 ReceptionMPI_RecvetMPI_StatusMPI_Statusest une structure de donneesC: struct MPIStatusf int MPISOURCE; /* expediteur du message recu : utile avecMPIANYSOURCE */
int MPITAG; /* etiquette du message recu : utile avecMPIANYTAG */
int MPIERROR; /* code si erreur */ g;Si la taille du message recu n'est pas connue, il est possible d'extraire cette information avec la fonctionMPIGetcount: int MPI_Get_count(MPI_Status *status,MPI_Datatype daty , int *count);
21Un exemple
Programme : #include
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