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Pour commencer, un peu de sémantique : l'état de l'art, c'est l'état des connaissances d'un domaine à un moment donné. Autrement dit, il permet de savoir où en est l'Homme dans ses connaissances sur un sujet.Quel est l'état de l'art ?
Pour résumer : si « état de l'art » il y a, c'est avant toute chose faire état de « son » art. C'est-à-dire montrer ses capacités à (bien) faire son métier de chercheur-se, comme un-e (bon-ne) professionnel-le. Et ce quand bien même les manières de bien le faire ne sont que rarement enseignées.
Yann JOLY
OPTOPRIM
yjoly@optoprim.comLa lumière est devenue un outil puissant dans l"analyse pour les sciences de la vie. De nouvelles technologies
apparaissent régulièrement sur le marché et visent à répondre à des exigences toujours plus poussées : produire
une lumière peu coûteuse, de haute intensité, uniforme, et monochromatique à travers un large spectre dans
l"ultraviolet, le visible et le proche infrarouge. Beau coup de ces sources lumineuses commerciales ont deslimitations significatives en termes de performances, comme une puissance insuffisante et instable, une dérive
spectrale et/ou une durée de vie courte, limitations qui ne peuvent être surmontées qu"au moyen d"investissements
prohibitifs. Les sources lumineuses disponibles aujourd"hui sont loin de satisfaire à toutes les exigences et le choix
de l"uneou l"autre est souvent un compromis entre prix et performances. Un aperçu des technologies d"illumination
employées dans les sciences du vivant permet de dresser leurs atouts et limitations respectifs.L"état de l"art en illumination pour
la microscopie de fluorescenceLes lampestendu pour un large ventail d"applica-
tion s. doute t la source lumineuse la plus uti- lise en sciences du vivant. La technologie mature a t maintes fois optimise pour des applications d"clairage varies. Ainsi, il est peu probable que l"on puisse encore amliorer sa faible efficacit de collection de vie et de stabilit sont galement inh- rents et difficiles rsoudre. Cette source trale de plus de 1000 nm doit tre forte- ment filtre pour crer les bandes de 10 ou 20 nm ncessaires en microscopie de fluorescence. Le rendement lumineux est liwatts, et parfois trop peu suffisant pour des applications d"imagerie.Les lampes arc (au xnon
ou aux halo- gnures mtalliques tel que metal-halide par exemple) permettent de contourner cette limitation. Ces lampes de puissanceleve engendrent des niveaux d"clai- surtout dans l"ultraviolet et l"infrarouge. En outre, elles crent des charges thermiquesleves qui doivent t
re soigneusement gres pour viter de compromettre les ou l"environnement biologique de l"chan- tillon. L"instabilit de puissance due l"instabilit de l"arc dans le temps est un considrablement amliore grce sa prolifration dans les vidoprojecteurs, cependant, l"arrive des diodes lectrolu- minescentes (LED) bas cot et les ques- tions souleves par de nombreux pays sur le risque d"utilisation du mercure, brillantes, les plus pures d"un point de vue spectral. Le laser argon fut le laser le plus utilis en sciences du vivant. Toutefois, son nom-bre limit de raies, son prix, son entretien, sa consommation lectrique leve et son dispara"tre au profit des nouvelles tech- nologies lasers. Actuellement, le rempla- cement des lasers argon par des lasersmettant dans la mme gamme de lon-
gueurs d"onde, mais plus compacts et plus conomes commence tre propos.Les lasers DPSSLes lasers DPSS (
diode pumped solid state ) sont des lasers semi-conducteurs dans lesquels un milieu gain solide, par exemple un rubis ou un cristal Nd:YAG, est pomp l"aide d"une diode laser. Un dou- blage et/ou une conversion de la fr- quence principale est ensuite ralis intra ou extra cavit pour obtenir diffrentes frquences dans le spectre visible, utiles pour la plupart des applications en ima - gerie biologique. Les lasers DPSS sont plus compacts et plus faciles d"utilisation que leurs prdcesseur s, mais ont surtout sante, brillante, stable et spectralement pure. Ils ncessitent cependant pourPhotoniques 62
IMAGERIE BIOLOGIQUEDOSSIER
30-41-IMAGERIE BIO:LOGIQUE_GAB-TECHNI:QUE 19/11/12 13:4:1 Page30Article disponible sur le sitehttp://www.photoniques.comouhttp://dx.doi.org/10.1051/photon/20126230
la plupart, des lments optiques ext- rieurs (comme des modulateurs acousto- optiques) pour pouvoir tre moduls fr- quence leve. Par ailleurs, bien qu"ils rpondent de nombreuses applications, ces lasers ne couvrent qu"une partie du spectre visible et leur prix est de loin l"in- convnient le plus important.Les diodes lasers
Longtemps utilises pour des applica-
tions en tlcommunications ou pour le pompage d"autres lasers, les diodes lasers apparaissent de plus en plus dans les applications de sciences du vivant. Elles couvrent, elles aussi, une partie limite duDPSS (
voir tableau 1 ) : les deux technolo- gies permettent d"imager les fluoro- phores les plus communment utiliss en microscopie de fluorescence. Leur qualit de faisceau et leurs puissances sont sou- vent infrieures celles des lasers DPSS, mais elles ont l"avantage de pouvoir treBien que moins chers que les lasers DPSS,
les diodes laser prsentent des tarifs le- vs, surtout pour des applications nces- sitant de couvrir un large spectre.Les lasers blancs ou super-continuum
arrives sur le march de la biologie. Les lasers super-continuum sont forms un effet d"optique non linaire conduisant l"mission d"un laser blanc, spectre
large, couvrant la gamme de longueurs d"onde allant d"environ 400 2500 nm (figure 1). Bien que son manque d"mis- che ultraviolet puisse tre une limitation pour certaines applications, les lasers super-continuum blancs runissent les principaux avan- tages des lampes blanches et des lasersDPSS ou diodes : le faisceau dlivre un
spectre large, puissant, brillant, stable et spatialement uniforme. Ici encore, l"incon- www.photoniques.comWelcome to
the World of www.kloe.frDILASE 250
DILASE 650
DILASE 750
UV-KUB 1
UV-KUB 2
K-ILU 1
K-ILU 2
orld of the Wo temocleW y tty iitlliiilttiasrrseVVerevveocsiisD .kloe.frwwww.kloe.fr echnolo through Dilase T Technology ! y .kloe.fr echnology ! 31Photoniques 62
DOSSIE
RIMAGERIE BIOLOGIQUE
Liste non exhaustive des lasers compacts les
plus communément utilisés en imagerie de fluorescence.Tableau 1
Longueur d"onde (en nm)Type de laser
355DPSS
375Diode
405Diode
445Diode
457DPSS
473DPSS ou diode
488Diode
491DPSS
515DPSS ou diode
532DPSS
553DPSS
561DPSS
594DPSS
637Diode
642Diode
660DPSS ou diode
705Diode
730Diode
785Diode
Figure 1.Exemple de spectres de lasers super-continuum blancs (Fianium).30-41-IMAGERIE BIO:LOGIQUE_GAB-TECHNI:QUE 19/11/12 13:4:1 Page31
www.photoniques.comLes diodes électroluminescentes
Elles offrent de loin la meilleure option
de source lumineuse moindre cot. Elles sont dsormais disponibles dans une gamme de longueurs d"onde relativementtendue et permettent des vitesses de
commutation on/off apprciables dans beaucoup d"applications. Cependant, reste large (40 50 nm) et ncessitent donc d"tre filtres. En outre, de par leur technologie, leur mission est vert et le jaune, ce qui peut tre une limitation pour certaines applica- tions en sciences du vivant. Parce que l"intensit lumineuse suffi- sante ne peut tre obtenue partir d"units individuelles, des matrices de LED sont souvent employes, formit et de stabilit. Leur princi- pal avantage, un cot unitaire fai- ble, est souvent annul par le cot et la complexit des composants supplmentaires ncessaires pour la mise en forme du faisceau.Les tubes luminescents
Dveloppe par la socit
Lumencor, c"est probablement
ayant fait ses preuves dans l"excita- tion lumineuse pour les sciences du vivant ( figure 2 gnre par un tube luminescent excit par un faisceau d"lectrons, des LED ou des lampes UV. Le tube constitu de mat- de luminescence et le temps de prchauf- fage du tube quasi nul offrent la possibilit de commutations on/off rapides.La gomtrie de ce type de tube permet
des rendements lumineux importants, comparables ceux des lasers DPSS visi- bles les plus puissants disponibles sur le march. Par ailleurs, le prix tant bien inf- compos de tubes luminescents et de bon comptiteur sur le march des sciences de la vie (figure 3).Comparaison des différents systèmes
La microscopie de fluorescence
devient de plus en plus exigeante quant aux sources d"excitation qui doivent contribuer amliorer le rapport signal sur bruit, diminuer la photo-toxicit et le blanchisse- ment, augmenter la vitesse d"ac- quisition et allonger la dure de vie de ses quipements tout en dimi- nuant leur cot. Certaines techno- logies ne semblent alors plus tre tout fait adaptes. arc dont l"mission de chaleur et
frarouge pose des questions de photo-toxicit, pourraient ne plus satisfaire les exigences actuelles de l"imagerie de fluorescence. Les autres sources, LEDs, lasers, tubes lumi- nescents, se disputent la course au meil- leur candidat : dans le cas des LEDs, la puis- sance est encore parfois trop faible ; le cot des lasers, surtout pour des applications multi-longueurs d"onde, est parfois exor- bitant. Cependant ces trois technologies prsentent un avantage crucial face aux lampes plus classiques : la possibilit d"ajuster finement la puissance mise et courtes, voire mme synchronises avec le dispositif de dtection, permet de trouver le compromis idal entre illumi nation, photo-toxicit et blanchissement. Le ta - bleau 2dresse le bilan des atouts et limita- tions de chaque technologie. Comparaison des différentes technologies d"illumination en imagerie de fluorescence.Tableau 2 32Photoniques 62
DOSSIE
RIMAGERIE BIOLOGIQUE
TechnologiesSpectre utilePuissanceUniformitéRéponse temporelleÉmission de chaleurTemps de viePrix
Lampe à arcÉlevéMoyenneFaibleFaibleÉlevéeFaibleMoyen Laser DPSSMoyenÉlevéeÉlevéeFaibleFaibleMoyenÉlevé Diode laserMoyenMoyenneÉlevéeÉlevéeFaibleMoyenÉlevé Laser blancÉlevéÉlevéeÉlevéeÉlevéeFaibleMoyenÉlevé Tube luminescentÉlevéÉlevéeÉlevéeÉlevéeFaibleÉlevéMoyenFigure 3.Comparaison des puissances spectrales
relatives des sources à arc et des systèmes hybrides comportant un tube luminescent et des LED filtrées (Lumencor).Figure 2.Schéma d"un tube luminescent (moduleLight Pipe de Lumencor).
30-41-IMAGERIE BIO:LOGIQUE_GAB-TECHNI:QUE 22/11/12 12:5:2 Page32
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