RÈGLEMENT (CE) N° 854/2004 DU PARLEMENT EUROPÉEN ET
15 nov. 2017 Qui nous a fait l'honneur d'accepter la présidence de notre jury de thèse ... Figure 11 : Granulome tuberculeux en coupe histologique .
LiquiDEs D’EPANCHEMENTs - Univ Oran 1
R=° de Rivalta : cette R=° permet d’évaluer grossièrement la teneur en protéines d’un liquide d’épanchement Dans un tube : 50 ml d’eau distillée + 2 gouttes d’acide acétique à 50 + 1 goutte du liquide d’épanchement Si le liquide se dissout instantanément R=° négative il s’agit d’un transsudat
Searches related to histologie des liquides d +épanchement ftlpo
Le diagnostic d'épanchement pleural est confirmé par une radiographie thoracique de face (tableau 26 2) idéalement réalisée en position debout et en inspiration La radiographie en expiration est à proscrire Tableau 26 2 Caractéristiques radiologiques et signes de gravité d'un épanchement pleural gazeux ou
VETAGRO SUP
CAMPUS VÉTÉRINAIRE DE LYON
Année 2017 - Thèse n°073
ÉTUDE COMPARATIVE DE LA PATHOLOGIE ET DES
MÉTHODES DE DIAGNOSTIC DE LA TUBERCULOSE À
MYCOBACTERIUM BOVIS CHEZ LES BOVINS ET CHEZ
L'HOMME
THESE Présentée à l'UNIVERSITÉ CLAUDE-BERNARD - LYON I (Médecine - Pharmacie) et soutenue publiquement le 15 novembre 2017 pour obtenir le grade de Docteur Vétérinaire parLAVIGE Vincent
Né le 26 mars 1991
à Clermont-Ferrand (63)
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CAMPUS VÉTÉRINAIRE DE LYON
Année 2017 - Thèse n°073
ÉTUDE COMPARATIVE DE LA PATHOLOGIE ET DES
MÉTHODES DE DIAGNOSTIC DE LA TUBERCULOSE À
MYCOBACTERIUM BOVIS CHEZ LES BOVINS ET CHEZ
L'HOMME
THESE Présentée à l'UNIVERSITÉ CLAUDE-BERNARD - LYON I (Médecine - Pharmacie) et soutenue publiquement le 15 novembre 2017 pour obtenir le grade de Docteur Vétérinaire parLAVIGE Vincent
Né le 26 mars 1991
à Clermont-Ferrand (63)
- 2 - - 3 - - 4 -Remerciements
À Monsieur le Professeur Jean-François MornexDe la Faculté de Médecine de Lyon,
Qui nous a fait l'honneur d'accepter la présidence de notre jury de thèse,Tous mes hommages les plus respectueux.
À Monsieur le Professeur Antonin Tortereau
De VetAgro Sup - Campus vétérinaire de Lyon, Pour avoir accepté d'encadrer et de corriger ce travail, Pour ses précieux conseils et sa disponibilité, Pour ses qualités humaines et son enseignement de qualité, Qu'il trouve ici l'expression de mon profond respect et de ma gratitude.À Monsieur le Professeur Pierre Demont
De VetAgro Sup - Campus vétérinaire de Lyon, Qui nous a fait l'honneur de juger ce travail et de prendre part à notre jury de thèse,Pour sa bienveillance et sa disponibilité,
Mes plus sincères remerciements.
À Madame le Professeur Zorée Djelouadji
De VetAgro Sup - Campus vétérinaire de Lyon,Pour avoir proposé de corriger ce travail,
Pour son enthousiasme et sa gentillesse,
Mes plus sincères remerciements.
- 5 - - 6 -Remerciements
À toute ma famille
Quelles que soient les circonstances, vous avez toujours été présents pour moi, Que vous trouviez ici l'expression de tout mon amour et de mon profond respect.À mes parents
À qui je dois tout et bien plus encore,
Sans vous je ne serais pas là où j'en suis aujourd'hui,Je vous aimerai toujours.
À ma soeur Fiona
Pour m'avoir soutenu et cru en moi toutes ces années et pour m'avoir poussé à me dépasser,
Je suis très fier de la femme que tu es devenue, Rien ne pourra jamais remplacer notre complicité.À ma grand-mère Jeanine
À qui je dédie cette thèse,
Tu aurais dû être présente à mes côtés aujourd'hui, Tu étais et tu resteras à jamais dans mon coeur.À Sarah
Pour tous les moments qui nous restent à vivre, Pour être présente à mes côtés et dans mon coeur,Je t'aime.
À mes amis
À William, Guillaume, Clémentine, Alexis, Chloé, Margot, Florence, Mélanie, Marie-Aude,Thomas, Hugues et Martin,
Pour votre bonne humeur et tous les merveilleux moments passés en votre compagnie,On a encore tellement à partager ensemble.
À toute l'équipe de la Clinique Vétérinaire du Haut Bugey Pour votre confiance, votre bonne humeur et votre gentillesse,Mes plus sincères remerciements.
- 7 - - 8 -Table des matières
Liste des annexes ....................................................................................................................15
Liste des figures ......................................................................................................................17
Liste des tableaux ...................................................................................................................19
Liste des abréviations .............................................................................................................21
Introduction ............................................................................................................................23
Première partie : L'agent étiologique ...................................................................................25
I) Bactériologie ........................................................................................................................27
A) Classification des mycobactéries ........................................................................................27
1) La classification selon le pouvoir pathogène ...............................................................27
2) Autres types de classifications ......................................................................................27
B) Caractéristiques bactériologiques des mycobactéries .........................................................29
1) Morphologie .................................................................................................................29
2) Affinité tinctoriale .........................................................................................................30
3) Résistance aux agents physico-chimiques et aux antibiotiques ....................................31
i) Les agents physico-chimiques ................................................................................31
ii) Les antibiotiques antituberculeux .........................................................................31
iii) Le cas particulier du pyrazinamide chez Mycobacterium bovis .........................324) Croissance ....................................................................................................................33
5) Propriétés biochimiques des mycobactéries .................................................................35
C) Caractéristiques biologiques des mycobactéries .................................................................35
1) Habitat ..........................................................................................................................35
2) Espèces sensibles aux mycobactéries ...........................................................................36
3) Facteurs influençant le pouvoir pathogène ..................................................................38
II) Épidémiologie ....................................................................................................................39
A) Épidémiologie descriptive ..................................................................................................39
1) Évolution du MTC dans le temps ..................................................................................39
2) Distribution de la tuberculose à M. bovis ....................................................................40
i) Chez les bovins .......................................................................................................40
ii) Chez l'Homme ......................................................................................................41
B) Épidémiologie analytique ...................................................................................................42
1) Sources de contamination .............................................................................................42
2) Réceptivité ....................................................................................................................43
- 9 -3) Mode de transmission ...................................................................................................43
i) Intraspécifique aux bovins .....................................................................................43
ii) Interspécifique des bovins à l'Homme ..................................................................43
C) Épidémiologie synthétique ..................................................................................................44
1) Modalités de contamination .........................................................................................44
i) Dans l'espèce bovine .............................................................................................44
a) Au sein d'un élevage ........................................................................................44
b) À l'échelle des différents pays .........................................................................45
ii) Dans l'espèce humaine .........................................................................................46
2) Facteurs de risque ........................................................................................................46
i) Dans l'espèce bovine .............................................................................................46
a) À l'échelle de l'individu ...................................................................................46
b) À l'échelle d'un troupeau ................................................................................46
ii) Dans l'espèce humaine .........................................................................................47
Deuxième partie : La pathologie ...........................................................................................49
I) Formation du complexe primaire et réactions immunitaires ............................................51
A) L'infection initiale ...............................................................................................................51
1) Le complexe primaire ...................................................................................................51
2) Lésions associées au complexe primaire ......................................................................51
B) Mécanismes mis en jeu durant l'infection à M. bovis .........................................................54
1) Le rôle des macrophages ..............................................................................................54
2) La sécrétion des cytokines ............................................................................................55
C) Les mécanismes d'échappement au système immunitaire ..................................................55
1) Inhibition de la lyse par les macrophages ....................................................................55
2) Modification des mécanismes de mort cellulaire .........................................................56
3) Subversion de la signalisation cellulaire ......................................................................57
4) Modification de l'expression de différents gènes .........................................................57
5) Les facteurs de virulence de M. bovis ...........................................................................58
i) Les différentes étapes de l'étude des facteurs de virulence ...................................58
ii) Le locus RD1 .........................................................................................................59
a) Organisation du locus RD1 .............................................................................59
b) Rôle du dimère ESAT-6/CFP-10 dans les interactions avec l'hôte .................60 c) La régulation des micro-ARN par ESAT-6/CFP-10 .........................................60iii) Les autres facteurs de virulence ..........................................................................60
- 10 -D) Réponses immunitaires associées .......................................................................................62
1) La réponse Th2 humorale .............................................................................................62
2) La réaction d'hypersensibilité retardée ........................................................................63
i) Les différents types d'hypersensibilité retardée .....................................................63
ii) Évolution de l'hypersensibilité retardée ...............................................................64
3) Le phénomène d'anergie ...............................................................................................64
E) Le phénomène de latence ....................................................................................................65
II) Les différentes évolutions du complexe primaire et les lésions associées .......................66
A) Les différentes évolutions du complexe primaire et la généralisation ................................66
1) La progression de l'infection ........................................................................................66
2) La tuberculose miliaire .................................................................................................67
3) Les autres formes de généralisation .............................................................................69
B) Tuberculose pulmonaire et tableau clinique général ...........................................................70
1) Le développement d'une tuberculose pulmonaire ........................................................70
2) Tableau clinique ............................................................................................................72
i) Chez les bovins .......................................................................................................72
ii) Chez l'Homme ......................................................................................................72
C) Les différentes localisations possibles de la tuberculose ....................................................73
1) La tuberculose ganglionnaire .......................................................................................73
2) La tuberculose cutanée .................................................................................................75
i) La tuberculose cutanée exogène ............................................................................75
a) Le chancre tuberculeux ....................................................................................75
b) La tuberculose verruqueuse .............................................................................76
ii) La tuberculose cutanée endogène .........................................................................76
a) Le scrofuloderme .............................................................................................76
b) La tuberculose orificielle .................................................................................76
iii) La tuberculose hématogène .................................................................................76
iv) La tuberculose éruptive ........................................................................................76
3) La tuberculose du système nerveux central ..................................................................77
4) La tuberculose ostéo-articulaire ...................................................................................78
5) La tuberculose de l'abdomen ........................................................................................80
i) La tuberculose digestive et viscérale .....................................................................80
ii) La tuberculose urogénitale ...................................................................................81
6) La tuberculose oculaire ................................................................................................82
7) Le cas particulier de la tuberculose de la mamelle ......................................................83
- 11 -Troisième partie : Les méthodes de diagnostic et de dépistage ..........................................85
I) Diagnostic clinique et lésionnel ..........................................................................................87
A) Diagnostic clinique .............................................................................................................87
1) Les différents signes cliniques ......................................................................................87
2) Diagnostic différentiel clinique ....................................................................................88
B) Diagnostic anatomopathologique ........................................................................................89
1) Diagnostic morphologique macroscopique ..................................................................89
i) Chez les bovins .......................................................................................................89
a) Modalités de l'inspection à l'abattoir .............................................................89
b) Les différentes lésions suspectes à l'abattoir ..................................................90
c) Aspects réglementaires de l'inspection à l'abattoir ........................................91
ii) Chez l'Homme ......................................................................................................92
2) Diagnostic différentiel morphologique .........................................................................92
i) Chez les bovins .......................................................................................................92
ii) Chez l'Homme ......................................................................................................93
3) Diagnostic histologique ................................................................................................93
C) Mise en évidence indirecte des lésions par les techniques d'imagerie ...............................95
1) L'examen radiographique dans le diagnostic de la tuberculose pulmonaire ...............95
2) L'apport de l'imagerie dans le diagnostic de la tuberculose .......................................95
II) Diagnostic immunologique et dépistage ...........................................................................98
A) Mise en évidence de l'immunité cellulaire .........................................................................98
1) L'intradermotuberculination ........................................................................................98
i) Principe de l'intradermotuberculination ...............................................................98
ii) L'intradermotuberculination chez les bovins dans le cadre du dépistage ............98 a) La réalisation de l'intradermotuberculination simple chez les bovins ...........98 b) L'intradermotuberculination comparative ....................................................100c) Interprétation des résultats ............................................................................101
iii) L'utilisation de l'intradermotuberculination chez l'Homme .............................1022) Le test à l'interféron gamma ......................................................................................103
3) Aspects réglementaires du dépistage chez les bovins en France ................................104
B) Mise en évidence de l'immunité humorale .......................................................................106
III) Mise en évidence de l'agent pathogène .........................................................................107
A) L'examen microscopique ..................................................................................................107
1) Les prélèvements .........................................................................................................107
- 12 -2) La mise en évidence de mycobactéries par différentes méthodes ...............................107
i) Les différentes méthodes de coloration ................................................................107
ii) Méthodes de lecture et interprétation des résultats ............................................108
iii) L'immunohistochimie ........................................................................................109
3) Les frottis d'expectorations chez l'Homme ................................................................110
B) Culture et identification de M. bovis .................................................................................111
1) Méthode de culture des mycobactéries .......................................................................111
2) Critères d'identification et expression des résultats ...................................................112
C) Méthodes d'identification par l'utilisation du génie génétique .........................................112
1) Hybridation directe avec une sonde spécifique ..........................................................112
2) L'hybridation inverse sur bandelettes ........................................................................113
3) Le séquençage de l'ADN ............................................................................................114
4) Méthodes basées sur l'utilisation de marqueurs génotypiques ..................................114
IV) Prophylaxie et traitement ................................................................................................115
A) Mesures prophylactiques ...................................................................................................115
1) Mesures hygiéniques et sanitaires ..............................................................................115
i) Chez les bovins .....................................................................................................115
ii) Chez l'Homme .....................................................................................................115
2) Mesures médicales applicables chez l'Homme ..........................................................116
i) L'antibioprophylaxie ............................................................................................116
ii) La vaccination avec le BCG ...............................................................................116
B) Le traitement de la tuberculose .........................................................................................117
Conclusion .............................................................................................................................119
Bibliographie ........................................................................................................................121
Annexes .................................................................................................................................131
- 13 - - 14 -Liste des annexes
Annexe 1 : Règlement (CE) n°854/2004 du parlement européen et du conseil du 29 avril ....2004, annexe I viandes fraîches, section IV exigences spécifiques, chapitre I : animaux ....
domestiques de l'espèce bovine .............................................................................................129
Annexe 2 : Arrêté du 15 septembre 2003 fixant les mesures techniques et administratives ....relatives à la prophylaxie collective et à la police sanitaire de la tuberculose des bovinés et ....
des caprins, chapitre III, section 1 : Définitions relatives aux animaux et aux troupeaux ....des espèces de bovinés d'élevage ..........................................................................................131
Annexe 3 : Arrêté du 15 septembre 2003 fixant les mesures techniques et administratives ....relatives à la prophylaxie collective et à la police sanitaire de la tuberculose des bovinés et ....
des caprins, chapitre V : Mesures de police sanitaire, section 2 : Mesures générales ....applicables dans les troupeaux infectés ..................................................................................135
Annexe 4 : Posologie des médicaments antituberculeux essentiels ......................................137
Annexe 5 : Effets indésirables des médicaments antituberculeux .........................................137
- 15 - - 16 -Liste des figures
Figure 1 : Arbre phylogénétique non enraciné des principales mycobactéries à croissance ....
lente, basé sur l'alignement multiple des séquences des gènes présents sur l'ARN 16S ........26
Figure 2 : Schéma de la structure de la paroi des mycobactéries ...........................................27
Figure 3 : M. bovis vu au microscope optique après une coloration de Ziehl-Neelsen ..........28Figure 4 : Mécanisme d'action du pyrazinamide sur les mycobactéries ................................30
Figure 5 : Aspect des colonies de M. bovis, M. tuberculosis et M. avium intracellulare sur ....Figure 6 : Exemple de manuel de dépistage de la tuberculose à l'usage des chasseurs .........34
Figure 7 : Momie atteinte de la maladie de Pott accompagnée d'un modèle .........................37
Figure 8 : Carte de la répartition géographique mondiale de la tuberculose bovine entre ....janvier et juin 2016 ..................................................................................................................39
Figure 9 : Modèle explicatif de l'origine d'un foyer de tuberculose dans un élevage bovin ....
indemne ....................................................................................................................................42
Figure 10 : Structure et constituants cellulaires d'un granulome tuberculeux ........................50
Figure 11 : Granulome tuberculeux en coupe histologique ....................................................51
Figure 12 : Schéma simplifié de la réponse immunitaire induite lors d'une infection par ....
les mycobactéries .....................................................................................................................52
Figure 13 : Les deux modalités de mort cellulaire des macrophages et leurs conséquences ....sur la multiplication des mycobactéries chez l'hôte ................................................................54
Figure 14 : Schéma récapitulatif des principaux mécanismes d'échappement au système ....
immunitaire mis en oeuvre par les mycobactéries ....................................................................56
Figure 15 : Diagramme de la région RD1 de M. tuberculosis ................................................57
Figure 16 : Représentation schématique des réponses immunitaires chez les bovins suite .....
à une infection par M. bovis .....................................................................................................60
Figure 17 : Les différentes voies d'évolution du complexe primaire .....................................64
Figure 18 : Tuberculose miliaire pulmonaire ..........................................................................65
Figure 19 : Signes cliniques orientant le diagnostic vers une tuberculose miliaire ................66
Figure 20 : Différentes formes de généralisation ....................................................................67
Figure 21 : Différentes formes de tuberculose pulmonaire .....................................................68
Figure 22 : Lésions cavitaires et bronchopneumonie tuberculeuse chez l'Homme ................69Figure 23 : Lésions macroscopiques de tuberculose ganglionnaire ........................................72
Figure 24 : Différentes formes clinique de tuberculose cutanée .............................................75
Figure 25 : Lésions macroscopiques de tuberculose du système nerveux central ..................76
Figure 26 : Lésions macroscopiques de tuberculose du rachis ...............................................77
- 17 -Figure 27 : Lésions macroscopiques de tuberculose abdominale ...........................................79
Figure 28 : Lésions macroscopiques de tuberculose uro-génitale ..........................................80
Figure 29 : Tuberculose de la mamelle chez un bovin ............................................................81
Figure 30 : Follicule fibreux calcifié ......................................................................................92
Figure 31 : Exemples d'images pouvant être observées lors de tuberculose pulmonaire ....chez l'Homme ..........................................................................................................................95
Figure 32 : Localisation de l'injection de tuberculine lors d'une IDS ....................................97
Figure 33 : Différentes étapes de l'IDS ...................................................................................97
Figure 34 : Localisation des injections de tuberculine lors d'une IDC ...................................98
Figure 35 : Représentation graphique des résultats obtenus avec une IDC ............................99
Figure 36 : Arbre décisionnel de la conduite à tenir en fonction des résultats de ....l'intradermotuberculination lors du dépistage chez les bovins ..............................................103
Figure 37 : Bacilles acido-alcoolo-résistantes vues au microscope à fluorescence après ....une coloration à l'auramine ....................................................................................................106
Figure 38 : Mycobactéries mises en évidence par immunohistochimie au sein d'une ....coupe histologique .................................................................................................................108
Figure 39 : Exemple de schéma utilisé pour le GenoType MTBC test permettant ....l'identification des mycobactéries appartenant au MTC ........................................................111
- 18 -Liste des tableaux
Tableau I : Principaux caractères distinctifs entre M. bovis et M. tuberculosis en culture ....Tableau II : Principales propriétés distinctives entre M. bovis, M. tuberculosis et les ....
mycobactéries atypiques ..........................................................................................................33
Tableau III : Liste non exhaustive des espèces sauvages chez lesquelles M. bovis a pu ....être isolé, et leur rôle de réservoir ou de relais dans la transmission de la tuberculose ....
bovine à des troupeaux de bovins domestiques .......................................................................35
Tableau IV : Incidence et mortalité de la tuberculose due à M. bovis chez l'homme en ....2015 selon les estimations de l'OMS .......................................................................................40
Tableau V : Liste des principaux facteurs de virulence des mycobactéries tuberculeuses .....59Tableau VI : Les différents types d'hypersensibilité retardée ................................................61
Tableau VII : Symptômes de la tuberculose pulmonaire chez l'Homme ...............................71
Tableau VIII : Étapes de l'évolution de l'aspect des ganglions périphériques affectés par ....
la tuberculose selon Jones et Campbell ....................................................................................72
Tableau IX : Classification des formes de tuberculose cutanée selon Byet ...........................73
Tableau X : Signes cliniques associés aux principales localisations des lésions de ....tuberculose ...............................................................................................................................85
Tableau XI : Les organes " porte d'entrée » et les ganglions lymphatiques associés ............87
Tableau XII : Les différentes formes des lésions observées à l'abattoir ................................88
Tableau XIII : Principales affections entrant dans le diagnostic différentiel ....
morphologique de la tuberculose chez les bovins ....................................................................90
Tableau XIV : Principales affections entrant dans le diagnostic différentiel ....morphologique de la tuberculose chez l'Homme .....................................................................91
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