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Sélection-"validation" de modèles
L. Rouvière
laurent.rouviere@univ-rennes2.frJANVIER2015L. Rouvière (Rennes 2)1 / 77
1Quelques jeux de données
2Sélection-choix de modèles
Critères de choix de modèles
Basés sur l"ajustement (AIC-BIC)
Basés sur la prévision (probabilité d"erreur-courbe ROC)Sélection de variables
3Validation de modèles
Test d"adéquation de la déviance
Examen des résidus
Points leviers et points influents
Bibliographie
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1Quelques jeux de données
2Sélection-choix de modèles
Critères de choix de modèles
Basés sur l"ajustement (AIC-BIC)
Basés sur la prévision (probabilité d"erreur-courbe ROC)Sélection de variables
3Validation de modèles
Test d"adéquation de la déviance
Examen des résidus
Points leviers et points influents
Bibliographie
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Quelques jeux de données
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Pannes de machines
Un chef d"entreprise souhaite vérifier la qualité d"un type de machines en fonction de l"âge et de la marque des moteurs. Il dispose1d"une variable binaireY(1 si le moteur a déjà connu une panne, 0sinon);2d"une variable quantitativeagerepésentant l"âge du moteur;3d"une variable qualitative à 3 modalitésmarquereprésentant la
marque du moteur,et den=33 observations : > panne etat age marque1 0 4 A
2 0 2 C
3 0 3 C
4 0 9 B
5 0 7 B
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Pannes de machines
Un chef d"entreprise souhaite vérifier la qualité d"un type de machines en fonction de l"âge et de la marque des moteurs. Il dispose1d"une variable binaireY(1 si le moteur a déjà connu une panne, 0sinon);2d"une variable quantitativeagerepésentant l"âge du moteur;3d"une variable qualitative à 3 modalitésmarquereprésentant la
marque du moteur,et den=33 observations : > panne etat age marque1 0 4 A
2 0 2 C
3 0 3 C
4 0 9 B
5 0 7 B
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Role des femmes
Il s"agit d"une étude effectuée en 1975 aux Etats-Unis. Il s"agit d"expliquer l" accord/désaccord d"individus a vecla phr aseWomen should take care of running their homes and leave running the country up to menpar lese xeet le nombre d"années d"études des répondants . > data("womensrole",package="HSAUR") > womensrole <- womensrole[-24,] > womensrole[1:5,] education sex agree disagree1 0 Male 4 2
2 1 Male 2 0
3 2 Male 4 0
4 3 Male 6 3
5 4 Male 5 5Remarque
On est en présence de données répétées.L. Rouvière (Rennes 2)6 / 77
Role des femmes
Il s"agit d"une étude effectuée en 1975 aux Etats-Unis. Il s"agit d"expliquer l" accord/désaccord d"individus a vecla phr aseWomen should take care of running their homes and leave running the country up to menpar lese xeet le nombre d"années d"études des répondants . > data("womensrole",package="HSAUR") > womensrole <- womensrole[-24,] > womensrole[1:5,] education sex agree disagree1 0 Male 4 2
2 1 Male 2 0
3 2 Male 4 0
4 3 Male 6 3
5 4 Male 5 5Remarque
On est en présence de données répétées.L. Rouvière (Rennes 2)6 / 77
Role des femmes
Il s"agit d"une étude effectuée en 1975 aux Etats-Unis. Il s"agit d"expliquer l" accord/désaccord d"individus a vecla phr aseWomen should take care of running their homes and leave running the country up to menpar lese xeet le nombre d"années d"études des répondants . > data("womensrole",package="HSAUR") > womensrole <- womensrole[-24,] > womensrole[1:5,] education sex agree disagree1 0 Male 4 2
2 1 Male 2 0
3 2 Male 4 0
4 3 Male 6 3
5 4 Male 5 5Remarque
On est en présence de données répétées.L. Rouvière (Rennes 2)6 / 77
Maladie cardiovasculaire
Il s"agit d"expliquer la
présence/absence d" une maladie cardiovasculaire ( chd) par9 v ariables. On dispose den=462 individus. > data(SAheart,package="bestglm") > SAheart[1:5,] sbp tobacco ldl adiposity famhist typea obesity alcohol age chd1 160 12.00 5.73 23.11 Present 49 25.30 97.20 52 1
2 144 0.01 4.41 28.61 Absent 55 28.87 2.06 63 1
3 118 0.08 3.48 32.28 Present 52 29.14 3.81 46 0
4 170 7.50 6.41 38.03 Present 51 31.99 24.26 58 1
5 134 13.60 3.50 27.78 Present 60 25.99 57.34 49 1
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Maladie cardiovasculaire
Il s"agit d"expliquer la
présence/absence d" une maladie cardiovasculaire ( chd) par9 v ariables. On dispose den=462 individus.> data(SAheart,package="bestglm") > SAheart[1:5,] sbp tobacco ldl adiposity famhist typea obesity alcohol age chd1 160 12.00 5.73 23.11 Present 49 25.30 97.20 52 1
2 144 0.01 4.41 28.61 Absent 55 28.87 2.06 63 1
3 118 0.08 3.48 32.28 Present 52 29.14 3.81 46 0
4 170 7.50 6.41 38.03 Present 51 31.99 24.26 58 1
5 134 13.60 3.50 27.78 Present 60 25.99 57.34 49 1
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Sélection-choix de modèles
L. Rouvière (Rennes 2)8 / 77
Le problème desélection/choix de modèles est ici abordé sous 2angles (différents mais pas nécessairement indépendants) :1On est en présence deM1;:::;Mkmodèles et on se pose le
problème d"en choisir un.Il n"existe pas decr itèreuniv erselper mettantde définir la notion de
meilleur modèle.On parlera toujours de meilleur modèlepar r apportà un cr itèredonné .
On présentera deux types de critère :
ajustement du modèle (vr aisemblancespénalisées) capacité de prédiction du modèle2Etant donnésYune variable à expliquer etX1;:::;Xppvariables
explicatives, comment sélectionner automatiquement un modèle logistique?Il s"agit de trouver automatiquement un sous-groupe des variables explicatives permettant d"expliquerY. On parle desélection de variablesL. Rouvière (Rennes 2)9 / 77
Le problème desélection/choix de modèles est ici abordé sous 2angles (différents mais pas nécessairement indépendants) :1On est en présence deM1;:::;Mkmodèles et on se pose le
problème d"en choisir un.Il n"existe pas decr itèreuniv erselper mettantde définir la notion de
meilleur modèle.On parlera toujours de meilleur modèlepar r apportà un cr itèredonné .
On présentera deux types de critère :
ajustement du modèle (vr aisemblancespénalisées) capacité de prédiction du modèle2Etant donnésYune variable à expliquer etX1;:::;Xppvariables
explicatives, comment sélectionner automatiquement un modèle logistique?Il s"agit de trouver automatiquement un sous-groupe des variables explicatives permettant d"expliquerY. On parle desélection de variablesL. Rouvière (Rennes 2)9 / 77
Le problème desélection/choix de modèles est ici abordé sous 2angles (différents mais pas nécessairement indépendants) :1On est en présence deM1;:::;Mkmodèles et on se pose le
problème d"en choisir un.Il n"existe pas decr itèreuniv erselper mettantde définir la notion de
meilleur modèle.On parlera toujours de meilleur modèlepar r apportà un cr itèredonné .
On présentera deux types de critère :
ajustement du modèle (vr aisemblancespénalisées) capacité de prédiction du modèle2Etant donnésYune variable à expliquer etX1;:::;Xppvariables
explicatives, comment sélectionner automatiquement un modèle logistique?Il s"agit de trouver automatiquement un sous-groupe des variables explicatives permettant d"expliquerY. On parle desélection de variablesL. Rouvière (Rennes 2)9 / 77
Le problème desélection/choix de modèles est ici abordé sous 2angles (différents mais pas nécessairement indépendants) :1On est en présence deM1;:::;Mkmodèles et on se pose le
problème d"en choisir un.Il n"existe pas decr itèreuniv erselper mettantde définir la notion de
meilleur modèle.On parlera toujours de meilleur modèlepar r apportà un cr itèredonné .
On présentera deux types de critère :
ajustement du modèle (vr aisemblancespénalisées) capacité de prédiction du modèle2Etant donnésYune variable à expliquer etX1;:::;Xppvariables
explicatives, comment sélectionner automatiquement un modèle logistique?Il s"agit de trouver automatiquement un sous-groupe des variables explicatives permettant d"expliquerY. On parle desélection de variablesL. Rouvière (Rennes 2)9 / 77
Le problème desélection/choix de modèles est ici abordé sous 2angles (différents mais pas nécessairement indépendants) :1On est en présence deM1;:::;Mkmodèles et on se pose le
problème d"en choisir un.Il n"existe pas decr itèreuniv erselper mettantde définir la notion de
meilleur modèle.On parlera toujours de meilleur modèlepar r apportà un cr itèredonné .
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