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MtDNA encodes for essential proteins involved in ATP production and maintenance of integrity of this genome is thus of crucial importance. Mutations in mtDNA.
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19 Goat breeding and feeding systems in Mediterranean More than other grazing ruminants goats exercise considerable selection and are.
Estimation des émissions et puits de méthane par inversion
votre expertise n'ont d'égales que votre humilité et votre gentillesse. Philippe merci d'avoir été E19 : (Etiope et al.
Thè se de doctorat
votre expertise n'ont d'égales que votre humilité et votre gentillesse. Philippe merci d'avoir été E19 : (Etiope et al.
Thèse de doctorat
NNT : 2021UPASJ015Estimation des émissions et puits de méthane par inversion atmosphérique multi-contraintes du transport et de la chimie atmosphérique à l"aide d"un ensemble d"observations Estimating methane emissions and sinks by multi-constraint inversion of at- mospheric transport and chemistry assimilating an ensemble of observa- tions Thèse de doctorat de l"université Paris-SaclayÉcole doctorale n
129, Sciences de l"environnement d"Île-de-France (SEIF)
Spécialité de doctorat : Météorologie, océanographie, physique de l"environnement Unité de recherche : Laboratoire des Sciences du Climat et de l"Environnement Référent : Université de Versailles -Saint-Quentin-en-Yvelines Thèse présentée et soutenue à Paris-Saclay, le 15 décembre 2021, parJoël THANWERDAS
Composition du jury :Valérie DauxPrésidenteProfesseure, LSCE/UVSQ Vincent-Henri PeuchRapporteur & ExaminateurDirecteur de recherche, ECMWF Peter RaynerRapporteur & ExaminateurProfesseur, Université de Melbourne (Australie) Guillaume MonteilExaminateurChercheur, Université de Lund (Suède) Martina SchmidtExaminatriceDirectrice de recherche, Université de Heidelberg (Allemagne) Direction de la thèse :Philippe BousquetDirecteurProfesseur, LSCE/UVSQ Marielle SaunoisCo-encadranteEnseignante-Chercheuse, LSCE/UVSQ Antoine BerchetInvitéIngénieur-Chercheur, LSCE/CEARemerciements
comité de thèse. Un grand merci également à Peter Rayner d"avoir accepté d"évaluer ce manuscrit. Enfin,
merci à Guillaume Monteil et Martina Schmidt d"avoir accepté de faire partie du jury d"évaluation de
cette thèse. "If I have seen further it is by standing on the shoulders of Giants." - Isaac NewtonPendant ces travaux de thèse, j"ai eu la chance d"être encadré par quatre brillant.e.s chercheur.se.s
que je tiens à remercier chaleureusement. Marielle, Antoine, Isabelle, Philippe, vos connaissances et
votre expertise n"ont d"égales que votre humilité et votre gentillesse. Philippe, merci d"avoir été aussi
présent malgré tes nombreuses responsabilités. Merci pour tes conseils ainsi que pour tes nombreux mots
d"encouragement qui m"ont porté tout au long de ma thèse. Isabelle, merci pour tes conseils réguliers et
toujours judicieux qui résonneront encore longtemps dans mon esprit. Merci aussi de transmettre autour
de toi ta motivation et ton entrain à toute épreuve. Antoine, merci d"avoir été aussi présent et de n"avoir
montré aucun signe d"impatience devant un petit thésard ignare en quête de connaissances. Tu resteras
longtemps un de mes modèles d"excellence, autant techniquement que scientifiquement. Enfin, mercimille fois Marielle pour ton temps, ta gentillesse, ton écoute et ta disponibilité. Tu as su me transmettre
patiemment une rigueur de travail que j"étais loin de posséder au commencement de cette thèse. Par
ailleurs, je n"ai jamais cessé d"être impressionné par l"étendue de tes connaissances sur le méthane. Merci
à vous quatre de m"avoir tant apporté et de m"avoir accordé une telle confiance.Je tiens aussi à remercier chaleureusement Frédéric Chevallier. Merci d"avoir toujours gardé ta porte
ouverte. Merci pour tes conseils avisés et tes explications toujours claires qui ont régulièrement réussi à
allumer une lumière dans mon esprit. Rien ne vaut une bonne discussion de couloir!Merci à l"équipe IT et au personnel administratif pour leur soutien et leur efficacité. J"ai eu de nom-
breuses occasions au cours de ces trois années de venir solliciter votre aide et vous avez toujours su
répondre avec gentillesse à ces demandes. Merci aux doctorants, post-doctorants, CDD, permanents et stagiaires du LSCE qui m"ont fait rirele temps d"un repas, d"une pause, d"un débat de société ou d"une soirée sportive ou festive (le foot et le
volley restant les deux meilleurs anti-dépresseurs). Merci tout particulièrement à Leslie, Audrey, Élise
et Grégoire pour votre présence, votre soutien et pour l"ensemble des fous rires partagés tout au long de
icette thèse. Merci à toi Franck, petit oiseau parti trop vite (peut-être pour le bien de ma thèse), pour cet
humour qui restera gravé dans ma mémoire. Merci aux groupes GTEE et climactions pour avoir considérablement enrichi ma réflexion sur lesimpacts environnementaux de la recherche et, plus généralement, sur le lien entre changement climatique
et société. Merci aussi de m"avoir montré tous les bénéfices de l"action en groupe. Merci pour votre
motivation sans faille, votre indignation raisonnée et votre espoir.Merci à l"ensemble du corps enseignant qui m"a formé, a éveillé ma curiosité et m"a appris à me
questionner. Merci d"avoir façonné l"esprit qui me permet aujourd"hui de comprendre le monde dans
lequel je vis et de pouvoir participer à la construction de celui dans lequel j"aimerais vivre. Merci aussi
au système éducatif français qui m"a permis d"accéder (presque) gratuitement à cet enseignement.
passer, accélérer, enrouler, smasher, corser et bloquer pendant ces trois années. Rien ne vaut un bon
entraînement de volley pour se libérer du poids d"une thèse!Merci aussi à tous mes amis qui m"ont soutenu et encouragé. Finalement, je l"ai trouvé cette atmo-
sphère. Enfin, je crois.Merci à Aliyah et Philippe pour leur soutien et leur infinie gentillesse en toute situation. Merci aussi
pour ces belles semaines passées à rédiger dans les montagnes de la Haute-Savoie.Merci à ma famille d"avoir toujours accepté mes choix et cru en moi. Merci à vous d"être si ouvert.e.s
d"esprit et d"accepter la remise en question. Merci pour ces débats bienveillants qui m"enrichissent et me
font grandir. Merci pour votre soutien inconditionnel pendant ces trois années, surtout dans les périodes
les plus sombres. Merci Papa et Maman de m"avoir transmis votre amour du vivant. Merci Maman etMamie, d"avoir été si précurseurs sur bien des sujets importants. Merci Mamie pour toute ta tendresse,
Merci Papi et Mamaya pour vos sourires, votre intelligence et votre fierté à l"égard de vos petits-enfants.
Merci à vous tous d"avoir pavé ma voie.
Enfin, merci à Yona. Merci de me tirer vers le haut au quotidien, par ta profondeur de réflexion, par
les désespoirs et les accomplissements de cette thèse avec toi m"a permis d"aller jusqu"au bout.
iiTable des matières
Remerciementsii
Table des matièresiii
Table des figuresviii
Liste des tableauxx
Introduction
3Partie I Introduction générale
5 I Évolution et impacts du méthane atmosphérique 71 Le méthane à travers l"histoire de la Terre
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81.1 Découverte contemporaine
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81.2 Origine du méthane sur Terre
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 101.3 Les variations de concentrations atmosphériques de méthane...
. . . . . . . . . . 111.3.1 ... des 800 000 dernières années
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 111.3.2 ... du dernier millénaire
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121.3.3 ... des dernières décennies
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Les impacts du méthane sur notre environnement
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142.1 Le rôle du méthane dans la chimie atmosphérique
. . . . . . . . . . . . . . . . . 142.2 Le rôle du méthane dans le réchauffement climatique
. . . . . . . . . . . . . . . 14II Le cycle biogéochimique du méthane
171 Les sources d"émission de méthane
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 181.1 Les sources biogéniques
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 181.1.1 Les zones humides
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 191.1.2 La culture du riz
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 201.1.3 Les déchets
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 201.1.4 Le bétail
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 201.1.5 Les termites
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 211.1.6 Les eaux douces
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 iiiTABLE DES MATIÈRES
1.1.7 Le permafrost
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 211.2 Les sources thermogéniques
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 211.2.1 Gaz naturel, pétrole et charbon
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 221.2.2 Sources géologiques
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 221.2.3 Hydrates de méthane
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 221.3 Les sources pyrogéniques
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 231.3.1 La combustion de biomasse
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 231.3.2 La combustion de biocarburants
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 232 Les puits de méthane
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 242.1 L"oxydation par des radicaux libres
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 242.1.1 Le radical hydroxyle OH
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 242.1.2 L"oxygène atomique O(
1D). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26
2.1.3 Le chlore atomique Cl
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 272.2 L"oxydation par le sol
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27 III Estimer le budget du méthane : approches classiques et intérêts des isotopologues 291 La quantification du bilan de méthane
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 301.1 Approche montante
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 301.2 Approche descendante
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 301.3 Liens et incertitudes
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 312 Les isotopologues du méthane : caractéristiques et intérêts
. . . . . . . . . . . . . . . . 322.1 Définition et présentation des différents isotopologues du méthane
. . . . . . . . 322.2 Le fractionnement isotopique d"un puits
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 332.3 La signature isotopique d"une source
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 342.4 Les variations temporelles des signaux isotopiques atmosphériques
. . . . . . . 362.4.1 Équation d"évolution temporelle du rapport isotopique atmosphérique
362.4.2 Observation de l"évolution temporelle des signaux isotopiques
. . . . 373 L"utilisation des observations isotopiques au coeur des objectifs de cette thèse
. . . . . . 383.1 La contrainte isotopique
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 383.2 Plan de thèse
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39Partie II Matériels et méthodes
41IV Modélisation et observation du méthane atmosphérique 43
1 Présentation du modèle de chimie-transport LMDz-SACS
. . . . . . . . . . . . . . . . . 441.1 Introduction à la modélisation atmosphérique
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 441.2 Équation de continuité et approche eulérienne
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 451.3 Le modèle de transport LMDz
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 461.4 Le module de chimie simplifiée SACS
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 472 Les ingrédients d"une simulation avec LMDz-SACS
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 482.1 Conditions initiales
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 482.2 Sources
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 492.3 Puits
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 502.4 Signatures isotopiques de sources
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 513 L"observation du méthane atmosphérique
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 533.1 Les mesures in-situ et flacon
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 533.2 Les mesures par télédétection
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