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Lycée Saint Martin
5 Cloître Saint Martin - BP 32209
49022 Angers cedex 02
Tel:02 41 88 09 00
lycee.st.martin@numericable.frSVTTRAVAUX PRATIQUES :
FICHE " ACTIVITÉ »NOM :
Prénom :
Classe : Première S
:: Variation génétique et santé :: C - Variation génétique bactérienne et résistance aux antibiotiquesDeux personnes " X1 » et " X2 » présentent exactement les mêmes symptômes d'une maladie
infectieuse.On réalise des prélèvements et après analyse il s'avère que leur maladie est due à un même agent
infectieux : une bactérie.On appelle " S1 » la souche bactérienne prélevée chez la personne " X1 » et " S2 » celle prélevée chez
la personne " X2 ».On cherche à déterminer si un même traitement utilisant l'antibiotique " A » sera adapté à ces deux
malades.Pour cela on réalisera deux antibiogrammes.
Matériel mis à disposition :
•1 PC avec un accès à Internet •netBioDyn est un environnement permettant la modélisation et la simulation de mécanismes biologiques complexes. •1 modèle (inclus par défaut dans netBioDyn) permettant de simuler la réalisation d'antibiogrammes et comprenant : •des " boîtes » = boîtes de Pétri avec milieu gélosé nutritif ; •des " pastilles » = disques de papier buvard imprégné d'une quantité définie de l'antibiotique A •des " Bactéries1 » = souche bactérienne S1 prélevée chez la personne X1 ; •des " Bactéries2 » = souche bactérienne S2 prélevée chez la personne X2 ;•Un document de référence : " Mesure de l'activité antibactérienne des antibiotiques:
l'antibiogramme ».•une fiche technique : " Logiciel Biodyn - Fonctionnalités utiles pour faire tourner un modèle »
•Une fiche " réponses ».Activités à réaliser :
Etape 1)- A partir des informations fournies dans le document de référence, justifiez l'intérêt de réaliser
deux antibiogrammes pour répondre au problème posé. Répondez sur la fiche " réponses ».
Etape 2)- Démarrez netBioDyn. Préparation de la simulation.•Dans la zone " Environnement », déposez 2 " boîtes » : cliquez sur " boite » dans la zone
" Panel » pour sélectionner cette entité, puis utilisez l'outil " crayon » pour disposer une " boite »
(simple clic) dans la zone " environnement ». NB : les " boites » apparaissent sous la forme de
figures rectangulaires !•Au centre de chaque " boite », déposez une " pastille » (imprégnée d'antibiotique " A ») : cliquez
sur "pastille» dans la zone " Panel » pour sélectionner cette entité, puis utilisez l'outil " crayon »
pour disposer une " pastille » (simple clic) au centre de chaque " boite » située dans la zone
" environnement ».•Dans une " boite », déposez 20 " Bacterie1 » : cliquez sur " Bactérie1 » dans la zone " Panel »
pour sélectionner cette entité, puis utilisez l'outil " crayon » pour disposer de façon homogène 20
© JMH 05/12/2012 - http://ent.sapiens-jmh.planethoster.org01S-3B_03_TP_Protocole.odtpage 1 / 2" Bactérie1 » (20 x simple clic) dans une " boite » située dans la zone " environnement ».
•Dans l'autre " boite », déposez 20 " Bacterie2 » en procédant de la même manière.
Réalisez une copie d'écran de votre environnement netBioDyn dans son état initial que vous " collerez »
sur la fiche réponse.3)- Réalisation de la simulation.
•Dans la zone " Panel », cliquez sur " Bacterie1 » puis (Ctrl + Clic) sur " Bacterie2 » pour
sélectionner ces entités. •Cliquez sur le bouton " play » pour lancer la simulation.•Observez la formation progressive d'une auréole d'inhibition bactérienne autour de chaque
" pastille » et la variation des populations bactériennes en fonction du temps dans la " fenêtre
d'affichage des résultats ».•Cliquez sur le bouton " pause » pour stopper la simulation dès que l'effectif des deux populations
bactériennes se stabilise. NB : l'arrêt de la simulation provoque l'ouverture d'une fenêtre d'alerte : ne pas relancer la simulation depuis le début (cliquez sur " non »).Réalisez une copie d'écran de votre environnement netBioDyn dans son état final que vous " collerez »
sur la fiche réponse.4)- Détermination du diamètre (en pixels) des auréoles d'inhibition.
A l'aide du curseur de " zoom » et du bouton de " Deplacement », agrandissez et centrez une " boite »
dans la zone environnement.En prenant comme échelle " 1 point coloré figurant une bactérie » = " 1 pixel », estimez le diamètre de
l'auréole d'inhibition en pixels. Faites la même chose avec l'autre " boite ».Reportez vos résultats en ordonnée sur le graphique de concordance figurant sur la fiche " réponses ».
5)- A partir des réponses aux questions suivantes, répondre au problème initial.
Déterminez graphiquement la concentration minimale inhibitrice (CMI) de l'antibiotique " A » pour la
souche " S1 » et pour la souche " S2 ».Comparez ces CMI à la " concentration critique supérieure » (CCS) d'une part et à la " concentration
critique inférieure » (CCI) d'autre part. Répondez sur la fiche " réponses ».