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TP20 ACTION DE MEDICAMENTS ANTI-INFLAMMATOIRES

Les anti-inflammatoires sont des médicaments utilisées existant lors de la réaction inflammatoire aigüe. Il en existe 2 types :

- les non stéroïdiens (AINS) (aspirine, ibuprofène, paracétamol. - les stéroïdiens (AIS) qui contiennent une hormone : les corticoïdes -inflammatoires.

Mise en situation et recherche à mener

Au cours de la réaction inflammatoire aigüe, la prostaglandine, comme la douleur

enzyme, nommée COX, qui permet la réaction aboutissant à la synthèse de la prostaglandine.

L'acide acétylsalicylique, mieux connu sous le nom d'aspirine, était un des anti-inflammatoires non-bloquant son

site actif. L. de arachido Concevoir une stratégie pour résoudre une situation problème

1- Lisez les documents ressources 1 à 3 puis proposez une stratégie de résolution réaliste permettant de montrer

Document 3 :

de la COX -7 à 10-3

µM).

Document 2 : La chaine de synthèse des prostaglandines

Parmi les molécules synthétisées lors de la réaction inflammatoire aigüe, certaines

prostaglandines provoquent une vasodilatation et une augmentation de la perméabilité cellule sécrétrice sont représentées ci-dessous :

Molécule de la membrane

Phospholipase

Acide arachidonique

Cyclooxygénases (COX)

Prostaglandines H et G

Prostaglandine synthase

Prostaglandines E, F, D = molécules inflammatoires NB : Chaque transformation chimique ne peut se produire spontanément : chacune

Document 1 : La réaction enzymatique

Les . Pour agir, doit entrer en contact avec la molécule de substrat (acide arachidonique) qui lui est spécifique pour

former un complexe enzyme-substrat . Cette liaison avec la molécule de substrat conduit à la libération des produits de la réaction (prostaglandines).

Ce contact au niveau du site actif complémentaire de forme de la molécule de substrat (acide arachidonique).

hidonique et ne pourra pas le transformer en prostaglandines.

Des études de biologie moléculaire ont déterminé que seuls certains acides aminés du site actif, dont on connait la position, assurent une liaison temporaire avec le substrat spécifique pour permettre

le déroulement de la réaction. Il est possible de mettre en évidence ces acides aminés du site actif .

La réaction enzymatique se résume ainsi :

Enzyme + Substrat Complexe enzyme/substrat Enzyme + Produit

Site actif de

2- Ouvrez le complexe enzyme-substrat " enzyme COX- acide arachidonique » avec libmol et utilisez les fonctionnalités du logiciel pour mettre en évidence judicieusement la zone de

liaison entre enzyme et substrat.

Prise mol pour visualiser des molécules en 3D

Sur internet logiciel en ligne : libmol.org

Exemple des anti-inflammatoires

Dans la fenêtre fichier, rechercher dans la librairie de molécules : COX

1ère visualisation : sélectionner dans la liste cyclooxygénase et son substrat (acide arachidonique).

Seuls quelques acides aminés du site actifs sont fondamentaux dans la réalisation du complexe enzyme-substrat, le 120, le 355 et le 385.

Vous allez devoir colorer les acides aminés du site actif. Pour cela : - " commande », " représenter », " squelette »

- " Séquence », et là sélectionner les acides aminés correspondants que vous voulez colorer (en prenant le mode de représentation

" sphères »).

ATTENTION :

* Si tous les acides aminés sont déjà sélectionnés dans la liste, cliquer sur aucun. * aucun utre couleur ;

2ème étape : complémentarité de forme entre les acides aminés du site actif et le substrat

» pour former le complexe enzyme-substrat.

Vela :

- revenir dans " commande » - " autre » - Puis dans " représenter » sur " sphères » - Et vous choisir la couleur dans " colorer » " palette ».

Si vous ny parvenez pas envoyer moi un mail !

Exploiter les résultats obtenus pour répondre au problème

3- Exploitez les résultats (réponse à la question 2 et résultats si-dessous) pour montrer que

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