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GHV S·PLP SMVBBB
en arrière... et des grands pas ... en avant... dans la SystématiqueProf. Patrick DAUBY
Ms Zoologie, Ms Océanologie, PhD OcéanologieSystématique et Diversité animale
Institut de Chimie, B6c
04-366.33.22
pdauby@uliege.be la Systématique F·HVP TXRL " - science de la classification des espèces (Taxonomie) (identification, description & inventaire) - présents & passés (fossiles) - mais aussi étude des relations entre espèces ou groupes G·HVSqŃHV GRQŃ GH OM Phylogénie G·RZ GH O·Evolution) -Outils: Morphologie, Embryologie, Génétique, Sérologie, Immunologie, Protéomique, mais aussi Ethologie, Morpho- fonctionnelle, Ecologie... toutes les disciplines de la Biologie la Systématique F·HVP TXRL "La place de la Systématique en Biologie
Systématique analytique (µicroSystématique) = Taxonomie Description espèces & taxons infra- & supraspécifiques Systématique synthétique (MacroSystématique) = PhylogénieOrganisation des taxons en Clades
TAXONOMIE:
Classification suivant caractères apparents = Phénétique du niveau infraspécifique ÓXVTX·MX QLYHMX GX 3O\OXP terrain (clés), pas de liens de parenté nécessaires Reptilia AvesPHYLOGÉNIE:
FOMVVLILŃMPLRQ OLpH j O·LGpH G·pYROXPLRQ Cladistique GX QLYHMX GH O·HVSqŃH ÓXVTX·MX QLYHMX GX 3O\OXP recherche de liens de parenté
notions de plésiomorphie G·apomorphie" (cfr plus loin) taxon (caractères nouvellement acquis) vs ses voisins supposés Lepidosauria ArchosauriaWilli Hennig
La place de la Systématique en Biologie
7UMYMLOOHU ORUV OM QRPLRQ G·HVSqŃH HVP XQH HQPUHSULVH MOpMPRLUH YRLUH LQXPLOH
Sinon, beaucoup de travaux de physiologie, de biochimie..... inutilisablesAttitudes condamnables
paresse, ignorance, dédain
(qui justifie la différence entre espèces), voire intraspécifique...??? une molécule, un gène, etc... est/a une existence/fonction indépendante deO·RUJMQLVPH RZ LO VH PURXYH.
Nomina si nescis, perit et cognitio rerum (K.Linnaeus) Si tu ignores le nom des choses, même leur connaissance disparaîtLa place de la Systématique en Biologie
Conséquences....
- Désintérêt croissant cadres - perte de la connaissance SOXVLHXUV JURXSHV Q·RQP plus de spécialistes)Mais....
- 3ULVH GH ŃRQVŃLHQŃH PRQGLMOH GH O·pURVLRQ de la biodiversité - FUpMPLRQ G·RUJMQLVPHV LQPHUQMPLRQMX[ GH recensement (ITIS, CITES, WoRMS...) - $X 01+1 3MULV ŃUpMPLRQ G·XQ Master enSystématique
- la cladistique (notamment basée sur la génétique) a redonné un coup de fouet (implicationsévolutives)
molécularistes systématiciens tsunamiLa place de la Systématique en Biologie
science aussi vieille que le langage humain
exemple des Papous (137/138 oiseaux)
QRPV YHUQMŃXOMLUHV ÓXVTX·MX 18e
gujavice, korien, ..... Linné (Karl von Linnaeus) et son Systema naturae (1735). La 10e édition (1758): point de départ de la nomenclature bota + zoolo Fixisme > Catastrophisme > Transformisme > Evolutionnisme Début du 20e, intérêt croissant pour la variabilité intraspécifique. Puis Intégration de tous les aspects de la Biologie animale dans un système ŃRPSMPLNOH MYHŃ OHV ŃRQŃHSPV G·pYROXPLRQ GH VSpŃLMPLRQ GH JpQpPLTXHBBB = la " nouvelle systématique »La place de la Systématique en Biologie
XQ SHX G·OLVPRLUH
Unité taxonomique =
(définie sur 1 individu)Holotype
Catégories infraspécifiques de
critères morphologiquesQuestions de nomenclature et de
priorité primordialesSystématique classique
La place de la Systématique en Biologie
XQ SHX G·OLVPRLUH
Unité taxonomique =
(définie sur 1 individu)Unité = population
(100, 1000...)Catégories infraspécifiques de
Catégories infraspécifiques
primordiale critères morphologiquesCaractères empruntés à
biochimie, la génétique...Questions de nomenclature et de
priorité primordialesQuestions de nomenclature sans
intérêt. Systématique classique nouvelle SystématiqueLa place de la Systématique en Biologie
XQ SHX G·OLVPRLUH
-FRQŃHSP G·espèce et problèmes associés -FRQŃHSP G·espèce et problèmes associés espèce biologiqueQuelques rappels:
Amixie: impossibilité de croisement entre 2 espèces Amphimixie: Appariement des chromosomes mâles et femelles dans l'ovule fécondé, constituant le point de départ d'un nouvel individu Sympatrie: En biologie, deux espèces ou populations sont sympatriques quand elles existent dans la même zone géographique et par conséquent se rencontrent régulièrement Allopatrie: par opposition, espèces ou populations qui ne vivent que rarement dans la même zone géographique Vicariance: fait que deux espèces ou populations allopatriques occupent des niches écologiques similaires Seul critère valable (eumétazoaires): AMIXIE, ou isolement reproductifE. Mayr (1963):
" JURXSH GH SRSXOMPLRQV G·LQGLYLGXV HQPUH OHVTXHOV O·MPSOLPL[LH HVP SHUPMQHQPH RX UpMOLVMNOH VSRQPMQpPHQP PMQGLV TX·HOOH HVP impossible, exceptionnelle ou artificielle avec des individus MSSMUPHQMQP j G·MXPUHV JURXSHV GH SRSXOMPLRQ »Ernst Mayr
(1904-2005) -FRQŃHSP G·espèce et problèmes associés espèce biologique amphimixie amixie sympatriques allopatriquesMême population de la même
espècePopulations différentes de la
même espèceEspèces jumelles
Espèces jumelles
sympatriques allopatriquesVariants individuels
même populationSous-espèces # ou variants
individuels de populations # de la même espèceEspèces différentes
Espèces différentes
Identité
morphologiqueDifférence
morphologique0pŃMQLVPHV G·LVROHPHQP UHSURGXŃPLI (en sympatrie):
1. de nature éthologique (signaux lors des parades sexuelles...)
2.de nature physiologique (notamment les phéromones)
-FRQŃHSP G·espèce et problèmes associés espèce biologique0pŃMQLVPHV G·LVROHPHQP UHSURGXŃPLI (en sympatrie):
3. de nature mécanique (anatomique)
cas des pièces copulatrices (édéages, genitalia) chez les arthropodes -FRQŃHSP G·espèce et problèmes associés espèce biologique0pŃMQLVPHV G·LVROHPHQP UHSURGXŃPLI (en sympatrie):
4. de nature écologique (niches)
5.de nature phénologique, biochimique, génétique ...
1 couple
5 genres
14 espèces
-FRQŃHSP G·espèce et problèmes associés espèce biologique pinsons des Iles Galapagos Pour établir la classification des organismes en SystématiqueTaxonomiques·· F7·V
définition: " tout attribut G·XQ organisme par lequel celui-ci diffère de tout autre organisme appartenant à une catégorie systématique différente, et par lequel il ressemble à tout autre organisme appartenant à la même catégorie systématique que lui- même » au point de vue biologique, un CT est O·H[SUHVVLRQ de O·MŃPLRQ de 1 ou + gène(s) = portions G·$G1 Ź mRNA Ź rRNA Ź protéines (enzymes)Problèmes des Caractères taxonomiques (CT)
OK, mais quid de la façon dont les formes spécifiques des structures morphologiques sont commandées par les gènes ? Pas encore ou peu connu... Comparant 2 arthropodes dont la cuticule diffère par la nature chimique de protéinesMVVRŃLpHV j OM ŃOLPLQH RQ SHXP UHPURXYHU OHV V\QPOpPMVHV HP GRQŃ LQ ILQH OHV SRUPLRQV G·$G1
mises en cause. Si la différence porte non sur la nature biochimique de la cuticule, mais sur sa morphologie pSLQHV VPULHVBBB PUqV SHX G·H[SOLŃMPLRQV SHXYHQP rPUH actuellement proposées....Problèmes des Caractères taxonomiques (CT)
une famille, n morphologies n phénotypes quid génotypes ?Hexapoda
Hemiptera
Membracidae
Un CT peut donc être
une molécule organique (1 seul gène impliqué) une structure, un comportement... (plusieurs gènes impliqués) LGpMOHPHQP LQYHQPMLUH GHV F7 GLUHŃPHPHQP MX QLYHMX GHV VpTXHQŃHV GH NMVHV G·$G1B $SSMUHPPHQP
Homologie si et seulement si: identité fondamentale et ŃRPPXQMXPp G·RULJLQH (formation avec les mêmes morceaux dérivés des mêmes ébauches embryonnaires, abstraction faite de la fonction)