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´El´ements de Calcul Matriciel

et d"Analyse Factorielle de Donn´ees

Jean-Fran¸cois Durand

jfd@helios.ensam.inra.fr

Universit´e Montpellier II

Licence MASS

Maˆıtrise MASS

Maˆıtrise d"Ing´enierie Math´ematique

DEA de Biostatistique

Novembre 2002

Calcul Matriciel et Analyse Factorielle des Donn´ees

J.F. Durand2

Table des mati`eres1 Matrices, D´efinitions et Propri´et´es9

1.1 Notations et premi`eres d´efinitions . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . 9

1.2 Matrice associ´ee `a une application lin´eaire . . . . . . .. . . . . . . . . . . 11

1.3 Quelques matrices particuli`eres . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . 11

1.3.1 Matrice adjointe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11

1.3.2 Matrices hermitiennes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12

1.4 Image, noyau, rang d"une matrice . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . 12

1.4.1 Image d"une matrice . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13

1.4.2 Noyau d"une matrice . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13

1.4.3 Rang d"une matrice . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14

1.5 D´eterminant d"une matrice carr´ee . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . 14

1.6 Inverse d"une matrice carr´ee . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . 15

1.7 Changements de base . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16

1.7.1 Effet sur les coordonn´ees d"un vecteur . . . . . . . . . . . . .. . . . 16

1.7.2 Effet sur les ´el´ements d"une matrice . . . . . . . . . . . . . .. . . . 17

1.8 Valeurs propres, vecteurs propres . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . 18

1.9 Trace d"une matrice carr´ee . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . 20

1.10 Formes lin´eaires, formes quadratiques . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . 20

1.11 Matrices orthogonales et unitaires . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . 22

1.11.1 Les matrices de permutation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. 22

1.11.2 Les matrices de rotation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .23

1.11.3 Construction d"une base orthonorm´ee par le proc´ed´e de Gram-Schmidt 24

1.12 Op´erateur vec et produit de Kronecker . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . 24

1.12.1 L"op´erateur vec . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24

1.12.2 Produit de Kronecker . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25

1.12.3 Matrice de commutation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27

3 Calcul Matriciel et Analyse Factorielle des Donn´ees

1.13 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28

2 D´ecomposition de Matrices33

2.1 Les projecteurs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33

2.1.1 Sous espaces suppl´ementaires et projecteurs . . . . . .. . . . . . . 34

2.1.2 Exemple fondamental . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34

2.1.3 D"autres matrices orthogonales : les matrices de r´eflexion . . . . . . 36

2.2 Matrices carr´ees diagonalisables . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . 37

2.3 Factorisation QR d"une matrice rectangulaire . . . . . . . .. . . . . . . . 38

2.4 D´ecomposition unitaire des matrices carr´ees . . . . . . .. . . . . . . . . . 39

2.4.1 Le th´eor`eme de Schur . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39

2.4.2 Matrices normales . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40

2.5 D´ecomposition en valeurs singuli`eres . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . 42

2.5.1 Deux versions de la DVS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43

2.5.2 D´ecomposition polaire . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46

2.6 Factorisation de Cholesky d"une matrice sym´etrique d´efinie positive . . . . 47

2.7 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48

3 Normes de Matrices51

3.1 Normes de vecteurs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51

3.1.1 Normes de H¨older . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52

3.1.2 G´en´eralisation de la norme Euclidienne, laM-norme . . . . . . . . 54

3.2 Normes de matrices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56

3.2.1 Normes subordonn´ees `a des normes vectorielles . . . .. . . . . . . 56

3.2.2 Normes Euclidiennes par vectorisation . . . . . . . . . . . .. . . . 58

3.2.3 Normes matricielles sous multiplicatives . . . . . . . . .. . . . . . 60

3.2.4 Normes unitairement invariantes . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . 61

3.3 Suites de matrices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62

3.4 Conditionnement d"une matrice . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . 63

3.5 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64

4 Inverses G´en´eralis´es, ProjecteursM-Orthogonaux 67

4.1 Inverses G´en´eralis´es . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . 67

4.1.1 D´efinition et propri´et´es . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . 67

4.1.2 Inverse de Moore-Penrose . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70

4.2 ProjecteursM-orthogonaux . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71

J.F. Durand4

Calcul Matriciel et Analyse Factorielle des Donn´ees

4.2.1 ProjecteurM-orthogonal surImA. . . . . . . . . . . . . . . . . . 72

4.2.2 Un probl`eme aux moindres carr´es . . . . . . . . . . . . . . . . .. . 74

4.3 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 76

5 D´erivation Matricielle77

5.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77

5.2 D´erivation matricielle . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . 77

5.2.1 Matrices Jacobiennes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77

5.2.2 Hessien de fonctions num´eriques . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . 81

5.3 Extremums de fonctions num´eriques . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . 82

5.3.1 Probl`emes d"extremums libres . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . 84

5.3.2 Probl`emes d"extremums li´es . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . 84

5.4 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 86

6 Le paysage math´ematique et statistique de l"Analyse Factorielle de

Donn´ees : la g´eom´etrie Euclidienne89

6.1 Le triplet (T,M,D) des donn´ees . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90

6.2 Statistique et g´eom´etrie sur (IRn,D), espace des variables . . . . . . . . . . 91

6.2.1 Le simplexe des poids statistiques et la droite des constantes . . . . 91

6.2.2 Moyenne et centrage vus comme une projection . . . . . . . .. . . 92

6.2.3 Variance et ´ecart-type . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93

6.2.4 Proximit´e entre deux variables, covariance et corr´elation lin´eaire . . 94

6.2.5 D´efinitions et notations pour la statistique multivari´ee . . . . . . . 96

6.3 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 98

7 G´en´eralisation de la D´ecomposition en Valeurs Singuli`eres. Analyse en

Composantes Principales du triplet(X,M,D)101

7.1 D´ecomposition en Valeurs Singuli`eres du triplet . . . .. . . . . . . . . . . 102

7.1.1 Lemme . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 102

7.1.2 La DVS du triplet (X,M,D) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103

7.1.3 Relation avec la DVS usuelle . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .104

7.1.4 Projecteurs orthogonaux associ´es `a la DVS . . . . . . . .. . . . . . 105

7.1.5 Th´eor`eme d"approximation d"Eckart-Young . . . . . . .. . . . . . . 105

7.2 Analyse en Composantes Principales d"ordrekdu triplet (X,M,D) . . . . 106

7.2.1 D´efinitions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 107

7.2.2 Principe fondamental de l"Analyse Factorielle . . . . .. . . . . . . 108

5J.F. Durand

Calcul Matriciel et Analyse Factorielle des Donn´ees

7.2.3 L"ACP usuelle d"ordrek. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110

7.3 Repr´esentations factorielles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . 111

7.3.1 D´efinitions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 111

7.3.2 Projections des points lignes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . 114

7.3.3 Projections des vecteurs colonnes . . . . . . . . . . . . . . . .. . . 118

7.3.4 ´El´ements suppl´ementaires . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121

7.4 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 123

7.5 Formulaires . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132

7.5.1 ACP usuelle d"ordrekdu triplet (X,M=Ip,D=n-1In) . . . . . . 132

7.5.2 DVS du triplet (X,M,D) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132

8 Traitement d"enquˆetes, Analyse Factorielle des Correspondances

Simples et Multiples135

8.1 Variables d"une enquˆete, codage . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . 135

8.1.1 Variables qualitatives . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. 135

8.1.2 Indicatrice des modalit´es . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . 136

8.2 Table de contingence, liaison entre deux variables qualitatives . . . . . . . 137

8.2.1 D´efinitions et notations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. 138

8.2.2 Ind´ependance de deux variables qualitativesLetC. . . . . . . . . 140

8.2.3 Profils lignes et colonnes, distributions conditionnelles . . . . . . . . 141

8.3 Analyse Factorielle des Correspondances . . . . . . . . . . . .. . . . . . . 143

8.3.1 D´efinition et propri´et´es . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . 143

8.3.2 ´El´ements propres des op´erateurs en dualit´e . . . . . . . . . . .. . . 145

8.3.3 Pratique de l"AFC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 146

8.3.4 Cas d"une variable ordinale, rapport de corr´elationet "optimal sco-

ring" . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149

8.4 Analyse Factorielle des Correspondances Multiples . . .. . . . . . . . . . . 152

8.4.1 D´efinitions et propri´et´es . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . 152

8.4.2 Pratique de l"AFCM . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155

8.5 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156

8.5.1 Analyse Factorielle des Correspondances . . . . . . . . . .. . . . . 156

8.5.2 Analyse Factorielle des Correspondances Multiples .. . . . . . . . . 161

9 La r´egression Partial Least-Squares lin´eaire 165

9.1 Motivations pour les r´egressions factorielles . . . . . .. . . . . . . . . . . . 166

J.F. Durand6

Calcul Matriciel et Analyse Factorielle des Donn´ees

9.2 La r´egression sur composantes principales . . . . . . . . . .. . . . . . . . . 167

9.3 Le contexte et le mod`ele PLS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. 168

9.4 L"algorithme PLS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 169

9.4.1 Le centrage des variables . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170

9.4.2 Construction de la composanteti. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171

9.4.3 Les r´egressions partielles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . 173

9.5 Premi`ere ´ecriture des mod`eles PLS en les composantes. . . . . . . . . . . 175

9.6 Orthogonalit´e des composantes principales et des poids . . . . . . . . . . . 176

9.7 ´Ecriture d´efinitive des mod`eles PLS en les composantes . . .. . . . . . . . 178

9.8 Les composantes PLS, compromis lin´eaires des variables explicatives initiales180

9.8.1 Expression du vecteur des poids . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. 181

9.8.2 Orthogonalit´e des vecteurs des poids au sens deV. . . . . . . . . . 182

9.8.3 Propri´et´es des vecteurs des poids . . . . . . . . . . . . . . .. . . . 183

9.9 Le mod`ele de r´egression PLS en les variables explicatives . . . . . . . . . . 184

9.9.1 Le mod`ele sur variables centr´ees, ´eventuellementr´eduites . . . . . . 185

9.9.2 Le mod`ele en les variables initiales . . . . . . . . . . . . . .. . . . 185

9.10 R´egression PLS et Analyse en Composantes Principalesusuelle . . . . . . . 186

9.11 Repr´esentations factorielles . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . 187

9.11.1 Repr´esentation des pr´edicteurs et des r´eponses .. . . . . . . . . . . 188

9.11.2 Repr´esentation des individus . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . 190

9.12 M´etriques pour les individus et optiques photographiques associ´ees . . . . . 193

9.12.1 M´etriques g´en´erales pour les individus . . . . . . . .. . . . . . . . 193

9.12.2 R´egression PLS discriminante . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . 194

9.13 Choix du nombre de composantes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . 195

9.13.1 Crit`eres bas´es sur l"ajustement . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . 195

9.13.2 Crit`eres bas´es sur la pr´ediction . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . 197

9.14 Pratique de la r´egression PLS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . 199

9.14.1 PLS univari´e, les donn´ees de Cornell . . . . . . . . . . . .. . . . . 199

9.14.2 "Calibration" PLS en spectroscopie proche infrarouge . . . . . . . . 207

9.15 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 211

7J.F. Durand

Calcul Matriciel et Analyse Factorielle des Donn´ees

J.F. Durand8

Chapitre 1Matrices, D´efinitions et Propri´et´es Ce chapitre n"est pas un cours de calcul matriciel mais a pourobjectif d"une part

de rappeler de fa¸con succincte les principales d´efinitions et propri´et´es ´etudi´ees au cours

du premier cycle et d"autre part, d"en introduire de nouvelles utilis´ees en statistique et en calcul diff´erentiel matriciel. On supposera que les notions deIK-espace vectoriel (IK estIRouIC) et d"applications lin´eaires sont connues. De fa¸con commode, pour ´eviter d"alourdir les notations, lorsqu"une base de l"espace vectorielIKnest sp´ecifi´ee,on notera de fa¸con identique le vecteur et la matrice colonne donnantles coordonn´ees de ce vecteur dans la base. La base choisie par d´efaut est la base canonique.

1.1 Notations et premi`eres d´efinitions

Une matricem×n,A, est un tableau d"´el´ements deIK, tel que

A= [aij] =????a

11... a1n......

a m1... amn???? L"´el´ement courantaij,i`eme ligne,ji`eme colonne, sera parfois not´eaji. La somme de deux matrices de mˆeme dimensions est d´efinie par

A+B= [aij] + [bij] = [aij+bij].

Le produit d"une matrice par un scalaireλ?IK, est d´efini par

λA=Aλ= [λaij].

9 Calcul Matriciel et Analyse Factorielle des Donn´ees Ces deux op´erations conf`erent `a l"ensembleMmn(IK) des matrices demlignes etnco- lonnes surIK, une structure d"espace vectoriel de dimensionmnqui sera aussi not´eIKm×n. On note{Eij(m,n)}i,jla base canonique deIKm×n, d´efinie par E ij(m,n) =Eij=?????0. . . . .0......0···0 1 0···0......0. . . . .0????? matrice dont le seul ´el´ement non nul est l"´el´ementijqui vaut 1. A=m? i=1n j=1a ijEij(m,n).

Outre les op´erations li´ees `a la structure d"espace vectoriel, il existe une autre op´eration

appel´ee produit matriciel. SoientA= [aij],m×n, etB= [bij],n×p, alors le produitAB est la matricem×pd´efinie par

C=AB=?

c ij=n? k=1a ikbkj?

SoitA= [aij], une matricem×n.

La matrice identit´e d"ordrem,Im=m?

i=1E ii(m,m). Alors,A=ImA=AIn. La matriceA?, transpos´ee deA, est la matricen×m,A?= [a?ij=aji]. La base canonique pourMm1(IK) =IKm×1identifi´e `aIKm, est not´ee {ei(m) =Ei1(m,1)}i=1,...,m, ou{ei}ilorsqu"il n"y aura pas d"ambigu¨ıt´e sur la dimension. On a les propri´et´es : ?Eij(m,n) =ei(m)e?j(n). ?AssimilantIRetIR1×1, le symbole de Kronecker,δij=e?i(n)ej(n) =?1si i=j

0si i?=j

?Eijer= colonne r deEij=δjrei e rEij= ligne r deEij=δire?j. ?SoientAila ligneietAjla colonnejdeA. a ij=e?i(m)Aej(n). Aquotesdbs_dbs6.pdfusesText_11