maladie en Afrique de l'Est et Trypanosoma brucei brucei Plimmer Bradford, 1899 (T b brucei), non season), January 2001 (cold dry season), April 2001
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UNIVERSITEMONPELLIERII
SCIENCESETTECHNIQUESDULANGUEDOC
lTFRDESSCIENCESAttribuéparlabibliothèque
THE8EPourobtenirlegradede
DOCTEURDEL'UNIVERSITEMONTPELLIERII
Formationdoctorale:Parasitologie
épidémiologiques
etnouvellesperspectivesPrésentéeetsoutenuepubliquement
ParMathurinKoffi
Le8Décembre2006
Jury IIRapporteur
Examinateur
Examinateur
Examinateur
Directeurdethèse
1 serapossi6fe. 2Remerciements
phénotypique chaquegèneresteindispensable icileplaisird'honorerenleurdisantmerci. d'unGrandProgrammeMobilisateur
d'unecollaborationtrès effet l'IRD(DSFIIRD)Jetiens
Garcia.
Jeremercieparticulièrement:
GérardCuny,mondirecteurdethèsequi
m'aaccueillidanssonunitéderechercheétude.Jesuisplusqu'heureuxd'avoireu
m'apermisd'êtreà monaisechaquefoisque pourm'avoiraccepté etencadrécetravail. 3 évènementsdeguerreconnusparlaCôted'Ivoire. Tescompétencesettesqualitésde parlenombred'articlesproduitsqueparle nombre remercie.VincentJamonneau,
PhilippeSolano,
oùjesuisvenuterejoindre,nousavonsàl'InstitutPierreRichetetquisont
l'aboutissementdecettethèse. commelesjoursnonouvrables, lediresans exprimeraientexactementceque familleJamonneauque jeremercie.SophieRavel,
Entecôtoyantj'aibeaucoup
appris formation. etDelphinePatrelavecqui aveztoujours unquelconqueaccessoiredulaboratoire.Jevoussuisreconnaissantdevotreaide.
ThierrydeMeeüsdepart
microorganismes, populations, 4 quenoust'avonssollicité.Jevoudrais icitediremercidufondducoeur.ChristianBarnabé,toiégalementtu
m'asbeaucoupapporté.C'estdansvotre plusieurslogicielsd'analyse.Tuas mesremerciementslesplussoutenus.AtoutelafamilleCourtin
particulier présentationdemessitesd'étudesAtoutel'équipe
j'appelleaffectueusement "DoyenKaba»,GrandLouis,Bamoro(mon délinquant),Alain jevousensuisplus jefélicitepoursanouvelle promotiondeMiezan,BléLeopold,GabinetDion.
àAbidjan.Lechef
étudeet
5àtousceuxquideprèsoudeloin
ontcontribuéàmonépanouissement.Mme MarieclaireKouassi,MmeAssamoi,MmeAnoKoffi,SamuelBoboettouslesautres.
Amesparents,
àmesfrèresetsoeurs
6REMERCIEMENTS3
INTRODUCTION10
PREMIEREPARTIE:ETATSDESCONNAISSANCES14
1.3.Evolutiondelamaladieaucoursdu20
ème
siècle171.4.SituationactuelledelamA18
Chapitre2.Lestrypanosomes21
2.1.Taxonomie21
2.2.1.MorphologieetCycleévolutif26
2.2.2.Structure
dugénome,302.2.2.1.Génomenucléaire30
2. 2.2. 2.Génomekinétoplastique31
2.2.4.Variationantigéniquedes trypanosomesafricainsetévitementdusystèmeimmunitaire33
2.4.1.Diagnostic39
2.4.1.1.Examenssérologiques39
2.4.1.2.Examensparnsitologiques40
2.4.3.Traitement
delamA42 ....•.•....•44TECHNIQUESD'ISOLEMENT.(ARTICLE1)
.49 58TRYPANOSOMABRUCEIGAMBIENSECIRCULANT
ENAFRIQUEDEL'OUEST
Introduction66
1.Matérieletméthodes67
1.1.Zonesd'étude67
1.2.Inclusiondessujetsd'étude69
1.2.1.Inclusiondespatientsconfinnés70
1.2.3.Souchesderéférence74
1.3.Isolementetculturedestrypanosomes76
1.6.Détectiond'infectionsmultiples79
71.7.1.Analysecladistique80
1.7.2.IndicedefixationdeWright.80
2.1.Caractérisationisoenzymatique82
2.2.Caractérisation
parPCRlMicrosatellites86 2.2.2. 2.Microsatellites
etgroupe1deT.b.gambiense882.3.1.Analysescladistiques98
2.3.2.5Testdeclonalité105
••.••••1113.2. 2.Biais
CONCLUSIONSETPERSPECTIVES120
BIBLIOGRAPHIE123
ANNEXES151
Annexe1 _152
•153Annexe3.ListedesPublications
8 ,---------oIntroduction
etdanscertainspays onobservedesprévalencesidentiques la annuellementrapportéspar maisrévèlentsimplementl'absenceLaTHAresteunemaladieprioritairepour
l'OMSetentenantcomptedesDALYs etd'annéesdevieproductive2001).
unprotozoaire flagellédel'espèce sous-espèces: rhodesiense maladieenAfriquede hématophage,laglossine(genreLaTHAévoluechez
10 dansleliquidecéphalorachidien(LeR). defièvrefréquents,des ducomportement,delaàlamortdumalade.Danslecasdela
formechroniqueàT.b.rhodesiense,laphase
observéeenAfriquedel'Ouest etCentrale(Jamonneauet al.,2002;2004a),allantdeformes asymptomatiques(Lapeyssonie1960;Ginoux al.,1997a;Garciaet etle traitementdesmalades. d'untraitementàunesituationpluscomplexe
queladichotomiemalade/non-malade confirmationparasitologique(Garcia auxtestsutilisés.àdesinteractionscomplexes
individuelleàlamaladie)(Garciaetal.,2006annexe3).
11 caractérisation génétiquedessouchesdetrypanosomescirculantdanslesfoyersde IRA leurmode dereproduction. 12Premièrepartie
Etatdesconnaissances
13Premièrepartie:Etatsdesconnaissances
Afriquesubsahariennedu
14ème
degrédelatitudenordau29ème
degrédelatitudesud,dansles1. 1.Lespremièresdescriptionsdelamaladie
14ème
siècle(1375)quandIlfautattendre
1734précisedel'affectionquel'auteur débutdu 19
ème
desobservateursanglais,français "lethargus"remarquel'importancede nonseulementconnudes"négriers systématiquedesganglionscervicaux l'onpuisseDenombreux
etal.,1909).Plusieursmilliersdemortsduéviterlescontaminations.
141.2.Identificationdel'agentpathogène
premièresdescriptionsremontentDuttondécriten1902souslenomde
enIlpensealorsqu'il
il Nabarroconstatentquelestrypanosomessanguicolessont identiquesàceuxdusystème nerveuxetqu'ilsconstituentGlossinapalpalissontlevecteurdela
maladie(Bruce etal.,1909;1911). qu'àl'époque,la maladie avoirremontélecours diffèrede cenouvelagentpathogèneKinghornetYorkedémontrentlerôlede
Glossinamorsitansdanslatransmissiondece
15Thous.3Ilds
(OMS,2000) 161.3.Evolutiondelamaladieaucoursdu20
ème
siècle intensémenten notammentauCameroun lamot(1879-1937) toutesleszonestouchées quequelquesrares cas "enzonetropicale (Gentilini,1993).L'éliminationpresquetotalede
àlarupturedes
systèmesdecontrôle,lamaladieait santépublique.C'estnotammentlecaspourlaRépublique
2). comparable 171.4.SituationactuelledelaTHA
l'endémiesommeilleuse(figure d'unDenombreuxfoyerssontactuellementactifsen
Afriquede
Actuellement,
2002).Danslesannées2000,
et500 l'OMSen2005annoncela d'unedétectiondemasse,etl'absenceou l'insuffisancededépistagedansL'importancede
Ghana,leBurkinaFaso
BoffaetDubrekaenGuinée
(Camara al.,2006). 18Ondistingue:
•ProfilépidèmiqueFortE>E'ndi?mie>
Faiblee>ndémi6'
DPaysilrisquE'
oPaysnmlouchés j 1 fKENYA,MALI,NIGIERA,TOGO,ZAMBIE:
NAMIBIE,R'NANDA,SENEGALSIERRA-LEON
NE, 19J\'1édecinetropicale,Gentilini,1993)
oZoneàT .b.gambiense •ZoneàT .b.rhodesiense
_______1.;,· •Foyerde lamangroveguinéenne(Dubreka,Boffa) 20Chapitre2.Lestrypanosomes
en1842parun (Trypanosomarotatorium).Depuiscette animalesT.equiperdum,parasitedes
équidés.
2.1.Taxonomie
Protozoairesduphylum
l'invertébré vecteurSalivaria.
Cettesectioncomprend3sousgenres:
(Trypanosomalewisi) dutubedigestifL'infestationdel'hôte 21Trypanozoon.
22OENRE
SOUS·ESPECEESPECE
Endotrypanum
Tejerala
DuttoneUa
Nannomonas
Trypanotcon
PycnonwllJl8
rr.lr.)rangeii T. (D.)"";./v';x r-:-(ûj r-:-(T-:) equlj;rdiim 1. ('P.) 1 T. (D.) uniforme T. (N.) mmlJl! r. (T.) eVaM 1 1 r. (T.) brucel 1 1 l 11 T. (T.) b.bruui 1 B.Sal/varla
T. (T.) b. rhodesiense 1 T. (T.) b. gambiense 1 11Herpetosoma
Megatrypanum
Schtzorrypanum
-r-:-(M-:)i&iï;'ri- 1 T. (H.)IllUSculi
r. (M.) T. (S.) dion/si/ 1 1 T. (H.) micron 1 l,1 A.SltrcoraT'ia
1 1111L,1 L. 1 genre (Luckins chezlescamélidés)maisaussi