Université catholique de Louvain - Ecologie microbienne - cours-2019-lboe2148 UCL - cours-{ANAC}-lboe2148 - page 1/3 lboe2148 2019 Ecologie
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2019Ecologie microbienne
Au vu du contexte sanitaire lié à la propagation du coronavirus, les modalités d'organisation et d'évaluation des unités
d'enseignement ont pu, dans différentes situations, être adaptées ; ces éventuelles nouvelles modalités ont été -ou seront-
communiquées par les enseignant·es aux étudiant·es.2 crédits24.0 hQ1EnseignantsDeclerck Stephan ;Langue
d'enseignementFrançaisLieu du coursLouvain-la-NeuveThèmes abordésAfin de donner un aperçu aussi large que possible de la microbiologie environnementale, les thèmes suivants
seront abordés: - une introduction à la microbiologie environnementale: l'écologie microbienne avant et après
l'avènement des outils moléculaires, le monde microbien dans sa toute sa diversité (y compris les Archaea), la
classification des microorganismes sur base de leur(s) signature(s) phylogénétique(s) et de leur métabolisme
cellulaire - un aperçu des outils permettant d'étudier les microorganismes dans leur habitat - une illustration de
l'adaptation des microorganismes à la vie en communautés complexes (biofilms) et à des environnements aussi
divers que les sols, eaux douces, océans, environnements extrêmes, environnements contaminés, organismes
supérieurs - l'exploitation des acquis de la microbiologie environnementale pour des applications biotechnologiques
et/ou industriellesAcquis
d'apprentissage1Ce cours a pour but de permettre aux étudiants d'acquérir des notions de base en écologie microbienne.
Cette discipline évolue rapidement depuis une vingtaine d'années principalement grâce à l'application
d'outils moléculaires pour étudier les microorganismes dans leur environnement. L'objectif visé est qu'au
terme de l'enseignement, les étudiants aient une vue d'ensemble actualisée de la diversité phylogénétique
et métabolique des microorganismes dans l'environnement, ainsi que de leur rôle dans les grands cycles
biogéochimiques dont dépend la vie sur terre.La contribution de cette UE au développement et à la maîtrise des compétences et acquis du (des) programme(s) est accessible
à la fin de cette fiche, dans la partie " Programmes/formations proposant cette unité d'enseignement (UE) ».
Modes d'évaluation
des acquis desétudiants
En raison de la crise du COVID-19, les informations de cette rubrique sont particulièrement susceptibles d'être modifiées.
L'évaluation est basée sur un examen écrit qui compte pour 75% de la note finale. Les étudiants présentent, par
ailleurs, oralement et avec les supports les plus appropriés le fruit de leur recherche. Un débat questions/réponses
est initié par tous les étudiants. L'évaluation se fait à fa fois sur la présentation (contenu scientifique et qualités
pédagogiques) et la capacité de répondre aux questions et de stimuler le public. Cette présentation orale est
obligatoir et évaluée pour 25% de la note finale pour ce cours.Méthodes
d'enseignementEn raison de la crise du COVID-19, les informations de cette rubrique sont particulièrement susceptibles d'être modifiées.
La méthode d'enseignement est basée sur un cours théorique donnée par l'enseignant. Les dernières heures de
cours sont consacrées à des présentations orales par les étudiants. Ceux-ci choisissent un écosystème/biotope
(environnement) particulier et en décrivent les principaux microorganismes et leur rôle potentiel en biotechnologie.
Cette présentation est suivie d'un débat entre tous les étudiants et l'enseignant.ContenuCet enseignement se présente sous forme d'une partie théorique (cours) de 20 heures. Les 4 heures restantes
seront dédiées à la présentation par les étudiants de sujets choisis en concertation avec l'enseignant et illustrant
une des nombreuses facettes de l'écologie microbienne. Le cours comprend les chapitres suivants : - Notions
générales microbiologie environnementale : historique de l'écologie microbienne, phylogénie microbienne et "
arbre de vie ", les grands types de métabolisme cellulaire - Techniques utilisées pour étudier les microorganismes
in situ - Consortia microbiens (biofilms), communication " cell-to-cell ", transfert d'éléments génétiques mobiles
- Microbiologie des sols et de la rhizosphère - Microbiologie des milieux aquatiques (eaux douces, océans)
- Microbiologie des milieux souterrains (aquifères, champs pétrolifères) - Adaptation des microorganismes
aux environnements extrêmes - Biotransformation et biodégradation de polluants - Relations symbiotiques /
syntrophiques avec des organismes eucaryotes - Biotechnologie et bioprospectionRessources en ligneMoodle
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Autres infosPré-requis en microbiologie générale (génétique, métabolisme cellulaire). Evaluation Une évaluation partielle
se rapporte à une présentation faite devant l'ensemble des étudiants sur un sujet choisi en concertation avec
l'enseignant. En fin de cours, une évaluation orale porte sur l'ensemble de la matière au travers de quelques
questions couvrant différentes parties du cours. Support Notes prises au cours, copie de transparents (documents
PowerPoint sous forme papier, qui seront aussi disponibles sur iCampus [http://www.icampus.ucl.ac.be/]). Des
références de livres et articles seront communiqués au cours.Faculté ou entité en
charge: BIOLUniversité catholique de Louvain - Ecologie microbienne - cours-2019-lboe2148UCL - cours-{ANAC}-lboe2148 - page 3/3Programmes / formations proposant cette unité d'enseignement (UE)Intitulé du programmeSigleCréditsPrérequisAcquis d'apprentissageMaster [120] : bioingénieur
en gestion des forêts et des espaces naturels