dans les grands cycles biogéochimiques du Carbone, de l'Azote, du Fer ou encore du Soufre Dans sera stocké dans la cellule sous forme de globules) ; la seconde consiste à oxyder le soufre complète de la solution, les échantillons ont été repris dans 2,5 ml d'acide nitrique à 0,24 mol/L, puis s (1 sur le sch
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Glucose (C6H12O6) + 6 dioxygène (O2) → 6 dioxyde de carbone (CO2) + 6 eau (H2O) Le cycle de Krebs est un ensemble de décarboxylations oxydatives, (= aérobiose), les cellules dégradent le glucose de façon complète en dioxyde
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18 jan 2011 · IV 1 GENERALITES - CYCLE REVERSIBLE DE BRAYTON premier corps est gagnée par le second En bref, la V 1 1 2 Selon le nombre de temps (nbre de tours pour faire un cycle complet) On appelle combustion compl`ete la réaction qui transforme tout le carbone en CO2 et tout l'hy-
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Niveau : De 8 à 12 ans ; cycle 3 ; Collège l'atmosphère terrestre, l'effet de serre, le cycle des saisons, la formation 837 14/SCH (J) la mer sont menacés par le taux de carbone trop élevé La seconde partie présente les pistes pédagogiques et L'objectif de ce kit est de fournir un support de formation complet sur
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10 avr 2015 · cycle 3 Les élèves sont alors capables de répondre à des exigences en terme au-sch C3 A9ma- C3 A0-l C3 A9cole-primaire1 pdf Ce deuxième type de codage peut également s'appuyer sur des effets de de carbone complété par une étude comparative des différents schémas retrouvés
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anthropique majeure du cycle du carbone, à cause de sa rapidité au regard des La seconde raison est que la bonne représentation spatio-temporelle des flux SCH SAC PRS PUY CMN HUN Figure II- 2 : Carte des stations continues reconstituer tous les produits de l'inversion sur l'année complète (les flux, les
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0 1 Importance de la biosphère continentale dans le cycle du carbone et contribution Cette deuxième étape de circulation de l'énergie qui réchauffe encore plus la requis par chaque variété pour effectuer son cycle complet [ Brisson et al , 2003; Contraintes pour l'optimisation Global incluant CarboEurope HUN SCH
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THÈSE / UNIVERSITÉ DE BRETAGNE OCCIDENTALE
sous le sceau de l'Université européenne de Bretagne pour obtenir le titre deDOCTEUR DE L'UNIVERSITÉ DE BRETAGNE CCIDENTALE
Mention : Microbiologie
École Doctorale des Sciences de la Mer
présentée parNolwenn Callac
Préparée à l'Unité Mixte de Recherche (UMR 6197)Laboratoire de Microbiologie des Environnements
Extrêmes (LMEE)
Cycles biogéochimiques du Fer et du
Soufre dans les systèmes
hydrothermaux en contexte sédimentaire du Bassin de Guaymas : traçages isotopiques et interactions micro-organismes/minérauxThèse soutenue le 9 juillet 2013
devant le jury composé de :Bénédicte Ménez (Rapporteur)
Professeur, Université Paris Diderot, IPGP
Nathalie Pradel (Rapporteur)
Chargée de recherche, IRD Marseille
Christian Mustin (Examinateur)
Directeur de recherche, CNRS Nancy
Mohamed Jebbar (Examinateur)
Professeur, Université de Bretagne Occidentale, BrestAnne Godfroy (Directeur de thèse)
Cadre de recherche, Ifremer Brest
Olivier Rouxel (Co-directeur de thèse)
Cadre de recherche, Ifremer Brest
3Remerciements
participésàceprojet. jebbar. etYvesFouquetpourleuraideetconseils. bienplus!! m'avoirpermisd'allerauMIT. analyses. etgentillesse. autre!). 4 avecKarineetMaria. depuisleMaster1. "Inskape»!!! fermentationsciblantlaferriréduction. conseiletsoutien.Bonnecontinuation!!
autres.Mouchel,Cécile,JulieetRonan.
5 sulfures,moietlesmodules!). nosrires! bientôtàLyon! quandilfaut!! thèse.Ungrandmerciàtous
7Sommaire
Sommaire
8 389Sommaire
9 11Listedesfigures
Listedesfigures
12Listedesfigures
13Figure
S (j) (i)(f)(c)(d) (f) (g)(a)(b)Listedesfigures
14Listedesfigures
15 HListedesfigures
16 17Listedestableaux
Listedestableaux
18Tableau
19Listedesabréviations
ADN:Acidedésoxyribonucléique
ANME:ANaerobicMEthanotroph
AOM:AnaerobicOxidationofMethane
APS:Ammoniumpersulfate(DGGE)
ARN:Acideribonucléique
ARNr:ARNribosomique
ATP:Adénosinetriphosphate
BLAST:BasicLocalAlignmentSearchTool
CT:Carottiertube
DIR:DissimilatoryIronReduction
DMSO:Diméthylsulfoxide
triphosphate)]EPR:EastPacificRise
FISH:Fluorescentinsituhybridization
GCT:Grandcarottiertube
MAR:MidAtlanticridge
Listedesabréviations
20MBG:MarineBenthicGroup
MCG:MiscellaneousCrenarchaeoticGroup
MG:MarineGroup
OTU:Operationaltaxonomicunit
pb:pairedebasesPBS:PhosphateBufferSaline
PCI:Phenol/Chloroform/Isoamylalcohol
PCR:Polymerasechainreaction
QPCR:PCRquantitative
RTPCR:ReversetranscriptionPCR
STXM:ScanningTransmissionXrayMicroscope
TAE:TamponTrisAcétateEDTA
TE:TamponTrisEDTA
UV:Ultraviolet
v:volume v.v.min1:volumeparvolumeetparminute v/v:volumeparvolume w/v:poidsparvolume 21I. Systèmeshydrothermauxocéaniquesprofonds:cycles microbiologiques:Contextedel'étude
5.Objectifsduprojet
Contextedel'étude
23unique. parmilesquelles: géographiquesdelavie? cetécosystème? desinterrogationstellesque: contextehydrothermal?
Contextedel'étude
24danscetécosystème.
1. Contextedel'étude:lessystèmeshydrothermauxocéaniquesprofonds
1.1. Contextegéographique
deGuaymas). Fi su *s igureI1:Localisati uspectés*ainsique suspectésselondes iondesdorsalesocé elesvolcansintrap sanomaliesdeteméaniques,zonedes
plaqueactifsmodifié mpérature,anomali C subductionetbassiésd'après:http://w
iesdelacolonned'Contextedel'étud
25insarrièrearcs,des www.interridge.org 'eau,desdépôtshy de ssourceshydrother g/irvents/files/Vent ydrothermauxmais rmalesactivesetsu tmap_2009.jp ssansconfirmation spectées*,desarcs nvisuellequelesso svolcaniquesactifs ourcessoientactive et es.
Contextedel'étude
261.2. Contextegéologique
ZnFigureI2
1985par
1.3. L trèsdive pH).Ma defluid e desmicr inféodés2:Représenta
Erauso,199
4 . HabitatsdLesmicroor
ersifiésente lgrélescara e,gradients roorganisme s).Ceshabita lefluide attachée tionschémati4(Jannaschan
descommu rganismesviv ermesd'espè ctéristiques physicochi m es,ontétéd atssont: ehydrother esauxpartic Con iqued'unesou ndMottl1985 unautésm vantdanslesèces,demét
intrinsèques miquesabrup décrits(Karl maloùles culesémises ntextedel'ét 27urcehydrothe
5;Erauso1994
microbienn sécosystème tabolismese sauxsystèm pts,variabilit1995),(sans
populations s.Seloncert tude ermaleocéani 4) es eshydrother etdeprefere meshydrothe téintrasite spourautan smicrobien tainesétude iquemodifiée rmauxocéan endum(ther ermaux:inst ;destypesd ntqu'ilsyso nesvivents scesmicro deJannasch niquesprofo rmique,salin tabilitédesé d'habitatsth oientobligat sousforme organisme s etMottl, nds,sont nitéetdeémissions
héoriques oirement libreou seraientContextedel'étude
281992;DemingandBaross1993;Takaietal.2004)
2012)al.2012;Bowlesetal.2012)