13 mar 2014 · Tableau n°8 : Aide au diagnostic de BVD selon les résultats de sérologie et de du protocole avortement bovin proposé par le GDS 50
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13 mar 2014 · Tableau n°8 : Aide au diagnostic de BVD selon les résultats de sérologie et de du protocole avortement bovin proposé par le GDS 50
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VETAGRO SUP CAMPUS VETERINAIRE DE LYON
Année 2014 - Thèse n°
VACHEDIAGNOSTIC ETIOLOGIQUE
THESE -BERNARD - LYON I (Médecine - Pharmacie) et soutenue publiquement le 19 septembre 2014 pour obtenir le grade de Docteur Vétérinaire parBricout Jeanne
Née le 16 septembre 1988
à Saint Quentin (02)
VETAGRO SUP CAMPUS VETERINAIRE DE LYON
Année 2014 - Thèse n°
VACHEDIAGNOSTIC ETIOLOGIQUE
THESECLAUDE-BERNARD - LYON I
(Médecine - Pharmacie) et soutenue publiquement le 19 septembre 2014 pour obtenir le grade de Docteur Vétérinaire parBricout Jeanne
Née le 16 septembre 1988
à Saint Quentin (02)
3 Liste des enseignants du Campus vétérinaire de Lyon (mise à jour 13/03/14) Civilité Nom Prénom Unités pédagogiques Grade M. ALOGNINOUWA Théodore Pathologie du bétailProfesseur
M. ALVES-DE-OLIVEIRA Laurent Gestion des élevages Maître de conférences Mme ARCANGIOLI Marie-Anne Pathologie du bétail Maître de conférences M. ARTOIS Marc Santé Publique et Vétérinaire Professeur M. BARTHELEMY Anthony Anatomie Chirurgie (ACSAI) Maître de conférences Contractuel Mme BECKER Claire Pathologie du bétail Maître de conférences M. BELLI Patrick Pathologie morphologique et clinique des animaux de compagnieMaître de conférences Contractuel
Mme BENAMOU-SMITH Agnès Equine Maître de conférences M.BENOIT Etienne Biologie fonctionnelle Professeur
M. BERNY Philippe Biologie fonctionnelle Professeur Mme BERTHELET Marie-Anne Anatomie Chirurgie (ACSAI) Maître de conférences Mme BONNET-GARIN Jeanne-Marie Biologie fonctionnelle Professeur Mme BOULOCHER Caroline Anatomie Chirurgie (ACSAI) Maître de conférences M. BOURDOISEAU Gilles Santé Publique et Vétérinaire Professeur M. BOURGOIN Gilles Santé Publique et Vétérinaire Maître de conférences M. BRUYERE Pierre Biotechnologies et pathologie de la reproductionMaître de conférences Stagiaire
M. BUFF Samuel Biotechnologies et pathologie de la reproductionMaître de conférences
M. BURONFOSSE Thierry Biologie fonctionnelle Maître de conférences M. CACHON Thibaut Anatomie Chirurgie (ACSAI) Maître de conférences Stagiaire M. CADORE Jean-Luc Pathologie médicale des animaux de compagnieProfesseur
Mme CALLAIT-CARDINAL Marie-Pierre Santé Publique et Vétérinaire Maître de conférences M. CAROZZO Claude Anatomie Chirurgie (ACSAI) Maître de conférences M. CHABANNE Luc Pathologie médicale des animaux de compagnieProfesseur
Mme CHALVET-MONFRAY Karine Biologie fonctionnelle Professeur M. COMMUN Loic Gestion des élevages Maître de conférences Mme DE BOYER DES ROCHES Alice Gestion des élevages Maître de conférences Mme DELIGNETTE-MULLER Marie-Laure Biologie fonctionnelle Professeur M. DEMONT Pierre Santé Publique et Vétérinaire Professeur 4 Mme DESJARDINS PESSON Isabelle Equine Maître de conférences Contractuel Mme DJELOUADJI Zorée Santé Publique et Vétérinaire Maître de conférences Mme ESCRIOU Catherine Pathologie médicale des animaux de compagnieMaître de conférences
M.FAU Didier Anatomie Chirurgie (ACSAI) Professeur
Mme FOURNEL Corinne Pathologie morphologique et clinique des animaux de compagnieProfesseur
M.FRANCK Michel Gestion des élevages Professeur
M. FREYBURGER Ludovic Santé Publique et Vétérinaire Maître de conférences M. FRIKHA Mohamed-Ridha Pathologie du bétail Maître de conférences Mme GILOT-FROMONT Emmanuelle Santé Publique et Vétérinaire Professeur M. GONTHIER Alain Santé Publique et Vétérinaire Maître de conférences Mme GRAIN Françoise Gestion des élevages Professeur M. GRANCHER Denis Gestion des élevages Maître de conférences Mme GREZEL Delphine Santé Publique et Vétérinaire Maître de conférences M.GUERIN Pierre Biotechnologies et pathologie de la
reproductionProfesseur
Mme HUGONNARD Marine Pathologie médicale des animaux de compagnieMaître de conférences
M. JUNOT Stéphane Anatomie Chirurgie (ACSAI) Maître de conférences M.KECK Gérard Biologie fonctionnelle Professeur
M. KODJO Angeli Santé Publique et Vétérinaire Professeur Mme LAABERKI Maria-Halima Santé Publique et Vétérinaire Maître de conférences M. LACHERETZ Antoine Santé Publique et Vétérinaire Professeur Mme LAMBERT Véronique Gestion des élevages Maître de conférences Mme LATTARD Virginie Biologie fonctionnelle Maître de conférences Mme LE GRAND Dominique Pathologie du bétail Professeur Mme LEBLOND Agnès Santé Publique et Vétérinaire Professeur M.LEPAGE Olivier Equine Professeur
Mme LOUZIER Vanessa Biologie fonctionnelle Maître de conférences M. MARCHAL Thierry Pathologie morphologique et clinique des animaux de compagnieProfesseur
5 Mme MIALET Sylvie Santé Publique et Vétérinaire Inspecteur en santé publique vétérinaire (ISPV) Mme MICHAUD Audrey Gestion des élevages Maître de conférences M. MOUNIER Luc Gestion des élevages Maître de conférences M. PEPIN Michel Santé Publique et Vétérinaire Professeur M. PIN Didier Pathologie morphologique et clinique des animaux de compagnieMaître de conférences
Mme PONCE Frédérique Pathologie médicale des animaux de compagnieMaître de conférences
Mme PORTIER Karine Anatomie Chirurgie (ACSAI) Maître de conférences Mme POUZOT-NEVORET Céline Anatomie Chirurgie (ACSAI) Maître de conférences Mme PROUILLAC Caroline Biologie fonctionnelle Maître de conférences MmeREMY Denise Anatomie Chirurgie (ACSAI) Professeur
M. ROGER Thierry Anatomie Chirurgie (ACSAI) Professeur M. SABATIER Philippe Biologie fonctionnelle Professeur M. SAWAYA Serge Anatomie Chirurgie (ACSAI) Maître de conférences Mme SEGARD Emilie Anatomie Chirurgie (ACSAI) Maître de conférences Contractuel Mme SERGENTET Delphine Santé Publique et Vétérinaire Maître de conférences Mme SONET Juliette Anatomie Chirurgie (ACSAI) Maître de conférences Contractuel M. THIEBAULT Jean-Jacques Biologie fonctionnelle Maître de conférences M. VIGUIER Eric Anatomie Chirurgie (ACSAI) Professeur Mme VIRIEUX-WATRELOT Dorothée Pathologie morphologique et clinique des animaux de compagnieMaître de conférences Contractuel
M. ZENNER Lionel Santé Publique et Vétérinaire Professeur 6 7 22B43A MONSIEUR LE PROFESSEUR OLIVIER CLARIS
DE LA FACULTE DE MEDECINE CLAUDE BERNARD DE LYON
YUI NOUS A FAIT L'HONNEUR D'ACCEPTER DE PRESIDER CE JURY.RESPECTUEUX HOMMAGES.
A MONSIEUR LE PROFESSEUR PIERRE GUERIN
DE VETAGRO SUP CAMPUS VETERINAIRE DE LYON
POUR AVOIR ENCADRE CE TRAVAIL AVEC BEAUCOUP DE DISPONIBILITE. POUR SON SOUTIENET SES NOMBREUX CONSEILS.
AVEC TOUTE MA GRATITUDE ET MON RESPECT LES PLUS SINCERES.A MONSIEUR LE PROFESSEUR PIERRE BRUYERE
DE VETAGRO SUP CAMPUS VETERINAIRE DE LYON
POUR AVOIR ACCEPTE DE RELIRE ET DE CORRIGER CE TRAVAIL. POUR SA MOTIVATION ETSES CONSEILS.
MES PLUS SINCERES REMERCIEMENTS.
8A mes parents,
suis là.A Louise,
Merci pour ton soutien !
A Charles,
Je suis très heureuse et fière que tu prennes la suite. Tu pourras toujours compter sur taA Papy et Mamie,
Merci de m'aǀoir toujours soutenue, dans mes moments de préparation au concours, comme aprğs. Votre aide m'a ĠtĠ prĠcieuse.A Simone, ma marraine,
Un grand merci pour tes encouragements tout au long de mon parcours, du collège à mes premiers pas de véto ! 9Table des matières
TABLEAUX............................................................................................................................................. 11
FIGURES ................................................................................................................................................ 14
ABREVIATIONS ..................................................................................................................................... 17
PREMIERE PARTIE: GENERALITES SUR LES AVORTEMENTS BOVINS : DEFINITION, MECANISMES PATHOGENIQUES ET OUTILS DE DETERMINATION DU STADE DE GESTATION DE L'AVORTANTE .... 21A) DEFINITION ............................................................................................................................ 21
1. DEFINITION LEGALE ............................................................................................................................ 21
2. AVORTEMENTS ISOLES OU REPETES ....................................................................................................... 22
3. L'AVORTEMENT BOVIN EST SOUMIS A UNE DECLARATION OBLIGATOIRE ........................................................ 23
B) MECANISMES DE L'AVORTEMENT BOVIN ........................................................................................ 24
1. LIENS ANATOMIQUES ENTRE LA MERE ET LE FVTUS................................................................................... 24
2. PERIODES A RISQUE LORS DE LA GESTATION ............................................................................................ 24
3. SECRETIONS PLACENTAIRES NECESSAIRES AU MAINTIEN DE LA GESTATION ..................................................... 26
4. NOTION D'ALLOGREFFE FVTALE............................................................................................................ 27
5. MECANISMES A L'ORIGINE DE L'AVORTEMENT ......................................................................................... 27
C) OUTILS DE DETERMINATION DU STADE DE GESTATION DE L'AVORTANTE ................................................. 28
1. BUT DE LA DETERMINATION DE L'AGE DE L'AVORTON ................................................................................ 28
2. EXAMEN DE L'AVORTON ...................................................................................................................... 28
DEUXIEME PARTIE: ETIOLOGIE DES AVORTEMENTS BOVINS : CAUSES NON INFECTIEUSES ET CAUSESINFECTIEUSES ............................................................................................................................. 33
A) CAUSES NON INFECTIEUSES ........................................................................................................ 33
1. TRAUMATISMES ET BATIMENT .............................................................................................................. 33
2. CAUSES IATROGENES .......................................................................................................................... 33
3. INTOXICATIONS ................................................................................................................................. 37
4. AUTRES CAUSES ABORTIVES NON INFECTIEUSES ....................................................................................... 54
B) CAUSES INFECTIEUSES ............................................................................................................... 57
1. AGENTS BACTERIENS .......................................................................................................................... 57
2. AGENTS VIRAUX ............................................................................................................................... 127
3. LES AVORTEMENTS MYCOSIQUES ........................................................................................................ 168
4. LES PROTOZOAIRES A L'ORIGINE D'AVORTEMENTS BOVINS ....................................................................... 180
TROISIEME PARTIE:DEMARCHE DIAGNOSTIQUE LORS D'AVORTEMENTS BOVINS ....................198A) CONSIDERATIONS FINANCIERES ET PRATIQUES...................................................................................198
B) SIGNES OBSERVABLES SUR LE FVTUS OU SUR LA MERE .........................................................................198
1. LESIONS FVTALES ............................................................................................................................ 198
2. EXAMEN CLINIQUE DE LA MERE ET DES CONGENERES .............................................................................. 199
C) INFORMATIONS NECESSAIRES PREALABLES A LA DEMANDE D'ANALYSES ................................................200
1. ELEMENTS EPIDEMIOLOGIQUES A PRENDRE EN COMPTE AVANT LA DEMANDE D'ANALYSES DE LABORATOIRE...... 200
2. MILIEU DE L'ELEVAGE ....................................................................................................................... 203
D) ANALYSES DE LABORATOIRE DISPONIBLES .....................................................................................204
1. ECHANTILLONS PRELEVABLES, METHODE DE PRELEVEMENT ET D'ENVOI AU LABORATOIRE .............................. 204
2. MISE EN EVIDENCE DE L'IMPLICATION D'UN AGENT INFECTIEUX ................................................................ 208
3. DIFFERENTES TECHNIQUES DE LABORATOIRE DE MISE EN EVIDENCE DE L'AGENT INFECTIEUX ........................... 219
4. METHODE DE RECHERCHE D'AGENT ABORTIF NON INFECTIEUX DANS L'ALIMENTATION .................................. 223
E) COMPARAISON DE DIFFERENTS PROTOCOLES PROPOSES DANS LE CADRE DES AVORTEMENTS BOVINS ............223
1. PROTOCOLE NATIONAL DE DIAGNOSTIC DIFFERENTIEL DES AVORTEMENTS CHEZ LES BOVINS ........................... 223
102. PROTOCOLE PROPOSE PAR UN GDS D'UN DEPARTEMENT PRINCIPALEMENT ALLAITANT : LA SAONE ET LOIRE ..... 229
3. PROTOCOLE PROPOSE PAR UN GDS D'UN DEPARTEMENT PRINCIPALEMENT LAITIER : LA MANCHE................... 234
QUATRIEME PARTIE: PROTOCOLE D'AIDE AU DIAGNOSTIC ETIOLOGIQUE ...................................237A) INTERETS DE L'UTILISATION D'UN PROTOCOLE SYSTEMATIQUE LORS D'AVORTEMENTS BOVINS ......................237
B) DEMANDE DE RECHERCHE D'AGENTS INFECTIEUX POUVANT ETRE IMPLIQUES DANS LES AVORTEMENTS .........237C) DEMARCHE A SUIVRE PAR LE VETERINAIRE LORS D'AVORTEMENT EN ELEVAGE BOVIN ...............................245
1. AVORTON DISPONIBLE LORS DE LA VISITE DU VETERINAIRE ....................................................................... 245
2. AVORTON NON DISPONIBLE ............................................................................................................... 247
3. AVORTON NON DISPONIBLE ET PLACENTA NON DISPONIBLE ...................................................................... 247
114A 3 D342A4CB3
TABLEAUX
Tableau n°1 : Seuils retenus pour différencier les avortements répétés des avortements
isolés selon la taille du troupeauTableau n°3 : Tableau rĠcapitulatif de la dĠmarche et des rĠsultats de l'Ġtude de Stegelmeier
et Col.(1995)Tableau n°4 : Tableau présentant les aliments susceptibles de contenir les principales
mycotoxines touchant les bovins Tableau n°5 : Caractéristiques de Coxiella burnetii selon son variant antigéniqueTableau n°6 : DĠtermination du type d'infection à Coxiella burnetii selon les valeurs des titres
en IgG anti-phase I ou II, et selon la prĠsence d'IgMTableau n°7 : Tableau résumant les caractéristiques des souches cytopathogènes et non
cytopathogènes Tableau n°8 : Aide au diagnostic de BVD selon les résultats de sérologie et de virologieTableau n°9: InterprĠtation des rĠsultats d'analyses indiǀiduelles sur une premiğre prise de
sangTableau n°10: InterprĠtation des rĠsultats d'analyses indiǀiduelles lors de la 2ème prise de
sang Tableau n°12 : Recommandations en termes de types de prélèvements et délais d'acheminement selon le type d'analyse demandĠTableau n°13 : Tableau résumant les liens entre sensibilité (Se), spécificité (Sp), valeur
prédictive positive (VPP) et valeur prédictive négative (VPN)Tableau n°14 : Tableau résumant les deux types de vaccins: délété / non délété jouant un
rôle dans le diagnostic de l'IBR impliqués dans les avortements bovins 12 impliqués dans les avortements bovins Tableau n°17 : Différentes techniques permettant la mise en évidence des deux principaux protozoaires impliqués dans les avortements bovins impliqués dans les avortements bovins Tableau n°19 : Recommandations en termes de prĠlğǀements, de demande d'analyses de Tableau n°20 : Recommandations en termes de prĠlğǀements, de demande d'analyses de laboratoire et d'interprĠtation des rĠsultats concernant la nĠosporose Tableau n°21 : Recommandations en termes de prĠlğǀements, de demande d'analyses de Tableau n°22 : Recommandations en termes de prélèǀements, de demande d'analyses de Tableau n°23 : Recommandations en termes de prĠlğǀements, de demande d'analyses de Tableau n°24 : Recommandations en termes de prĠlğǀements, de demande d'analyses de Tableau n°25 : Recommandations en termes de prĠlğǀements, de demande d'analyses de laboratoire et d'interprĠtation des rĠsultats concernant la chlamydophilose Tableau n°26 : Recommandations en termes de prĠlğǀements, de demande d'analyses de Tableau n°27 : Recommandations en termes de prĠlğǀements, de demande d'analyses de Tableau n°28 : Recommandations en termes de prĠlğǀements, de demande d'analyses de Tableau n°29 : Types d'analyses conseillĠes par le GDS 71 concernant la brucellose et lors de intention lors de l'utilisation du pack aǀortementsTableau n°32 : Types d'analyses proposĠes sur les congĠnğres de la vache ayant avorté en
deudžiğme intention lors de l'utilisation du pack aǀortements 13 Tableau n°33 : Tableau regroupant les prélèvements et analyses recommandés dans le cadre du protocole avortement bovin proposé par le GDS 50Tableau n°35 : Prélèvements (les prélèvements préférentiels sont en italique), analyses de
laboratoire, critğres d'imputabilitĠ et niǀeaudž de diagnostic concernant les agents abortifs
recherchĠs en premiğre intention lors d'aǀortements boǀins en sĠrie Tableau n°36 : Prélèvements et analyses de laboratoire des agents abortifs recherchés en deudžiğme intention lors d'aǀortements boǀins en sĠrieTableau n°37 : RĠsultats d'analyses et niǀeaudž de diagnostic concernant les agents abortifs ă
rechercher en deuxième intentionTableau n°38 : PrĠlğǀements, analyses de laboratoire et critğres d'imputabilitĠ des agents
abortifs recherchés en troisième intention 14FIGURES
Figure n°1 : Déroulement de la gestation : définition des notions de mortalité embryonnaire,
avortement et mise-bas prématurée selon le stade de gestationFigure n°2 : Schéma de placentome
Richardson
Figure n°6 : RĠtrocontrole nĠgatif edžercĠ par le cortisol sur l'adže hypothalamo-hypophysaire
Figure n°7 : Cartes de répartition de la brucellose bovine en 1992 et 2000 en France
métropolitaine brucellose lorsque la réalisation de 2 PCR quantitatives est possibleFigure n°12 : Grille d'interprĠtation des rĠsultats de PCR sur lait de tank et sĠroprĠǀalence
bovinFigure n°13 : Pathogénie de la salmonellose
Figure n°14 : Pathogénie des Chlamydophila
Figure n°15 : Pathogénie de la listériose Figure n°16 : Pathogénie de Campylobacter fetus subsp veneralis Figure n°17 : Distribution mondiale de la campylobactériose bovineFigure n°18 : Carte de répartition des cas bovins, humains, équins et de faune sauvage entre
1991 et 2006 en France
Figure n°19 : Suite des ĠǀĠnements menant ă la naissance d'un ǀeau IPIFigure n°20 : EǀĠnements possibles suite ă l'infection par le ǀirus de la BVD selon le stade de
gestation 15Figure n°22 : Répartitions des exploitations qualifiĠes indemnes d'IBR en France (Corse
exclue) au 31 mai 2009Figure n°23: RĠpartition des Ġleǀages infectĠs par le ǀirus de l'IBR en France (Corse edžclue)
au 31 mai 2009Figure n°26 : Carte de la situation FCO en Europe en 2008, répartition des différentes
sérotypesFigure n°27 : Obserǀation d'Aspergillus fumigatus au microscope optique après mise en
culture Figure n°28 : Observation de Mucor sp. au microscope optique après mise en culture Figure n°29: Observation de Rhizopus sp. au microscope optique après mise en culture Figure n°30 : Observation de Candida albicans au microscope optique après mise en culture mycosique Figure n°34 : Représentation schématique du cycle de Neospora caninumNeospora caninum
Figure n°39 : Répartition des principales causes d'aǀortements par stade de gestation Figure n°40 : Exemple de boite de prélèvementFigure n°41 : Schéma du triple emballage
Figure n°42: Principe de rĠalisation de l'ELISA en sandwich Figure n°43 : Schématisation du principe de la méthode PCR Figure n°44 : Principe de la PCR en temps réel Figure n°45 : Principe de réalisation de la méthode ELISA indirecteFigure n°46 : Mise en contact du sĠrum ă tester et des antigğnes lors de l'Ġpreuǀe ă
16Figure n°47 : Principe de la rĠaction d'agglutination lors de l'Ġpreuǀe ă l'antigğne tamponnĠ
(EAT) pour le diagnostic de la brucellose Figure n°48 : Principe de réalisation du test de fixation du complément Figure n°49 : Protocole de demande d'analyses proposĠ par le GDS 71 lors d'aǀortement bovinFigure n°50 : Conduite ă tenir en premiğre intention lors d'aǀortements en sĠrie en Ġleǀage
bovin 17ABREVIATIONS
ACERSA : association pour la certification de la santé animale en élevageACTH : adrénocorticotrophine
ADN : acide desoxyribonucléique
ANSES : Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'enǀironnement et du travail APMS : arrêté préfectoral de mise sous surveillance APPDI ͗ arrġtĠ prĠfectoral portant dĠclaration d'infectionARN : acide ribonucléique
BHV : bovine herpesvirus
BTV : bluetongue virus
BVD : bovine diarrhea virus
CBG : corticosteroid-binding globulin
CFU : colony-forming unit
CP : cytopathogène
CRH : corticotropin-releasing hormone
Ct : cycle threshold
DICC50 : dose infectante pour 50% des cultures cellulaires EAT ͗ Ġpreuǀe ă l'antigğne tamponnéECA : épreuve cutanée allergique
ELISA : enzyme-linked immunosorbent assay
FC : fixation du complément
FCO : fièvre catarrhale ovine
g : grammeGDS : groupement de défense sanitaire
18GnRH : Gonadotropin-releasing hormone
Gp : glycoprotéine
IFN࠺ : interféron gamma
IBR : rhinotrachéite infectieuse bovine
IFU : inclusionforming units
IgG, IgA et IgM : immunoglobulines G, A et M
IPI : infecté permanent immunotolérant
LH : hormone lutéinisante
LPS : lipopolysaccharide
MAT : micro-agglutination
MD : maladie des muqueuses
MDBK : Madin Darby Bovine Kidney
ml : millilitreMm : millimètre
NCP : non cytopathogène
NL : noeud lymphatique
Nm : nanomètre
PCR : polymerase chain reaction
PGF2 ɲ : prostaglandine F2 ɲ
pH : potentiel hydrogènePSP-B : pregnancy specific protein B
RESSAB ͗ RĠseau d'EpidĠmio-Surveillance de la Salmonellose BovineRK-13 : Rabbit Kidney 13
RT-PCR : Polymerase chain reaction, rétrotranscriptaseUMT : unité mixte technologique
µm : micromètre
19B42CD4CB
succombant dans les 48 heures après la naissance (décret du 24 décembre 1965). Les
avortements sont soumis à déclaration obligatoire principalement dans le but de maintenir la surveillance vis-à-vis de la brucellose bovine. Mais il semblerait que seulement un tiers desavortements soit déclaré (1). Les raisons de cette sous-déclaration sont multiples :
nécropsiques évocateurs rendent le diagnostic étiologique très difficile. Le rôle du
répétés. Le défi est de réaliser les prélèvements adéquats et de cibler les agents à rechercher
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