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RĠdaction d'un protocole de
rechercheLionel PIROTH
CHU Dijon, Université de Bourgogne
Session DESC Infectiologie
4 avril 2018
Rappeler le contedžte d'un protocole de recherche Voir les grands principes de la rĠdaction d'un tel protocole En parlant un peu de littérature dans ce monde de brutes scientifiquesObjectifs pédagogiques
Contexte/préambule =
première question ?Première question
= quelle est la question?
Protocole de recherche AEformuler une bonne question de recherche (et une seule) ±Question innovante AEfaire avancer les connaissancesAEfaisabilité d'une publication
ÎInutile de refaire une étude qui a déjà été rĠalisĠe par une multitude d'autres chercheurs ÎNécessite une bonne connaissance des études déjà réalisées dans le domainePremière question
Bilan des connaissances existantes
ma question connais sances connais sancesvidePremière question
Bilan des connaissances existantes
développées par ou en collaboration avec des groupespluridisciplinaires(inclusion de tous les points de vue )valides : fondées sur la totalité des
informations disponibles (littérature, opinionsdocumentées selon une méthodologie
explicite (y compris le financement ayant permis l'Ġlaboration de la recommandation)détaillées
±Situations cliniques couvertes
±Contexte (hôpital, médecine ambulatoire)±Types de patients concernés
internationales / nationales / locales?
ma question connais sances connais sancesvidePremière question
Bilan des connaissances existantes
±= littérature
±Recherche documentaire aussi exhaustive que possible±Multibase(Pubmed, BDSP, Embase...)
±Au moins en français et en anglais
±Critğres de recherche ă dĠfinir d'emblĠe ͬ algorithme précis et reproductible Bonne identification des termes dans chacune des bases Ne pas hĠsiter ă demander de l'aide ă des documentalistes Penser à documenter/tracer chacune des recherches effectuées ma question connais sances connais sancesvidePremière question
Bilan des connaissances existantes
ÎRésumé des connaissances Îmise en évidence des lacunes±Sur la pathologie / phénomène
Si connue : définition, fréquence, gravité, charge pour la société / perceptionSi inconnue AEquestion possible
±Sur les facteurs de risque / facteurs pronostiques(biologiques, environnementaux, comportementaux,...)
Connus AEbilan
Inconnus AEquestion possible
±Sur la prise en charge
Preuǀes d'efficacitĠ mais sans recommandations AEniveau de preuve / évaluation médico-économique (efficience)
Possible question restante sur profils spécifiques ou utilisation des pratiques ma question connais sances connais sancesvidePremière question
ma question connais sances connais sances connais sancesPremière question
Quand ça veut pas?
±! Préférer les études originales
±! Regard critique sur les études
Grilles d'aide ă la lecture critique
En regardant notamment les critères
essentiels: question posée ±Puissance de l'Ġtude AEtaille de l'Ġchantillon (quanti /quali)±Existence ou non de biais importants
Dans la réalisation de l'Ġtude (sélection/ mesure/ exécution)Dans l'analyse de l'Ġtude (confusion)
ma question connais sances connais sancesPremière question
ma question connais sances connais sancesvide ma question connais sances connais sanceséthique
Première question
ma question connais sances connais sancesvide ma question connais sances connais sancesCompte-tenu des lacunes AEdéfinition
1) d'une question principale
et 2) éventuellement de questions secondaires (à limiter)ÎRéflexion sur le schĠma d'Ġtude
QuestionsProtocole
Epidémiologie
-IncidenceSuivi de population (registre) -PrévalenceTransversal (représentatif)Thérapeutique
-EfficacitéEtude contrôlée randomisée -Sécuritéidem ou suivi de cohorteDiagnostic
-ReproductibilitéTransversal comparatif avec répétition de mesure -Validité (Se/Sp)Transversal comparatif avec gold-standard -Efficacité/utilitéEtude contrôlée randomisée -StratégieIdem ou analyse de décisionCausalité
-Phénomène contrôlable étude contrôlée randomisée fréquent -Phénomène non contrôlablesuivi de cohorte (exposé/non exposé) fréquent -Phénomène rareétude cas-témoinPronostic
-Maladie fréquentesuivi de cohorte (exposé/non exposé) -Maladie rareétude cas-témoinLa rédaction
Principes de la rédaction:
±établir un document écrit
±définissant de manière précise
±avant la mise en place de l'Ġtude
±toutes les étapesprévues de la recherche de l'identification du problğme de rechercheà la valorisation des résultats
±et qui devra être respectéscrupuleusementLa rédaction
Document écrit
±Absolue nécessité AEdocument clé
Permet de mettre ă plat l'Ġtude enǀisagĠeDe mieux cerner les difficultés
Convaincre les intervenants et les financeurs
±Document de référence
Bonnes pratiques
+++ lorsque plusieurs investigateurs
ÎProtocole = à la fois engagement, cahier des charges, convention, et guideLa rédaction
Éviter toute
ambiguïté d'interprĠtation et toute improvisation ultérieureSans complexifier
inutilement le document et/ou les procécudres (inclusion, prise en charge dans le cadre du protocole)Garantir la
faisabilitéet la qualité scientifique de l'ĠtudeLa rédaction
Précision = clarté et concision
Élaboration et rédaction en commun
±Groupe d'inǀestigateurs
±Aide d'un méthodologisteͬd'une personne expérimentée Rédaction type adaptée à chaque problématique ±prĠdĠfinie par nombre d'organismes de recherche/promoteurs (modèles types) ±mais quelques grands principes/lignes commun(e)sModèle
présentation ici = recherche cliniqueLa rédaction
Plan habituel:
±Titre de l'Ġtude
±Justification de l'Ġtude (inclproblématique et hypothèses de travail)±Objectif(s)
±Matériel/Population et Méthode (inclcalendrier et intervention)±Retombées attendues
±Budget
Justification de l'Ġtude
Présenter
±Le problème scientifique = nature et importance du phénomène étudiéPour la pratique clinique ou scientifique
±La situation de l'Ġtude par rapport audž recherches dĠjă réalisées sur le sujet Justifier son intérêt compte tenu de l'Ġtat des connaissances actuelles, notamment ±Prise en charge habituelle et traitement(s) de référenceÎNécessité
±de s'appuyer sur une reǀue complğte de la littĠratureJustification de l'Ġtude
Pour gagner en efficience:
Lors de la revue de la littérature:
±Sélection des articles sur leur titre
±Si titre dans le domaine AElecture du résumé ±Si résultats semblent intéressants AErĠcupĠration de l'article±Lecture de la méthode
si non valide, marque raisons du rejet sur fichesi valide,
±lecture du reste de l'article
±enregistrement de la référence dans un logiciel bibliographique (Bibus, Zotero, Endnote, Procite...)
±Noter les principaux résultats utiles
Justification de l'Ġtude
Grilles d'aide ă la lecture critique (Grilles internationales: EquatorNetwork (http://www.equator-network.org/) ±Essais thérapeutiques = CONSORT (CONsolidatedStandards of Reporting Trials) ±Etudes observationnelles-cohortes= STROBE (Strengthening the Reporting ofObservational Studies in Epidemiology)
±Revues systématiques et méta-analyses = PRISMA (Preferred Reporting Items forSystematic Reviews and Meta-Analyses)
±Case report: CARE
±Etude diagnostique : STARD
±Modèles de prédiction (pronostic et diagnostic) : TRIPOD±Médico-économique: CHEERS
±Recherche qualitative(entretien individuel et focus group) : COREQ ou SRQR±Recherche en pédagogie : GREET
±Synthèse de recherche qualitative: ENTREQ
±Qualité et sécurité des soins: SQUIRE±Etudes précliniques animales = ARRIVE
Justification de l'Ġtude
exempleJustification de l'Ġtude
STROBE (suite)
Justification de l'Ġtude
STROBE (suite)
STROBE-NI: Strengthening the Reporting of Observational Studies inEpidemiology for Newborn Infection
STROBE-AMS: recommendations to optimisereporting of epidemiological studies on antimicrobial resistance and informing improvement in antimicrobial stewardship STROME-ID: Strengthening the reporting of molecular epidemiology for infectious diseasesJustification de l'Ġtude
STROBE (suite)
Justification de l'Ġtude
Hypothèses testées dans l'Ġtude
±Question de recherche = ce que l'on veut savoir au moyen d'une question claire et précise ±Hypothèse de recherche = réponse présumée à la question qui oriente la rechercheDoit avoir un/du sens "scientifique»
±Ex non infériorité ou supériorité? Ne doit pas être "délirante» (notamment pour de mauvaises raisons / aspect quantitatif+) ±Ex intervalle attendu très important pour réduire nombre de sujets nécessaires Ne doit pas être "complexée» ou "étriquée» (aspect qualitatif+)Justification de l'Ġtude
Hypothèses testées dans l'Ġtude
±Conditionnent aussi la faisabilité
Ne pas sacrifier les hypothèses à la faisabilité Înon scientifique, non éthiqueJustification des choix méthodologiques
±du schĠma d'Ġtude retenu
±discussion des difficultés inhérentes au plan expérimental choisiObjectif (s)
Présentation
±de l'objectif principal de l'Ġtude
±des éventuels objectifs secondaires
±en les séparant bien
Doit découler du paragraphe précédent!Méthode
Partie servant de référence pour la mise en Doit respecter les règles de bonne pratique et la réglementation de la rechercheMéthode
Sert à décrire
±Le schémad'Ġtude
±La populationd'Ġtude
±Les critères de jugement
±Le déroulement pratique de l'Ġtude
±Les structures de superǀision de l'Ġtude±Les aspects statistiques
±Les considérations éthiques et réglementairesMéthode -schĠma de l'Ġtude
Dépend directement de la question posée/ de l'hypothğse de recherche Synthétique à ce stade -justification déjà abordée auparavantMéthode -population d'Ġtude
±Caractéristiques des sujets pouvant être inclus / des groupes comparés AEConditionne la population à laquelle les résultats pourront être appliqués ±Doit contenir les critğres d'inclusionet de non- inclusion Îtrop larges = mélange de torchons et de serviettes avec risque de ne rien démontrer et/ou de ne pas savoir pourquoi souvent de portée limitéeMéthode -critères de jugements
UN critğre principal correspondant ă l'objectif principal ±critèressecondaires Etre au plus près de la réalité/ de la pertinence / de l'usage ±Eviter si possible les critères intermédiaires/ de substitution Toujours détailler la procédure de mesure de ce(s) critère(s)±Moment et méthodes de la mesure (instrumentation, contrôles de qualité, formation des acteurs)
±Méthode de calcul du critère si multi-composite ( ) ±Insu AEévaluation par un examinateur ne connaissant pas le statut du patientMéthode -dĠroulement de l'Ġtude
Pour tous les acteurs (investigateurs, intervenants, patients) avec définition de leur rôle
Consentement écrit du patient le plus souvent -loi Jardé ±CATEGORIE 1 : Les recherches interventionnelles qui comportent une intervention sur la personne non justifiée par sa prise en charge habituelle Îinformation et consentement écrit ±CATEGORIE 2 : Les recherches interventionnelles qui ne comportent que des risques et des contraintes minimes Îinformation et consentement exprès ±CATEGORIE 3 : Les recherches non interventionnelles dans lesquellestousles actes sont pratiqués et les produits utilisés de manière habituelle, sans procédure supplémentaire ou inhabituelle de diagnostic, de traitement ou de surveillance Îinformation et droit d'oppositionMéthode -schĠma de l'Ġtude
Doit comprendre
±Calendrier
Des examens et/ou des interventions
±Consentement
Modalités et moment exact du recueil du consentement des patientsDestinataires du formulaire de consentement
Conditions d'archiǀage
±Recrutement des patients : qui fait quoi et comment ? Visite de pré-inclusion AEǀĠrification des critğres d'ĠligibilitĠ±Information des patients
±Déroulement (et timing) des examens, des prélèvements préalables Visite d'inclusion AEremise des ordonnances, réalisation des Doit préciser ce que deviennent les patients non inclusMéthode -dĠroulement de l'Ġtude
Doit comprendre
±Suivi : qui fait quoi et quand?
Surǀenue d'un critğre de jugement
±Modalités de validation
±±ModalitĠs de notification au centre de gestion de l'Ġtude ±Arrġt dĠfinitif ou non de l'Ġtude AEsuite pour le patient Arrġt de l'Ġtude en cours de route (abandon du patient ou arrêt simple du traitement)±Lister les raisons possibles de cet arrêt
±Préciser le suivi/ prise en charge malgré cet arrêt ±±Modalités de notification au centre de gestion de l'ĠtudeAttitude à adopter en cas
±D'absence d'inclusion
±Violations majeures / mineures du protocole par un centre ou un investigateur±Perdus de vue
= déviations par rapport aux protocolesMéthode -les structures de supervision
Objectif :
±Garantir le bon dĠroulement de l'Ġtude
Généralement
±Comité de pilotage/ scientifique
±Comité indépendant de surveillance
Îmissions spécifiques et rythmes de réunion à définir précisément ±+ comité de validation des événements±+ centre de gestion
Méthode -aspects statistiques
Présentation des méthodes statistiques permettant de rĠpondre audž objectifs de l'ĠtudeComprend:
±Justification et calcul du nombre de sujets nécessaire (si pas présenté auparavant) de signification±Analyses intermédiaires
Plan d'analyse prĠcis Ġtabli a priori AEgarantie sur l'impartialitĠ de l'analyse et des rĠsultatsMéthode -considérations éthiques et
règlementairesEnregistrement de l'Ġtude
±Déclaration de Helsinki:"toute
recherche impliquant des êtres humains doit être enregistrée dans une banque de données accessible au public avant que ne soit recrutée la première personne impliquée dans la recherche»±L'Organisation mondiale de la santĠ a
identifié plusieurs bénéfices à dont notamment:prévention contre les publications
biaisées et les rapports sélectifsprévention contre la duplication
inutile des essais cliniquesamélioration de la qualité
générale des essais cliniquesMéthode -considérations éthiques et
règlementaires enregistrement de l'Ġtude sur registres primaires de l'OMSou sur registre américain ClinicalTrials.gov Registres qui satisfont aussi aux critères du Comité international des rédacteurs en chef de revues médicales (ICMJE) qui exigent comme condition à la publication que l'essai public aǀant, ou au moment de, l'inscription du premier participant.Retombées attendues -publications
Retombées attendues:
±permet de resituer le problème et les avancées qui pourraient découler du projetPlan scientifique
Plan pratique
Plan économique
±élément clé pour convaincre les décideurs et les financeursPublications ă prĠǀoir d'emblĠe avec Conseil scientifique, Promoteur, Industriels impliqués, Investigateurs
Budget
= Identifier les ressources requises pour réaliser l'Ġtude ±Matériel (papier enveloppes tablettes appareils de mesures ...)±Traitements / intervention
±Prélèvements
±Tests biologiques
±Stationnements, repas
±etc
Stress test
La lettre d'intention
±Souǀent demandĠe lors des appels d'offre±= protocole rédigé en condensé
±= impose de respecter tout ce qui a été dit avant! AuET ON FINIT PAR LE DEBUT!
1èrepage
±Titre de l'Ġtude
Explicite, informatif et concis mais intégrant la pathologie concernée, la population d'Ġtude, l'objectif ou le schéma d'Ġtude, les traitementsÎacronymes
(doit aussi apparaître dans le formulaire de consentement)±Version (provisoire / définitive) + date
±CoordonnĠes du promoteur et de l'inǀestigateur principal ±Liste des principaux responsables pour le protocoleSommaire
Résumé du protocole (Synopsis)
±Titre
±Introduction
±Objectif
±Méthodes (critères d'inclusion et de non inclusion, [intervention], critères de jugement, plan d'analyse, nombre de sujets nécessaire)