Transcriptional regulation of the rod-specific transcription

Le dernier rebondissement de l’affaire Céline: le projet d’une réédition des trois pamphlets antisémites Marc Knobel s’entretient avec Annick Duraffour et Pierre-André Taguieff Début décembre 2017, nous avons appris avec stupeur que Gallimard projetait

Transcriptional regulation of the rod-specific transcription

bon rebondissement ;‐) Virginie, bonne chance pour tes manip Aux doctors‐to‐be : Ouafaa, je te souhaite beaucoup de courage pour l’achèvement de ton manuscript de thèse et bonne chance pour ta soutenance

Enigma Variations And By Roche Paul

Rebondissement avec l'origine énigmatique de Phobos et Yellowtail Kingfish be simple in its method but gathering the bait is the most difficult part, despite the bay having a very healthy population of calamari, yellowtail scad and slimy mackerel Vic/Tas Fishing Monthly February 2018 by Fishing Monthly Parfum en ligne au Maroc

Séance 1 Lecture analytique des animaux malades

- L’ultime rebondissement met en scène une figure de juge avec le loup L’expression « crier haro sur le baudet » (v 55) appartient au lexique de la justice tout comme les mots « harangue », « jugée » et « pendable » - Le moraliste s’en prend donc aussi à la justice, dont il dénonce ici la partialité :

Un Avion Sans Elle Michel Bussi - superbiographycom

Un avion, sans elle m'a poussée à ne plus rien faire avant d'avoir fini Je ne pouvais pas le quitter Les rebondissement se suivent et les suppositions que l'on peut faire sont toutes fausses Amazon com: Un avion sans elle (Audible Audio Edition

Ces Messieurs De Saint Malo Roman

Le rebondissement de multiples situations, le foisonnement de personnages où se détachent d'admirables portraits de femmes, la présence permanente de l'histoire, font de Ces messieurs de Saint-Malo un grand roman d'aventures et d'amours qui est aussi un grand roman de société

Dissertation sur les Fables de La Fontaine

Mlle Grilli 2 Il ne faut pas faire une partie « plaire » et une autre « instruire » puisque nous avons étant donné que l’intérêt – et la difficulté – du sujet repose sur le lien entre les deux notions « tout en »

KRAKEN - Le VerbatBlog

de rebondissement Selon des sources fiables, sa carrière ne serait donc pas mise en danger, malgré les lourdes séquelles que laisserait son coma C’est d’abord le responsable des courses Formule 1 chez Ferrari qui s’est exprimé début janvier, au sujet de Schumacher William Antons

Phobia - mrynjtryhypeco

Phobia - Wikipedia pho·bi·a (fō′bē-ə) n 1 A persistent, abnormal, and irrational fear of a specific thing or situation that compels one to avoid it, despite the awareness and reassurance that it is not dangerous 2 A strong fear, dislike, or aversion [From -phobia ] phobia (ˈfəʊbɪə) n (Psychiatry) psychiatry an abnormal

Batman Hush - ionmfberndpulchco

Batman: Hush (film) - Wikipedia Batman: Hush is an American comic book story arc published by DC Comics featuring the superhero Batman It was published in monthly installments within the comic book series Batman, running from issue #608–619 in October 2002 until September 2003 The story arc was written by

[PDF] oeuvre de l'humanisme

[PDF] révision anglais 4am

[PDF] programme d anglais 4ème moyenne

[PDF] inscription lille 1 2017-2018

[PDF] université de lille 1 villeneuve-d'ascq

[PDF] université lille 1 inscription 2017-2018

[PDF] inscription administrative en ligne lille 1

[PDF] mouvement relatif cours

[PDF] inscription lille 1 2016-2017

[PDF] mouvement absolu définition

[PDF] récapitulatif inscription lille 1

[PDF] mouvement relatif physique

[PDF] validation d'études lille 1

[PDF] mouvement relatif cours pdf

[PDF] dossier inscription lille 1

UNIVERSITÉ DE STRASBOURG

ÉCOLE DOCTORALE ED414

CNRS UPR 3212

THÈSE présentée par :

Marie-Audrey KAUTZMANN

soutenue le : 12 Juin 2012 pour obtenir le grade de :

Docteur de l'Université de Strasbourg

Discipline/ Spécialité : Sciences du vivant / Neurosciences

Régulation transcriptionnelle du facteur

de transcription spécifique des bâtonnets, Nrl

Transcriptional regulation of the rod-specific

transcription factor, Nrl THÈSE dirigée par : Dr. FELDER-SCHMITTBUHL Marie-Paule

THÈSE dirigée par : Pr. SWAROOP Anand

RAPPORTEURS : Dr. PERRON Muriel

Dr. VOISIN Pierre

AUTRES MEMBRES DU JURY : Pr. DOLLFUS Hélène

performedatNͲNRLandwassupported th

UniversityofStrasbourg.

DoctoralCollegeoftheUniversityof

internationalexperts. effectuéeàN

EyeInstitute.

pourlaRechercheMédicale,Paris,France. deStrasbourg. aidesspécifiquesdu deStrasbourg. whatmorecanascientistdesire?

HansSpemann1927

REMERCIEMENTS/ACKNOWLEDGEMENTS

ACKNOWLEDGEMENTS

Mesremerciementss'adressent

SchmittbuhletDrAnandSwaroop.

tonmentoringaucours dema doctoratm'ontconfortés aussiagréables. studentatNEI.DrSwaroop, firsttwoyearsIworkedwithyoubutit goodmentorforthenextstepin mycarreer,whichisdoingapostdoc. labodeDrSwaroop.Ton

REMERCIEMENTS/ACKNOWLEDGEMENTS

2 doncmercisincèrement! desrythmesàl'INCI. you, projetdethèse.Surleplan

Iamthankfulto

everydaylife.Iwishyougoodluckfor st yearof mythesiswasreallyappreciable. outsidethelab.Winette,the

DucôtéStrasbourgeois,je

REMERCIEMENTS/ACKNOWLEDGEMENTS

3 luckwith

Catherine,jetesouhaiteune

...Etàceuxqui tudécrocherasuneoffredethèse.

Unclind'oeil

conditionsoptimalesmafindethèse. accompagnés toutaulongdecelabeur. 4

MarieͲAudreyKAUTZMANN

Régulationtranscriptionnelledu

facteurdetranscriptionspécifique desbâtonnets,Nrl

Résumé

desbâtonnets.

Rhodopsine

Résuméenanglais

photoreceptors.

ABBREVIATIONS

RECURRENTABBREVIATIONS

AAVAdenoͲassociatedvirus

BMAL1BrainandmucleARNTLprotein1

bZIPbasicmotifleucinezipper

CLOCKCircadianlocomoteroutputcycleskaput

CMVCytomegalovirus

Crx Conerodhomeobox

EGFPEnhancedGreen

FluoresceentProtein

EMSAElectrophoreticmobilityshifhtassay

GCLGanglioncelllayer

HEKHumanembryonickidney

INL Innernuclearlayer

MafMusculoAponeuroticFibrosarcoma

Nrl Neuralretinaleucinezipper

ONLOuternuclearlayer

Outersegment

Otx2Orthodenticlehomolog2

ABBREVIATIONS

PBSPhosphatebuffersaline

PCRPolymerasechainreaction

PERPeriod

PR Photoreceptor

RK RhodopspinKinase

RORRARͲrelatedorphanreceptorb

RORERORresponseelement

RP Retinitispigmentosa

RPERetinalpigmentedepithelium

TF Transcriptionfactor

RÉSUMÉ DE LA THÈSE EN FRANÇAIS

RÉSUMÉDELATHÈSEEN

FRANÇAIS

RÉSUMÉENFRANÇAIS

9 synergie influenceraleniveau del'ARN altération promoteurpourinitierlatranscription. donné.

Ladiversitédes

fonddel'oeil,et

RÉSUMÉENFRANÇAIS

dudéveloppementdelarétine générer quis'exprimedanstoutes

RÉSUMÉENFRANÇAIS

10 jusqu'auxcentres etdeladétection particulièrementsensiblesaux conduisant

àlacécité.

dansl'acquisitionde sedifférencieren chezdesanimaux Nrl

RÉSUMÉENFRANÇAIS

Figure2'.Ordredenaissance

descellulesdelarétinede souris

Laneurogenèserétiniennesuitun

ordrehistogéniqueprécis.Les cellulesganglionnaireset horizontalessontlespremièresàse différencier,suiviesdesphasesde naissancejuxtaposéesdes photorécepteursdetypecône,des cellulesamacrines,des photorécepteursdetypebâtonnets, descellulesbipolairesetenfindes cellulesglialesdeMüller.Chaque courbereflète laproportionrelative

Marquardtetal.2002)

transcriptionnellementactive montre

Barred'échelle,20µm.

RÉSUMÉENFRANÇAIS

11 (Rehemtulla, laRétinitePigmentaire(Bessant, bonmodèlepourcomprendre desphotorécepteurs. desrégionsdu nés,correspondantà analysedes consensusprédits(Figure4'). d'utilisationdecepromoteur

RÉSUMÉENFRANÇAIS

dupromoteur/enhancerdeNrl 32

Petretardés

ou100ng

RORɴ,et

l'extrémité5'de

RÉSUMÉENFRANÇAIS

12 natal).Deplus,deuxtypesderétinesde des cherchéà rétineontétéchoisis,P4,P10et aussibiendansdes photorécepteurs. maisaussidupointvue dela Ror,

RÉSUMÉENFRANÇAIS

virusrecombinantsadénoͲassociés 3 e12

D';concentréà1

e12 couche

RÉSUMÉENFRANÇAIS

13 de24 h,del'ordrede1x10 6 (Brandenburg,

Rollagetal.2005),ou

RevErbɲ.C'est

gène.

RORE»(Retinoidrelatedorphan

l'étudedela

RÉSUMÉENFRANÇAIS

deNRLdansdesrétinesNrlKO antiͲRhodopsine(RHO)surdesrétines

RÉSUMÉENFRANÇAIS

14 composantessentielde présenced'uneséquence"E parlesfacteursCLOCKet

RÉSUMÉENFRANÇAIS

développement mCherry ;bleu,DAPI.Barred'échelle,20µm. desphotorécepteursderat sont

RÉSUMÉENFRANÇAIS

RORetRevErbensembles(0.15µg

lecontrôleinternedela

00.20.40.60.811.21.41.61.8

RelativefoldͲchange(ratioF/R)

Expressionconstruct

TABLEDESMATIÈRES

B.Anatomyanddevelopment

1.4NonͲneuronal

TABLEDESMATIÈRES

42
2.NRL B.

TABLEDESMATIÈRES

4. AAV83 A. 24h

FIGURESANDTABLES

FIGURETITLEPAGE

RÉSUMÉDELATHÈSEENFRANÇAIS

dudéveloppementdelarétine5 transcriptionnellementactive6 dupromoteur/enhancerdeNrl7 laréͲintroduction deNRLdansdesrétinesNrlKO9 développement9i

Figure8'Profilesd'expressiond'ARNmdeROR

etRevErbdanslacouche desphotorécepteursderat9i et/ouRevErb9ii

INTRODUCTION

Figure3Corepromoterelements20

Figure4FunctionsofTAFs20

steps21

Figure6Transcriptionfactor

domains22 initiation.23

Figure8ModelforadimericbZIPprotein24

Figure10Thehumanretina25

Figure12Retinalorganization

Figure13Thematureretina27

FIGURESANDTABLES

Figure14Rodandconestructures28

Figure17Retinalcelldiversification31

Figure25Lightоdarkcyclingofopsin,G

Gand48kDaproteinmRNA

levels41 promoter45 transgenicmice47

MATERIALSANDMETHODS

Figure29

Table5

RESULTS

predictedsitesfor transͲactingregulators70 sequenceelements.71

FIGURESANDTABLES

Table6Cosinoranalysis

ofmRNAlevelsofclockoutputgenesinwhole retinaandisolatedphotoreceptors.92 retina andisolatedphotoreceptors99 photoreceptors106 bovinerhodopsinpromoterbyNonO116

Figure48NonOis

requiredforrodphotoreceptorsurvival.117

PREFACE

underͲexpression dystrophies. todissect roleasaregulatorofroddifferentiation thirdchapterwill discussourfindingsandpresentacoherent viewofwhatmystudieshavecontributedto thefield. 22

INTRODUCTION

A. Generalmechanismsoftranscriptionalregulation

1. Transcriptioninitiation

1.1 Promoterdescriptionandfunction

factors.Thesefactors The bind onthe (Tjian1996;Naar,

MTE(MotifTen

transcriptionfactorimportantforthe

CritRevBiochemMolBiol.,2006.

TATAbox"forTFIIDbinding

Specificityprotein1(Sp1)

withsequenceͲspecific methylcytosinewillleadtogenesilencing.

1.2 Recruitmentoftheinitiationcomplex

transcriptionfactors,theTBPͲ etal.1991; transducingsignalsfrom promoter(Kim,Bjorklundetal.1994)(Figure 5).

Figure3.Corepromoterelements

onlyafractionofcorepromoterswith

FromBaumannetal.,Mol.Biotechnol.,2010.

Figure4.FunctionsofTAFs

al,AnnuRevBiochem,2001. 25
carboxyͲ

2. Regulationofthetranscription

2.1 Roleofenhancers

Promoterand

Whilethe

asaresponsetoa proximitytothePIC(LiebermanͲAiden,

20kbupstreamofAtoh7(Math5)gene

istodownͲregulatethetranscriptionby methylation(Me), 26

2.2 Transcription

factorsandchromatinremodeling

2.2.1 Modeofaction

DNAͲbindingdomain

domainisthetransͲactivatingdomain themselvesenzymesalteringchromatin activatorstoaccesstothe proteins yeastandpossessesaDNAͲ

Figure6.Transcriptionfactordomains

27
histones3and4ofthecoreofhistone coͲactivatorthatbridges ofyeastGcn5)andSAGA activitiesviaone conservedinmetazoans (Wang,Tangetal.2008). chromatinmodificationsduringgene

2007).

2.2.2 SubͲfamilyofbasicmotifleucinezipper

transcriptionandfurtherin initiation. oflysinesinhistone(circledAc), aroundthehistoneoctamer,thusexposingthe adjacentTATAbox.(d)TBP/TFIIDbindsthe instances,recruitmentof 28
expressionandcellular smallMafsincludethehighly extendedhomologyregion(EHR)specific DNA residueseverysevenaminoͲacids (Mafresponseelement,TGC containingconsensussitesforfixationofquotesdbs_dbs8.pdfusesText_14

[PDF] Transcriptional regulation of the rod-specific transcription

UNIVERSITÉ DE STRASBOURG

ÉCOLE DOCTORALE ED414

CNRS UPR 3212

THÈSE présentée par :

Marie-Audrey KAUTZMANN

Docteur de l'Université de Strasbourg

Régulation transcriptionnelle du facteur

Transcriptional regulation of the rod-specific

THÈSE dirigée par : Pr. SWAROOP Anand

RAPPORTEURS : Dr. PERRON Muriel

Dr. VOISIN Pierre

AUTRES MEMBRES DU JURY : Pr. DOLLFUS Hélène

UniversityofStrasbourg.

DoctoralCollegeoftheUniversityof

EyeInstitute.

HansSpemann1927

REMERCIEMENTS/ACKNOWLEDGEMENTS

ACKNOWLEDGEMENTS

Mesremerciementss'adressent

SchmittbuhletDrAnandSwaroop.

REMERCIEMENTS/ACKNOWLEDGEMENTS

Iamthankfulto

DucôtéStrasbourgeois,je

REMERCIEMENTS/ACKNOWLEDGEMENTS

Catherine,jetesouhaiteune

Unclind'oeil

MarieͲAudreyKAUTZMANN

Régulationtranscriptionnelledu

Résumé

Rhodopsine

Résuméenanglais

ABBREVIATIONS

RECURRENTABBREVIATIONS

AAVAdenoͲassociatedvirus

BMAL1BrainandmucleARNTLprotein1

CLOCKCircadianlocomoteroutputcycleskaput

CMVCytomegalovirus

Crx Conerodhomeobox

EGFPEnhancedGreen

FluoresceentProtein

EMSAElectrophoreticmobilityshifhtassay

GCLGanglioncelllayer

HEKHumanembryonickidney

INL Innernuclearlayer

MafMusculoAponeuroticFibrosarcoma

Nrl Neuralretinaleucinezipper

ONLOuternuclearlayer

Outersegment

Otx2Orthodenticlehomolog2

ABBREVIATIONS

PBSPhosphatebuffersaline

PCRPolymerasechainreaction

PERPeriod

PR Photoreceptor

RK RhodopspinKinase

RORRARͲrelatedorphanreceptorb

RORERORresponseelement

RP Retinitispigmentosa

RPERetinalpigmentedepithelium

TF Transcriptionfactor

RÉSUMÉ DE LA THÈSE EN FRANÇAIS

RÉSUMÉDELATHÈSEEN

FRANÇAIS

RÉSUMÉENFRANÇAIS

Ladiversitédes

RÉSUMÉENFRANÇAIS

RÉSUMÉENFRANÇAIS

àlacécité.

RÉSUMÉENFRANÇAIS

Figure2'.Ordredenaissance

Laneurogenèserétiniennesuitun

Marquardtetal.2002)

Barred'échelle,20µm.

RÉSUMÉENFRANÇAIS

RÉSUMÉENFRANÇAIS

Petretardés

RORɴ,et

RÉSUMÉENFRANÇAIS

RÉSUMÉENFRANÇAIS