Manuel de référence du logiciel BD FACSDiva
Historique Révision Date Modification effectuée 341756 Rév A 8/01 Version finale pour le logiciel BD FACSDiva™ version 1 0 330798 Rév A 1/02 Mise à jour vers la version 2 0 : Performances améliorées, utilitaire de restructuration de la base de
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Réservé au diagnostic in vitro
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référence du logicielBD FACSDiva
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Révision Date Modification effectuée
341756 Rév. A 8/01 Version finale pour le logiciel BD FACSDiva™ version 1.0.
330798 Rév. A 1/02 Mise à jour vers la version 2.0 : Performances améliorées, utilitaire de restructuration de la base de
données et de gestion des données, affichage de données modifiable, fonctionnalités de réglages
d'appareil, bouton Next, fonctions copier/coller et fonctionnalités d'affichage du graphe accrues.
330802 Rév. A 6/02 Mise à jour vers la version 2.1 : Performances améliorées, nouvelle conception de l'aire de travail
avec éléments séparables, dossiers au niveau du navigateur, curseur d'acquisition opérationnel,
redéfinition de la fonction Sort Layout, copie d'objets par simple glissé, fenêtrage en mode
descendant, quadrillage par décade logarithmique pour les graphes, affichage/masquage des limitesd'une région, curseurs dépendant du contexte, lissage de l'histogramme, modifications de fenêtrage
téléchargées lors du tri, acquisition automatique lors de l'enregistrement/du tri, importation/
exportation d'expériences, facteur de mise à l'échelle du ratio par ratio, facteur de mise à l'échelle
de l'aire par laser.333602 Rév. A 11/02 Mise à jour vers la version 2.2 : Modèles d'acquisition, préférences utilisateur, calcul automatique
de la compensation, copier/coller des valeurs de recouvrement spectral, rapport d'état de l'appareil,
rapport de tri, compteurs de Sort Layout, tracés de contour, régions Auto-Interval, touches rémanentes, éditeur des vues statistiques.337370 Rév. A 1/04 Mise à jour vers la version 4.0 : Nom d'utilisateur, expériences privées et partagées, nouveaux
boutons page de travail (augmentation/réduction du graphe, région snap-to interval), nouvellespréférences utilisateur, modèles d'expériences et d'échantillons, analyse en série, commandes
d'ajustement pour les régions snap-to, fonctions spécifiques de l'appareil BD FACSCanto™.337999 Rév. A 4/04 Mise à jour vers la version 4.0.1 : Version CE IVD
338572 Rév. A 9/04 Mise à jour vers la version 4.1 : Graphes biexponentiels, régions quadrant pivotables, tracés de
densité, modèles par défaut et couleur du fond du graphe dans les préférences utilisateur, réglages
généraux de l'appareil, restrictions concernant la modification des réglages de l'appareil, nouveau
procédé de création des tubes de contrôle de la compensation, modèles de CQ par défaut, mise
à l'échelle de l'aire des FSC, copier/coller d'éléments de la page de travail vers des applications
Microsoft® Office, support de l'échantillonneur haut débit High Throughput Sampler (HTS) deBD™ sur le BD™ LSR II.
640749 Rév. A 5/06 Mise à jour vers la version 5.0 : Améliorations du flux de travail du Passeur de tubes BD FACS™ et
prise en charge de l'option BD HTS sur les appareils BD FACSCanto, nouvelle apparence,possibilité de désactiver la mise à l'échelle biexponentielle, application des valeurs de mise
à l'échelle aux autres éléments des expériences, mise à l'échelle d'une population, copier/coller des
régions, importation/exportation des profils utilisateur, importation/exportation, duplication et impression des configurations des appareils. Pour obtenir davantage de détails, consulter les nouvelles fonctionnalités dans le Démarrage avec le logiciel BD FACSDiva.642218 Rév. A 5/07 Mise à jour vers la version 6.0 : Configuration du cytomètre facilitée, améliorations des flux de
travaux pour l'administration, utilisation du navigateur, acquisition, importation et exportationdes fichiers, apparence améliorée, statistiques robustes, nouvelles options de fenêtrage et prise en
charge du Laser 375 pour le BDFACSAria. Pour obtenir davantage de détails, consulter les nouvelles fonctionnalités dans le Démarrage avec le logiciel BD FACSDiva. vTable des matières
À propos de ce manuel xi
Conventions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . xii
Assistance technique . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . xiii
Limitations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . xiv
Chapitre 1 : Installation et configuration du logiciel 15À propos du logiciel BD FACSDiva . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16
Composition . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16
Configuration requise . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18
Compatibilité . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19
Installation du logiciel BD FACSDiva . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20 Installation du nouveau logiciel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21Fichiers installés . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
Démarrage du logiciel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
Administration des comptes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31
Ajout d'utilisateurs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31
Ajout ou modification de mot de passe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36 Suivi des connexions des utilisateurs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37 Exportation de profils d'utilisateurs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38Invalidation d'utilisateurs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41
Fermeture du logiciel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42
Chapitre 2 : Aire de travail BD FACSDiva 43
Composants de l'aire de travail . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44
viManuel de référence du logiciel BD FACSDivaBarre d'état . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45
Barre d'outils de l'aire de travail . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45Options d'affichage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46
Inspecteur . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48
Navigateur . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49
Utilisation du navigateur . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
Utilisation de la zone de recherche . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51 Ajout de nouveaux éléments au navigateur . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52 Utilisation du marqueur du tube en cours . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56 Organisation du navigateur . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57Expériences . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59
Lancement d'une nouvelle expérience . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59Ouverture d'expériences . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61
Utilisation de l'inspecteur d'expérience . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62 Enregistrement des expériences . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62Expériences partagées ou privées . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67
Exportation et importation d'expériences . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68Recherche de données enregistrées . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68
Utilisation de la boîte de dialogue Experiment Layout . . . . . . . . . . . . . . 70 Utilisation des listes de la boîte de dialogue Experiment Layout . . . . . . . 71Étiquettes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71
Mots-clés . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73
Critères d'acquisition . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 76
Échantillons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79
Utilisation de l'inspecteur d'échantillon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79 Exportation d'un échantillon en tant que modèle de panel . . . . . . . . . . . 80 Importation d'un modèle de panel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 82 Application d'une analyse de panel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84Tubes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85
Utilisation de l'inspecteur de tube . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85Table des matièresviiCréation d'un tube à partir d'un modèle d'analyse prédéfini . . . . . . . . . 89
Réglages du cytomètre . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90
Objets d'analyse . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91
Enregistrement d'un modèle d'analyse . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91Copie des analyses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 93
Mots-clés . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 94
Définition et modification des mots-clés . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 95Suppression des mots-clés . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100
Préférences utilisateur . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100
Préférences de l'onglet General (général) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 101
Préférences de l'onglet Gate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103
Préférences de page de travail . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104
Préférences de l'onglet Plot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
Préférences de l'onglet FCS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
Préférences de l'onglet Template . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 107
Préférences de l'onglet Statistics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108
Préférences de l'onglet Biexponential . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109
Chapitre 3 : Commandes du cytomètre et d'acquisition 111Commandes du cytomètre . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 112
Configurations du cytomètre . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 113
Détails relatifs au cytomètre . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127
Messages d'état . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127
Commandes laser . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128
Rapports d'état du cytomètre . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132
Veille et connexion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135
Panneau d'acquisition (Acquisition Dashboard) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135 Activité en cours et commandes de base . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136Acquisition Setup . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139
Acquisition Status (État de l'acquisition) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142Curseur de tube en cours . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143
viiiManuel de référence du logiciel BD FACSDivaRéglages du cytomètre . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
Ajustement des réglages du cytomètre . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 146 Création de réglages spécifiques à l'échantillon ou au tube . . . . . . . . . . . 155Utilisation des réglages généraux du cytomètre . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156
Impression des réglages du cytomètre . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 159
Exportation des réglages du cytomètre . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 160 Contrôles de correction de la compensation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 162 Utilisation de la configuration de la compensation . . . . . . . . . . . . . . . . . 163 Utilisation des configurations des compensations . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175 Calcul manuel de la compensation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 180Chapitre 4 : Outils d'analyse des données 189
Pages de travail . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 190
Pages de travail standard . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 190
Pages de travail générales . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 192
Utilisation de la barre d'outils des pages de travail . . . . . . . . . . . . . . . . . 195 Utilisation de l'inspecteur de pages de travail . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 199 Modification des pages de travail . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 201 Impression des pages de travail . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 207 Enregistrement de pages de travail sous forme de fichiers PDF . . . . . . . . 208Graphes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 210
Création de graphes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 211
Modification des graphes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 213
Utilisation de l'inspecteur de graphe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 218 Utilisation d'un affichage biexponentiel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 230Régions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 236
Traçage des régions manuelles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 239
Création de régions automatiques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 241
Fonctionnement des régions Snap-To . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 242Modification des régions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 248
Masquage et affichage des régions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250Table des matièresixCopier-coller de régions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 251
Glisser-déposer des régions dans les graphes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 251 Glisser-déposer dans une hiérarchie de population . . . . . . . . . . . . . . . . . 252Hiérarchie de population . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 253
Utilisation de la hiérarchie de population . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 254Définition d'une région dérivée . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 257
Application des coordonnées des régions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 260Statistiques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 261
Sélection des statistiques à afficher . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 262
Calcul des statistiques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 267
Exportation de statistiques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 270
Analyse en série . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 271
Travail hors-ligne . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 275
Chapitre 5 : Gestion des données 277
Travail avec les données BD FACSDiva . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 278Maintenance des données . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 279
Optimisation du traitement des données . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 281 Vérification de la taille de la base de données . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 281Suppression d'expériences . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 282
Exportation et importation de fichiers FCS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 283Export de fichiers FCS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 284
Importation de fichiers FCS provenant d'autres applicationsBD Biosciences . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 289
Importation de fichiers FCS provenant d'autres applications . . . . . . . . . 291Exportation et importation d'expériences . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 293
Exportation d'expériences . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 294
Import d'expériences . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 296
Utilisation de l'utilitaire Data Manager . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 297
Sauvegarde de la base de données . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 298 Restauration de la base de données . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 301 xManuel de référence du logiciel BD FACSDivaChapitre 6 : Résolution des problèmes 305Résolution des problèmes d'installation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 306
Résolution des problèmes électroniques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 308
Résolution des problèmes généraux de logiciel. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 310
Résolution des problèmes de configuration de la compensation . . . . . . . . . . 315Résolution des problèmes d'analyse . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 318
Résolution des problèmes du programme Data Manager . . . . . . . . . . . . . . . . 320Résolution des problèmes d'impression . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 322
Impression directe sur l'imprimante. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 322Annexe A : Menus et raccourcis clavier 325
Menus du logiciel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 326
Menus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 327
Raccourcis clavier . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 328
Annexe B : Théorie numérique 331
Méthode de mesure des signaux numériques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 332Seuil . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 333
Valeurs paramètres . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 333
Ratios . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 334
Compensation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 334
Interruptions électroniques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335