[PDF] L3-BH01 Cours n°7 Réparation de l’ADN

LES SYSTEMES DE REPARATION DE LADN

4- réparations par excision : schéma 5) a- Excision d’une base ( BER) : Elle se déroule en cinq étapes successives : → Une ADN-glycosylase reconnaît la base altérée et l’élimine par excision → Le site de l’ADN ainsi modifié devient un site AP (apurique ou apyrinique)

REPARATION DE L’ADN - NCA

Réparation par excision de base (BER): Système existant chez les procaryotes et les eucaryotes et corrige les bases anormalement appariées telles que U à la place de T et T-G au lieu de C-G, T obtenue /désamination d’une C méthylée

L3-BH01 Cours n°7 Réparation de l’ADN

Systèmes de réparation par excision Tous les systèmes de réparation par excision fonctionnent de la même manière : Étapes : 1- reconnaissance de la région d’ADN endommagé 2- le brin d’ADN endommagé est scindé par une endonucléase 3- une exonucléase élimine un fragment du brin endommagé

Test fonctionnel de mesure des activités enzymatiques de

2) Le fonctionnement mécanistique de la réparation par excision de nucléotides _____ 7 3) Voie de signalisation et régulation de la REN _____ 12 B) La réparation par excision de base (REB)_____ 16

iche ncologie - Eurofins Biomnis

de réparation de l’ADN 5 systèmes présentent un intérêt particulier en cancérologie : X la réparation par excision de base ou Base Excision Repair (BER) X la réparation par excision de nucléotides ou Nucleotide Excision Repair (NER) X la réparation par recombinaison homologue Homologous Repair (HR)

La lyase du photoproduit des spores (SPL - Collège de France

Réparation par excision de: *nucl éotides *bases Chez tous les organismes vivants Excision d ’un oligonucl éotide de 12 -13 bases 3 étapes : Reconnaissance du dommage Excision de l ’oligonucl éotide ou de base Re -synth èse et ligation 5’ 3’ 3’ 5’ 5’ 3’ 3’ 5’ REN CDF18/05/11

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S. Bourgerie

2006-07

L3-BH01

Cours n°7

Réparation de l'ADN

Ce cours est présent sur le web à l'adresse suivante :http://www.univ-orleans.fr/sciences/BIOCHIMIE/L/ressources.htm

Int r oduction I-

Erreurs de la réplicatio

n - m

écanisme de leur réparation

fonction de correction d'ép reuve des ADN polymérases activité 3'-5' exonucléasique de l'ADN pol I système de réparation des mésappariements mécanisme de réparationméthylation II-

Dommages d

e l'ADN dommages spont a nés désam i nation dépurinati o n dommages provoqués radiation UV alkylationag ents intercal ant analogues de bases III-

Systèmes de réparation des d

o mmages de l'ADN réparation par simple réversion phot oréactivation dé-alkylation

B.E.R : 'bas

e ex cisi on repair'

N.E.R : 'nucleotide

e x c ision repair'

Synthèse translésionnelle

Récapitulati

f Plan

INTRODU

C TION

Les mutations

c orrespondent à des chan gements permanents dans la séquence nuc léotidique de l'ADN p euvent aller du re mplaceme nt d'une paire de bases pa r une autre (substitutio n)

à l'addition ou l

a délétion d'une ou plusieurs paires de bases (i nsertion ou déléti on

Mutation silencieuse

: mutation touchant un ADN non essentiel ou qui occasi onne un effet négligeable

Mutation favorabl

e : celle qui confère un avantage à la cellule

Le plus souvent les mutations sont néfastes

Toutes les cellules possèdent

de multiples systèmes de réparation de l'ADN

Système

E nzymes - p rotéines T y pe d'altération

Réparation des erreurs d'appariement

Dam méthylas

e Protéines MutH, MutL, MutSADN hélicase IISSBADN poly m

érase II

I

Exonucléase

I

ADN ligase

Erreurs d'appariement

Réparation directe

ADN phot

olyases

O6-méthyl

guanine transféras e

Dimères de pyrimidineO6-méthylguanine

Réparation par excision d'une base

ADN glycosylasesEndonucléasesADN poly

m

érase I

ADN ligase

Bases anormalesBases alkykées(dimères de pyrimidine)

Réparation par excision d'un nucléotide

Excinucléase

A BC

ADN poly

m

érase I

ADN ligase

Lésions de l'ADN qui provoquent des changements structuraux

La correction d'épreuve des ADN polymérases

Un exemple

d 'accident de la ré plication

Transition TA -

C G

Transit

i on : remplacement d'une purine p ar une purine ou remplacement d'une pyrimidine par une p yrimidine

Erreurs dans la réplication : un exemple

1 er type de réacti on catalysée pa r l

ADN pol

I : synthèse d'ADN

Structure de l'ADN polymérase I d'

E. coli

Fonction de correction d'épreuves des ADN po

lymérases Mise en oeuvre d'uneactivité 3'-5' exonucléolytique C o rrection d'épreuve

Fonction de correction sur épreuv

e de l'ADN pol y mérase I : m o dèle 2

ème

type de réaction catalysée par l

ADN pol

I : Exonucléase

Correction

de l'ADN pol I : activ i té

3'-5' exonucléase

Lo rsqu'un nucléotide mal appari

é par des liaisons hydrogèn

e est accidentellement incorporé lors de la sy nthèse d'ADN, la polymérase s'arrête, excise le nucléotide en caus e et reprend sa copie.

Fidélité de la réplication de l'ADN

Processus

Fréquence d'erreur

cumulée

Appari

em ent des bases 10 -1

à 10

-2

Sélectivité de l'ADN

polymérase et action correctrice par activi té exonucléase 3'- 5 10 -5

à 10

-6

Rôle des protéines

accessoires (ssb par exem pl e) 10 -7

Correcti

o n postrépl icati v e des mésappariements 10 -10

Le système de réparation des er

reurs de réplication de l'ADN (systèm e MMR, m is m atch r epair ou système MutHLS chez

E. coli

Les mésappariements de l'ADN susceptibles d'être réparé spar le système MMR sont, dans la grande majorité descas , la conséquence d'erreurs commises par l'ADN polymérase au cours du processus de réplication.

Correction des mésapp

ariements suite à l a réplication

Les causes de mésappariements

Imperfections de la correction des épreuves

Tautomérisation

s pontanée

Mésappariements provoqués

par le s formes tautomériques d es bases N N OO H 3 C thym ine (c t o) N N N N ad én i n e (am i n o H NH H N N OO H 3 C t hym i n e nol N N N N gua ni ne (c t o) O H H NH H A p p a ri em en t s t a n d a rd A p p a ri emenquotesdbs_dbs49.pdfusesText_49