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Écologie microbienne en milieu aquatique : des virus aux

Écologie microbienne en milieu aquatique : des virus aux protozoaires Microbial ecology in aquatic Systems: a review from viruses to protozoa C AMBLARD 1*, J C BOISSON2, G BOURDIER1, D FONTVIEILLE 3, X GAYTE3, T SIME-NGANDO 1 SUMMARY Récent advancements in the ecology of aquatic microbial comntunities, Le



Dynamique et diversitØ des communautØs microbiennes

boucle microbienne" "RØseaux trophiques microbiens en milieu pØlagique lacustre" MATIERE Les publications de l™Équipe de Microbiologie Aquatique



Unité d’Enseignement BIOLOGIE II

II La survie microbienne dans le milieu marin (la forme VBNC) III Les microorganismes pathogènes des milieux aquatiques IV Les biofilms V Les microorganismes des milieux océaniques profonds: Chapitre IV : Réseaux trophiques marins I Photosynthèse et réseaux trophique II Plancton autotrophe III Boucle microbienne 1



étude des réseaux microbiens - limnology-journalorg

ou nanomolaire comme c'est souvent le cas en milieu aquatique Cette réintégration de la matière organique dissoute dans le réseau trophique est bien connue sous le nom de «boucle microbienne» («microbial loop» : Azam et al 1983) Au sein de cette boucle microbien­ ne, les bactéries vont donc à la fois «limiter» les pertes



Fiche d’UE - LU3SV563 GEOMICROBIOLOGIE ENVIRONNEMENTALE

- Distribution spatiale microbienne en milieu aquatique - Rôle des virus dans un milieu aquatique - La vie en milieux arides - Eutrophisation en milieu aquatique : impact sur les compartiments microbiens - Biorémédiation dans les drainages miniers - Cascade redox et mobilité des métaux



Biocénose pélagique du lac oligomésotrophe de Poméranie

Biocenose microbienne pélagique du lac oligomésotrophe de Poméranie 29 2-LE MILIEU ÉTUDIÉ Le lac examiné est situé en Poméranie de l'ouest (latitude 54°00,5'N, longi­ tude 16°48,3'E), à une altitude de 176,4 mètres La surface du lac est de 5,25 km2, le volume des masses d'eau est d6-me3 4, le9 xs profondeur 10 s



Importance de la variabilité verticale dans un lac

structurant pour le développement de l’écologie microbienne aquatique Dans ce concept, une fraction importante de la matière organique élaborée lors de la photosynthèse phytoplanctonique (10-60 ) est excrétée sous forme dissoute dans le milieu ( Larsson and Hagström 1982, Obernosterer and Herndl 1995 )



Utilisation des protozoaires ciliés (Paramecium africanum

corrélation observée en milieu lacustre dans l’évolu-tion des effectifs des bactéries et du zooplancton (4, 17) suggérait l’utilisation par le zooplancton, des bac-téries comme ressource nutritionnelle Plusieurs tra-vaux sur la boucle microbienne dans divers types de milieux aquatiques montrent que le rôle de chaque

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Écologie microbienne en milieu aquatique : des virus aux Tous droits r€serv€s  Revue des sciences de l'eau, 1998 Ce document est prot€g€ par la loi sur le droit d'auteur. L'utilisation des services d'ƒrudit (y compris la reproduction) est assujettie " sa politique d'utilisation que vous pouvez consulter en ligne. Cet article est diffus€ et pr€serv€ par ƒrudit. ƒrudit est un consortium interuniversitaire sans but lucratif compos€ de l'Universit€ de Montr€al, l'Universit€ Laval et l'Universit€ du Qu€bec " Montr€al. Il a pour mission la promotion et la valorisation de la recherche.

https://www.erudit.org/fr/Document g€n€r€ le 2 mai 2023 08:22Revue des sciences de l'eauJournal of Water Science

€cologie microbienne en milieu aquatique : des virus aux protozoairesMicrobial ecology in aquatic systems: a review from viruses toprotozoa C. Amblard, J. C. Boisson, G. Bourdier, D. Fontvieille, X. Gayte et T. Sime-Ngando

Volume 11, num€ro hors-s€rie, 1998URI : https://id.erudit.org/iderudit/705336arDOI : https://doi.org/10.7202/705336arAller au sommaire du num€roƒditeur(s)Universit€ du Qu€bec - INRS-Eau, Terre et Environnement (INRS-ETE)ISSN0992-7158 (imprim€)1718-8598 (num€rique)D€couvrir la revueCiter cet article

Amblard, C., Boisson, J. C., Bourdier, G., Fontvieille, D., Gayte, X. & Sime-Ngando, T. (1998). ƒcologie microbienne en milieu aquatique : des virus aux protozoaires. Revue des sciences de l'eau / Journal of Water Science 11

145...162. https://doi.org/10.7202/705336ar

R€sum€ de l'article

Par leur abondance et leur diversit€ taxonomique et fonctionnelle, les microorganismes jouent un r†le pr€pond€rant dans les flux de mati‡re et d'€nergie au sein des €cosyst‡mes aquatiques.

Au cours de ces derni‡res ann€es, les progr‡s r€alis€s au niveau des techniques

d'identification, de d€nombrement et de mesure d'activit€ m€tabolique, notamment en microscopie " €pifluorescence et en biologie mol€culaire, ont permis d'entrevoir l'extraordinaire diversit€ des microorganismes aquatiques, l'€tendue de leurs conditions de vie et leurs abondances jusqu'alors largement sous-estim€es. De plus, l'am€lioration sensible des m€thodes s€paratives a permis de d€crire, in situ, la composition biochimique des communaut€s et d'aborder les transferts de mati‡re sous un angle qualitatif. L'ensemble des r€sultats disponibles laisse apparaˆtre que les relations trophiques entre les microorganismes forment un v€ritable r€seau " l'int€rieur duquel la boucle microbienne permet le transfert, au moins en partie, de la production picoplanctonique vers les niveaux trophiques sup€rieurs. Ainsi, des

progr‡s cons€quents ont €t€ r€alis€s quant " la compr€hension du r†le des

communaut€s bact€riennes dans les flux de mati‡re, y compris au niveau d'environnements particuliers (biofilms, milieux extr‰mes). Par ailleurs, alors qu'il a €t€ longtemps admis que la r€gulation des communaut€s bact€riennes €tait essentiellement li€e " la disponibilit€ ou " la qualit€ des substrats organiques, il apparaˆt maintenant que la limitation par les €l€ments nutritifs min€raux, la pr€dation des protistes phagotrophes et du m€tazooplancton et la lyse virale sont €galement des facteurs susceptibles d'intervenir significativement dans ce contr†le. Malgr€ ces progr‡s consid€rables dans le domaine de l'€cologie microbienne, pr‡s de 90% des microorganismes pr€sents dans l'environnement n'ont pas encore €t€ d€crits et la compr€hension des relations entre les microorganismes et le fonctionnement des €cosyst‡mes restent un enjeu majeur pour les ann€es " venir. REVUE DES SCIENCES DE L'EAU, Rev. Sci. Eau n" spécial (1998) 145-162

Écologi

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