Plant Growth Promoting Rhizobacteria (PGPR): Current & Future
1 Chapter I Introduction 1 1 General Background The population of this entire world will be more than 10 billion mark by 2050 This rapidly increasing population is putting inviolable pressure on the existing land area for food, fiber, fuel
Plant growth promoting rhizobacteria: Beneficial effects for
1454 A J Biotechnol Gage, 2006) It constitutes of bacteria, fungi, algae, nematodes, actinomycetes and protozoa The microbial
Effets bénéfiques de rhizobactéries sur les plantes exemple
Les rhizobactéries sont des bactéries qui présen- tent l'aptitude à coloniser les racines de façon in- tense (Schroth et Hancock, 1981, 1982) définition appartiennent à différents
DELETERIOUS RHIZOBACTERIA - ResearchGate
335 S S Gnanamanickam (ed ), Plant-associated bacteria, 335-357 ©2006 Kluwer Academic Publishers Printed in The Netherlands ROBERT J KREMER
MEMOIRE DE FIN D’ETUDE
ensemble de bactéries qualifiées de PGPR (Rhizobactéries promotrices de la croissance des plantes) pour leurs effets stimulateurs de la croissance des plantes qu‘elles colonisent Ces rhizobactéries sont présentes dans une zone d‘interface entre la plante et le sol, appelée rhizosphère (QURESHI , 2012)
Les stress de la plante - d1n7iqsz6ob2adcloudfrontnet
I 1 Définition du stress On désigne par stress, toute condition externe qui affecte la croissance, le développement ou la productivité d’une plante On distingue les stress biotiques (causés par d’autres organismes) et les stress abiotiques (se présentant à chaque
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République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche
Université Echahid Hamma Lakhdar El
Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie
Département de Biologie
THEMEPrésenté Par :
elle. BENDJIDA Habiba elle. AOUDevant le jury composé de :
Président : Mme.
MmedAnnée 2018/2019
Effet promoteur
(vicia fabaNous remercions Mme.
laboratoire de facultéJe dédie ce mémoire :
A mes très chers parents.
A mes Frères
$ PHV V±XUVA mon amie intime
A tous mes amis sans exception.
Et les autres collègues du département.
$ PRXV TXL P·RQP MSSRUPp GX VRXPLHQ PRXPH PM vie.A tous mes enseignants
Habiba
Dédicace
Dédicace
Je dédie ce mémoire :
A mes très chers parents.
A mes Frères
$ PHV V±XUVA mon amie intime
A tous mes amis sans exception.
Et les autres collègues du département.
$ PRXV TXL P·RQP MSSRUPp GX VRXPLHQ PRXPH PM vie.A tous mes enseignants
SalmaSommaire
IÉNÉRALITÉ SUR LA RHI 5
1. Le sol 5
2 52.1. Activité de 6
2.2. La microbiologie rhizosphèrique................................6
3 73.1. Définition de Rhizobacteria (PGPR) 7
3.2 Biodiversité des PGPR dans la rhizosphère 7
3.2.1. Les Rhizobia 7
3.2.2. Les PGPR diazotrophes 7
3.2.3. Bacillus 8
3.2.4. Pseudomonas 8
3 A 9 B 12CHAPITRE II LA FÈVE
1ISTORIQUE ET BOTANIQ 17
17 b. Taxonomie 172 APPAREIL 18
a. La tige 18 b. Les feuilles 183 APPAREIL DE 18
a. Les fleurs 18 b. Le fruit 184YCLE BIOLOGIQUE ET 18
-XIGENCES AGRO-ÉCOLOGIQUES DE LA FÈ 196ES BESOINS EN EAU DE 19
7ES BESOINS EN ÉLÉMEN 19
8 - INTÉRÊTS DE LA FÈVE 20
8 208 INTÉRÊT ECOLOGIQUE 20
8 20 8 209A PRODUCTION DE LA FÈVE 21
CHAPITRE III SOLUBIL
1. CYCLE DU PHOSPHORE ET 23
1.1 Le phosphore 23
1.2 Formes du phosphore dans le sol 24
2. SOLUBILISATION DU PHO 25
3. LES MÉCANISMES BIOLOGP 25
4. FACTEURS INFLUENÇANT 26
DEUXIÈME PARTIE PART
CHAPITRE I PRÉSENTAT
1. PRÉSENTATION DES ZONEPGPR 30
1.1 Situation géographique 30
1.2 Relief 31
1.3 Caractères 31
1.3.1 Climat 31
1.3.2 Température................................31
1.3.3 32
1.3.5 Humidité relative de l'air 33
1.3.6 Vents 34
1.4 Insolation 34
1.5 Évaporation 34
1.6 Sol 35
1.7 Texture 35
CONCLUSION 35
CHAPITRE II: MATÉRIE
1ATÉRIELS 37
371.2. Verreries 37
1.3. Petits matériels 37
2. ECHANTILLONNAGE 37
3. ISOLEMENT DES BACTÉRI 38
3.1. Préparation de milieu de culture 38
3.2. Ensemencement 39
3.3. Isolement 40
3.4. Test de solubilisation du phosphate calcique 40
3.5. Purification des bactéries 40
3.6. Conservation des souches 40
4. EFFET DE L'INOCULATION DU SOL 41
4.1. Préparation du support pédologique 41
4.2. Préparation de l'inoculation................................41
4.4. Matérielle végétale 42
CHAPITRE III RÉSULTA
1. TEST DE SOLUBILIS DU 44
LA PLANTATION 45
CONCLUSION
ListeFigure 01 : Représentation schématique des zones de la rhizosphère................................5
Figure 02 6
Figure 03: Interactions entre les plantes et les bactéries dans la rhizosphère 9Figure 04: 15
Figure 05 : Cycle simplifié du P montrant la répartition des différents stocks de P du sol. 23
Figure 06 : 30
Figure 07: Température 32
Figure 08: Précipitations mensuelles du Souf durant Les cinq premiers mois de l'année 2019 33 Figure 09 : Préparation de milieu de culture 38Figure 10 : 39
Figure 11: 39
Figure 12: 40
Figure 13 : 41
Figure 14: Diagramme expérimentale montre le placement des pots. 42Figure 15 : 44
Figure 16: 45
Figure 17: La fève attaqué par une ma la die fongique (fusariose). 45 Liste Tableau 01: Classification des mécanismes de stimulation de la croissance des plantes 14 Tles détails relatifs à la systématique de la fève................................17 Tableau 03 : L'apport en phosphore et en potassium selon les analyses du sol. 19Tableau 04: 21
Tableau 05 :
31Tableau 06 Précipitations mensuelles du Souf durant Les cinq premiers 32
Tableau 07 mensuelles du Souf durant Les cinq premiers mois de l'année 2019......33
Tableau 08
l'année 2019. 34Tableau 09 l'indice du halo. 44
Liste des abréviations
PGPR plant growth promot
P ACC: ..................................... carboxilate ISR: ....................................... indicedDAPG: ..................................
HCN:hydrogène
LPSlipolysaccharides
BPS: ......................................
NBRIP:
BN:DAPG:diacetylphloroglucinol
IAA M: m:T moy: Moyennes mensuelles des températures
Introduction
Introduction
Introduction
Vicia faba L. est une légumineuse qui fait partie de nos systèmes agraires depuis fort en Chine, 20% en Afrique du nord et moins de 10(ABU AMER et (Singh et al., , (YAHIA et al., (LAAMARI et a2008). La fève occupe (AOUARal.,. alimentaire des (HACISEFEROGULLARIet al.,2003 ; CHAFI et BENSOLTANE, 2009 ; VIOQUE, 2012 ; al., 2012). lutte biologique contre leurs mi(BARRIUSO et al. Rhizobactéries promotrices de la croissance des rhizosphère (QURESHICes bactéries intéressantes est libre ou liées, colonisent les (Dal., 2005).Introduction
Cet "effet rhizosphère" (KATZNELSON et alest un processus dynamique entretenu parPremière partie
Première partie
Chapitre I
Génér
Chapitre I Généralité sur la rhizosphère et les PGPRChapitre I
5 I1. Le sol
friable, qui est le biologique...)(BOURAS, (LEPINAY. (ANTON et , (MORGAN et . La plus ou moins grande de 1 à 5mm ausparaît (ANTOUN., PREVOST., 2005., VEGA., 2007., NIHORIMBERE et al., 2010., QURESHI., Représentation schématique des zones de la rhizosphère .Chapitre I
62.1. Activité de la rhizosphère
(SOUFIANE. La (MENCH. surtout de la libération de composés organiqu (STENGEL et GELIN. Les exsudats racinaires (LEMANCEAU.2.2. La microbiologie rhizosphèrique
(PRESCOTT et al., 2003).9 (MALEK.
(NOUMEUR.RC= Racine
Chapitre I
7 3bactéries qui exercent un effet bénéfique sur la croissance et le développement des plantes par
(ABNATURA. (SCHROTH et HANCOCK. (LEMANCEAU.3.2 Biodiver
la disponibilité des phosphates pour la plante par mobilisation de formes organiques et
(SAHRAN et NOHRA. Elles peuvent produire des phytohorm (ANTOUN et PREVOST.3.2.2. Les
pWDEOLVVHPHQWGXSURFHVVXVGHIL[DWLRQGH plante. Azoarcus sp., Gluconacetobacter diazotrophicus, Herbaspirillium Azotobacter spAHMAD et al., 2008)
3.2.2.1. Azotobacter
, décrite par DOBEREINER et PEDROSA, (1987) est une bactérie rhizosphère de Paspalum notatum, une herbe tropicale qui possède une grande spécific Azotobacter paspali affecte positivement la germination des graines et leur développement, il estChapitre I
8 (SAHARAN et NOHRA.3.2.2.2. Azospirillum
Azospirillum, isolées à partir des rhizosphères de plusieurs céréales à travers le (ANTOUN et PREVOST.3.2.2.3. Azoarcus
Azoarcus a gagné une grande attention due principalement à sa grande diversité génétique et
Azovibrio, Azospira et Azonexus, qui se différencient des (REINHOID et .,. Azoarcus est une bactérie endophyte du riz et est considérée (AHMAD et al2008).3.2.3. Bacillus
Bacillus B. subtilis, isolée à
(ANTOUN et PREVOST.3.2.4. Pseudomonas
Pseudomonas et les Pseudomonas fluorescentes sont des (SAHARAN et NOHRALes effets bénéfiques de la S par P.fluorescens et P. putida (BUR et al.1978, al.1993) ont démontré que Fusarium oxusporumnon pathogènes, P. fluorescens et P. putida se (CHUNG et al., 2005). 3Plusieurs interactions, bénéfiques (symbioses) ou non, voire délétères (pathogénie) sont
(EMILY. Les PGPR interviennent sur la croissance des plantes selon plusieurs (fi.Chapitre I
9efficacement les systèmes racinaires et influencent de manière bénéfique la plante en stimulant
(HAAS et DEFAGO.disponibles, (phosphore et autres nutriments minéraux), la production de régulateurs de
(HASSEN et LABUSC. résistance de la plante (Antoun et Prévost.Figure (KHAN et
A ASODQWHVRDXFXQHHVSqFHYpJpWDOHQ
XWLOLVHU
directement pour sa croissance (PUJIC et NORMAND, 2009 ; ARORA et al., 20. Les Azoarcus sp., Burkholderia sp., Gluconacetobacter diazotrophicus,Chapitre I
10 Herbaspirillum ; Azotobacter Paenibacillus et Azospirillu, qui transforment l'azote (WEYENS et al., 2010; ARORA et al., 2012). interactions symbiotiques par la colonisation et forme de nodules racinaires dans le végétale, (MUNEES et MULUGETA. animaux. Le phosphore a un rôle important dans le métabolisme de la pléléments nutritifs essentiels pour la croissance et le développement des végétaux. Cependant, le
(QURESHI et al., 2012). (FAO A (PARMAR et SINDHU. (KUMAR et DUBEY . Les (ROGERS et al.. (NEILANDS.Chapitre I
11généralement inférieurs à 1 kDa contenant des groupements fonctionnels capables de capter le
(KIRDI et ZERMANE (ROSSUM et al., 1994) sont des (BOUKHALFA et CRUMBLISS. A (HAN et al., 2005 ; BACA et ELMERICHal., 2007 ; MARTINEZ al., 2010).Aacide L'auxine
Elle augmente également la ramification des racines et améliore l'absorption de minéraux et al., acide Les cytokinines et les gibbérellines (VAN LOOM processus de reproduction dans une large variété de plantes etChapitre I
12 fruits et les graines, mais une forte évidence indique que la racine est le site principal de la al., 2005).Aacide L'éthylène
croissance des racines (SALEEM et al., 2007). B production des enzymes (chitinase, protéase, l (LUGTENBERG et KAMIal., 2014). B (DOMMERGUES et ). Dans certains cas, une réduction de la (PIANO et al.. Mais (REYES et al.. (HAAS et DEFAGO, 2005). Toutefois,Chapitre I
13La compétition pour les nutriments et les différentes sources nécessaires pour la vie se produit
part (PAL et al., 2006). B (HARMAN et SHORESH. Il consiste à pbioactives sont des métabolites secondaires à faible poids moléculaire tels que les antibiotiques
(CORBAZ, 1990 ; BABALOLA, 2010 ; SHAMEER et PRASAD, 2017). B . Il (CORBAZ, 1990). B (GUPTA et al., 2015 ; SHAMEER et P Pseudomonas sp, sont connues pour leur capacité àChapitre I
14 efficacement à le sol(KIRDI et ZERMANE. Tableau Classification des mécanismes de stimulation de la croissance des plantes (MARTINEZal., 2010).Terme Definition Mécanismes Référence
Biofertiliseur
Vessey, 2003;
Somers et al.,
2004;Fuentes-
Ramírez et
Caballero-
Mellado,
2006.Phytostimulateur
Lugtenberget
al., 2002;Somers et al.,
2004.Biopesticide
ou agentde biocontrôleVessey, 2003;
Somers et al.,
2004;quotesdbs_dbs44.pdfusesText_44