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INTRODUCTION A LA TOXICOLOGIE

La toxicologie est la science qui traite des poisons (toxiques) Son champ d’application est très vaste Elle recouvre plusieurs disciplines (médicale, biologique, épidémiologique, chimique ) En milieu professionnel, les produits chimiques sont très nombreux et de nature très



PHARMACOLOGIE ET THÉRAPEUTIQUES - Fnac

QCM 8 Iatrogénie, toxicologie, pharmacodépendance SCORE 1 « Tout dommage résultant de la prise de médicaments 01 ou de l’intervention d’un professionnel de



ISBN 978 92 4 259532 1 - WHO

Service de toxicologie industrielle et des pollutions intérieures de l’Etat de Genève, et le plein soutien de l’OMS, il offre une bonne introduction à l’hygiène du travail Il ne s’agit nullement ici de former des hygiénistes professionnels, mais de permettre aux importants réseaux de médecins



Écotoxicologie Exercices supplémentaires (CORRIGÉ)

Écotoxicologie Exercices supplémentaires (CORRIGÉ) 1 Le phosphore ayant été déposé dans le sol à l’aide de l’engrais sera retourné



TOUT L’UE6 EN FICHES - Dunod

TOUT L’UE6 EN FICHES Yves Landry Professeur honoraire, université de Strasbourg 100 1re année Santé Initiation à la connaissance du médicament PACES 99782100582266-landry-lim indd I782100582266-landry-lim indd I 116/08/12 09:246/08/12 09:24



ECN / RESIDANAT - EXAMEN BLANC 2020

QCM 3 : Voici les premiers résultats que vous obtenez : NFS: Hb: 13g/dL, GB: 12000 PNN 9000/mm3 Ionogramme: Na : 138 K: 4 5 ; CRP : 78 VS : 62 GDS: pH : 7 32 PaO2: 78 mm Hg; PaCO2 : 50 mm Hg HCO3-: 34 mmol /L Toxicologie négative Interprétez ces examens (indiquez les réponses vraies)



PROGRAMME DE L’ÉPREUVE DE PATHOLOGIE MÉDICALE

PROGRAMME DE L’ÉPREUVE DE PATHOLOGIE MÉDICALE 1 INSUFFISANCE CORONAIRE ET INFARCTUS DE MYOCARDE 1 Définir l'insuffisance coronaire 2 Expliquer les mécanismes physiopathologiques de l'angor d'effort et de l'angor de repos



Biochimie en 24 fiches - Dunod

Biochimie en 24 fiches Catherine BARATTI-ELBAZ Pierre LE MARÉCHAL 9782100721528-baratti-lim qxd 20/10/14 11:19 Page I



PROPRIETES MECANIQUES DES MATERIAUX

Quelques valeurs du module d ’Young E (GPa) Diamant 1000 Fibre de carbone 300 Carbure de silicium (SiC) 450 Silicium 107



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Biochimie

en 24 fiches

Catherine BARATTI-ELBAZ

Pierre LE MARÉCHAL

9782100721528-baratti-lim.qxd 20/10/14 11:19 Page I

© Dunod, Paris, 2008, 2015 pour la 2

e

édition

5 rue Laromiguière 75005 Paris

ISBN 978-2-10-072152-8

www.dunod.com9782100721528-baratti-lim.qxd 7/11/14 11:53 Page II © Dunod - Toute reproduction non autorisée est un délit.

Appeler chaque molécule par son nom

Les acides aminés des protéines

Structure 3D des protéines

Applications de l'action des protéases

Séparation et dosage des protéines

Enzymologie michaelienne : KM

et V M

Inhibitions des enzymes michaeliennes

Modifications post-traductionnelles des protéines

Vitamines et coenzymes

Mono et disaccharides

Polyosides

Glycoprotéines

Structure des acides gras et des lipides

Lipides membranaires

Structure des membranes biologiques

Échanges membranaires

Fermentations

Acétyl-CoA et cycle de Krebs

Catabolisme des acides gras

Métabolisme de l'azote

Néosynthèse des sucres

Les oxydations phosphorylantes

Ligands extracellulaires et transduction du signal

Les protéines du cytosquelette

9782100721528-baratti-tdm.qxd 20/10/14 11:30 Page 3

Fonction Nom Préfixe SuffixeR--CO--OH Acide carboxylique Carboxy Acide... - oïque

R--CO--OR' Ester Carboalkoxy - oate d'alkyle

R--CO--SR' Thioester Carboalkothioxy - thioate d'alkyle

R--CO--NHR' Amide Carboxamide - amide

R--CHO Aldéhyde Oxo, aldo, formyl - al

R--CO--R' Cétone Oxo, céto - one

R--OH Alcool Hydroxy - ol

R--SH Thiol Mercapto - thiol

R--NH2 Amine primaire Amino - amine

R - CO - O - CO - R'

OHP O HO OH PO O OH

R - S - S - R'

Anhydride d'acideEntre 2 acides organiques

Phosphoanhydride :

entre 2 fonctions acide phosphorique

Disulfure α

•Les conventions d'écriture dans le cas d'un carbone asymétrique Exemple du 2,3-dihydroxy-propanal (glycŽraldŽhyde)

Biochimie en 24 fiches

9782100721528-baratti-F01.qxd 20/10/14 9:50 Page 4

FICHE 1- Appeler chaque molécule par son nom

© Dunod Ð Toute reproduction non autorisŽe est un dŽlit. 1 •Projections de Fischer (utilisées en Biologie) CHO C HOH 2 COH H CHO C CH 2 OHHO H miroir (2R) 2,3-dihydroxy-propanal (D-glycéraldéhyde)(2S) 2,3-dihydroxy-propanal (L-glycéraldéhyde) CHO CH 2 OH CHO CH 2 OH

OHHCHO

C HOH 2 COH H CHO C CH 2 OHOHH

Dans le plan

de la feuilleDerrière le plan de la feuille

Devant le plan

de la feuille (2R) 2,3-dihydroxy-propanal (D-glycéraldéhyde)

Cas de 2 acides aminés :

COOH CH 3 HH 2 NCOOH C H 3 CH NH 2

Acide (2S) 2-amino-propionique (L-alanine)

COOH C H NH miroir COOH C H HN

L-prolineD-proline

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Savoir dessiner à partir des mots

Dessiner les structures des molŽcules biologiques suivantes (nom chimique et nom commun sÕil existe) :

1.acide 2-hydroxy-propionique ou acide lactique

2.sel tŽtrasodique du 2,3-bis-phospho-D-glycŽrate (lÕacide glycŽrique est lÕacide

2,3-dihydroxy-propionique)

3.acide 2-phosphono-oxyprop-2-Žnoique ou acide phosphoŽnolpyruvique

4.acide 2 oxo-butanedio•que ou acide oxaloacŽtique

Solution

Acide lactique CH

3

CHOH--COOH

La molŽcule que lÕon trouve dans les cellules est propionique (reprŽsentation ci-contre). LÕacide lactique existe sous forme de lactate au pH cellulaire. Il se forme au cours de la fermentation du mme nom (voir glycolyse en condition anaŽrobie). Ne pas confondre le lactate avec le lactose, qui est le sucre du lait (voir fiche n¡ 11). Cette molŽcule dont la structure de base est lÕacide 2,3- supplŽmentaires : une fonction anhydride mixte (entre un carboxyle et une acide phosphorique) sur le carbo- ne 1 et une fonction phosphoester sur le carbone 3. CÕest un intermŽdiaire important de la glycolyse. Il existe Žgalement le 2,3-bis-phosphoglycŽrate (voir LÕacide phosphoŽnolpyruvique est prŽsent sous forme de phosphoŽnolpyruvate (PEP) au pH cellulaire. Žnergie importante qui est couplŽe ˆ la formation dÕune fonction phosphoanhydride de lÕATP dans la glycolyse. La rŽaction est catalysŽe par la pyruvate kinase.βBiochimie en 24 fiches COOH CCH 3 HHO C OPO 32
O C CH 2 O Na PO 322Na
OH H 1 2 3 2

HOOCOP

CCH 2 O OH OH

9782100721528-baratti-F01.qxd 17/11/14 12:28 Page 6

Acide oxaloacŽtique. Ce nom commun vient de lÕaci- de oxalique (OHC --COOH) et de lÕacide acŽtique (CH 3 --COOH). Cette molŽcule est un intermŽdiaire du cycle de Krebs (voir fiche n¡ 18). Dans la cellule, il existe sous forme dÕoxaloacŽtate du fait du pH intracellulaire. CÕest un di-acide ˆ 4 carbones qui pos-

Et inversement...

Donner les noms des molŽcules biologiques suivantes (nom chimique et nom com- mun) :

1.HSCH

2 --CH(NH 2 )--COOH 2.H 2 N--CH 2 --CO--NH--CH 2 --COOH 3.CH 3 --(CH 2 14 --COOH 4.CH 3 --(CH 2 4 --CH==CH--CH 2 --CH=CH==(CH 2 7 --COOH

Solution

mercapto-propionique. Elle correspond ˆ la cystŽine, un acide aminŽ prŽsent dans les protŽines dans sa confi- guration 2R, cÕest-ˆ-dire la L-cystŽine (reprŽsentation ci-contre). La cystŽine peut former des ponts disulfures dans les pro- tŽines (voir structure tertiaire des protŽines fiche n¡ 3). Le nom chimique de cette seconde molŽcule est complexe, mais on peut noter quÕelle fonction acide organique. Il sÕagit de deux molŽcules de glycine, lÕacide aminŽ natu- rel le plus simple, liŽes par la fonction amide pour former un dipeptide glycine-glyci- ne. La fonction amide est celle qui relie les acides aminŽs dans les protŽines. Elle est appelŽe Ç liaison peptidique È. Les formules 3 et 4 correspondent ˆ des acides gras. On nomme ainsi les acides orga- molŽcule 3 est un acide n-hexadŽcano•que (16C) ou acide palmitique. La molŽcule 4 sont gŽnŽralement de configuration Z (cis) dans les acides gras insaturŽs.

FICHE 1- Appeler chaque molécule par son nom

© Dunod Ð Toute reproduction non autorisŽe est un dŽlit. 1 COOH CH 2 COOHC O COOH C CH 2 SHH H 2 N 2R

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Biochimie en 24 fiches

¥DŽfinitions

Les acides

-aminés, ou -aminoacides, sont des molécules organiques consti- tuées d'au moins une fonction amineet d'au moins une fonction acide carboxy- lique. Ces deux fonctions sont portées par un même carbone (carbonequi porte également un hydrogène et un radical R(chaîne latérale). Ce radical R donne son identité à chaque acide -aminé.COOH R H H 2 NCOOH CRH NH 2

L-acide -aminŽ Vingt acides -aminés de la sŽrie Lsont identifiés par des codons de l'ARN mes-

sager et sont associés à un ARN de transfert lors de la traduction du code gŽnŽ- tiqueen protéines. Ces 20 acides -aminés constituent le squelette des protéines.

¥Les autres acides-aminŽs

On connaît plus de 20 acides

-aminés chez les organismes vivants. En effet, les protéines peuvent subir des modifications sur une partie des chaînes latérales des acides -aminés qui les constituent. Ces modifications se produisent uniquement après la traduction (modifications post-traductionnelles), voire pendant la traduc- tion (modifications co-traductionnelle, voir fiche n° 8). Elles sont si variées que ce sont près de 200 -aminoacides différents que l'on peut identifier lorsque l'on pro- cède à l'analyse chimique des protéines. Enfin, certains acides -aminés se retrou- vent dans des peptides cycliques (hormones) ou chez les bactéries dans le peptido-

glycane (où ils peuvent être de la sŽrie D).9782100721528-baratti-F02.qxd 20/10/14 9:52 Page 8

FICHE 2Ð Les acides aminŽs des protŽines

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Position 1 Position 2 Position 3

5ÕU C A G 3

UUU Phe (F) UCU Ser (S) UAU Tyr (Y) UGU Cys (C) U

U

UUC Phe (F) UCC Ser (S) UAC Tyr (Y) UGC Cys (C) C

UUA Leu (L) UCA Ser (S) UAA Stop UGA Stop A

UUG Leu (L) UCG Ser (S) UAG Stop UGG Trp (W) G

CUU Leu (L) CCU Pro (P) CAU His (H) CGU Arg (R) U

C

CUC Leu (L) CCC Pro (P) CAC His (H) CGC Arg (R) C

CUA Leu (L) CCA Pro (P) CAA Gln (Q) CGA Arg (R) A

CUG Leu (L) CCG Pro (P) CAG Gln (Q) CGG Arg (R) G

AUU Ile (I) ACU Thr (T) AAU Asn (N) AGU Ser (S) U

A

AUC Ile (I) ACC Thr (T) AAC Asn (N) AGC Ser (S) C

AUA Ile (I) ACA Thr (T) AAA Lys (K) AGA Arg (R) A

AUG Met (M) ACG Thr (T) AAG Lys (K) AGG Arg (R) G

GUU Val (V) GCU Ala (A) GAU Asp (D) GGU Gly (G) U

G

GUC Val (V) GCC Ala (A) GAC Asp (D) GGC Gly (G) C

GUA Val (V) GCA Ala (A) GAA Glu (E) GGA Gly (G) A

GUG Val (V) GCG Ala (A) GAG Glu (E) GGG Gly (G) G

Les propriétés physicochimiques propres à chaque acide aminé découlent de la nature biochimique du radical : hydrophylie, charge... On classe souvent les acides aminés en comparant ces propriétés chimiques et notamment la capacité de la fonction portée par la chaîne latérale à s'ioniser. On peut ainsi distinguer : • les acides aminŽs non-polairesconstitués d'une chaîne aliphatique ou aromatique (plus ou moins hydrophobes), Le 21quotesdbs_dbs10.pdfusesText_16