Initiation au logiciel gratuit CHEMSKETCH
pris dans le tableau périodique Par défaut chemsketch lui associe une molécule hydrogénée qu’il faudra modifier Exemple, pour écrire l’acide sulfurique (ci-dessous), clique sur S puis dans la zone de travail, vous obtenez H 2 S O S O OH OH Mettez-vous en mode continu puis choisissez O dans la barre de gauche, cliquez sur S (de la
I) Prise en main du logiciel Chemsketch
structure dessine directement la formule brute et semi-développée, il faut créer 4 fois chaque molécule ensuite les 2 dernières serviront à créer la formule développée et le modèle moléculaire 3d •Pour obtenir la formule semi-développée : Il n'y a rien à faire si le logiciel est bien configuré il dessine directement les
TP N° 2 : DESSINER DES MOLECULES AVEC « CHEMSKETCH
Sauvegarder le fichier Chemsketch pour une utilisation ultérieure III- Faire des formule en 3D Réaliser tout d’abord la molécule CH 4 comme précédemment Sélectionner la molécule (icône avec un carré ou un lasso) Utiliser « add explicit hydrogen » dans « tools », et « Clean structure » ensuite
TP – Construction et visualisation de molécules I) Prise
Clean Structure, la formule développée plane apparaît • Pour obtenir le modèle de Lewis : Sélectionner la molécule, cliquer sur l'icône (3D Optimization), dans le menu Tools choisir Clean Structure, la formule développée plane apparaît, il faut passer en mode Draw pour dessiner les doublets
TP MOLECULES Géométrie des Molécules
Placer l’image dans la bonne case (formule développée) Retour dans Chemsketch : ACD/LABS 3D Viewer pour voir et manipuler la molécule en 3D On peut la visualiser sous différente forme : Choisir le 4ème ( modèle compact) Optimisation 3D de la structure : Mesures : o Distance entre les atomes : puis cliquer sur les deux atomes
EGLS CHEMSKETCH TRAVAUX PRATIQUES Modéliser des molécules à l
Pour obtenir une formule développée plane, sélectionner la molécule puis faire clean structure Pour visualiser la molécule en 3D, sélectionner la molécule puis faire Le 3D-Viewer se lance et permet la visualisation de la molécule en 3D et en différents types de représentation BAC PRO 1/2
L’exemple utilisé dans cette fiche est la molécule de
Fiche pratique : Comment créer et visualiser en 3D une molécule avec le logiciel ChemSketch L’exemple utilisé dans cette fiche est la molécule de dopamine Partie I : Création de la molécule Molécule de dopamine : Formule brute : C8H11NO2 1 Ouvrir le logiciel ChemSketch présent sur le bureau 2
TP 14: DES ATOMES AUX MOLECULES (livre : chap9)
La formule développée, comme le modèle moléculaire, donne la structure de la molécule (enchainement des atomes et nombre de liaisons) Chaque atome est représenté par son symbole chimique et les liaisons par des tirets (simple, double ou triple) entre les atomes Question 8 : Représenter la formule développée de la molécule de valine
OBSERVER TP 10 : Structure et géométrie des molécules
La formule développée est une formule de Lewis ne faisant pas apparaître les doublets non liants La formule semi-développée ne fait pas apparaître les liaisons avec l’hydrogène 10 Donner les formules semi-développées de deux molécules isomères de formule brute C 2 H 6 O 11
Notice simplifiée des logiciels de création et visualisation
On peut obtenir la formule brute de la molécule par le menu : Tools / Calculate Pour obtenir la vue en trois dimensions , on clique sur : , ce qui ouvre le logiciel ACD 3D Viewer Pour revenir sur Chemsketch , cliquer sur : en bas de la fenêtre
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