PARTIE I : Phylogénie moléculaire
Pourquoi réaliser une phylogénie ? • Histoire de l'évoluqon des séquences moléculaires (phylogénie moléculaire) : ADN ARN
Cours Phylogenie ABiMS IFREMER part phylogenie v .
ATS Bio TD A9 - Construction d'abres phylogénétiques - T. JEAN
II. Initiation à une méthode moléculaire (WPGMA). Comment peut-on construire à la main un arbre phylogénétique à partir de séquences comparées ? Activité 3.
ats tda construction arbres phylogenetiques
cours de phylogénie moléculaire
Les étapes principales du bootstrap sont les suivantes : 1. à partir des séquences réaliser l'alignement multiple global. 2. construire l'arbre qui en découle
Cours de phylognie molculaire
SVT TB TP 5.1. - Diversité des Animaux / Phylogénie - T. JEAN
II. Initiation à une méthode moléculaire (WPGMA). Comment peut-on construire à la main un arbre phylogénétique à partir de séquences comparées ?
tb tp diversite animaux
Phylogénie moléculaire
186 chapitre 6. PHYLOGÉNIE MOLÉCULAIRE. 5. I. II Comment synthétiser l'informa- ... matiques autorisant la construction d'arbres phylogénétiques.
Douzery LivPhy InP
Méthodes efficaces pour reconstruire de grandes phylogénies
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Partie II L'organisme vivant : un système physico-chimique en
moléculaires (en plein essor grâce aux outils de la biologie Construction et évaluation des arbres phylogénétiques. Essor des caractères moléculaires ...
Lycée Valentine Labbé (59) • Classe préparatoire TB • SVT • Partie 5 • TP 5.1. Diversité des Animaux (inclus : Reconstruction phylogénétique)
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ENSEIGNEMENT DE SCIENCES DE LA VIE ET DE LA TERRE (SVT)°° SCIENCES DE LA VIE °°
Partie 5. Biologie évolutive >> Travaux pratiques <<TP 5.1.
TD Diversité des Animaux
(Reconstruction phylogénétique)Objectifs : extraits du programme
Séance(s)
Connaissances clefs à construire, commentaires, capacités exigiblesDiversité des
Animaux
(1 séance) - comparer les plans d"organisation - construire un arbre phylogénétiqueIntroduction
Dans ce TP, on se propose de :
- Construire des arbres phylogénétiques par analyse cladistique sur des exemples simples ; - Construire un arbre phylogénétique par une méthode moléculaire simple ; - Comparer succinctement les plans d'organisation animaux (en lien avec le chapitre 8 sur les plans d"organisation et les divers TP de zoologie de la partie 2Comment construit-on des arbres phylogénétiques ? Que nous enseigne la comparaison des plans d'organisation animaux ?
I. Analyse cladistique A. Travail à la main Comment peut-on construire à la main un arbre phylogénétique à partir d'une collection de taxons et
de caractères choisis ? Activité 1. Construction d"arbres à la main (intragroupes de 3 ou 4 taxons)Savoirs
à construire
Construction d"arbre
s phylogénétique s à la mainSavoir-faire sollicités
Capacité ou attitude
viséeÉvaluation
Maîtriser un outil, un geste technique, un logicielH Polarisation de caractères
H Construction d"une matrice de caractères
H Construction d"arbres phylogénétique possibles HApplication du principe de parcimonie
Produire un dessin, un schéma, un tableau, un graphe... HArbres phylogénétiques
En utilisant la feuille annexe (ou sur papier libre), construisez les arbres à partir des collections
d"organismes proposées lors de la séance et en utilisant les caractères retenus.B. Travail sur Phylogène Comment peut-on construire à la main avec Phylogène à partir d'une collection de taxons et de
caractères choisis ? Activité 2. Construction d"arbres sous PhylogèneSavoirs
à construire
Construction d"arbres phylogénétiques
avec PhylogèneSavoir-faire sollicités
Capacité ou attitude
viséeÉvaluation
Maîtriser un outil, un geste technique, un logicielH Logiciel Phylogène
Produire un dessin, un schéma, un tableau, un graphe... HArbres phylogénétiques
Exercice 2.1. Travail sur une collection de Vertébrés D"après http://svt.ac-rouen.fr/productions/phylogene/phylogene.html (octobre 2015) Utilisez le logiciel Phylogène (Lycée) en employant la fiche technique1. Sélectionnez la collection : " Vertébrés actuels et fossiles ».
2. Dans la collection, choisissez les êtres vivants suivants : Lézard, Homme, Pigeon,
Archaeopteryx. Sélectionnez les caractères anatomiques suivants : crâne et vertèbres, doigts,
mâchoire, squelette osseux, ailes, plumes.3. Complétez la matrice de caractères.
4. Construisez les arbres possibles avec le logiciel (Homme : extragroupe) et choisissez le plus
parcimonieux.Pistes de réflexion et d'exploitation
Quels caractères possédait l'ancêtre commun au Lézard, au Pigeon et à l'Archaeopteryx ? Quels
sont les caractères non informatifs dans cette étude ?Lycée Valentine L
ABBÉ
41 rue Paul D
OUMER - BP 2022659563 L
A MADELEINE
CEDEXLycée Valentine Labbé (59) • Classe préparatoire TB • SVT • Partie 5 • TP 5.1. Diversité des Animaux (inclus : Reconstruction phylogénétique)
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TD Diversité des Animaux
(Reconstruction phylogénétique)Objectifs : extraits du programme
Séance(s)
Connaissances clefs à construire, commentaires, capacités exigiblesDiversité des
Animaux
(1 séance) - comparer les plans d"organisation - construire un arbre phylogénétiqueIntroduction
Dans ce TP, on se propose de :
- Construire des arbres phylogénétiques par analyse cladistique sur des exemples simples ; - Construire un arbre phylogénétique par une méthode moléculaire simple ; - Comparer succinctement les plans d'organisation animaux (en lien avec le chapitre 8 sur les plans d"organisation et les divers TP de zoologie de la partie 2Comment construit-on des arbres phylogénétiques ? Que nous enseigne la comparaison des plans d'organisation animaux ?
I. Analyse cladistique A. Travail à la main Comment peut-on construire à la main un arbre phylogénétique à partir d'une collection de taxons et
de caractères choisis ? Activité 1. Construction d"arbres à la main (intragroupes de 3 ou 4 taxons)Savoirs
à construire
Construction d"arbre
s phylogénétique s à la mainSavoir-faire sollicités
Capacité ou attitude
viséeÉvaluation
Maîtriser un outil, un geste technique, un logicielH Polarisation de caractères
H Construction d"une matrice de caractères
H Construction d"arbres phylogénétique possibles HApplication du principe de parcimonie
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En utilisant la feuille annexe (ou sur papier libre), construisez les arbres à partir des collections
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caractères choisis ? Activité 2. Construction d"arbres sous PhylogèneSavoirs
à construire
Construction d"arbres phylogénétiques
avec PhylogèneSavoir-faire sollicités
Capacité ou attitude
viséeÉvaluation
Maîtriser un outil, un geste technique, un logicielH Logiciel Phylogène
Produire un dessin, un schéma, un tableau, un graphe... HArbres phylogénétiques
Exercice 2.1. Travail sur une collection de Vertébrés D"après http://svt.ac-rouen.fr/productions/phylogene/phylogene.html (octobre 2015) Utilisez le logiciel Phylogène (Lycée) en employant la fiche technique1. Sélectionnez la collection : " Vertébrés actuels et fossiles ».
2. Dans la collection, choisissez les êtres vivants suivants : Lézard, Homme, Pigeon,
Archaeopteryx. Sélectionnez les caractères anatomiques suivants : crâne et vertèbres, doigts,
mâchoire, squelette osseux, ailes, plumes.3. Complétez la matrice de caractères.
4. Construisez les arbres possibles avec le logiciel (Homme : extragroupe) et choisissez le plus
parcimonieux.Pistes de réflexion et d'exploitation
Quels caractères possédait l'ancêtre commun au Lézard, au Pigeon et à l'Archaeopteryx ? Quels
sont les caractères non informatifs dans cette étude ?