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Modélisation moléculaire

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  • Pourquoi modéliser les atomes ?

    La matière qui nous entoure est constituée d'atomes.
    Souvent, ils se regroupent pour former des molécules.
    Pour décrire la constitution de la matière, il faut savoir représenter et modéliser les atomes et les molécules.

  • Quels sont les différents logiciels utilisés en modélisation moléculaire ?

    Les logiciels concernés sont notamment MarvinSketch (éditeur de molécules 2D/3D très complet) et Jchem, un plugin adossé aux outils Microsoft (Word, Excel, PowerPoint, Outlook).
    MarvinSketch propose beaucoup de formats en import/export et permet également de calculer des propriétés de molécules.

  • Quel est le modèle moléculaire de H2O ?

    Exemple : la molécule d'eau H2O (carte n°4) est constituée de 2 atomes d'hydrogène et de 1 atome d'oxygène.
    La masse molaire de la molécule d'eau se calcule donc ainsi : M (H2O) = 2 M(H) + M(O).
    On représente les molécules à l'aide de modèles moléculaires, qui sont des boules de plastiques de couleurs différentes.

  • Il existe deux types de modèles moléculaires : les modèles éclatés et les modèles compacts.
    Dans le modèle compact, les liaisons entre les atomes ne sont pas représentées.
    Les atomes liés sont accolés les uns aux autres et sont représentés par des sphères tronquées.
La modélisation moléculaire consiste à construire des modèles des molécules ou d'ensemble de molécules, dans le but de mieux en comprendre la structure et les autres propriétés physico-chimiques. Du point de vue du chimiste, une molécule est un assemblage d'atomes liés entre eux par les liaisons chimiques.

Modélisation moléculaire
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Introduction à la chimie supramoléculaire Des atomes aux molécules
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La structure des molécules
COURS DE CHIMIE ORGANIQUE Semestre 2 SVI
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