[PDF] Profil bactériologique des infections du tractus urinaire au

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UNIVERSITEPOLYTECHNIQUE

DEBOBO-DIOULASSO

UNITEDEFORMATIONETDERECHERCHE

ENSCIENCESETTECHNIQUES

GENIEBIOLOGIQUE

N°d'ordre-------

CLINIQUEFRANY

TEL:50369932

RAPPORTDEFINDECYCLE

Pourfo6tentiondera

LICENCEPROFESSIONNELLEDEGENIEBIOLOGIQUE

Option:AnalysesBiologiques

Présentépar

TRADREKali'aAbdoulRachid

Sur{ethème,'

Profilbactériologiquedesinfectionsdu

tractusurinaireaulaboratoire delaclinique Frany

Maîtredestage:DrAbdoulAzizSAWADOGO

Directeurderapport:DrJacquesKABORE

Annéeuniversitaire:2014-2015

Dédicace

vivant,atoutfaitpour memanquenttoujours; ses scolarité,vosapports mesontinestimablesj laforce demedépasserj cetteconfiancequevousm'accordez j d'épreuvesensemble,et suisheureuxd'avoir faitceparcoursavecvous.

Remerciements

unsoutienénorme.

Jeremercie:

clinique; ouvertlesportesdulaboratoire; conseils; l'admirationdetous; deRechercheenSciencesetTechniques. vous; stagesàvenir;

Sommaire

-----------------------------i .-----------.---------i iv ----------------viii Liste ------------.------------viii Liste -----------------ix --------------x xi ---------3 ------------------------------4 -----4 .-------------------------------4 ---------------------------5 -------------------------5 -----------------------7 ---7 ----7 -----8 ------8 ---8

II.2. 2.Examenàl'étatfrais--.----------.--------------------------.----.---.--------------------.-

--8 --------9 1\1 II.2. 2. 2.Lescylindres------------------------------------------------------------------------ ------9 --------------------------Il ------------Il ------11 ----------Il --------------12 --12 12 ---12 ----------------------14 _---0------------------------14 -----14 ------15 15 ------------15 --------------.-.----------16 2

ème

---------------17 ------18 -----------------------------18 -----------------------------18 -----------------19 ---------------------------20 -------20 21
--0--------21 ------------------21 II1.4. 4.L'identification---------------------------------------------------------------.------.- -----.-21 -----------22 --24 ------------------------------24 --------------------------------------28 ]11 --------------------------------------29 --------30 -----------------------------30 ----------------.----------31 II.l. ---31 -----------------------------32 --34 II.4. 4.SensibilitéauxsouchesdeStreptocoqueetd'Enterobacterauxantibiotiques --------35 -------37 ----39 ------------------------------1

Listedestableaux

Tableaul :Interprétationdelacytologie-·-·.·-••••---------.---------------------------------·-------10

-------------·-·-----23

Listedesfigures

Figure2 :Cristauxrencontrésdanslesurines---------------------------------------------------------9

Figure4 :Numérationbactériennesurensemencementurinaire----------------------------------12 Figure6 :Diagrammed'étudedelasensibilitéglobaleauxantibiotiques-----------------------27 Figure7 :Diagrammedesensibilitédessouchesd'E.coliauxantibiotiques-------------------28 Figure8 :DiagrammedesensibilitédessouchesdeS.aureusauxantibiotiques---------------29 11111

Listedesannexes

---------------1 -------1 --II -II

Siglesetabréviations

ADN: ATB BCC: BGN: CHU: CLED: CMI: ECBU:

E.coli:

EMB: MH:

GC+PVX:

nu: OMS:

S.aureus:

S.saprophyticus:

AcideDésoxyriboNucléique

Antibiotique

Bouilloncoeur-cervelle

BacilleGramNégatif

CentreHospitalierUniversitaire

CystineLactoseElectrolyteDéficient

ConcentrationMoyenneInhibitrice

ExamenCytobactériologiquedesurines

Escherichiacoli

EosinMéthylenBlue

MuellerHinton

GéloseChocolat+Polyvitex

InfectionduTractusUrinaire

OrganisationMondialedelasanté

Staphylococcusaureus

Staphylococcussaprophyticus

Résumé

cytobactériologique antibiotiques. XI

Introduction

[25]. deuxparties: méthodes,lesrésultatsetdiscussion.

1èrepartie:Généralités

1

Chapitre1:Infectionsdutractusurinaire

1.Définition

II.Typesd'infectionsdutractusurinaire

II.1.Infectionurinairebasseoucystite

parlede: l'urètre. peuventcauserl'urétrite.

II.2.Lespyélonéphrites

4

III.I.Lesexe

111.2.L'âge

continus[22]. courssupérieureà10mg/j); l'infection; lafemmeenceinte; artérielle[3;22].

IV.Rappelsurlesbactéries

dimension. (lui• 1Il 6

ChapitreII

(ECBU)

Examencytobactériologiquedesurines

1.Leprélèvement

I.l.Conditionsdeprélèvement

decelledulaboratoire.

I.2.Transportetconservation

dûmentremplis[27]. 7

Il.Examencytobactériologiquedesurines

II.l.Examenmacroscopique

(phosphates)[38].

II.2.Examenmicroscopique

Il.2.1.Examencytologique

3 d'urineet rapporterlenombred'élémentsauml. )Lesleucocytes parcequelaleucocyturieestfaiblement positive,voirenégative,qu'iln'yapasd'infection. leucocytes/mld'urine[36].

Leshématies

nu[36].

II.2.2.Examenàl'étatfrais

levures...etc. 8

11.2. 2.l.Leris/aux

bactérieuréasique[36J.

Figure2 :Cristauxrencontrésdanslesurines(341

Il2.2.2.Lescylindres

àsavoir:

atteintedesglomérul infectieuse. [36].

Figure3 :Cylindresrencontrésdanlesurines[37]

9

Il.2.2.3.Lescellulesépithéliales

II.3.ExamenaprèscolorationdeGram

bactéries[14].

II.4.Interprétationdelacytologie:

coloniesinterprétation

NonNon0ECBUstérile

Suites

conduite

Normal

Oui Oui Non Non Non Oui Non Oui Oui Non Oui Oui oTraitement antibiotique

1sorteLeucocytesgénitaux

Infectiontypique

1sorteInfectiondébutante

Contamination

1sorteouplusContamination

1sorteouplusContamination

Sujetimmuno

déprimé

2sorteouplusInfection

polymicrobienne

Refaire

prélèvement

Adapteretrefaire

Identifieret

Antibiogramme

Identifieret

antibiogrammeou

àrefaire

Arefaire

Antibiogramme

ouRefaire

Identifieret

antibiogramme 10

III.Uroculture

111.1.LagéloseEosinMethylenBlue(EMB).

lactose(+)yestfavorisée[21;31].

III.2.LemilieuCLED

d'électrolytes

111.3.LemilieuSabouraud

111.4.LeMilieuChapmanmannité

111.5.LaGéloseausang

1 1

IV.Lecturedescultures

IV.1.Numérationdescolonies

5

UFC/ml.Lafigure4donnela

IV.2.dentificationdescolonies

IV.2.1.Identificationdescoce'

staphylocoques[Catalase(+)][21]. d'identifierchacundesmembres: •larechr hdlacoagulae(enzymequicoaguleleplasma)surplasmadlapin.EUe

Chapman(+),Mannitol(+)Pl).

12 l'1

ChapitreIII:Lesantibiotiques

I.Définition

organismes[10]. d'actionetleurnaturechimique.

II.Résistanceauxantibiotiques

acquise[4;20] avecunantibiotique[4].

1•

d'antibiotiques[4]. bactérienneinvitro. pharmacocinétiques

111.2.Méthoded'étude

Ils'agitdeladilutionetdeladiffusion.

1.; spécialisés[10]. traitement 16 2

ème

Partie:Etudeexpérimentale

1"7

Chapitre1:Matérieletméthodes

I.Cadredel'étude:lacliniqueFrany

patientsvenusenurgence.

II.Matériel

II.1.Petitmatériel

1R

II.2.Grosmatériel

grosmatérielétaitcomposéde: optimalesauxcultures; concentration. observation; manipulations; 19

II.4.Milieuxdecultureetd'isolement

.:.laGalerieApi20 e

III.Méthodes

III.1.Populationetpérioded'étude

collecteélaboréeàceteffet.

III.2.Collectedesdonnées

auplus48heures.

III.4.Etudecytobactériologique

III.4.1.Examenmacroscopique

.:.lacouleur; .:.l'aspect.

III.4.2.Examenmicroscopique

III.4.3.Culture

III.4.4.L'identification

(+)etagglutination(+)]. ?1

III.5.L'antibiogramme

Hinton(MH).

d'écouvillonsstériles. chaquezoned'inhibitionenmmsontprises. chimique

Pénicilline

Amoxicilline

Augmentin

Betalactamine

Cefadroxyl

CéphalosporineCefixime

Cefuroxime

AminosideDesoxystreptamineGentamycine

QuiniloneurinaireAcidenalidixique

Quinolone

Ciprofloxacine

Fluoroquinilone

Norfloxacine

23

ChapitreII:Résultatsetdiscussion

1.Résultats

Tranched'âge

MasculinFémininTotalPourcentage

despatients

0-1410122222%

15-30Il203131%

31-5016143030%

51-70951414%

71-9021 33%

Total4852100100%

EtatdelacultureNombrePourcentage

Positive

2929%

Monomicrobienne2626%

Polyrnicrobienne33%

Négative7171%

24
culturesnégatives. engenre TableauV :Répartitiondesgermesidentifiésentyperespiratoire,enfamilleetengenre

Escherichia1344,82

Klebsiella620,68

germesidentifiésenespèces. 6,89 /3,44 20,68

Candidaalblcon

Enterobactersp

Eschcoli

Klebsp

Stophaureus

Strepsp

.:.2foisavecandUiaalbicans 26

Nombred'ATB

NOMd'ATB

6,66 90,9
84,21
90,9
o...--......-.......- 60
40
80
20 100
27
utilisés satisfaisanteàlagentamycineetauNortloxacine.Lafigur7révèllasensibilitéd ssouches d'E.coliauxantibiotiques.

Nombred'ATB

100
80
60
40
28,57
20

NOMD'ATB

utilis' 28

Nombred'ATB

120
100
80
60
40
20 o o

Nombresd'antibiotiquest.estés

.Dt",

Nombresdesouchessensibles

o

Nomd'ATB

Figure8 :DiagrammedesensibilitédessouchesdeS.aurew'auxantibiotiques majoritairementutilisés Lagentamycine,laciprofloxacine ontenregistrélesmeilleurstauxd'activitésurlesuchesde 29

Nombred'ATB

100
80
60
o 20 o

Nomd'ATB

Figure9 :DiagrammedeenibilitédouchesdeKlebsiellaaU.lantibiotiques antibiotiquemajoritairementutilisé majoritairement utilisés. 30

II.Discussion

II.1.Limitesetcontraintesdel'étude

hospitalisésensontatteints[3]. •l'anatomie symptômesd'uneITU[38]; lesvoiesexcrétrices[16]; '}1 certaineshormones[16J; •l'usaged'un risqued'ITU[38]. premierstroublesprostatiques.

II.3.Laculture

prédominanced'E.coli44,68%. représentait81,48%[16]. ,(l'adhésivité ,(l'hémolysine ,(l'antigèneK complément; facteurshormonaux[38]. 33
34
II.4.2.Sensibilitédessouchesde staphylocoqueauxantibiotiquesquotesdbs_dbs35.pdfusesText_40

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