DGS-URGENT
DGS-URGENT. DATE : 17/12/2021. RÉFÉRENCE :DGS-URGENT N°2021_131. TITRE : ACTUALISATION DE LA DOCTRINE DE CRIBLAGE. Professionnels ciblés.
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texte français donné à la traduction latine correspondante par de la langue le texte latin (généralement fabriqué et en phrases isolées dans les débuts ...
DGS-URGENT
DATE : 17/12/2021 RÉFÉRENCE : DGS-URGENT N°2021_131TITRE : ACTUALISATION DE LA DOCTRINE DE CRIBLAGE
Professionnels ciblés
܈ Tous les professionnels ܆
܆Chirurgien-dentiste ܆Audioprothésiste ܆ ܆Ergothérapeute ܆Autre professionnel de santé ܆ ܆Manipulateur ERM ܆Orthopédiste-Orthésiste ܆ ܆Médecin-autre spécialiste ܆Pédicure-Podologue ܆܆Infirmier ܆Opticien-Lunetier ܆
܆Masseur Kinésithérapeute ܆Orthoptiste ܆ ܆Médecin généraliste ܆Orthophoniste ܆Zone géographique ܈National ܆
Mesdames, Messieurs,
La stratégie nationale de tests, portée par les laboratoires de biologie médicale (LBM), orientée vers le dépistage des
différents variants doit tenir compte de la situation épidémique actuelle. Depuis février 2021, une stratégie de criblage
systématique des tests RT-PCR positifs a été mise en place sur le territoire national. Tout résultat de test RT-PCR positif
est suivi par une RT-PCR de criblage pour rechercher les 3 mutations d'intĠrġt. Depuis le 31 mai, Les kits de criblage
recherchent 3 mutations : - E484K (A) ͗ substitution d'intĠrġt pour la thĠrapie par anticorps monoclonaudž ; - E484Y (B) ͗ substitution d'intĠrġt pour la thĠrapie par anticorps monoclonaux ; - L452R (C) : mutation associée à la transmissibilité très élevée de Delta. réalisation de cette PCR de criblage. gagner en réactivité et en pertinence.Table des matières
I. Actualisation des mutations à rechercher
II. Eǀolution de l'indication de criblage
III. Actualisation de la doctrine de séquençage post-criblageIV. Adaptation des systğmes d'information
I. Actualisation des mutations à rechercher
Pour fluidifier l'opĠration de criblage, le criblage doit se faire en 2 temps maximum, soit le test de dépistage par RT-
PCR en 1ère ligne puis le criblage en 2nde intention. Ainsi, la mutation E484K, comparativement à la E484Q, semble
aǀoir le plus d'impact en cas d'Ġchappement ă la neutralisation des traitements par anticorps monoclonaudž.
En tenant compte des amorces déjà disponibles chez les fabricants et celles très prochainement mises à disposition
des laboratoires, les mutations spécifiques du variant Omicron dans le contexte actuel sont les suivantes :
- Substitution K417N : semble ġtre une mutation clĠ informant sur d'autres ǀariants passĠs et potentiellement
futurs ;- Délétion 69/70 : associée à une perte de certains sites de neutralisation (fixation d'anticorps neutralisants),
possible Ġchappement immunitaire et une perte d'efficacitĠ ǀaccinale ; - Substitution Q493R ͗ mutation d'intĠrġt pour la thĠrapie par anticorps monoclonaux ;Afin de tenir compte des donnĠes complĠmentaires sur Omicron et de la pertinence de rechercher d'autres mutations
A partir du 20 décembre 2021 : E484K (A) + L452R (C) + K417N OU del69/70 OU S371L-S373P OU Q493R (D)
II. Eǀolution de l'indication de criblage
Selon les données de Santé publique France, près de 10% des résultats de criblages sont ininterprétables sur les 3
mutations actuellement recherchée (A8B8C8). Un cycle de seuil (Ct) élevé augmente le risque de rendre un résultat
de criblage ininterprétable et donc une manipulation complémentaire évitable. Criblage systématique des seuls prélèvements avec Ct ч30 III. Actualisation de la doctrine de séquençage post-criblage définies (exemple : échappement à la vaccination). Pas de séquençage systématique pour les résultats de criblage A0B9C0D1IV. Adaptation des systğmes d'information
Depuis le 29 novembre 2021, la lettre " D ͩ d'identification du rĠsultat de suspicion du variant Omicron par criblage
est en cours de dĠploiement dans tous les systğmes d'information des laboratoires. Pour aider les laboratoires et leurs
Ġditeurs de solutions logicielles, ă cette mġme date, l'outil d'aide au paramĠtrage a ĠtĠ mis ă jour et un guide
d'utilisation ͨ SI-DEP » diffusé. En fin de ce déploiement, SI-DEP ne doit collecter que des résultats sous la forme
AxBxCxDx. (Pour rappel 0 : absence ; 1 : présence ; 8 : ininterprétable ; 9 : non recherché).
A partir du 20 décembre, chaque saisie de rĠsultat deǀra tenir compte de l'absence de recherche de la mutation E484Y
(B9).Nomenclature de criblage : AxBxCxDx
Je vous remercie pour votre mobilisation,
Pr. Jérôme SALOMON
Directeur général de la santé
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