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peptidique (carboxypeptidase) en libérant l'aminoacide terminal 4 3 2 Endopeptidase L'enzyme hydrolyse des liaisons peptidiques internes entre deux

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Éléments constitutifs des peptides : les acides aminés Chapitre 4: Effets de la topologie des peptides sur l'organisation structurale des complexes

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La liaison peptidique est formée durant l'étape de traduction par une liaison covalente entre un groupement ?-aminé d'un acide

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Un peptide : combinaison de 2 ou plusieurs AA par des liaisons amides particulières = liaisons peptidiques Liaison peptidique

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aminés avec la ninhydrine • Le réactif de coloration biuret réagit avec les peptides contenant plus de 4 acides aminés • Hydrolyse de la liaison peptidique en

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La rupture des liaisons peptidiques qui permet d'obtenir les amino-acides à l'état libre est réalisée par action soit d'un acide fort à chaud soit d'enzymes

A- Formation de la liaison peptidique

Un peptide: combinaison de 2 ou plusieurs AA par des liaisons amides particulières = liaisons peptidiquesLiaison peptidique Chaîne peptidique :( réaction positive au Biuret) O Nt Ct C N O

HChaîne polypeptidique

C R 1 H H 2 N CC R 2 H C N O H C C R 3 H CCOOH R 4 H N O H O NH La chaîne polypeptidique apparaît comme une succession de motifs "liaison peptidique» appelée squelette polypeptidique, sur laquelle sont greffées les chaînes latéralesdes acides aminés.

Motif de la liaison peptidique:

B- Structure de la chaîne peptidique

Le placement des Radicauxd'AAsur les Cn'est possible que dans la configurationtrans.

Configuration Trans de 2

résidus successifs Rotationde 2 liaisons peptidiques successives autour d'un même atome de C Si les angles sont égaux, la chaîne peptidique prend une forme organisée(Structure ordonnée), sinon la structureest désordonnée (pelote statistique)

Les peptides sont des polymères chargés

Méthodes d'analyse de la séquence peptidique

A- Composition globale en AA:Elle peut être déterminée après HAT: -coupe les l. peptidiques

-détruit le Trp ( HCl 5.6N à 100°pd 24 à 72h) -transforme Asn en Asp -et Glnen Glu B- Détermination du résidu N-terminal*Les réactifs chimiques -Le 2,4-dinitrofluorobenzène(DNFB) (DNP AA). -Le chlorure de dansyl(DNS-Cl) DNS AA -Le phénylisothiocyanate(PITC) PTH AA. Cette réaction est cyclique. ( Réaction d'Edman)

Phénylisotiocyanate

(PITC

AA Nterminal

Phénylthiocarbamyl (PTC)

de peptide l'acide trifluoroacétique anilinothiazolinoneSolution acide phénylthiohydantoïne acide aminé (PTH - acide aminé).

Le reste de la chaîne polypeptidique

subit de nouveau l'ensemble du traitement et les acides aminés sont ainsi séquencés tour à tour à partir de l'extrémité N-terminale Le PTH - acide aminé est séparé, quantifié et identifié par chromatographie en phase reverse

Chaine polypeptidique

racourcie de (n-1) AA * Méthode enzymatique utilisant les aminopeptidases A et Nqui sont spécifiques des AA N-terminaux. C- Détermination du résidu C-terminal-Méthode chimique: -par l'hydrazineanhydre à chaud R 1 R 2

NH2-NH2

R 1 NH 2 -CH-C-NH-CH-COOH NH 2 -CH-C-NH-NH 2 O O

NH2-CH-COOH

R 2 AA Ct -Réduction par le Borohydrure de Lithium ----Rn-CH-NH 2 -- Rn-CH-CH 2 -OH+ H2O

COOHNH2

LiBH4 -Méthode enzymatique: Les Carboxypeptidase A ou Bsont desexopeptidasesqui libèrent l'AA en Ct.

D-Hydrolyse partielle des chaînes

-Digestion enzymatique:

Endopeptidases spécifiques:

-TrypsineArget Lys -Chymoptrypsineles AA aromatiques: Phe, Tyr, Trp. -ClostripaïneArg -Protéase de staphylocoqueGlu - ThermolysineLeu, Ile, Tyr - Méthode chimique:-Le BrCN qui coupe après la Met et la transforme en homosérine.

Synthèse chimique des peptides (Merrifield)

ère

condensation

Copolymère styrène divinyl-benzène

Lavage

déprotection

Lavage et couplage

avec le 2 e AA

DéprotectionFixation du 3

e AA

Déprotection

Tripeptide libéré par hydrolyse

A- les Hormones Peptidiques

COOHņCys

ņTyrņPheņGluņAspņCys

ņProņArgņGlyņNH2°La vasopressine

: action antidiurétique .

°La somatostatine

: 2 chaîne, une de 14 AAl'autre de 28 AA. Elle a une action inhibitricesur plusieurs hormones dont l'insuline et le glucagon.1-Hormones Hypophysaires:

Vasopressine: 9AA

2- Hormones Hypothalamiques:

°La TRH ou protiréline

: hormone hypothalamique TSH (Thyrotropine). La TRH est un tripeptide: L-pyroglutamyl-L-histidyl-L-proline amide.

Protiréline

3-Hormones Pancréatiques:° L'insuline:

hormone hypoglycémiante, 2 chaînes : A (21AA)et B ( 30AA) liées par des ponts disulfures.

° Le Glucagon:

hormone hyperglycémianteformée de 29 AA. B- Peptides Neurotransmetteurs:Ils sont libérés au niveau des terminaison nerveuses .

°Enképhaline

: pentapeptide à activité analgésique (Morphine) C- Peptides de microorganismes:°La pénicilline est un tripeptide produit par un champignon (antibiotique naturel).quotesdbs_dbs46.pdfusesText_46

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