[PDF] S5_Fiche UE_Biochimie-Structurale_HAV505V





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Cet enseignement offre un approfondissement en biochimie structurale des biomolécules plus particulièrement des protéines et des acides nucléiques.



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Direction du département Biologie Mécanisme du Vivant de la Faculté des Sciences de Montpellier

Secrétariat Licence Sciences de la Vie : Régine PIRONE

Bât 25 - 04 67 14 38 63

e-mail : regine.pirone@umontpellier.fr Fiche UE du département Biologie-Mécanismes du Vivant

L1 L2 L3 M1 M2

Intitulé : Biochimie Structurale, HAV 505V

Responsable(s) : Rachel Cerdan

Coordonnées du/des responsable(s) (tel/mail) : 0467144039 / rachel.cerdan@umontpellier.fr Nombre ECTS : 4 Effectif min : Effectif max : 120

Nombre d"heures

CM :18 TP : TD : 18 Terrain : SPS :

Noms des intervenants pressentis : Rachel Cerdan / Jean-François Guichou (Fac de Pharma)

Description de l"UE

Cet enseignement offre un approfondissement en biochimie structurale des biomolécules, plus particulièrement des protéines et des acides nucléiques.

Les notions de base et la nomenclature utilisées pour l"analyse des structures 3D des protéines

y sont brièvement reprises (diagramme de Ramachandran, motif et domaine structuraux,

repliement, famille, superfamille, etc......). Ces notions sont complétées par l"étude de la

stabilité et de la dynamique des biomolécules.

La classification structurale des protéines est détaillée en fonction des 4 principaux types de

repliement. Les relations structure-fonction sont illustrées à l"aide d"exemples de protéines.

Les spécificités des structures des protéines membranaires (protéines intégrales, protéines

liées à la membrane) sont abordées. Les principaux outils de modélisation et de prédiction de structures secondaires et tertiaires sont présentés.

Les différentes structures et fonctions des acides nucléiques sont étudiées. Les complexes

protéine-acide nucléiques sont décrits d"un point de vie structural (principaux motifs de reconnaissance, ...) et les notions de spécificité de reconnaissance sont détaillées.

Cet enseignement est illustré en travaux dirigés. Ces travaux consistent à se familiariser avec

les principales bases de données utilisées en biologie structurale ainsi qu"avec le logiciel

PyMol pour l"analyse des structures 3D.

Direction du département Biologie Mécanisme du Vivant de la Faculté des Sciences de Montpellier

Secrétariat Licence Sciences de la Vie : Régine PIRONE

Bât 25 - 04 67 14 38 63

e-mail : regine.pirone@umontpellier.fr

Compétences visées par l"UE :

Cet enseignement permet d"appréhender une problématique biologique à l"échelle

moléculaire. L"étudiant.e saura décrire et analyser toutes les structures de biomolécules et

pourra identifier les déterminants moléculaires essentiels aux interactions entre biomolécules

et comprendre leur importance. Il.elle sera en mesure d"explorer les relations structure- fonction.

A l"issue de cet enseignement, l"étudiant.e doit pouvoir étudier tous types de biomolécules en

3D à l"aide du logiciel de son choix. Il doit être capable de donner les informations

structurales précises comme par exemple la distance entre une protéine et un ligand ainsi que l"organisation spatiale. Prérequis (compétences et/ou UE) : HAV201V, HAV204V Modalité des contrôles de connaissances : contrôle continu + contrôle terminal Epreuve Coefficient Nb heures Nb Sessions Organisation (FDS ou local)

Ecrit 0,8 2 2 FDS

Contrôle

Continu

0,2 1h30 1 local

TP Oral

Informations additionnelles :

Cadre réservé à l"administration :

Code UE : HAV505V

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