[PDF] Présentation PowerPoint Les microbes. Microbiologie médicale.

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Les microbes

Microbiologie médicale

Professeur Guillaume Arlet

GH HUEP, AP-HP

Faculté de Médecine, UPMC

Cours IFSI 2016

Cours IFSI

Définition

"Micro-organismes "Etres vivants microcopiques "Premiers êtres vivants sur terre

Cours IFSI

Evolution

HQ PLOOLRQV G·MQQpH

4500 3000 2000 1000 0

Archaebactéries

Cellule

eucaryote9

E. coli

0,3

Cours IFSI

Classification des

microbes "Etres unicellulaires : protistes "La division cellulaire génère deux individus "Protistes eucaryotes (vrai noyau) "Protozoaire "Algues "Champignons et levures "Protistes procaryotes "Bactéries "Acaryotes : virus

Cours IFSI

LES BACTERIES

Définition

Etre vivant, unicellulaire, de petite taille

(généralement 1 micro de diamètre et quelques microns de longueur). absence de membrane nucléaire, chromosome unique en général.

Classificationest fondée sur les caractères

morphologiques, tinctoriaux, biochimiques, antigéniques génétiques

Cours IFSI

Structure générale

Capsule

Paroi

Membrane cytoplasmique

Pili sexuel

Flagelles

Pili communs

Chromosome

Ribosomes

Cours IFSI

Rôle du peptidoglycane

Propriétés du Peptidoglycane

forme et rigidité de la bactérie coloration de Gram sensibilité au lysozyme, aux antibiotiques

Cours IFSI

peptidoglycane

PorineMembrane externeAcides téchoiquesLPS

espace périplasmique

Membrane cytoplasmique

Bactérie à Gram positifBactérie à Gram négatif

Cours IFSI

Autres composants de la paroi bactérienne

Membrane externe (Gram -):

lipopolysaccharide(LPS), endotoxine, antigène somatique O Membrane interne (Gram -) ou cytoplasmique (Gram +) : barrière osmotique métabolisme énergétique.

Capsule(inconstante): polysaccharidique,

virulence, (opsonisation): S. pneumoniae

Cours IFSI

Appendices externes

Flagelles: 15 à 20µ de longMobilité

Protéine antigénique: antigène H

Implantation

Polaire

Péritriche

MonotricheLophotriche

Pili .: 0,2 à 5 µ de long

Structure et fonctions:

poils raides, en protéine, sexuels (transfert génétique), communs (adhésion): Escherichia coli, Neisseriagonorrheae

Cours IFSI

Cours IFSI

Spore: chez bacilles à gram positif ,

Bacillus, Clostridium

Formation: sporulation (intracytoplasmique)

sécheresse, chaleur, appauvrissement du milieu formation de la préspore, maturation, germination

Fonction

Conservation du patrimoine génétique

résistance aux agents physiques et chimiques.

Température, chaleur (100°C),

UV, Rayons X, agents chimiques

Stérilisation: Chaleur humide à 120°C

Cours IFSI

LES CONSTITUANTS INTERNES

Cytoplasme

Acide désoxyribonucléique :

Chromosome, ADN surenroulé

Plasmide

Réplication sur les deux brins (< 20 min.)

Acides ribonucléiques :

messager, de transfert,

Ribosomal

Small ARN

Cours IFSI

Morphologie quelques exemples

Coques Gram + en amas

Coques Gram + en chainettes

Bacilles gram

mobiles péritriches

Bacilles Gram -

capsulés

Bacille Gram

mobile polaire

Diplocoques Gram + capsulés

Bacilles Gram + sporulés

Vibrions, Campylobacter

Spirilles

Tréponème

Cours IFSI

ECBU à Escherichia coli

Cours IFSI

Hémoculture à Campylobacter

Cours IFSI

Méningite à méningocoque

Cours IFSI

Endocardite à Streptocoque

Cours IFSI

LA CROISSANCE

Conditions physicochimiques

-Température bactéries mésophiles -optimum de 20°C à 40°C. certaines bactéries (psychrophiles) cultivent mieux à 4°C. bactéries thermophiles -pH en général optimum de croissance à la neutralité -Pression osmotique saumure (NaCl > 30 %) empêche la croissance

Cours IFSI

-2type respiratoire : Aéro Anaerobie Aérobie Microaérophile Anaérobie

LA CROISSANCE

Cours IFSI

Quelques exemples de temps de génération

Escherichia coli: 17 minutes

Staphylococcus aureus: 30 minutes

Lactobacillus acidophilus: 75 minutes

Mycobacterium tuberculosis: 20 heures

Treponema pallidum: 33 heures

LA CROISSANCE

Cours IFSI

Génétique :

"Mutation "Transformation "Transduction "Conjugaison "Transposons conjugatifs "Remodelage interne "transposons

Cours IFSI

Cours IFSI

CARACTERES DES MUTATIONS

1/ Rareté : 1 individu sur 106-108

2/ Spontanéité

La bactérie mutantepré-existe au sein de la population

3/ Discontinuité

4/ Stabilitéet transmissible à la descendance.

Cours IFSI

Plasmides

Gènes de résistance

Gènes de virulence

Cours IFSI

CONJUGAISON

Flores bactériennes humaines

Pr. Guillaume ARLET

UFR de Médecine

Université Pierre et Marie

Curie

Cours IFSI

Homme et bactéries

quelques notions Homme : 1013cellules eucaryotes et 1014bactéries

Nouveaux nés : stériles à la naissance

Cours IFSI

Flore humaine

quelques définitions "Flore commensale (cum mensa) "Flore saprophyte "Flore transitoire

Notion de virulence

"Bactérie pathogène stricte "Bactérie pathogène opportuniste

Cours IFSI

Les flores humaines

Flores humaines

peau : 102-106/cm2 rhinopharynx 108/ml oropharynx : 108/ml digestive : 102-1011/g vagin : 108/ml

Cours IFSI

Le corps humain

Les régions stériles

trachée, bronches, poumons sous la peau les urines séreuses et organes

Cours IFSI

Flore bactérienne cutanée

"La peau est située en première ligne dans la défense vis-

à-vis des infections.

"La flore cutanée normale a un rôle de protection contre production de peptides antimicrobiens. "Plus de 200 espèces bactériennes identifiées

Cours IFSI

Cours IFSI

Variation quantitative

de la flore cutanée "Régions sébacées : 105-106/cm2 "Régions pileuses "Conduit auditif externe "Régions humides : 106-107/cm2 "Aisselles "Périnée "Espaces interdigitaux "Nombril "Régions sèches : 102/cm2

Cours IFSI

Flore aérienne supérieure

Rhinopharynx Oropharynx

"Streptocoques,dontS.pneumoniae "Haemophilus,dontH.influenzae esttransitoire)

Cours IFSI

Flore digestive humaine

Cours IFSI

Cours IFSI

Flore digestive humaine : rôle

1.Commensalité

"Participation à la digestion alimentaire "Synthèse de vitamines (K, folates, B)

2.5pVLVPMQŃH j O·LQIHŃPLRQ

Effet de barrière

"Bactériocines "Encombrement stérique "Métabolites toxiques "Déplétion alimentaire

Cours IFSI

Effet de barrière

Cours IFSI

Flore vaginale

fécondation). "Corynébactéries "Bifidobacterium. entérobactériessontplusabondantes.

Cours IFSI

Flore bactérienne et antibiotiques

"Flore commensale habituellement sensible "Flore soumise à pression de sélection "Émergence de la résistance "Transfert de la résistance "Conjugaison (acquisition de plasmides R)

Cours IFSI

Flore bactérienne

et système immunitaire "Système immunitaire et flore digestive "La flore digestive permet le développement du système immunitaire digestif et sa stimulation permanentequotesdbs_dbs23.pdfusesText_29

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