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Quelles sont les ADN polymérases requises pour la réplication et la

chez les eucaryotes? Lors de la synthèse d'ADN la polymérisation de désoxyri- bonucléotides s'effectue grâce à des enzymes spécifiques: les ADN polymérases 



CHAPITRE 2 BIOLOGIE MOLECULAIRE Mme OUNIS.pdf

Les eucaryotes ont des origines multiples sur chaque chromosome (chez la levure Les ADN polymérases des procaryotes et des eucaryotes ne peuvent ...



REPLICATION DE LADN

Elles sont de 3 types (I II et III) pour les procaryotes et les ADN polymérases eucaryotes de. 5 types (?



La réplication dADN-Biologie Moléculaire-Dahmani.pdf

chez les procaryotes. (9 ADN polymérases chez les eucaryotes). ? La polymérase alpha/primase. Cette polymérase est impliqué dans l 



La structure des acides nucléiques

Comprendre la réplication chez les procaryotes et les eucaryotes Eucaryotes: 5 types d'ADN polymérases: ADN Pol ? ?



MODULE :

d- Les DNA polymérases I des procaryotes ont une activité5' 3' exonucléasique. e- Les amorces des ADN polymérase eucaryotes peuvent être du DNA double brin. f- 



La réplication de lADN chez leuryarchaea Pyrococcus Abyssi : mise

eucaryotes a été faite lors de l'étude des ARN polymérases ADN dépendantes (Huet et al. 1983). Bien que les régulations transcriptionnelles archées soient 



Fonction et régulation de lADN polymérase spécialisée eta dans la

19 déc. 2021 Figure 4 : Représentation schématique du réplisome Eucaryote. Figure 5 : Structure en « main droite » des ADN polymérases réplicatives.



« Les ADN polymérases B et D de lArchaea hyperthermophile

CHAPITRE 3 - ETUDE D'UN MOTIF RICHE EN GLYCINES DE L'ADN POLYMERASE D DE des protéines de type eucaryote pour les processus informatifs.

Which eukaryotic polymerase requires a specific set of transcription factors?

Each eukaryotic polymerase also requires a distinct set of transcription factors to bring it to the DNA template. RNA polymerase I is located in the nucleolus, a specialized nuclear substructure in which ribosomal RNA (rRNA) is transcribed, processed, and assembled into ribosomes.

Which enzyme removes RNA primers?

RNA primers need to be replaced with DNA, and nicks in the sugar-phosphate backbone need to be connected. The group of cellular enzymes that remove RNA primers include the proteins FEN1 (flap endonulcease 1) and RNase H.

What dnaps do eukaryotes use for replication?

Eukaryotes utilise various multimeric DNAPs for replication of the genome; namely Pol a, Pol d and Pol e (Burgers, 2009). All contain a catalytic core identifiable as a Family B polymerase, along with various accessory subunits fundamental to their roles in replication (Hubscher et al., 2002).

What are the types of DNA polymerases?

Based on the sequence similarity and enzymatic properties, DNA polymerases are classified into six main groups: families A, B, C, D, X, and Y . Families B and C are eukaryotic and bacterial replicative DNA polymerases, respectively [2, 3].

BIOLOGIE

MOLECULAIRE

ème

3 ANNEE BIOLOGIE MOLECULAIRE ET

CELLULAIRE

Mme : OUNIS.L

UNIVERSITE MENTOURI CONSTANTINE 1

CHAPITRE II:

I. GENERALITES

Lors de la division cellulaire, quand une cellule-mère donne deux cellules-filles, il est présent dans la cellule- la mitose (ou division cellulaire) on parle de de réplication conditionnent donc le déroulement de la division cellulaire.

II. LOIS FONDAMENTALES DE LA REPLICATION DU DNA

La réplication est gouvernée par un ensemble de lois fondamentales:

Semi-conservative.

Bidirectionnelle.

Complémentaire et dans le sens 5

Discontinue.

-conservatrice: : Chaque cellule-fille reçoit un brin de la mère et un brin néo-synthétisé. roposé par WATSON et CRICK, elle fut vérifiée en 1957 par MATTHEW MESELSON et RANKLINF STAHL.

Dans les années 1950, trois mécanismes différents ont été proposés pour la réplication

d'ADN (voir Fig1):

-Théorie conservatrice: Les deux brins parentaux restent intacts après la réplication d'ADN.

-Théorie Semi conservatrice -Théorie Dispersive Fig1 : Les hypothèses de la réplication d'ADN proposés paWATSONr et CRICK:

deux sens à partir de ce point créant ainsi deux fourches de réplication on dit que la réplication

est bidirectionnelle. Les boucles de réplication débutent toujours en un point unique appelé

origine est symbolisé par ORIC chez les procaryotes. Ce point de départ renferme des

séquences nucléotidiques bien déterminées. Les procaryotes possèdent une origine unique (ORIC) sur chaque chromosome

(Fig.4) . Les eucaryotes ont des origines multiples sur chaque chromosome (chez la levure ARS= les séquences de réplication autonomes). des directions opposées, délimitant ainsi deux fourche de réplication au niveau de chaque origine (Fig4).

Fig. cation

II.3. Orientation :

Chez tous les organismes vivants, la réplication (La synthèse du nouveau brin de (Fig5a).

La synthè

antiparallèles, en suivant la direction de la fourche de réplication un brin est synthétisé dans le

in devrait être synthétisé dans le mpossible.

Comment ce brin est-il donc synthétisé?

Fig5a : La direction de la fourche et des brins nouvellement synthétisés La découverte de cette synthèse revient à REIJ OKAZAKI. Ce brin est synthétisé par étapes ou par morceaux. Ce sont de petits fragments peuvent aller de quelques centaines à des milliers de nucléotides.

Le premier brin est donc synthétisé d

(Fig5b). On appelle le brin continu, le brin directeur ou précoce ou le brin avancé et le brin discontinu le brin retardé ou tardif (sens inverse du mouvement de la fourche de réplication). Fig5b : La direction de la fourche de réplication et des brins nouvellement synthétisés

Une séquence nucléot

III. LES ENZYMES DE LA REPLICATION

La réplication est catalysée par un complexe multienzymatique appelé réplicase de Ces enzymes présentent de grandes similitudes chez les procaryotes et les eucaryotes, parfois même sont communes. On distingue: III.1. Les helicases ou déroulases: Ce sont des enzymes dont le rôle est le (elles

ADN par rupture des liaisons hydrogènes). Elle

e

III.2. Les topoisomérases A- la conformation

des ADN les topoisomères. la même séquence et diffèrent des brins autour de lifférents états des topoisomères. stable de la molécule. - -même en formant un super enroulement. Deux formes de superenroulement sont alors possibles: -Un superenroulement qui correspond à: une a

B (rotation droite). On parle de

superenroulement positif (Fig6).

On parle de superenroulement négatif(Fig6).

Fig 6: Les to

B- Rôle des TOPOISOMÉRASES

-Les topoisomérases de type I:

Agissen

autour du brin intact, puis joignent les deux bouts, leurs rôle principal est de catalyser le if(Fig7).

Fig7 : Rôle des topoisomérases I

-Les topoisomérases II : (exemple: gyrase bactérienne). Elles nécessitent de

III.3. La primarase: Les ADN polymérases des procaryotes et des eucaryotes ne peuvent fonctionner que

t fourni par une enzyme appelée ADN primase.

III.4. Les DNA polymérases

Chez les procaryotes:

du brin avancé et synthèse de

ADN polymérase

Nombre de sous unités

Activités

Rôle

I 1 - Une activité polymérase 5'- hydrolyse les amorce et les remplace par de - Une activité exonucléasique 3'->5' - Une activité exonucléasique 5'- II - Une activité polymérase 5'- activité surtout de réparation - Une activité exonucléasique 3'->5'

III - Une activité polymérase 5'-

- Une activité exonucléasique 3'->5' Synthétise le Brin avancé et brin retardé Tableau1 : Rôles des ADN polymérases des procaryotes

Chez les eucaryotes:

- ĮSynthèse les amorce mixte ARN/ADN de 25 à30 nucléotides à - ȕ: impliquée dans la réparation d'ADN dans des celules en cours

de division que dans des cellules quiescentes - įPrincipale action polymérase eucaryotique intervenant dans la

- Synthèse du brin avancé. - Synthèse du brin retardé. - Ȗ: responsable de la réplication de l'ADN mitochondriale dont la réplication est indépendante de l'ADN nucléaire. - İPeut remplacer la DNA polymérase dans certains cas tel que la réparation et la synthèse du brin retardé. ADN

Nombre de

Activités

rôle polymérase sous unités - Une activité polymérase 5'->3' Synthèse les amorce mixte ARN/ADN de 25 à30 nucléotides à

Alpha Į 4 - une activité primases5'->3'

- alpha n'a pas d'activité exonucléasique 3'->5' - Une activité polymérase 5'- Principale action polymérase eucaryotique intervenant dans

Delta į

2 - Une activité exonucléasique 3'->5''

· Synthèse du brin avancé .

· Synthèse du brin retardé .

- pas d'activité primase, · vers 5 - Une activité polymérase 5'- Epsilon İ 2 Peut remplacer la DNA polymérase dans certains castel que - Une activité exonucléasique 3'->5' la réparation et la synthèse du brin retardé - Pas d'activité primase - Une activité polymérase 5'-

Bétaȕ 1> - Une activité exonucléasique 3'->5' - impliquée dans la réparation d'ADN dans des

cellules en cours de division que dans des - Pas d'activité primase cellules quiescentes - Une activité polymérase 5'- Gamma Ȗ 1 responsable de la réplication de l'ADN mitochondriale dont la

- Une activité exonucléasique 3'->5'' réplication est indépendante de l'ADN nucléaire

- Pas d'activité primase Tableau2 : Rôles des ADN polymérases des eucaryotes.

Les caractéristiques DNA polymérases:

La synthèse de nouveau

Selon la loi de complémentarité, une cytosine est

Les ADN polymérase initient la

amorce. Une amorce est un ensemble de nucléotides qui est déjà appariés.

polymérase en ajoutant les désoxynucléotides tout en respectant la loi de complémentarité. La

les dNTP (dATP, dGTP, dCTP et dTTP). La présence de certains ions (cations bivalents: Mg 2+, ce cation est indispensable

La fidélité des polymérases est très élevée. Pour environ 10000 nucléotides ajoutés la

polymérase peut faire une seul erreur cependant cette erreur est réparé

III.5. la lygase:

Les DNA ligases sont des enzymes qui sont capables de reconstituer la liaison phosphodi-OH et le phosphate - brin de DNA. Elles interviennent dans la réplication pour lier ensemble les brins de DNA ou les Elles interviennent aussi dans de nombreux processus de réparation du DNA génomique(Fig :8).

Fig8 : Rôle des ligases

IV. LES PROTEINES DE LA REPLICATION

Chez les procaryotes

- La protéine Dna A: ouvre la double hélice. - lication. - Les protéines SSB: stabilisent les ADN simple brin . Notion de réplicon.

origine où est initiée la réplication et une terminaison où est arrêtée la réplication.

réplication peut progresser soit de manière unidirectionnelle, soit de manière bidirectionnelle. Chez les procaryot de réplication), la réplication progresse dans les deux sens. On compare souvent

ève.

. Initiation de la réplication. de bases. Cette séquence contient en tandem - trois séquences nucléotidiques presque identiques constituées de 13 nucléotides chacunes (séquences de type GATCTNTTNTTTT). - quatre sites de liaison comportant un motif de 9 paires de bases (DNA-boxes) pour réplication, codée par le gène dnaA. Ces séquences sont appelées 9mères et 13mères. -unités de DnaA se lient aux 9mères. Cette étape est indispensable à la transformation Cette étape facilite la liaison des protéines DnaB et DnaC qui ouvrent et déstabilisent ne dnaB, ou hélicase réplicative) est codée par le gène dnaB. La protéine appelée dnaC est indispensable à cette étape, elle sera ensuite relâchée. lagging). Elle forme un hé-unités simple brin grâce à la fixation de protéines appelées SSB (pour " single strand binding »). Ces protéines SSB enzyme appelé réplication. Le complexe de protéines qui se déplace le long de l'ADN pour catalyser la réplication est appellé réplisome. ADN : brins l utilisant té de manière anti- discontinu de ce brin retardé se fait dans le sens de la propagation de la réplication. Il est important de comprendre que le brin qui sert de matrice de lecture pour la constitution du bri copie au niveau de c retardé; de manière discontinue. -polymérase III. -OH d'ADN polymérase III comporte 10 polypeptides (2X5 sous unités protéiques). La même enzyme synthétise le brin avancé et les fragments discontinus sur le brin retardé. Ce complexe est organisé en trois modules fonctionnels comprenant : * Le core enzyme : - sous-unité Į fait 130 000 Da (activité polymérase), - sous-unité İ (activité exonucléase 3-5)quotesdbs_dbs44.pdfusesText_44
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