[PDF] Epidémiologie et génétique humaine de lulcère de Buruli





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Epidémiologie et génétique humaine de lulcère de Buruli >G A/, i2H@yRk9N83y ?iiTb,ffi?2b2bX?HXb+B2M+2fi2H@yRk9N83y

Zm2MiBM oBM+2Mi

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Année 201

Pour obtenir le grade de

>[hE/sZ^/dWZ/^^Zd^

Discipline

o[µoOEµOEµo] (Membre d'honneur) 1

Sommaire

Etat des connaissances

M. ulcerans

M. ulcerans, une maladie vectorielle ?

M. ulcerans

L'analyse du gĠnome de M. ulcerans

M. ulcerans

M. ulcerans

objec

EpidĠmiologie de l'UB

EpidĠmiologie de l'UB

EpidĠmiologie de l'UB

Diagnostic et prise en charge de l'UB au CDTUB de Pobğ 2 surreprĠsentĠ parmi les cas adultes d'UB la sĠǀĠritĠ de l'UB

EpidĠmiologie de l'UB

Collection des données cliniques et biologiques

Description de l'Ġchantillon primaire

MĠthodes d'identification

3 Structure de population ă l'Ġchelle mondiale

Structure de population ă l'Ġchelle locale

MĠthodes d'association

composantes principales d'ajustement SĠlection des SNPs pour l'Ġtude de rĠplication 4

Table des illustrations

M. tuberculosis, M. leprae M.

M. ulcerans

M. ulcerans

M. ulcerans

M. ulcerans

M. ulcerans M. marinum mais a subi une évolution réductrice

M. ulcerans

M. ulcerans

M. ulcerans

s cas d'UB en fonction de l'annĠe du diagnostic (A), du mois du diagnostic (B) et du statut de confirmation par examen complémentaire (C) impact de l'ąge au diagnostic

Figure 27. Impact du dĠlai d'edžtraction et de la tempĠrature de conservation sur le rendement et

l'intĠgritĠ de l'ADN ͗ conditions de laboratoire

Figure 28. Impact du dĠlai d'edžtraction et

l'intĠgritĠ de l'ADN ͗ conditions de terrain Figure 30. Alignement des noms et prĠnoms par l'algorithme BLAST. Figure 33. Principe de l'assignation de génotypes par puce à ADN Figure 34. Principe de l'imputation de gĠnotypes 5 ͗ identitĠ par Ġtat et ACP ă l'Ġchelle mondiale

͗ ACP ă l'Ġchelle locale

7

C'est l'action de se frayer un passage

j'ai des doutes, est-

C'est marrant,

in >[ˆµÀOEµv}]OE

Marguerite Yourcenar

9

Remerciements

J'ai passĠ en tout et pour tout deudž ou trois petites semaines ă Pobğ rĠparties en deudž sĠjours en juin

Laurent a instauré la confiance, je crois, en prenant à sa charge, semaine après semaine, le diagnostic

à Angers des suspicions d'ulcğre de Buruli vus à Pobè. Incroyable et fidèle collaboration

la réalisatimon sens, c'est cette confiance , d'aǀoir ĠcoutĠ et acceptĠ notre projet. Merci données qui étaie l'incertain nous aǀoir hĠbergĠs ă Onigbolo. J'ai ainsi ĠtĠ initiĠ conjointement une photo des hauts 10

Camille Dantec, qui a su faire face certaines semaines aux envois massifs des journées de

, ă l'ambiance Merci audž membres de l'U550 deǀenue U980 puis U1163 de m'aǀoir ĠcoutĠ lors de mes

topos du vendredi. Autre grande angoisse de ma thèse que ces mises à nues tous les trois ou quatre

Laurent Casanoǀa, Laurent Abel et Aledžandre AlcaŢs de m'aǀoir donnĠ une place au laboratoire

l'ENS et comme passer de

Merci de m'aǀoir permis de tant ǀoyager au cours de ma thğse, sur le terrain ou en congrğs, au

Bénin, au Vietnam, en Inde, au Canada, aux Etats m'ont écouté 11 partagée vivre plusieurs mois dans un autre laboratoire de génétique épidémiologique 'avoir Merci ă elle de m'aǀoir accueilli ă l'U946 en 2009. S calendairesMerci ă Eric Comte d'aǀoir 12 Merci ă Etienne Patin d'aǀoir acceptĠ d'ġtre examinateur de ma thèse. n'a de sens sinon ă la lumiğre de l'Ġǀolution dit- d'une pierre deudž coups, u[explique et d'Ġleǀeur Merci ă Bernard Carbonnelle d'aǀoir [}quotesdbs_dbs29.pdfusesText_35
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