[PDF] Untitled 30 juin 2017 Salon de

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Sommaire

Sommaire .............................................................................................................................................. 2

Mot du Directeur ................................................................................................................................... 7

Organigramme ..................................................................................................................................... 13

1. Présentation des entités ................................................................................................................... 15

Direction Scientifique .................................................................................................................................. 16

Direction Administrative et Financière ........................................................................................................ 19

Unité de Bactériologie Expérimentale ......................................................................................................... 23

UnitĠ d'Entomologie MĠdicale.................................................................................................................... 26

Unité d'Épidémiologie ................................................................................................................................. 31

Unité des Helminthiases .............................................................................................................................. 39

UnitĠ d'Immunologie des Maladies Infectieuses........................................................................................ 41

Unité des Mycobactéries ............................................................................................................................. 46

Unité Peste .................................................................................................................................................. 50

Unité de Recherche sur le Paludisme .......................................................................................................... 56

Unité de Virologie ........................................................................................................................................ 60

G4 Malaria Group ........................................................................................................................................ 65

Centre de Biologie Clinique ......................................................................................................................... 68

Laboratoire d'Hygiğne des Aliments et de l'Enǀironnement..................................................................... 71

Service Médical ............................................................................................................................................ 75

Service Qualité ............................................................................................................................................. 77

Cellule Communication ............................................................................................................................... 79

2. Activités de recherche ...................................................................................................................... 83

Entomo-coustani ......................................................................................................................................... 84

Entomo-Evalkartman ................................................................................................................................... 86

Entomo-flea-bio ........................................................................................................................................... 89

Entomo-flea-pop ......................................................................................................................................... 90

Entomo-flea-phylo ....................................................................................................................................... 92

Entomo-infect .............................................................................................................................................. 94

Entomo-MALDI ............................................................................................................................................ 96

Entomo-resist .............................................................................................................................................. 99

-WN ............................................................................................................................................... 101

Entomo-G4-CV2 ......................................................................................................................................... 103

Entomo-G4-RESIN ...................................................................................................................................... 105

Entomo-G4-RMT ........................................................................................................................................ 107

EPI-CAPM ................................................................................................................................................... 109

EPI-CQ TDR ............................................................................................................................................... 111

EPI-ENISM 2014 ......................................................................................................................................... 113

EPI -EVA AC .............................................................................................................................................. 115

EPI-GISVEC ................................................................................................................................................. 117

EPI-i-CCM ................................................................................................................................................... 119

EPI-MALINEA .............................................................................................................................................. 122

EPI-MOPPRAM ........................................................................................................................................... 124

EPI-PECADOM + ......................................................................................................................................... 126

EPI-PTR 558 - MICROBIOME ...................................................................................................................... 128

EPI-QSM ..................................................................................................................................................... 131

EPI- SENTFI ................................................................................................................................................. 134

EPI-SSDS ..................................................................................................................................................... 137

Helminthiases-Taenia ................................................................................................................................ 139

IMI -AFRIBIOTA - ImmunoHealth ............................................................................................................. 141

IMI-Cysti-Antanifotsy ................................................................................................................................. 144

IMI-Cysti-Ifanadiana .................................................................................................................................. 147

IMI-CystiDiag ............................................................................................................................................. 150

IMI-LeptoDiag ............................................................................................................................................ 154

IMI-PaluSéro .............................................................................................................................................. 157

IMI-PaluVivax ............................................................................................................................................. 160

Palu- Gametocyte ...................................................................................................................................... 163

Palu-HTC .................................................................................................................................................... 165

Palu-Plante-VITRO ..................................................................................................................................... 167

Palu-Plante-VIVO ....................................................................................................................................... 169

Peste-ASM-MJG ......................................................................................................................................... 171

Peste-ATB® ................................................................................................................................................ 173

Peste-FAS ................................................................................................................................................... 175

Peste-IPM .................................................................................................................................................. 177

Peste- LAMP............................................................................................................................................... 179

Peste-LEPTO ............................................................................................................................................... 181

-PAMM .............................................................................................................................................. 183

Peste-PRIZM .............................................................................................................................................. 185

Peste-SELV ................................................................................................................................................. 187

Peste- TANA ............................................................................................................................................... 189

Peste- VOCs ............................................................................................................................................... 191

TB-Mada-Xpert .......................................................................................................................................... 193

TB-Clin-Divers ............................................................................................................................................ 195

TB-Genom .................................................................................................................................................. 197

TB-KIDS ...................................................................................................................................................... 198

TB-SLIDE ..................................................................................................................................................... 201

TB-Prot_Inh ................................................................................................................................................ 203

UBE-BIRDY ................................................................................................................................................. 205

UBE-ChART ................................................................................................................................................ 209

UBE-CHILD's PLAY...................................................................................................................................... 212

UBE-Kpn ..................................................................................................................................................... 215

UBE-LAMP .................................................................................................................................................. 217

Viro-EV-A71 ............................................................................................................................................... 220

Viro-Hanta-MADOI .................................................................................................................................... 222

Viro-HepMada ........................................................................................................................................... 224

Viro-Immuno-POL ...................................................................................................................................... 226

Viro-NeoVac ............................................................................................................................................... 228

Viro-POLIO-ASIDE ...................................................................................................................................... 230

Viro-RIFT-Mada .......................................................................................................................................... 232

Viro-SARI Burden ....................................................................................................................................... 235

Viro-SEROMADA ........................................................................................................................................ 237

Viro-Switch-bOPV ...................................................................................................................................... 239

Viro-Zika ..................................................................................................................................................... 241

3. Activités de Santé Publique ............................................................................................................ 243

Centres et Laboratoires de Références ................................................................................................ 244

Helminthiases-LCB ..................................................................................................................................... 244

Peste-CCOMS ............................................................................................................................................. 246

Peste-LC ..................................................................................................................................................... 248

TB - CNRM .................................................................................................................................................. 250

Viro-CNR Arbovirus_SurvArbo ................................................................................................................... 253

Viro-CNR grippe_SurvGIR .......................................................................................................................... 255

............................................................................................................................................ 259

Viro-LNR Polio-SurvPFA ............................................................................................................................. 261

Viro-LNR Rougeole-SurvéRo ...................................................................................................................... 263

Autres activités de Santé Publique ...................................................................................................... 265

Entomo-Indicateurs ................................................................................................................................... 265

Entomo-bednet ......................................................................................................................................... 267

Entomo-chlorfenapyr ................................................................................................................................ 268

Palu-Diagnostic .......................................................................................................................................... 270

Palu-MIS2016 ............................................................................................................................................ 272

Palu-P.ovale ............................................................................................................................................... 275

Palu-RDTY HTC ........................................................................................................................................... 277

SM-CTAR .................................................................................................................................................... 281

SM-CVI ....................................................................................................................................................... 283

Viro-SuDIRA ............................................................................................................................................... 286

4. Laboratoires de services ................................................................................................................. 287

CBC ............................................................................................................................................................. 288

CBC- LACP .................................................................................................................................................. 295

LHAE ........................................................................................................................................................... 301

5. Services supports ........................................................................................................................... 303

SceQual-AQ ................................................................................................................................................ 304

SceQual-HSE .............................................................................................................................................. 306

SceQual-MET ............................................................................................................................................. 307

SM-DISP ..................................................................................................................................................... 309

6. Formation ...................................................................................................................................... 311

Thèses de sciences..................................................................................................................................... 311

Thèses d'exercice (médecine, pharmacie, vétérinaire, dentisterie) ......................................................... 313

Master 2, Master pro, DEA & equivalent .................................................................................................. 314

Internat qualifiant ...................................................................................................................................... 316

Autres stages ............................................................................................................................................. 316

Accueil de volontaire international ........................................................................................................... 320

Accueil de missionnaires en collaboration ou de délégations étrangères ................................................ 320

Formations données .................................................................................................................................. 321

Formations reçues ..................................................................................................................................... 323

Appartenanceͬparticipation ă des groupes ou comitĠs d'edžperts nationaudž........................................... 327

Appartenanceͬparticipation ă des groupes ou comitĠs d'edžperts ................................... 328

.................................................................................................................................... 330

7. Productions scientifiques ................................................................................................................ 332

Publications ............................................................................................................................................... 332

Communications orales ............................................................................................................................. 338

Communications affichées ........................................................................................................................ 341

Mot du Directeur

depuis 1898, l'Institut

Au 31 dĠcembre 2016, l'IPM compte 570 personnes dont 97й de nationalitĠ malgache. Parmi e 25 sont

des chercheurs statutaires nationaux, et, plus de 30 médecins, pharmaciens ou ingénieurs, ont une activité

dans le domaine de la recherche. Parmi les expatriés, six sont des experts techniques internationaux du

Ministère français des affaires étrangères et du développement international, quatre du personnel mis à

disposition par l'Institut Pasteur ă Paris, et une chercheuse du CIRAD (Centre de coopération

internationale en recherche agronomique pour le développement) hĠbergĠe ă l'IPM.

L'objectif de l'IPM est de contribuer ă la prĠǀention et au traitement des maladies et au dĠǀeloppement

he, de formation et de santé publique.

Les principales thématiques de rechercheconcernent différents problèmes de santé publique à Madagascar

Ces thématiques notamment celles relatives à des agents pathogènes ayant un cycle complexe faisant

interǀenir l'homme, un animal et un arthropode ou un mollus, ne peuvent être abordées que grâce à la

complémentarité de ses équipes pluridisciplinaires (entomologiste, médecin, vétérinaire, immunologiste,

l'enfant ă traǀers des tudes sur les infections du jeune enfant, la malnutrition ou la vaccination (BIRDY,

MALINEA, AFRIBIOTA, NEOVAC, PERILIC).

Les activités de recherche ont été valorisées en 2016 par 45 articles publiés par des scientifiques affiliés à l'IPM

nternationales référencées à comité de lecture dont 20 en tant que premier ou dernier auteur.

Simultanément à leurs activités de recherche, les laboratoires sont engagés dans des activités de santé

poliomyélite, (ii) pour la rougeole et la rubéole, reconnus par l'OMS; x de référence pour, le choléra - les salmonelles et les shigelles, les mycobactéries ; ) la

rage, (iii) l'analyse des eaudž dans les istries agro-alimentaires et de contrôle des denrées animales ou

d'origine a

référence des mycobactéries, le Laboratoire central de la peste, le Laboratoire central de la bilharziose.

Enfin l'IPM, toujours d

L'IPM propose Ġgalement des activités de servicesau bénéfice de la population à travers : le Centre de

d'accrĠditation pour la microbiologie des aliments et le centre de ǀaccinations internationales.

L'IPM mğne activités de formationen participant à différents enseignements

UniǀersitĠs d'Antanarivo (faculté de médecine et de pharmacie, faculté des sciences) et de Toliara et en

accueillant de nombreux stagiaires dont 25 thésards en sciences.

Ressources humaines

6. Celle-ci aǀait assurĠ l' de la

Direction de l'Institut Pasteur de Madagascardepuis janvier 2016.

Dans les unités de recherche, Mme Laurence Baril et M. Romain Girod ont succédé respectivement à

Sept jeunes scientifiques ont intégré le corps des Personnels scientifiques de recrutement local (PSRL) de l'IPM

nationaux au sein de la région Afrique-Océan Indien du RIIP.

La reconnaissance de la qualité des jeunes chercheurs malgachesa été mise en relief par le prix reçu par

Mme Elisabeth Raǀaoarisoa de l'UnitĠ de recherche sur le paludisme pour ses traǀaudž noǀa

mieudž Ġǀaluer la transmission du paludisme. Elle s'est ǀue remettre en octobre 2016, le pridž Robert Deschiens

En juin 2016, la Cellule de rĠalisation de projets de l'UnitĠ d'ĠpidĠmiologie s'est autonomisĠe en deǀenant

Partenariat scientifique sur la bilharziose avec le Japon

L'IPM a reĕu du 12 au 19 juin une dĠlĠgation de la Dokkyo Medical Uniǀersity au Japon menĠe Yuichi

Chigusa qui devrait déboucher sur un partenariat scientifique dans le domaine de la bilharziose. Epidémie de peste à Befotaka (sud-est de Madagascar)

d'inǀestigation de l'ĠpidĠmie de peste ă Befotaka dans le sudest du pays. Dans des conditions rendues

particulièrement délicates du fait des grandes difficultĠs d'accğs de cette rĠgion enclaǀĠe et sa dangerosité

liée à la présence des " dahalo » (voleurs de bétail), nos équipes en collaboration étroite avec celles du

Ministère de la santé publique ont réalisé leur difficile mission au profit des populations de cette région.

Le LHAE a initiĠ un projet aǀec le Ministğre auprğs de la PrĠsidence en charge de l'Agriculture et de l'Eleǀage.

de Madagascar en facilitant les exportations des denrées alimentaires et sera utile à la santé des populations

en permettant de détecter les aliments dangereux.

Cours de bactériologie médicale : " Approches moléculaires pour la bactériologie médicale en Afrique »

L'UnitĠ de BactĠriologie edžpĠrimentale a organisĠ du 14 au 25 noǀembre un cours rĠunissant 20 biologistes:

10 de Madagascar et 10 du continent Africain.

La deuxième édition de ce cours théorique et pratique visait à étudier les principales infections bactériennes

contagieuses par pathologie d'organes (infections intestinales, respiratoires et méningées) et expérimenter le

diagnostic et le typage de bactéries pathogènes prévalentes sur le continent africain et dans l'OcĠan Indien. Il

Premier colloque francophone en anthropologie de la santé des femmes et des enfants santé des femmes et des enfants. Village de la Francophonie (21-27/11) où a pu être

accueilli Monsieur le Président de la République de Madagascar, et en organisant quelques jours plus tôt à la

fin octobre, la 1édition des JournĠes Portes Ouǀertes de l'IPMau profit de 200 élèves du Collège

d'Enseignement GĠnĠral.

L'IPM a eu l'honneur de receǀoir deudž pridž Nobel de mĠdecine. Le Pr Franĕoise BarreSinoussi co-découvreuse

du ǀirus de l'immunodĠficience humaine Ġtait prĠsente ă l'Institut dans le cadre du lancement du projet

bel de médecine pour ses travaux montrant le lien entre infection et ulcère gastrique a effectuĠ une ǀisite de l'Institut le 17 juin.

qui chaque année se réunit pour évaluer les scientifiques du CERMES au Niger, du Centre Pasteur du

Cameroun, de l'Institut Pasteur de Bangui, de l'Institut Pasteur du Cambodge, de l'Institut Pasteur de Dakar et

Aménagements et infrastructure

L'atelier de lancement d'AFRIBIOTA a ĠtĠ l'occasion d'une rĠnoǀation importante de la Salle de conférence de

Pour conclure

L'Institut Pasteur de Madagascar a, une fois de plus en 2016 et comme le détaillent les pages suivantes de ce

rapport, prouvé son efficacité dans la lutte contre les maladies infectieuses et son engagement au profit de la

protection de la santé des populations de Madagascar en collaboration étroite avec le Ministère de la santé

publique.

Cependant 2016 a été la troisième année consécutive où les comptes de l'IPM ont ĠtĠ dĠficitaires. Une

de notre Institut, trop tributaire de ses recettes

sur fonds propres, doit être diversifié. Des financements complémentaires doivent être recherchés pour

i et son soutien financier peut-être au-delà même de celui prévu par certaines

dispositions de la convention de 1961.

Dr André SPIEGEL

-de-Grâce

Directeur de l'Institut Pasteur de Madagascar

7, 8, 9 mars 2016

14, 15, 16 mars 2016

18 mars 2016

ă l'IPM

1er avril 2016

19 au 22 mai 2016

9 juin 2016 Doter Madagascar d'un laboratoire dĠdiĠ

9 juin 2016

14 juin 2016

12 au 19 juin 2016

28 juin 2016

Nationale sur l'Iode et le Sel ă Madagascar)

5 au 7 juillet 2016

23 août 2016

23 septembre 2016

7 octobre 2016

20 et 21 octobre 2016 Ġdition ă l'UniǀersitĠ d'Antananariǀo

27 et 28 octobre 2016 Portes ouǀertes de l'IPM audž collĠgiens

8 novembre 2016 Visite d'une DĠlĠgation de la Direction GĠnĠrale des Douanes

14 au 25 novembre 2016

14 novembre 2016 l'Ambassadeur des Etats

21 au 25 novembre 2016

21 au 27 novembre 2016 Stand de l'IPM au Vi

26 et 28 novembre 2016 , secrĠtaire d'Etat

ConfĠrences de l'IPM en 2016

Pr Marcel TANNER, " Promouvoir

la santĠ de l'enfant dans les pays ă bas reǀenus, une approche globale». Symposium Afribiota, 08/03/2016

Dr Val CURTIS, tale, London School of Hygiene and Tropical

Medicine, Royaume-Uni. " Comment promouǀoir l'hygiğne dans les comportements de la mğre et de l'enfant

». Symposium Afribiota, 08/03/2016

Pr David COHENrtement de Psychiatrie de l'Enfant et de l'Adolescent, Hôpital Pitié peut affecter cognition et comportement ? ». Symposium Afribiota, 08/03/2016

Dr Joël DORE, Directeur de recherche et directeur dΖunitĠ adjoint de l'UnitĠ Microbiologie de lΖalimentation au

Microbiote,

nutrition et santé ». Symposium Afribiota, 08/03/2016

Pr Andrew MACPHERSON,

͞Les Ġtapes clefs du dĠǀeloppement du systğme immunitaire des nourrissions et des jeunes enfants".

, 08/03/2016

Dr Holy RAOBELINA, Coordonnateur National de l'Office National de Nutrition, Madagascar. ͨUn programme

pour amĠliorer la nutrition de l'enfant ă Madagascar». Symposium Afribiota, 08/03/2016 Pr. Peter SMALLGlobal Health Institute - Stony Brook University - New York, USA. ͞Moder

Dr. Nicolas MARILLEAU,Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Unité Mixte Internationale de

de phénomènes spatialisés illustrés par l'exemple : application ă lΖĠpidĠmiologie",

Dr Philippe GLASER,Unité Ecologie et Evolution de la Résistance aux Antibiotiques, Institut Pasteur à Paris,

" CRISPR : un système bactérien d'immunité innée appliqué au typage et à la biologie synthétique »,

31/05/2016

Mr. Benjamin RICE, Ġtudiant en thğse ă lΖUniǀersitĠ de Haǀard, ͞Notes on the Ecology and Eǀolutionary

um in Northeastern Madagascar",

Dr METCALF Jessica

Dr. Nathalie JOLLY slationnelle à

l'Institut Pasteur, Paris. Soutien à la recherche clinique auprès des porteurs de projets : exemple du modèle

parisien, 23/11/2016

Dr. Fabien TAIEB, Centre de Recherche Translationnelle et UnitĠ d'EpidĠmiologie des Maladies Emergentes,

Initiative INCREASE : International Network Clinical ResEArch Sustainable InitiativEs,

23/11/2016

Pr WAGNER David M.,Northern Arizona University, Department of Biological Sciences, Associate Director -

Pathogen and Microbiome Institute, ͞Molecular study on plague in Madagascar͗ more than 15 years of

research between NAU and IPM"/12/2016

Organigramme

1. PrĠsentation des entitĠs

La Direction scientifique : ses missions

nt les activités correspondent à ses missions qui sont respectivement : i) la ifiques, notamment les universités.

En matière de stratégie scientifique, la Direction scientifique appuie le Directeur dans la coordination de

projets institutionnels prioritaires comme le projet " Biobanque ͩ de l'IPM initiĠ dans le cadre de l'initiatiǀ

Pasteur Institutes Biobanking Network (PIBNet) du Réseau International des Instituts Pasteur.

Valorisation des activités de recherche

-cinq articles scientifiques ont été publiés dans des revues internationales dont 31 ayant un

Impact Factor х3, et 20 aǀec des chercheurs de l'IPM en premier ou dernier auteur. Yuaranteneuf

communications orales et 41 communications affichées ont été présentées à des conférences nationales ou

internationales.

Les figures 1 et 2 représentent une analyse bibliométrique sommaire des publications parues de 2012 à 2016.

0 5 10 15 20 25
30
35
40
45
50

20122013201420152016

4ème auteur et +

3ème auteur

2ème ou avt dernier

Dernier auteur

1er auteur

1er et Dernier auteur

Figure 1 : Distribution des articles publiĠs par les chercheurs de l'IPM en fonction de l'annĠe et du rang

Figure 2 : Distribution des articles publiĠs par les chercheurs de l'IPM en fonction de l'impact factor de la reǀue

-2016) de l'IPMest assurée par l'accueil de stagiaires, l'organisation de formations au niǀeau national (ateliers, cours), mais aussi à travers la participation des chercheurs à (Structure et Dynamique des Systèmes Vivants).

de recherche ă l'IPM. De plus, 5 salariĠs de l'IPM se sont inscrits dans des facultĠs Ġtrangğres dont 4 en thğse

Par ailleurs, l'IPM s'inǀestit da

Ainsi, l'IPM a mis en place depuis plusieurs annĠes une procĠdure de sĠlection de stagiaires en Master 2 de

candidatures de stages sont envoyés auprès des universités et écoles supérieures de Madagascar. En 2016, 18

étudiants ont été retenus après les épreuves de sélection pour des stages de Master 2 ou thğse d'edžercice

de science (PhD) ă l'IPM. Ainsi, 16 Ġtudiants ont pu en bĠnĠficier en 2016

bactériologie médicale " Approches moléculaires pour la bactériologie médicale en Afrique ». Ce Cours du

africains (République Démocratique de Congo, Sénégal, Seychelles, Maurice, Comores, Centrafrique, Maroc, et

Madagascar).

0 5 10 15 20 25
30
35
40
45
50

20122013201420152016

шϭϬ 5-9,994-4,993-3,99

2-2,991-1,99<1

, deux types de conférences sont organisĠes ă l'IPM:

parlures ͩ, confĠrences internes hebdomadaires dont l'objectif est double: i) former les chercheurs

et les étudiants à la communication orale et ii) partager des résultats de recherche. En 2016, 36 parlures et 6 confĠrences de l'IPM ont ĠtĠ faites.

Les perspectives pour 2017

Les analyses des données générées par les différentes études en santé publique et les projets de recherche

Dr Voahangy RASOLOFO, PhD, HDR

de l'Institut Pasteur de Madagascar

La Direction Administratiǀe et Financiğre (DAF) concourt ă la bonne marche de l'Institut en assurant ă

Activités I.

et les quatre cellules suivantes : vre la comptabilité générale, la comptabilité fournisseurs, la comptabilité clients, la comptabilité analytique, la trésorerie. paie.

des Achats (SAC), dont le rôle est de rationaliser, optimiser les achats et sécuriser les procédures.

ns de réceptions. Il a également la responsabilité de

l'ensemble des opĠrations douaniğres pour les produits et matĠriels importĠs. Il coordonne Ġgalement

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