[PDF] Synthèse de lactivité des plateformes hospitalières de génétique

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Synthèse de l"activité

des plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers en 2012, en vue d"optimiser leur évolutionJANVIER 2014

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Bilans d"activité &d"évaluation

SYNTHÈSE DE L"ACTIVITÉ 2012

POUR LES TESTS MOLÉCULAIRES

DANS LES CANCERS

LES TESTS DÉTERMINANT

L"ACCÈS À UNE THÉRAPIE CIBLÉE

ÉVALUATION DE LA QUALITÉ

DES ANALYSES

BASES DE DONNÉESwww.e-cancer.fr

SYNTHÈSE DE L"ACTIVITÉ DES PLATEFORMES HOSPITALIÈRES DE GÉNÉTIQUE MOLÉCULAIRE DES CANCERS EN 20122

CE DOCUMENT S"INSCRIT DANS LA MISE EN OEUVRE

DU PLAN CANCER 2009-2013.

Mesure 21

Garantir un égal accès aux traitements et aux innovations. Actions 21.2 Développer les plateformes de génétique moléculaire des cancers et l"accès aux tests moléculaires.

Ce document doit être cité comme suit : ©Synthèse de l"activité des plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers en 2012, en vue

d"optimiser leur évolution. Collection Bilans d"activité et d"évaluation, ouvrage collectif édité par l"INCa, Boulogne-Billancourt, janvier 2014.

Il peut être reproduit ou diffusé librement pour un usage personnel et non destiné à des fins commerciales ou pour des courtes

citations. Pour tout autre usage, il convient de demander l"autorisation auprès de l"INCa en remplissant le formulaire de

demande de reproduction disponible auprès du département communication institutionnelle de l"INCa à l"adresse suivante :

diffusion@institutcancer.fr

Agence sanitaire et scientifique de référence dédiée au cancer, l"Institut national du cancerstimule, soutient et

met en oeuvre une politique coordonnée de lutte contre la maladie. Créé par la loi de santé publique du 9 août

2004, l"INCa regroupe environ 150 collaborateurs en quatre entités opérationnelles : Recherche et innovation,

Santé publique et soins, Recommandations et qualité de l"expertise, Communication et information.

Ce document est téléchargeable sur le site:

www.e-cancer.fr ONT PARTICIPÉ À L"ÉLABORATION DE CE RAPPORT : ?Étienne LONCHAMP, département biologie, transfert et innovations, direction de la recherche et de l"innovation, INCa

?Frédérique NOWAK, responsable du département biologie, transfert et innovations, direction de la

recherche et de l"innovation, INCa

BILANS D'ACTIVITÉ ET D'ÉVALUATION

Ź Synthèse de l'activité des plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers en 2012

3T

TêBLETDESTMêTI»REST

1.2.1.Cancerdel'estomac-

BILANS D'ACTIVITÉ ET D'ÉVALUATION

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4T

BILANS D'ACTIVITÉ ET D'ÉVALUATION

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5T

FêITSTMêRQUêNTST

T T

28 plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers sont soutenues par

l'INCa et la DGOS depuis 2006 et réparties sur tout le territoire. Elles regroupent plusieurs laboratoires, pouvant appartenir à des établissements différents, permettant d'offrir aux patients l'ensemble des techniques de génétique moléculaire indispensables pour toutes les pathologies concernées. Elles mettent en oeuvre des examens moléculaires innovants dès que ceux-ci s'avèrent indispensables pour les patients.

78 000 tests déterminants pour l'accès à une thérapie ciblée ont été réalisés en 2012

pour 63 000 patients répartis comme suit :

PathologieTBiomarqueursTNombreTdeTtestsT

CancerTduTseinTTAmplification d'HER2 8 853

Cancer de l'estomac Amplification d'HER2 648

Cancer colorectal Mutations de KRAS 18 568

GIST

Mutations de KIT 925

MutationsTdeTPDGFRA 860

Cancer du poumon

Mutations d'EGFR 22 359

TranslocationTdíALK 13 801

Mélanome Mutation de BRAF V600 4 629

Leucémies

Translocation de BCR-

êBL 6 677

MutationsTdíABL 836

TOTAL PATIENTS uqTutzT

T

3 campagnes d'évaluation externe de la qualité ont été réalisées en 2012 dans les 28

plateformes pour : La détection et la quantification de BCR-ABL dans les leucémies ; La recherche de mutations d'EGFR dans le cancer du poumon ; La recherche de mutations de KRAS dans le cancer colorectal. Deux bases de données (BIOMARQUEURS France et MELBASE) sont soutenues par l'INCa pour collecter les données moléculaires en lien avec les données épidémiologiques, cliniques, histologiques, thérapeutiques et de suivi des patients dans le cancer du poumon et le mélanome.

BILANS D'ACTIVITÉ ET D'ÉVALUATION

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LEXIQUET

T êMMTT TAutorisation de mise sur le marché d'un médicament ATU Autorisation temporaire d'utilisation d'un médicament CGHarray Comparative genomic hybridization/puce d'hybridation génomique comparative

CH Centre hospitalier

CHRU Centre hospitalier régional universitaire

CHU Centre hospitalier universitaire

CISH chromogenic in situ hybridization/hybridation in situ chromogénique

CLCC Centre de lutte contre le cancer

CNAMTS Caisse nationale d'assurance maladie des travailleurs salariés

EEQ Évaluation externe de la qualité

EMA European Medicament Agency/Agence Européenne du Médicamment FISH Fluorescent in situ hybridization/hybridation in situ par fluorescence GBMHM Groupe des biologistes moléculaires des hémopathies malignes GIST Gastro-intestinal stromal tumor/tumeur stromale gastro-intestinale GMFmel Groupe multidisciplinire français du mélanome cutané

HIS Hybridation in situ

IFCT Intergroupe francophone de cancérologie thoracique

IHC Immunohistochimie

ITK Inhibiteur de tyrosine kinase

LAL Leucémie aiguë lymphoblastique

LAM Leucémie aiguë myéloblastique

LLC Leucémie lymphoïde chronique

LMC Leucémie myéloïde chronique

LNH Lymphome non hodgkinien

NABM Nomenclature des actes de biologie médicale

OMS Organisation mondiale de la santé

PMSI Programme de médicalisation des systèmes d'information

SMD Syndrome myélodysplasique

SMP Syndrome myéloprolifératif

STIC Soutien aux techniques innovantes et coûteuses

BILANS D'ACTIVITÉ ET D'ÉVALUATION

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7T

Figure 1. Situation des 28 plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers

Colmar

Reims Nancy

StrasbourgLille

Dijon

Montpellier

GrenobleBesanÁon

StmTEtienne

LyonRouen

NantesCaen

Limoges

Poitiers

Marseille

Bordeaux

Clermontl

Ferrandêngers

NiceRennes

Brest

Toulouse

VersaillesêPlHP

IGR Tours

êmiens

OrlÈansMulhouse

NÓmesCurie

LaTRÈunion

BILANS D'ACTIVITÉ ET D'ÉVALUATION

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8T T

INTRODUCTION

L'identification d'altérations génétiques au sein des cellules cancéreuses a permis la mise en

évidence de nouveaux biomarqueurs moléculaires. Ces paramètres sont aujourd'hui indispensables pour le diagnostic, la classification, le choix et la surveillance du traitement d'un nombre croissant de cancers. L'analyse de ces biomarqueurs doit donc être accessible à tous les patients, quel que soit l'établissement de santé dans lequel ils sont pris en charge. Afin d'anticiper ce besoin sanitaire émergent, l'INCa a mis en place un programme spécifique

dès 2006 pour soutenir la structuration de la génétique moléculaire. Deux appels à projets

nationaux INCa ont été conduits en 2006 et 2007 afin de structurer ce dispositif. On compte

28 plateformes de génétique moléculaire des cancers réparties sur l'ensemble du territoire

(Fig. 1). Les plateformes regroupent plusieurs laboratoires pouvant appartenir à des établissements différents, permettant d'offrir aux patients l'ensemble des techniques indispensables de génétique moléculaire pour toutes les pathologies concernées. Les plateformes ont pour vocation de réaliser les tests moléculaires pour l'ensemble des

patients de la région, quel que soit l'établissement où ils sont pris en charge : CHU, CLCC, CH

ou établissements privés. Il s'agit d'organiser un maillage territorial suffisant pour que les prélèvements tumoraux parvenant dans les laboratoires habituels d'anatomopathologie ou d'hématocytologie puissent être pris en charge rapidement dans une plateforme avec laquelle il existe des liens organisés.

Elles ont pour mission de réaliser des tests moléculaires qui selon leur nature contribuent à :

participer au diagnostic, en complémentarité de paramètres cliniques, morphologiques et biologiques ; orienter le processus diagnostique ; déterminer l'accès à une thérapie ciblée ; orienter la stratégie de traitement du patient ; permettre le suivi de la maladie résiduelle. Actuellement, les plateformes disposent d'un catalogue de 60 tests dont certains sont

déterminants pour l'accès à des thérapies ciblées existantes ou en cours de développement.

Le tableau 1 présente la liste des marqueurs effectués par les plateformes de génétique

moléculaire en fonction de leur rôle dans la prise en charge des patients. Elles reçoivent des

financements de l'INCa et de la DGOS pour la réalisation de ces tests moléculaires.

Par ailleurs, afin d'anticiper l'arrivée des nouvelles molécules et de les rendre disponibles le

plus rapidement possible, l'INCa a mis en place un programme de détection prospective des biomarqueurs émergents dans le cancer du poumon, dans le cancer colorectal et dans le mélanome depuis 2010. Il s'agit, pour les patients atteints d'un cancer du poumon chez lesquels la mutation de l'EGFR doit être cherchée chaque année, de rechercher aussi les mutations des gènes KRAS, BRAF, PI3KCA et HER2, ainsi que la translocation du gène ALK. Outre les mutations du gène KRAS, la mutation du gène BRAF et l'instabilité des microsatellites (MSI), pour les patients de moins de 60 ans, sont aussi recherchées dans le cancer colorectal. Dans le mélanome, il s'agit de rechercher les mutations des gènes BRAF et KIT. Ce programme a pour objectif de permettre aux plateformes d'être immédiatement

opérationnelles le jour où des thérapies ciblées dirigées contre ces altérations deviennent

disponibles pour les patients.

BILANS D'ACTIVITÉ ET D'ÉVALUATION

Ź Synthèse de l'activité des plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers en 2012

9T T T T

BILANS D'ACTIVITÉ ET D'ÉVALUATION

Ź Synthèse de l'activité des plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers en 2012

10T Tableau 1. Catalogue des tests effectués par les plateformes de génétique moléculaire en 2012

CancerTduTseinTêmplificationTdeTHER2

PrescriptionTduTtrastuzumabTdansTleT

cancerTduTseinTmÈtastatiqueTetTenT adjuvantTdansTleTcancerTduTseinT prÈcoceT

PrescriptionTduTpertuzumabTenT

associationTavecTtrastuzumabTetT docetaxelTdansTleTcancerTduTseinT mÈtastatiqueT

PrescriptionTduTlapatinibTdansTleT

cancerTduTseinTmÈtastatiqueT

PrescriptionTduTtrastuzumabTdansTleT

cancerTgastriqueTmÈtastatiqueT

CancerTcolorectalT

mÈtastatiqueTMutationsTdeTKRAS Prescription du panitumumab et du cetuximab

TMutationsTdeTBRAF*

GISTTfGastrolIntestinalT

StromalTTumorgT

MutationTdeTKIT PrescriptionTdíimatinibT

MutationTdeTPDGFRA PrescriptionTdíimatinibT

CancerTduTpoumonTTMutationsTdíEGFR Prescription du gefitinib, d'erlotinib ou d'afatinib TranslocationsTdíALK Prescription de crizotinib

MutationsTdeTKRAS*

MutationsTdeTBRAF*

MutationsTdeTPI3KCA*

MutationsTdeTHER2*

MÈlanomeT

MutationsTdeTBRAF

PrescriptionTdeTvemurafenibTouTdeT

dabrafenibT

MutationsTdeTKIT*

T GlioblastomeTMÈthylationTdeTMGMT Sensibilité au temozolomide

LeucÈmieTmyÈloÔdeTchroniqueT

fLMCgTnT

LeucÈmieTaiguÎT

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