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  • Quel est la relation entre gène et protéine ?

    Les gènes indiquent à chaque cellule son rôle dans l'organisme. Sur leur ordre, les cellules synthétisent des protéines : c'est la traduction du code génétique. Nous produisons des dizaines de milliers de protéines. Chacune a un rôle différent à jouer dans notre organisme.
  • Comment on passe du gène à la protéine ?

    Si la cellule a besoin d'une certaine protéine, le gène de cette protéine est copié dans une sorte de molécule messagère, l'ARNm (acide ribonucléique messager). Ce processus de copie - appelé transcription - nécessite une enzyme spécifique, l'ARN polymérase.
  • Pourquoi le gène code pour une protéine ?

    De l'ADN aux protéines qui assurent la plupart des fonctions cellulaires, l'information contenue dans le génome subit une série de transformations. La transcription de l'ADN donne tout d'abord lieu à un pré-ARN, composé de segments qui codent pour des protéines (exons) et de segments non-codants (introns).
  • Ces protéines (Enzymes, protéines de structure, hormone,…) déterminent les caractères héréditaires qui s'expriment chez chaque individu. Ce qui rend généralement facile la distinction entre un individu et un autre de même esp? par la physionomie de chacun.

La relation gène-ARN-protéine permet de comprendre comment les informations génétiques portées par l'ADN aboutissent à la

production de protéines qui contrôlent en partie le phénotype des individus. Mais cette relation montre certaines complexités, comme par exemple :

- le gène qui code l'insuline, porté par le chromosome 11, est constitué d'une séquence de 1431 nucléotides. Or,

l'insuline est une protéine constituée d'une séquence de 55 acides aminés, séquence qui correspond donc à 165 nucléotides

et non pas à 1431 nucléotides !

- le génome est constitué d'environ 25000 gènes alors qu'un individu peut produire entre 250000 et un million de

protéines différentes !

Comment expliquer le décalage entre le nombre de nucléotides d'un gène et le nombre d'acides aminés

constitutifs de la protéine codée par ce gène ? Comment 25000 gènes environ peuvent coder un nombre beaucoup plus élevé de protéines ? Activité 1 - Un long gène pour l'hémoglobine ... mais une petite protéine !

L'hémoglobine est une protéine localisée dans les globules rouges où elle permet la fixation et le transport de l'O2. Cette

molécule est formée par l'association de quatre chaînes protéiques identiques deux à deux : deux chaînes alpha (globines alpha)

et deux chaînes bêta (globine β). Chaque chaîne de globine β est constituée de 147 acides aminés.

La synthèse de la globine β se réalise à partir du gène de cette protéine par les phénomènes de transcription, puis de traduction.

Cependant, l'étude de cette synthèse montre qu'il existe différentes molécules d'ARN produites au cours de cette synthèse :

- l'ARN prémessager (ARN-Prémessager) - l'ARN messager (ARNm-HB-Beta) - l'ARN messager codant (ARNm codant-Beta)

•On cherche à comprendre la diversité de ces molécules et leur place dans la synthèse de la globine β .

Les séquences de ces différentes molécules d'ARN ainsi que celle du gène de la protéine β sont contenues dans le fichier "HB-

Beta.edi » (dans le dossier TD9_GeneProtComplexe sur le groupe classe du réseau).

Stratégie (utilisation du logiciel Anagène)

1. comparer les différentes séquences entre elles avec deux fonctions différentes :

Utiliser la fonction " Comparer les séquences » (avec alignement des discontinuités)

Utiliser la fonction " dot-plot » (permet de repérer les parties totalement similaires entre deux séquences communes et de les

localiser)

2. déterminer la chronologie de formation de ces différentes séquences et les mécanismes qui se sont produits entre les

différents stades.

3. schématiser les étapes de la synthèse de la globine β depuis le gène de la globine β jusqu'à la protéine, en mettant en

évidence les modifications moléculaires successives qui se sont produites.

Remarque : vous disposez d'informations de comparaison entre les séquences en sélectionnant la ligne " traitement » dans la

fenêtre " comparaison avec alignement », puis en cliquant sur l'icône de la barre d'outils.

Activité 2 - Un même gène mais des protéines différentes !

Le gène CGRP est situé sur le chromosome 11. Il s'exprime dans les cellules C de la thyroïde où il code pour une hormone, la

calcitonine, intervenant dans la régulation de la calcémie (hormone hypocalcémiante). Ce même gène s'exprime aussi dans de

nombreux neurones du système nerveux central et périphérique où il code pour un neuromédiateur, le CGRP.

Calcitonine et CGRP ont des rôles physiologiques différents, mais leur synthèse se réalise à partir d'un même gène.

•Nous cherchons à comprendre comment un même gène, donc une même séquence de nucléotides de l'ADN, peut

permettre la synthèse de protéines différentes.

Pour proposer une explication, vous disposez d'un fichier CGRP.edi (dans le dossier TD9_GeneProtComplexe sur le groupe

classe du réseau) qui contient les séquences de plusieurs molécules, parmi lesquelles des exons qui sont des fragments des ARN

messagers : - le gène CGRP : GENE-CALCA.adn- l'ARN prémessager : ARN-Prémessager - l'ARNmessager1 : ARNm1-CGRP- l'exon1 : CGRP-Exon1 - l'ARNmessager2 : ARNm2-Calcitonine- l'exon2 : CGRP-Exon2 - l'ARN1 strictement codant : CDS-ARNm1-CGRP- l'exon3 : CGRP-Exon3 - l'ARN2 strictement codant : CDS-ARNm2-Calcitonine- l'exon4 : CGRP-Exon4 - la protéine issue de la traduction de l'ARN1strictement codant : Pro-CGRP- l'exon5 : CGRP-Exon5

- la protéine issue de la traduction de l'ARN2strictement codant : Pro-Calcitonine- l'exon6 : CGRP-Exon6

Conseils : adoptez une stratégie comparable à celle mise en oeuvre pour l'activité précédente !

Chapitre 2 : L'expression des gènes

TD9 - Relation complexe Gène/Protéine

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