[PDF] COR- Brochure coraf 104+couv OK_A4

View - Download COR- Brochure coraf 104+couv OK_A4

Previous PDF

Next PDF

Novembre 2011

RAPPORT FINAL ›Référence

Projet CORAF/WECARD -Labo d"excellence

4 Dr Nazaire K. Kouassi, Rapport Final - Evaluation des Capacités des Laboratoires Nationaux et Régionaux d"Afrique de l"Ouest qui pourraient servir de Centre d"excellence de la CEDEAO et du CORAF/WECARD en Biotechnologie et Biosécurité

© CORAF/WECARD 2012

Le CORAF/WECARD encourage l"utilisation équitable sans permission des informations publiées dans

le présent rapport à des fins de recherche agricole, de développement et d"éducation. Toute

référence doit se faire de façon appropriée. Les désignations utilisées dans la présentation des

informations publiées dans la présente publication n"impliquent de la part du CORAF/WECARD aucune

prise de position quant au statut juridique d"un pays, d"un territoire, d"une ville, d"une zone ou de leurs

autorités ni au tracé de leurs frontières ou limites.

CORAF/WECARD

7, Avenue Bourguiba

BP 48 CP, 18523 Dakar Sénégal

Email : secoraf@coraf.org

Site Internet : www.coraf.org

ISBN ...

Références photographiques: CORAF/WECARD

Référence

5

Cette étude a été commanditée par le CORAF/WECARD dans le cadre de la mise en place du " Plan

d"Action pour le Développement de la Biotechnologie et de la Biosécurité en Afrique de l"Ouest»

(PADBBAO). L"objectif global est de développer la biotechnologie agricole dans l"espace CEDEAO à

travers des centres d"excellence nationaux et régionaux spécialisés en biotechnologie et biosécurité.

Le PADBBAO a, en effet, défini explicitement comme action prioritaire à mener l"identification et le

développement des capacités des centres d"excellence opérant en Afrique de l"Ouest, et ce, conformément aux recommandations de la Conférence ministérielle de Ouagadougou.

Cette étude, initialement prévue pour une période d"un mois (septembre-octobre 2010), a connu un

retard dû au climat d"insécurité découlant de la crise politico-sociale qu"a vécue la Côte d"Ivoire

d"octobre 2010 à mai 2011. En outre, les événements liés aux élections présidentielles au Nigeria au

premier trimestre 2011 n"ont pas permis d"effectuer la visite des laboratoires présélectionnés dans ce

pays.

Nous exprimons notre gratitude au Secrétariat Exécutif du CORAF/WECARD, institution qui a initié et

commandité cette étude, pour son rôle déterminant dans la recherche et le développement

agricoles, et en particulier dans la promotion des biotechnologies en Afrique de l"Ouest et du Centre.

Nous adressons nos remerciements aux directeurs des institutions et aux responsables des laboratoires

visités pour leur disponibilité et leur compréhension.

Avant-propos

Projet CORAF/WECARD -Labo d"excellence

RAPPORT FINAL ›Avant-propos

Remarques

Lors de l"enquête dans les différents laboratoires, pour des raisons diverses, certains

aspects du questionnaire n"ont pas été renseignés comme il aurait fallu. Ainsi les résultats

exposés dans certains tableaux de ce rapport connaissent des insuffisances que nous corrigerons dès que les personnes-ressources des différents laboratoires concernés communiqueront les données manquantes.

RAPPORT FINAL ›SOMMAIRE

Projet CORAF/WECARD -Labo d"excellence

6

Avant-propos05

Résumé exécutif07

Liste des sigles10

Liste des tableaux12

Liste des figures12

I. CONTEXTE ET JUSTIFICATION 14

II. RAPPEL DE QUELQUES NOTIONS SUR LA BIOTECHNOLOGIE ET LA BIOSECURITE 16

2.1 Définition de la biotechnologie 16

2.2 Applications de la biotechnologie 16

2.3 Biosécurité : prévention et gestion des risques liés aux OGM 18

III. EVALUATION DES CAPACITES DE LABORATOIRES DE L"AFRIQUE DE L"OUEST EN MATIERE DE BIOTECHNOLOGIE ET DE BIOSECURITE 20

3.1 Problématique20

3.2 Méthodologie utilisée dans le cadre de l"étude 21

3.3 Résultats21

3.3.1 Domaines d"activités et spécialités des laboratoires 21

3.3.2 Activités en cours et techniques utilisées 24

3.3.3 Capacités en infrastructures et équipements techniques

des laboratoires 38

3.3.4 Capacités humaines des laboratoires

et encadrement d"étudiants 45

3.3.5 Aptitude à la production scientifique 51

3.3.6 Aptitude des laboratoires à la collaboration

nationale, régionale et internationale 54

3.3.7 Forces et faiblesses des laboratoires visités 64

3.3.8 Besoins en renforcement des capacités des laboratoires 70

3.3.9 Rôles potentiels des laboratoires et stratégies envisagées 86

3.3.10 Dispositifs de biosécurité dans les pays abritant les laboratoires visités 93

IV. DISCUSSION 96

V. MISE EN RÉSEAU DES LABORATOIRES 100

VI. TRANSFERT DE TECHNOLOGIES 102

6.1 Des laboratoires du Nord vers les laboratoires d"excellence 102

6.2 Des laboratoires d"excellence vers les laboratoires du groupe

de spécialité ou les SNRA 102

VII. CONCLUSION ET RECOMMANDATIONS 104

SOMMAIRE

7

a.L"évaluation des principaux laboratoires de biotechnologie de la région, y compris les laboratoires

des systèmes nationaux et des institutions internationales, a été effectuée sous l"égide du

CORAF/WECARD. Il s"agissait d"évaluer les capacités techniques des laboratoires nationaux et régionaux pouvant servir de centres d"excellence dans la zone CEDEAO afin d"identifier les

laboratoires ayant les meilleurs potentiels et d"apprécier également leurs faiblesses. Au terme de

cette évaluation, il s"agit de proposer des mesures devant permettre un renforcement des capacités

des laboratoires en fonction de leurs avantages comparatifs.

b.Une séance de travail préliminaire s"est tenue au secrétariat du CORAF à Dakar au Sénégal avec

les gestionnaires des programmes du CORAF/WECARD. Au cours de cette séance, la méthodologie

d"évaluation des centres d"excellence a été présentée et validée. En outre, une liste de 23

laboratoires de biotechnologies agricoles, localisés dans sept pays de la sous-région (zone CEDEAO)

a été élaborée sur la base des données antérieures disponibles.

c. Les missions d"enquête-évaluation des laboratoires présélectionnés se sont déroulées dans les

différents pays selon l"ordre suivant : la Gambie, le Sénégal, le Mali, le Burkina Faso, la Côte d"Ivoire,

le Ghana et le Nigeria. Au cours de ces missions, 23 laboratoires appartenant à 19 différentes institutions mères ont été visités.

d.Dans chaque laboratoire présélectionné, une séance de travail avec les personnes-ressources

désignées par les responsables des institutions ou des laboratoires a été organisée afin d"expliquer

et de renseigner la fiche d"évaluation. Elle a été suivie d"une visite des locaux permettant

d"apprécier l"aspect général du laboratoire et de réaliser des prises de vues afin de disposer de

données numériques des équipements.

e.Les laboratoires sont classés en trois grands types en fonction de leur spécialisation : production

végétale, production animale ou les deux domaines à la fois. Au total, 24 spécialités différentes

regroupées en six domaines ont été répertoriées dans les laboratoires visités. Ces domaines varient

d"un laboratoire à un autre, chacun des laboratoires pouvant servir en biotechnologie et/ou en biosécurité en Afrique de l"Ouest.

f.Les six domaines recensés dans les laboratoires visités sont la biotechnologie végétale, la

biotechnologie animale et halieutique, les ressources génétiques, l"environnement et la biosécurité,

l"agroalimentaire et la sécurité sanitaire et enfin l"adaptation au changement climatique.

g.Les activités de biotechnologies et /ou biosécurité en cours dans les différents laboratoires visités

sont très diversifiées et ont des niveaux de densité très variés. Ces activités portent sur les végétaux,

les animaux et les microorganismes (champignons, virus, bactéries et levures).

h.Les techniques utilisées pour mener les activités dans ces laboratoires vont de la culture in vitro (micro

propagation, embryogénèse somatique, culture de méristème et d"anthère) à la transformation

génétique en passant par l"amplification de l"ADN et ses dérivés (PCR, RT-PCR, Real Time PCR), le

clonage, le séquençage, les microfarads, les marqueurs et autres outils moléculaires d"étude de la

diversité (RAPD, AFLP, SSR, SNP).

RESUME EXECUTIF

Projet CORAF/WECARD -Labo d"excellence

RAPPORT FINAL ›RESUME EXECUTIF

RAPPORT FINAL ›RESUME EXECUTIF

Projet CORAF/WECARD -Labo d"excellence

8

i.Les techniques de base en biologie moléculaire et en biologie cellulaire sont utilisées par tous les

laboratoires ; certains laboratoires utilisent des techniques additionnelles spécifiques en fonction de

leurs domaines et de leurs activités. La technique de base en biologie moléculaire la plus communément utilisée est la PCR.

j.La transformation génétique est annoncée dans certains laboratoires visités. Cependant, elle n"est

pas pratiquée effectivement sur site pour le moment, mais dans des laboratoires partenaires régionaux ou internationaux dans le cadre d"une collaboration Sud-Sud ou Sud-Nord.

k. Au plan des infrastructures et des équipements, la majorité des laboratoires disposent de salles

spacieuses, adaptées à leurs domaines de recherche. De même, les laboratoires présentent en

général un niveau d"équipement assez important, mais il existe d"un laboratoire à un autre des

différences en termes de qualité et de quantité.

l.Au niveau institutionnel, les pays abritant les laboratoires visités se sont dotés de cadres de

biotechnologie et biosécurité. Cependant, concernant la loi sur la biosécurité, deux des pays visités

(la Côte d"Ivoire et la Gambie) n"en disposaient pas au moment de l"enquête.

m.L"insuffisance de capacités humaines constitue l"une des faiblesses des laboratoires en matière de

biotechnologies. En effet, seul le laboratoire LCV-MEP au Mali présente un effectif relativement

important de 33 chercheurs. Les autres laboratoires disposent d"effectifs en chercheurs variant entre

3 et 15.

n.L"effectif du personnel d"appui technique à la recherche varie d"un laboratoire à un autre. Le

laboratoire (LaGeFaGe) de l"université d"Abobo-Adjamé (RCI) ne dispose d"aucun technicien

spécialisé, les laboratoires CERAAS-ISRA et LCBV-UCAD (Sénégal) ont chacun deux techniciens

spécialisés quand les autres laboratoires disposent d"un effectif compris entre 3 à 34. o.Concernant la formation, 15 des 23 laboratoires (soit 65%) encadrent beaucoup plus d"étudiants de niveau 3 cycle (DEA, master II et doctorat) que de stagiaires de niveau 2 et 1 cycles (BSc, maîtrise, licence, DUT et BTS). Au niveau du 3 cycle, sept laboratoires (soit 30%) ont de bonnes dispositions à la formation (au moins deux stagiaires de 3 cycle formés par laboratoire et par an).

Il est à remarquer que le laboratoire LAPGBV-IPR (Mali) forme par an un peu plus de 20 stagiaires de

2 et 1 cycles et que le BGEAL-SHESTCO (Nigeria) en forme 45.

p.Dans les laboratoires visités, le nombre de productions scientifiques des cinq dernières années par

laboratoire est compris entre 2 et 80. De même, le nombre de revues scientifiques concernées par

ces publications varie entre 1 et 45 par laboratoire. Le Laboratoire de Biotechnologies Animales (LBA-CIRDES, Burkina Faso) se démarque des autres laboratoires par le nombre exceptionnel de 80

publications parues dans 45 revues scientifiques différentes au cours des cinq dernières années.

q.Il existe, dans les pays concernés, un nombre relativement élevé de laboratoires nationaux et

régionaux collaborant déjà avec les laboratoires visités ; ces laboratoires pourraient, chacun dans

sa spécialité, assister les laboratoires dans le cadre de la mise en œuvre du Plan d"Action pour le

Développement de la Biotechnologie et de la Biosécurité en Afrique de l"Ouest (PDBBAO).

r.Les laboratoires visités sont beaucoup plus ouverts sur le plan international que sur le plan régional.

Ainsi, par laboratoire visité, on note en moyenne, au niveau régional, 3,5 laboratoires ou institutions

partenaires et, au niveau international, 4,5 laboratoires ou institutions partenaires. 9

s.Sur la base des dix critères définis pour évaluer les forces et les faiblesses de chaque laboratoire, trois

groupes de laboratoires se distinguent : les laboratoires ayant plus de forces que de faiblesses, les

laboratoires dont les forces et les faiblesses sont approximativement équilibrées et les laboratoires

présentant plus de faiblesses que de forces. t.En matière de renforcement des capacités, le Laboratoire d"Agro-physio-génétique et de

Biotechnologies Végétales (LAPGBV-IPR, Mali) a exprimé les besoins en équipements les plus

importants; il est suivi des laboratoires de Microbiologie et Laboratoires Associés (LMLA-IRSAT, Burkina

Faso) et Biotechnology Laboratory (BL-NACGRAB, Nigeria). Des équipements de pointe, tels que séquenceur automatique d"ADN, machine à PCR quantitative (qPCR), spectrophotomètre d"absorption atomique, LICOR pour SNPs, sont sollicités par les laboratoires visités.

u.Les besoins exprimés sont liés à la taille des laboratoires et à l"importance des travaux en perspective.

Dans ce contexte, ces besoins peuvent être qualifiés de raisonnables, même si certains laboratoires

expriment des besoins qui semblent démesurés pour un renforcement des capacités. Ces besoins

traduisent la volonté des laboratoires d"améliorer leurs potentialités pour relever les défis à venir.

v.Le recrutement de chercheurs (niveau doctorat), ingénieurs de recherche, techniciens supérieurs

et techniciens est sollicité. Les spécialités demandées couvrent tous les domaines de la recherche

(moléculaire, génétique, microbiologie, biochimie, reproduction, entomologie, etc.). Le nombre de

chercheurs à recruter varie, selon les laboratoires, entre 1 et 11. La formation de chercheurs et de

techniciens est également réclamée. Les besoins exprimés par certains laboratoires sont en

adéquation parfaite avec les faiblesses en capacités humaines révélées par l"étude.

w. Les laboratoires visités ont identifié 47 laboratoires du Nord avec lesquels ils souhaitent collaborer,

dans le cadre de la mise en œuvre du PADBBAO, pour la réalisation de différents types de travaux.

Ces vœux ont pour raisons : la compétence, la longue expérience, la grande expertise, la

technicité, le plateau technique avancé des laboratoires dont le partenariat est sollicité, ainsi que

l"aide financière ou l"appui à la formation qu"ils peuvent apporter. Dans certains cas, cette collaboration existe déjà.

x.S"agissant des rôles et des stratégies envisagés par les laboratoires visités pour le renforcement de

leurs capacités, différentes préoccupations ont été exprimées par les laboratoires en fonction de

leurs spécificités. Presque tous les laboratoires ont souhaité fonctionner sous un statut hybride

(laboratoire à mandat national et régional).

y.De façon générale, les laboratoires envisagent des stratégies en rapport avec les faiblesses

identifiées au cours de l"étude et avec les rôles qu"ils souhaitent jouer.

Projet CORAF/WECARD -Labo d"excellence

RAPPORT FINAL ›RESUME EXECUTIF

RAPPORT FINAL ›LISTE DES SIGLES

Projet CORAF/WECARD -Labo d"excellence

10

LISTE DES SIGLES

ADNAcide désoxyribonucléique

ADRAOAssociation pour le Développement de la Riziculture en Afrique de l"Ouest AIEAAgence Internationale de l"Énergie Atomique

ARNAcide ribonucléique

BCBiotechnology Centre

BGEALBiotechnology and Genetic Engineering Advanced Laboratory

BLBiotechnology Laboratory

BtBacillus thuringiensis

CDBConvention sur la diversité biologique

CEDEAOCommunauté Économique des États de l"Afrique de l"Ouest CERAASCentre d"Etude Régional pour l"Amélioration de l"Adaptation à la Sécheresse GCRAI/CGIARGroupe Consultatif sur la Recherche Agricole Internationale

CIATCentre International d"Agriculture Tropicale

CIRAD Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le

Développement

CIRDESCentre International de Recherche-Développement sur l"Elevage en Zone Subhumide CNRA*Centre National de Recherche Agronomique / Bambey, Sénégal CNRACentre National de Recherche Agronomique /Abidjan, Côte d"Ivoire CORAFConseil Ouest et Centre Africain pour la recherche et le développement agricoles

CPGChromatographie en phase gazeuse

CRICrop Research Institute

CSIRCouncil for Scientific and Industrial Research DLSDepartment of Livestock Services, USDA-ARS Miami

ECOWASEconomic Community of West African States

ELISAEssai d"immuno-absorption enzymatique

FAOOrganisation des Nations Unies pour l"Alimentation et l"Agriculture

FEMFonds pour l"Environnement Mondial

GMOGenetically Modified Organisms

HPLCHigh Performance Liquid Chromatography

ICCOOrganisation Internationale du Cacao

ICGEBInternational Centre for Genetic Engineering and Biotechnology ICRISATInstitut International de Recherche sur les Cultures des Zones Tropicales Semi-arides

IERInstitut d"Economie Rurale

IITAInstitut International pour l"Agriculture Tropicale INERAInstitut de l"Environnement et de Recherches Agricoles [Burkina Faso] INRABInstitut National de Recherche Agronomique du Bénin

IPRInstitut Polytechnique Rural

IRDInstitut de Recherche pour le Développement

IRSATInstitut de Recherche en Sciences Appliquées et Technologies ISRAInstitut Sénégalais de Recherches Agricoles

ITCInternational Trypano-tolerance Center

ITRADInstitut Tchadien de la Recherche Agronomique pour le Développement LaGeFaGeLaboratoire de Génomique Fonctionnelle et Amélioration Génétique LANADALaboratoire National d"Appui au Développement Agricole

LBALaboratoire de Biotechnologies Animales

LBMALaboratoire de Biologie Moléculaire Appliquée 11

Projet CORAF/WECARD -Labo d"excellence

RAPPORT FINAL ›LISTE DES SIGLES

LCBLaboratoire Central de Biotechnologies

LCBVLaboratoire Campus de Biotechnologies Végétales

LCVLaboratoire Centrale Vétérinaire

LGBVLaboratoire de Génétique et de Biotechnologies Végétales LMLALaboratoire de Microbiologie et Laboratoires Associés LNERVLaboratoire National d"Elevage et de Recherches Vétérinaires

LNSPLaboratoire National de Santé Publique

LVBVLaboratoire de Virologie et de Biotechnologies Végétales LVCQVLaboratoire de Virologie et de Contrôle de Qualité Vaccin

MEPMinistère de l"Elevage et des Pêches

MRCMedical Research Council

MSUMichigan State University

NACGRABNational Centre for Genetic Resources and Biotechnology

NARINational Agricultural Research Institute

NARS / SNRANational Agricultural Research System/Système National de Recherche Agronomique

OGMOrganisme génétiquement modifié

OIEOrganisation Mondiale de la Santé Animale (anciennement Office International des Epizooties)

ONUOrganisation des Nations Unies

OVIOndonstepoort Vet Insitute

OVMOrganisme vivant modifié

PADBBAOPlan d"Action pour le Développement de Biotechnologie et Biosécurité en Afrique de l"Ouest

PBPlant Biotechnology

PCRRéaction de polymérisation en chaîne

PNUDProgramme des Nations Unis pour le Développement PNUEProgramme des Nations Unies pour l"Environnement

QPCRQuantitive Polymerisation Chain reaction

RECRadiation Entomology Center

RETRO-CIProjet de recherche et de prise en charge en direction des prostituées

RFLPRestriction Fragment Length Polymorphisme

RVTHRoyal Victoria Teaching Hospital

SAMSélection assistée par marqueurs moléculaires SHESTCOSheda Science and Technology Complex [Nigeria]

SIDASyndrome immuno déficience acquis

SSRSingle sequence repeats (micosatellites)

SNRA / NARSSystème National de Recherche Agronomique / National Agricultural Research System

UAAUniversité d"Abobo-Adjamé

UACUniversité d"Abomey Calavy

UACUniversité d"Abijan-Cocody

UBUniversité de Bamako

UEMOAUnion Economique et Monétaire Ouest Africaine

UFRUnité de Formation et de Recherches

UGLUniversity of Ghana, Legon

UNEP-GEFUnited Nations Environment Program -Global Environment Facility USAIDUnited States Agency for International Development

USDAUnited States Department of Agriculture

VIHVirus d"immunodéficience humaine

WAITROWorld Association of Industrial and Technological Research Organizations WECARDWest and Central African Council for Agricultural Research and Development RAPPORT FINAL ›LISTE DES TABLEAUX • LISTE DES FIGURES

Projet CORAF/WECARD -Labo d"excellence

12

Tableau I :Identification des laboratoires visités et de leurs spécialités dans la recherche 25

Tableau II :Liste des activités de biotechnologies et / ou biosécurité en cours dans les laboratoires visités31 Tableau III :Equipements disponibles dans les laboratoires de biotechnologies visités39 Tableau IV :Capacités humaines et encadrement d"étudiants46 Tableau V :Niveau et spécialité des étudiants encadrés au cours des cinq dernières années (2005-2010)49 Tableau VI : Récapitulatif des productions scientifiques des cinq dernières années52

Tableau VII :Laboratoires nationaux ou régionaux établis dans le pays des laboratoires visités 55

Tableau VIII :Laboratoires régionaux et internationaux collaborant avec les laboratoires visités59

Tableau IX :Fiche technique des laboratoires visités62 Tableau X :Récapitulatif des forces et faiblesses des laboratoires enquêtés65 Tableau XI :Besoins en équipements et infrastructures exprimés par les laboratoires 71 Tableau XIIa :Liste détaillée des besoins en personnel et en formation exprimés par les laboratoires75 Tableau XIIb :Récapitulatif des besoins en personnel et en formation (effectif de chercheurs et de techniciens) 80

Tableau XIII :Collaborations sollicitées avec des laboratoires des pays développés identifiés 83

Tableau XIV :Rôles souhaités par les laboratoires visités et stratégies envisagées87 Tableau XV :Proposition de rôles des laboratoires devant devenir centres d"excellence92

Tableau XVI :Présence de dispositifs de biotechnologies/biosécurité dans les pays concernés94

Tableau XVII :Liste par spécialité des laboratoires susceptibles de servir de centres d"excellence.97

Tableau XVIII :Interlocuteurs des laboratoires visités106 Figure 1a : Effectif de chercheurs et de techniciens des laboratoires (au cours des cinq dernières années)47 Figure 1b: Effectif de stagiaires formés dans les laboratoires pendant les cinq dernières années47 Figure 2: Nombre de publications parues au cours des cinq dernières années et diversité des revues53 Figure 3a: Recrutement (effectif de chercheurs et de techniciens) sollicité par les laboratoires visités81 Figure 3b: Formation (effectif de chercheurs et de techniciens) ollicitée par les laboratoires visités81

LISTE DES TABLEAUX

LISTE DES FIGURES

quotesdbs_dbs24.pdfusesText_30

[PDF] cétacé du mois - juin - Réseau

[PDF] CÉTACÉS

[PDF] cetaces association de recheche insulaire (cari)

[PDF] cétacés de polynésie française cetaceans of french polynesia - Anciens Et Réunions

[PDF] CETE APAVE Sud Europe - Agence de l`eau Rhône Méditerranée - Anciens Et Réunions

[PDF] Cetearyl alcohol - De L'Automobile Et Des Véhicules

[PDF] Cetelem, crédit responsable - Gestion De Projet

[PDF] CETH 30 Mme Phair Reading Reflections Français - France

[PDF] Cetia Résidence

[PDF] CETII - Formation DPE sans mention

[PDF] CETII Formation - Formation DPE sans mention

[PDF] Cetim 5.0 - Ouvrons les portes du futur

[PDF] Cetim Etat de l`Art - Cercle de confiance Numérique des Industries - Fabrication

[PDF] Cetin Civata est une société turque spécialisée dans la production

[PDF] Cetirizine Teva 1 mg/ml solution buvable - Chirurgie