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Bases Méthodologiques
médicalePr. Jean-Pierre TASU,
CHU et Université de Poitiers
Objectifs
Connaître les notions de :
¾Bit, octet
¾Pixel, voxel, matrice,
¾Imagerie 2D, 3D et 4D
¾Echelle de gris, échelle de couleur
¾Résolution spatiale,
¾Bruit, rapport signal sur bruit,
¾Contraste, contraste sur bruit, détectabilité¾Fonction de transfert de modulation
¾DQE
¾Norme DICOM
¾Compression numérique,
¾Signal, échantillonage
¾Fonction porte,
¾Transformation de Fourier
¾Filtre passe bas et passe haut
propriétés des systèmes ¾Stockage et échange des images numériques¾Notion sur le signal en imagerie
Plan du cours
Une image médicale est
numérique -1 bit = 0 ou 1, ouvert ou fermé, noir ou blanc -2 bits = 2 x 2 possibilités (00/01/10/11) -8 bits = 28soit 256 possibilités (soit 256 valeurs différentes à -8 bits = 1 octet -1 kilo octet = 1 Ko = 2 10octets -1 méga octet = 1 Mo= 2 20octets -1 giga octet = 1 Go = 2 30octetsAspects
dimensionnels (2D, 3D, 4D) taille du pixel ~ 1 mm champ de vue ~ 20 cmPixel picturexelement)
Matrice: nombre de pixels dans le champ de vue (ici 200) -souvent 2n nPixel, champ de vueet matricese déduisentde selonla formule;Pixel = Champ de vue/ Matrice
nExemple; Dans les pays anglosaxons, on parle parfois de DPI (dot per inch) pour donner la taille du pixel :150 DPI = 0,168 mm
300 DPI = 0,084 mm
3000 (9 millions de pixels de 0,143) est proche de 150 DPI.
1 inch=2,54 cm
En imagerie il peut y avoir deux approches :
2 multi-coupesvrai 3D
VOXEL = Volume xElement
Résolution temporelle : nombre intégralementacquises par unité de temps si une image est acquise en 200 ms : 5 images / seconde (par abus de langage : " résolution » de 200 ms) Attention aux interpolations (ex.: image cardiaque en IRM) ou rafraichissement keyhole») = fausse amélioration de la résolution temporelleLa 4D : temps
tRésolution temporelle vraie
Résolution temporelle apparente
Le signal dans
Signal, contraste, bruit, RS
signal = intensité du pixel nombre caractérisant la mesure physiqueUnité Hounsfield par ex.
Signal, contraste, bruit, RS
Signal:
127141
141
0 78
147
chaque pixel est codé en 8 bits (28=256 possibilités) 253
À chaque valeur, on donne une correspondance en niveau de gris
Signal, contraste, bruit, RS
256 niveaux
8 niveaux
2 niveaux de gris
Signal, contraste, bruit, RS
2000 niveaux de
densité différents signal physique niveau de grisPrincipe du fenêtrage en TDM :2000 niveaux HU
256 niveaux de gris
Sir GodfreyHounsfield
Signal, contraste, bruit, RS
250niveaux soit
8 bits
En imagerie couleur, le codage se fait en rouge vert bleu (RVB) : -Le codage couleur se fait sur un octet (= 8 bits) -Chaque pixel peut avoir 3 octets soit 24 bits (donc 0 à 255 pour le rouge, le vert ou le bleu) -soit 256x 256 x 256 valeurs = plus de 16 millions de couleurs possibles par pixelsPalette de couleur en 24 bits
environ 2 millions deSignal, contraste, bruit, RS
Le contraste dans
Signal, contraste, bruit, RS
12 12ContrasteII
II K 0 -1C = 1K
0,5 -1
C = 0,33K
0,75 -1
C = 0,14K
0,9 -1
C = 0,05
Signal,contraste, bruit, RS
Contraste:
KK On peut jouer avec le contraste en imagerie numérique :Signal,contraste, bruit, RS
KKLe bruit
Les rapports S/B, C/B
Signal, contraste, bruit, RS
Certain = déterministe
Aléatoire
Signal,contraste,bruit, RS
Bruit:
Signal :
1-le bruitest le signal aléatoire provenant du système,
2-Il est TOUJOURS présent +++
3-Il VARIE dans le temps +++
Signal,contraste,bruit, RS
Bruit:
Signal,contraste,bruit, RS
Bruit + objet= image finale
t1 t2 t3Signal,contraste,bruit, RS
Attention ! Le
Signal,contraste,bruit, RS
n 0Signal,contraste,bruit, RS
Variation au cours du temps
temps signal Rapport signal sur bruit (RSB) = Signal to noise ratio (SNR) valeur du signalécart-type du signal dans le temps sur 1pixel
SignalRSB
Signal,contraste,bruit, RS
Écart type (= Racine Carrée de la Variance)Impose de répéter les acquisitions
valeur du signalécart-type du signal dans une région vide de signalRSBEn pratique, on utilise une valeur estimée :
moyenne signal