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contexte, le résultat "ARN du VHC non détecté" serait également acceptable pour ces spécimens La valeur attendue de la charge virale du spécimen 12150202 

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29 nov 2012 · Limite inférieure de quantification Signal détectable non quantifiable Notion de stricte indétectabilité Temps ARN VHC Indétectabilité stricte

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13 mai 2016 · La concentration en ARN VHC d'un échantillon est calculée à partir Interprétation ▫ Non détecté (Cp absent) ARN du VHC non détecté

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18 oct 2017 · 80's : hépatite non A non B à transmission parentérale • 1989 : clonage du cDNA ARN VHC peut être détecté 11-12 jours après l'infection

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recherche des anticorps anti-VHC et de l'ARN du VHC - Diagnostic détecter simultanément les IgG et l'antigène Core avec 5' non codante, région NS5B)

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Le génome du VHC est formé d'une molécule d'ARN de polarité positive non codantes, la polyprotéine et les différentes protéines structurales (C, E1, E2) et non L'antigène de capside du VHC (AgC) peut être détecté et quantifié dans le  

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a détecté dans le sang des anticorps contre le virus de l'hépatite C (appelé d' anticorps) et rechercher l'ARN du VHC si l'on a une infection virale ou non

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25 nov 2016 · virale du VIH-1 et du virus de l'hépatite C (VHC) Madame Non détecté ou

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Donald Murphy

Laboratoire de santé publique du Québec

D 2

Déclaration de la personne ressource

affiliation ou des intérêts financiers ou intérêts de tout ordre avec une société commerciale ou je reçois une rémunération ou des redevances ou

Fonds de recherche

Fonds de recherche

Tests virologiques pour la prise en charge

3

ƒMesure de la charge virale

ƒGénotypage

ƒDétermination génotypique de la résistance aux 4 ƒLa limite de détection est définie comme la concentration supérieure ou égale à 95%.

ƒLa limite de détection du dosage Abbott me

est de 12 UI/ml (procédure de préparation de 0,5 ml).

ƒLa limite inférieure

RealTime

de 12 UI/ml.

Calcul de la limite de

5

UI/ml* Nombre

Détecté

Nombre

25

LD = 12 UI/ml

Quantification des acides nucléiques

6 Cp

Courbe de calibration construite avec

crossing auquel un niveau réactif de 7

Résultat Interprétation

ƒNon détecté (Cp absent)

ƒ<12 UI/ml, détecté

ƒ12 à 100 millions UI/ml

ƒ>100 millions UI/ml

Génotypage effectué par séquençage populationnel 8

UTR 3 C E1 E2 NS2 NS3 NS5A NS5B NS4B UTR 5 NS

4A P

7 3 C E1 E2 NS2 NS3 NS5A NS5B NS4B 5 NS

4A P 7

340 pb 424 pb 196 pb

1er e e

¾Premier choix :

¾Deuxième choix :

¾Troisième virale

Murphy

9

3a BM116062 BM116158

BM116165 3k 3b 4a 4c 4d

4k 4r BM109484 109484C+4r 5a 2c

2k 2a 2b BM115929 1c 1b BM115644

BM116002 BM116059

BM116068 1a BM116144 BM116155

BM115860 BM116100 6a 6b 6e BM116151

6e 6d 6g 6h

0.05 6 1 2 5 4 3 a Caractéristiques des différentes régions utilisées 10

NS5B/CE1

ƒMéthode de référence; permet

le

ƒles génomes

recombinants

ƒModérément

ƒPlus complexe pour le

ƒle

ƒNe

(sauf 6a/6b) du génotype

ƒNe permet pas

génomes

ƒTrès

Répartition des génotypes du VHC au LSPQ

11 59,7%
8,6% 25,6%
3,7%

0,6% 1,6% 0,02%

Génotype 1

Génotype 2

Génotype 3

Génotype 4

Génotype 5

Génotype 6

Génotype 7

Exclus

par deux génotypes et un

Répartition

12 46,4
25,5
12,4 4,2

2,7 1,3

0,9 0,7 0,6

5,3 1a 3a 1b 2b 2a 4a 2c 6e 5a

Répartition des

13

Montréal

50,4
31,2
8,9 4,2

1,2 0,9

3,1 1a 3a 1b 2b 2a 4d 40
22,9
16,2 4,2

2,8 1,9

1,8 1,2 1

8 Antiviraux à action directe (AAD) approuvés et 14

UTR 3 C E1 E2 NS2 NS3 NS5A NS5B NS4B UTR 5 NS

4A P

7 3 C E1 E2 NS2 NS3 NS5A NS5B NS4B 5 NS

4A P 7

Inhibiteurs de la protéase

NS3/NS4A

Inhibiteurs de

NS5A

Inhibiteurs de la

polymérase NS5B

Adapté

Échec thérapeutique et substitutions associées à la 15 ƒLes AAD présentement utilisés pour le traitement de réponse virologique soutenue > 85%. ƒChez certains individus en échec thérapeutique des substitutions ou variantes associées à la résistance

RAVs) ont été observées.

échec

Outils de séquençage pour la recherche de

16 ƒSéquençage de la population (SP) virale (méthode

Sanger)

ƒMéthode de référence utilisée en pratique clinique ƒSensibilité analytique restreinte pour la détection de différentes du même virus)

Outils de séquençage pour la recherche de

17

ƒSéquençage

ƒMéthode essentiellement utilisée en recherche clinique

ƒSéquençage massif de la quasi

ƒSensibilité

de la quasi ƒErreurs de substitutions liées à la technique (PCR +

Exemple de VAR dans la région NS5A du VHC ±

18 1"$G" 2"$G" 3"$G" "$G" 5"$G" "$G" "$G" "$G" "$G"

10"$G"

11"$G"

12"$G"

13"$G"

14"$G"

15"$G"

Y93

Séquençage

19

ƒNos

divers régimes thérapeutiques. abritant au départ des VAR NS5A identifiées par SNG et non traitement ƒLe développement de méthodes standardisées avec des

VAR sur la réponse au traitement.

Positions des mutations les plus communes associées à 20

Antiviraux

Siméprévir *,

Lédipasvir,

L31, Y93

S282

Grazoprévir,

Polymorphisme Q80K de NS3 ±

21
0 20 40
60
80
100
120
140
160
180
200

KQLQ/LQ/R

Nombre

Acide aminé en position 80 de NS3

Détecté

Persistance des substitutions associées à la résistance 22

ƒNS3

une capacité réplicative faible chez une minorité

ƒNS5A

(substitutions détectables chez la majorité des personnes

ƒNS5B

mutations de résistance aux antiviraux (LSPQ) 23

ARN Hépatite C/génotype:

l'interprétation des profils de résistance

Merci de votre attention.

Questions?

24
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