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the ETs, and their potential role in diseases other than SSSS It is hoped that the information provided will (i) help the clinician to make a correct diagnosis of SSSS by using the available routine investigations and to manage the disease ap-propriately, (ii) discourage repetitive research by bringing re-



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Microbiologie Biologie des procaryotes et de leurs virus Sous la direction de Luciano Paolozzi Jean-Claude Liébart 9782100720811-Livre indb 3 15/03/15 10:55





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Chapitre 1 : Introduction à

la microbiologie micromètre. Le monde microbien regroupe des espèces appartenant aux trois règnes du

vivant : bactéries, archées, eucaryotes. Ces espèces présentent une grande diversité de

formes, de fonctions et d'origines Ġǀolutiǀes. Dans ce premier cours, nous allons dĠcouǀrir

les caractéristiques générales des micro-organismes de chacun des trois règnes du vivant.

Fig. 1 : L'arbre Ġǀolutif des trois rğgnes du ǀiǀant. Au centre, " Luca » (Last universal common ancestor) désigne le dernier ancêtre commun des 3 règnes du vivant. Image sous licence Creative Commons, auteur " Spiridon Ion

Cepleanu ».

I. Les bactéries

1. Caractéristiques

Les bactéries sont des êtres vivants unicellulaires. Avec les archées, elles forment le domaine des procaryotes, les êtres vivants sans noyau. Le monde bactĠrien est edžtrġmement diǀersifiĠ. D'apparence simple, les bactĠries

semblent être les êtres ǀiǀants les moins ĠǀoluĠs des trois rğgnes. Il s'agit en fait moins de

bactéries ont eu autant de temps que les autres êtres vivants pour évoluer et ont mis ce

temps à profit en se propageant et en se diversifiant. Leur stratégie évolutive est basée sur

Présentes dans presque tous les environnements terrestres, certaines bactéries

peuvent surǀiǀre ă des conditions edžtrġmes de chaleur, d'humiditĠ, de profondeur ou mġme

plupart des cas, les conditions optimales de croissance des bactéries se situent généralement dans des conditions moyennes de tempĠrature, d'odžygğne, de pression, et Certaines espèces sont capables de se déplacer activement en direction des sources de nutriments, on parle de chemotaxie. Les bactéries sont souvent les premières à coloniser un milieu riche en nutriments, et tentent de s'approprier ceudž-ci en se multipliant le plus

rapidement possible. Les bactéries acquièrent les nutriments par diffusion passive à travers

leur paroi cellulaire. Leur métabolisme peut être basé sur la fermentation ou la respiration.

2. Intérêts

Les bactéries représentent à elles seules plus de la moitié de la biomasse terrestre et monde ǀiǀant, comme le cycle de l'azote, du carbone ou de l'hydrogğne.

Les bactĠries peuǀent ǀiǀre sous forme libre, ou associĠes aǀec d'autres espğces

supérieures dans des relations de parasitisme ou de symbiose. Certaines bactéries causent des maladies infectieuses, on parle de bactéries pathogènes. D'autres ǀiǀent en symbiose avec nous, on parle de flore ou de microbiome, composées de bactéries symbiotiques. Certaines bactéries symbiotiques peuvent devenir pathogènes lorsque le système immunitaire est affaibli ; on parle de bactéries opportunistes.

Les bactéries jouent également un rôle important pour la recherche et l'industrie, où leurs

utilisations sont nombreuses et variées.

II. Les eucaryotes

1. Caractéristiques

Le règne des eucaryotes regroupe tous les êtres vivants dont les cellules possèdent un noyau. Les eucaryotes peuvent être pluricellulaires (plantes, champignons, animaux) ou unicellulaires (protistes). Les eucaryotes se distinguent des procaryotes (archées, bactéries) par la présence

d'un noyau qui contient le matériel génétique. Les cellules eucaryotes présentent également

plusieurs organites (ou organelles), des structures présentes dans le cytoplasme, délimitées

par une membrane plasmique et capables de remplir plusieurs fonctions très spécialisées : - Réticulum endoplasmique : assemblage et synthèse des protéines non cytoplasmiques - Appareil de Golgi : synthèse des produits sécrétés par la cellule - Les vésicules de digestion (peroxysome, lysosomes, endosome) : Recyclage des protéines, de la membrane et des autres organites - La mitochondrie ͗ crĠation d'Ġnergie (sous forme d'ATP) L'un des organites les plus intĠressants des eucaryotes est la mitochondrie. Cette

structure est responsable de la conǀersion des sucres et de l'odžygğne de la cellule eucaryote

respiration cellulaire. Les mitochondries possèdent leur propre ADN et se divisent double membrane plasmique ; la première est semblable à une membrane eucaryote mais la seconde est semblable à une membrane bactérienne. Cette observation a conduit au

développement de la théorie endosymbiotique (Fig.2). Selon cette thĠorie, l'ancġtre

commun des eucaryotes serait une cellule primitive proche des archées, qui aurait phagocyté une bactérie et aurait entamé avec elle une relation symbiotique qui a perduré archéale. Fig. 2 : Principe de la théorie endosymbiotique. autour de la mitochondrie chez les eucaryotes. A l'opposĠ des bactĠries et des archĠes, les eucaryotes possèdent plusieurs chromosomes, aussi les seuls capables de reproduction sexuée. Ce mode de reproduction assure un

brassage génétique à chaque nouvelle génération, ce qui permet une diversification

Les protistes (eucaryotes unicellulaires) forment un groupe très hétérogène. Ils

mesurent en moyenne une centaine de micromètres, ce qui est supérieur à la taille moyenne

des bactéries et des archées mais toujours inférieur au millimètre ; leur étude tombe donc

dans le champ de la microbiologie. On distingue trois types de protistes : - les champignons unicellulaires ou levures. - les algues unicellulaires, qui pratiquent la photosynthèse. - les protozoaires, qui se nourrissent par phagocytose.

2. Intérêts

Les levures présentent un intérêt particulièrement important dans le domaine

industriel, et agro-alimentaire en particulier. Elles sont par exemple utilisées pour la

production de ǀin, de fromage, de produits laitiers et d'alcool. Les algues unicellulaires jouent un rôle primordial dans les écosystèmes marins, où

elles sont à la base de la chaîne alimentaire du zooplancton. Elles sont également

bactéries et sont à leur tour mangés par des organismes pluricellulaires. Certains

protozoaires sont également pathogènes (maladie du sommeil, malaria, amibe mangeuse de protozoaires pathogènes.

III. Les archées

1. Caractéristiques

Les archées forment le règne du vivant le moins bien connu. Longtemps classées

parmi les bactéries du fait de leur apparence similaire, de récentes analyses de leurs

au niveau évolutif (cf. Fig.1). Ainsi, les archées possèdent certains points communs avec les bactéries, des points communs avec les eucaryotes, et aussi quelques caractéristiques uniques, qui sont résumés dans le tableau suivant : Tableau 1 : Caractéristiques des archées, points communs avec les autres règnes. extrêmophiles, c'est-à-dire des organismes vivant dans des conditions extrêmes de chaleur, de profondeur, d'acidité ou de concentration en certains produits chimique (sel, métaux

Points communs avec

les bactéries Caractéristiques uniques Points communs avec les eucaryotes Strictement unicellulaires Certaines sont capables de métaboliser le méthane (méthanogènes)

Enzymes impliquées dans la

réplication/transcription/ traduction similaires

Taille et forme similaire Membrane composée

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